{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[286.2121569285899, 709.4038613728407, 1, 0, 0.2874724308040782, 0.003493911686810357, 0, -0.0221622394472378, 1, 0.2874724308040781, 0.0009725942641376282],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.0009729300689736662],
[285.8879821247353, 709.7280361766951, 1, 0, 0.2871468285659708, 0.003497873511743811, 0, -0.02218736970830156, 1, 0.2871468285659708, 0.0009733365738684775],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009730163171572351],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009722500124568399],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 0, 1, 0.287501643730167, 0, 0.001409682598136395, 0.008941761007423782, 0.712498356269833, 1, 0.0009725942641748778],
[286.2431659091417, 709.2707711324105, 0, 1, 0.2875330573068552, 0, 0.00140989878717745, 0.008943132316639122, 0.7124669426931447, 1, 0.0009724975359504073],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.00097285882141667],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729740916890622],
[286.395429963782, 709.1085852604126, 0, 1, 0.2876888747648936, 0, 0.001410221256357742, 0.008945177771655906, 0.7123111252351064, 1, 0.0009732381320917625],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009745621808395461],
[286.1044501911307, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873642498030906, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126357501969094, 1, 0.0009730215256584304],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009724760396628939],
[286.3818816271527, 709.2341366742778, 0, 1, 0.287642902848966, 0, 0.001409971613449366, 0.008943594261135992, 0.712357097151034, 1, 0.0009724394048215967],
[286.3818816271527, 709.2341366742777, 0, 1, 0.287642902848966, 0, 0.001409971613449367, 0.008943594261135994, 0.712357097151034, 1, 0.0009726575059957246],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009725942641748778],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009724760397010901],
[286.2431659091417, 709.2984516519002, 0, 1, 0.2875250625989934, 0, 0.00140984376558426, 0.008942783309041807, 0.7124749374010066, 1, 0.0009727589339986435],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009725577737542819],
[286.0885263462612, 709.5274919551694, 0, 1, 0.2873482558409839, 0, 0.001409388658421686, 0.008939896517727312, 0.7126517441590161, 1, 0.0009731486713073214],
[286.2431659091417, 709.3184717278207, 0, 1, 0.2875192806630844, 0, 0.001409803973614435, 0.008942530904504321, 0.7124807193369156, 1, 0.0009741457619035222],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.0009729594179702103],
[286.3477211473309, 709.6872038488564, 0, 1, 0.2874876311675788, 0, 0.001409071481881999, 0.008937884634471604, 0.7125123688324212, 1, 0.0009825739994325014],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009731486713073214],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729740916890622],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009728588213750909],
[286.2431659091417, 709.474933652167, 0, 1, 0.287474101389996, 0, 0.001409493066727948, 0.008940558790300592, 0.712525898610004, 1, 0.0009731633513925188],
[286.2431659091417, 709.552162862246, 1, 0, 0.2874518062484874, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2874518062484874, 0.0009725942641748778],
[286.324259214385, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875850267082566, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124149732917434, 1, 0.0009724760396628939],
[286.395429963782, 709.0274919551694, 0, 1, 0.2877123116792168, 0, 0.001410382547004579, 0.008946200854737626, 0.7122876883207832, 1, 0.00097285882141667],
[286.1044501911308, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873642498030906, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126357501969094, 1, 0.0009729740916900349],
[286.2431659091417, 709.474933652167, 0, 1, 0.287474101389996, 0, 0.001409493066727948, 0.008940558790300592, 0.712525898610004, 1, 0.0009731633513925188],
[286.2816227287403, 709.2571663626112, 0, 1, 0.2875645086516773, 0, 0.001409925831456097, 0.008943303861266688, 0.7124354913483226, 1, 0.0009745622130790055],
[286.2431659091417, 709.3184717278207, 0, 1, 0.2875192806630844, 0, 0.001409803973614435, 0.008942530904504321, 0.7124807193369156, 1, 0.0009741302274765034],
[286.3818816271527, 709.2341366742777, 0, 1, 0.287642902848966, 0, 0.001409971613449367, 0.008943594261135994, 0.712357097151034, 1, 0.0009724760397032111],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.000972048337941382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.011612707064, 709.4956442654302, 0, 1, 0.2873023885098273, 0, 0.001409451922760344, 0.008940297809902811, 0.7126976114901726, 1, 0.0009725387492356698],
[286.0500695266626, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873253234281136, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126746765718864, 1, 0.000973016317119167],
[286.1111427559854, 709.5048755454451, 1, 0, 0.2873709718372199, 0.003495145244492859, 0, -0.02217006402987817, 1, 0.2873709718372199, 0.000973018109846054],
[286.2121569285898, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494567, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874323838494568, 0.0009725942641376282],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.00097285882141667],
[286.3551689863776, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875837204921637, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2875837204921636, 0.0009724760397032111],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009725942641748778],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 1, 0, 0.287501643730167, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.287501643730167, 0.0009724824715282985],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009728745960795797],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729740916890622],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009724975359504073],
[286.2357180700951, 709.4575294414144, 0, 1, 0.2874737965588005, 0, 0.001409527644011815, 0.008940778117551307, 0.7125262034411995, 1, 0.00097285882141667],
[286.3551689863776, 709.2608493150528, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009720333927047418],
[286.4362622916208, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2876975229670321, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7123024770329679, 1, 0.0009725942641376282],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009732381320917625],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009728588214141434],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729740916496316],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009728745960795797],
[286.2121569285898, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494567, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874323838494568, 0.0009724975359886491],
[286.2741748896936, 709.3418434117369, 1, 0, 0.2875347218479784, 0.003493154771593761, 0, -0.02215743825654521, 1, 0.2875347218479785, 0.0009730215256179906],
[286.3978054720223, 709.2182128294082, 0, 1, 0.2876588968110727, 0, 0.001410003271081442, 0.00894379506873655, 0.7123411031889273, 1, 0.0009724975359907416],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009741302275899066],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.000972048337941382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.6644481121387, 709.9515701892918, 1, 0, 0.2869223102692705, 0.00350061061713723, 0, -0.02220473144796723, 1, 0.2869223102692704, 0.0009729955922286263],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.000973192568915006],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149754, 1, 0.0009730638508421149],
[286.1044501911307, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873642498030906, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126357501969094, 1, 0.0009730068529106785],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009724824714901102],
[286.2357180700951, 709.5596107012926, 0, 1, 0.2874443269614979, 0, 0.001409324861390646, 0.008939491846629505, 0.7125556730385021, 1, 0.0009728745960405938],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009729594179702103],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009732234674901357],
[286.2431659091417, 709.7145298769666, 0, 1, 0.287404944125875, 0, 0.001409017228621987, 0.008937540500490285, 0.712595055874125, 1, 0.0009735520944747737],
[286.1311628319059, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2874234141260265, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2874234141260265, 0.0009729594179308331],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009735417529764768],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009725667583538542],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729153937353005],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009722047930788148],
[286.4362622916208, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2876975229670321, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7123024770329679, 1, 0.0009724975359100754],
[285.324259214385, 710.2917590870455, 0, 1, 0.2865806234226345, 0, 0.001407872169719839, 0.008930277274671956, 0.7134193765773655, 1, 0.000973536351726993],
[286.2121569285899, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494568, 0.003493911686810357, 0, -0.0221622394472378, 1, 0.2874323838494568, 0.0009725792396177915],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.0009745777014266944],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009724824715304239],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009729594179712159],
[286.0885263462612, 709.4502627450903, 0, 1, 0.2873705469652066, 0, 0.001409542081400717, 0.008940869695386842, 0.7126294530347934, 1, 0.000973223612088759],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.0009726663986851731],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.0009729300689736662],
[286.3818816271527, 709.0719500637912, 0, 1, 0.2876897677320559, 0, 0.001410294117416485, 0.008945639936809174, 0.7123102322679441, 1, 0.0009730180972909551],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.0009731925634921329],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009730638508421149],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149754, 1, 0.0009729740916890622],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009741302275899066],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009731633513520573],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009725577737542819],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009731486713073214],
[286.3644209832302, 709.1972166537322, 0, 1, 0.2876410763103898, 0, 0.001410045015007797, 0.008944059854734104, 0.7123589236896102, 1, 0.0009728745960795797],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009730068528693091],
[286.316712166779, 709.4786166046086, 0, 1, 0.2875256630496918, 0, 0.001409485749952205, 0.008940512379243154, 0.7124743369503082, 1, 0.0009731984003051936],
[286.2121569285898, 709.4038613728407, 1, 0, 0.2874724308040782, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874724308040781, 0.0009724819091448118],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729300689736662],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009730034376071923],
[287.0074330410179, 708.6085852604126, 0, 1, 0.2882712087443777, 0, 0.001411216319983622, 0.008951489562084164, 0.7117287912556223, 1, 0.0009725636839671554],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009728775100805042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3551689863776, 709.2608493150528, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0005122969861171178],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 0, 0.2875035763260283, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004597180519530439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.831036494438, 708.6762204780563, 0, 1, 0.2881255103722092, 0, 0.00141108163517244, 0.008950635242541232, 0.7118744896277908, 1, 0.0009728754334852241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2925796748394, 709.2146772976548, 0, 1, 0.2875846234868277, 0, 0.001410010300139775, 0.008943839654773014, 0.7124153765131722, 1, 0.0009738212716019967],
[286.3644209832302, 709.1972166537322, 0, 1, 0.2876410763103898, 0, 0.001410045015007797, 0.008944059854734104, 0.7123589236896102, 1, 0.0009730767822020272],
[285.9765232690253, 709.4463986499261, 1, 0, 0.2872914787995106, 0.003496790535701683, 0, -0.0221805002804188, 1, 0.2872914787995107, 0.0009729594179712159],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.000973541752254596],
[286.395429963782, 709.0274919551694, 0, 1, 0.2877123116792168, 0, 0.001410382547004579, 0.008946200854737626, 0.7122876883207832, 1, 0.0009725667583538542],
[286.6620726038984, 708.953945697532, 0, 1, 0.2879243275866111, 0, 0.001410528858847257, 0.008947128925731419, 0.712075672413389, 1, 0.0009729594179712159],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.000973223612088759],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009726663981113158],
[285.9831166253207, 709.213994981353, 0, 1, 0.2873632904376316, 0, 0.001410011656673939, 0.00894384825940806, 0.7126367095623684, 1, 0.000972977505853342],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 1, 0, 0.287501643730167, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.287501643730167, 0.0009720846752756594],
[286.2121569285898, 709.2107649903616, 1, 1, 0.2875281959318731, 0.003493911686810357, 0.001410018078354451, -0.01321835045445297, 0.9173275365441623, 0.4923839284079086, 0.00194668021130913],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009729479383447089],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009727364797917112],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009734728672088001],
[286.1657555563401, 709.4502627450904, 0, 1, 0.2874258251133332, 0, 0.001409542081400717, 0.008940869695386841, 0.7125741748866667, 1, 0.0009731242207526221],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009720846752783787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.01915975467, 709.5968585467605, 0, 1, 0.2872785838084773, 0, 0.001409250883731333, 0.008939022598764532, 0.7127214161915227, 1, 0.0009733445096626816],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009728422704329628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009729428244921592],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009731328655978737],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729300689736662],
[286.2975465736098, 709.3184717278206, 0, 1, 0.2875581964440945, 0, 0.001409803973614435, 0.008942530904504323, 0.7124418035559055, 1, 0.0009740033460603523],
[286.3551689863776, 709.2608493150528, 2, 0, 0.2876160725848038, 0.006984333501223243, 0, -0.04430234227665409, 1, 0.08272300520910703, 0.001946376381366972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009731938398224944],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009734036563734463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 0, 1, 0.287501643730167, 0, 0.001409682598136395, 0.008941761007423782, 0.712498356269833, 1, 0.0009720846752756594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2282702310484, 710.2255614598955, 0, 0, 0.2872468960707693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003686959886940649],
[286.2357180700951, 709.7992069260921, 0, 1, 0.2873751822218391, 0, 0.001408849136829375, 0.008936474277044784, 0.7126248177781609, 1, 0.0006040295950030789],
[286.1311628319058, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2874234141260265, 0.003494900695550846, 0, -0.02216851283090828, 1, 0.2874234141260265, 0.0009730767935773895],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729594179712159],
[286.2431659091417, 709.1797560098097, 0, 1, 0.2875593474955643, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538235, 0.7124406525044358, 1, 0.0009728745960821537],
[286.3551689863776, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875837204921637, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2875837204921636, 0.0009724609748227747],
[285.7431659091417, 709.8728523922888, 0, 1, 0.2870013746832172, 0, 0.001408702976356929, 0.008935547166207865, 0.7129986253167828, 1, 0.0009731937310553442],
[286.0575173657093, 709.4812717256423, 0, 1, 0.2873393990271336, 0, 0.001409480475175533, 0.008940478920794826, 0.7126606009728664, 1, 0.000973403656378926],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729594179308331],
[286.2741748896937, 709.3418434117369, 1, 0, 0.2875347218479785, 0.00349315477159376, 0, -0.02215743825654521, 1, 0.2875347218479785, 0.0009735417515143587],
[286.2357180700951, 709.4575294414144, 0, 1, 0.2874737965588005, 0, 0.001409527644011815, 0.008940778117551307, 0.7125262034411995, 1, 0.0009725667583538542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.8569731441835, 709.6502838283108, 0, 0, 0.2871470510556827, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003671470963080281],
[286.0500695266626, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873253234281136, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126746765718864, 1, 0.0006054779279063433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 0, 0.2875035763260283, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000367147096028271],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0006054779279063433],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 0, 0.2875035763260283, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003671618839945918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0006054653819994106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.01915975467, 709.5968585467605, 0, 0, 0.2872785838084773, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003671766704203998],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0006054528360924898],
[285.0566026531274, 707.577669187575, 0, 1.75, 0.2871718323048926, 0, 0.002473226722953695, 0.01568793024973278, 0.5529979128954128, 1, 0.0009749208051139952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009730715690013571],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.000972829955584701],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2580686002973, 709.6140438710557, 0.5, 2.5, 0.2874446076112325, 0.001746675656846378, 0.003523041886772855, 0.01126767281561072, 0.5807080580530769, 0.6382105544392223, 0.002931403358609093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.542432230027, 709.3510175074255, 0, 1, 0.2877239852371438, 0, 0.001409739290307752, 0.0089421206116694, 0.7122760147628562, 1, 0.0009723258653139309],
[286.181147948038, 709.7123017894145, 0, 1, 0.2873612112053593, 0, 0.001409021652123933, 0.008937568559215891, 0.7126387887946407, 1, 0.0009722168763620531],
[286.181147948038, 709.7123017894145, 0, 1, 0.2873612112053593, 0, 0.001409021652123933, 0.008937568559215891, 0.7126387887946407, 1, 0.0009719181577099446],
[286.181147948038, 709.7123017894145, 0, 1, 0.2873612112053593, 0, 0.001409021652123933, 0.008937568559215891, 0.7126387887946407, 1, 0.000972066968622805],
[286.2121569285898, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494567, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874323838494568, 0.0009725168070547008],
[285.9881507741181, 709.7665832453234, 1, 0, 0.287207422674964, 0.003496648365651448, 0, -0.02217959848123841, 1, 0.287207422674964, 0.0009732236197669532],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009730600232252916],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.1365010239309, 707.516595534139, 1, 1.75, 0.2872468760865347, 0.003507092204642268, 0.002473440214754029, -0.006556560370857591, 0.8308269400083886, 0.6059216228994689, 0.001948481703261897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[284.8529466148968, 707.8896599836281, 0.25, 1.5, 0.2869353493257434, 0.0008776458273327401, 0.002118974304603759, 0.00787387358696243, 0.6507301831562093, 0.4466809942799098, 0.0009745814722034507],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.000973778585162845],
[286.0909018545014, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2872949219241808, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7127050780758193, 1, 0.0009734486014491525],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009727675756424814],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.745541417382, 710.0635732665277, 0, 1, 0.286948108029804, 0, 0.00140832460310514, 0.008933147105943541, 0.713051891970196, 1, 0.0009817932068265894]
],
"NAMES": [
["epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3"],
["Node374"],
["epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3"],
["epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_417240_England_20200303_null_4"],
["epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2"],
["epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1"],
["epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3"],
["epi_isl_426630_New_Taipei_city_20200317_null_4"],
["epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3"],
["epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1"],
["epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2"],
["epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1"],
["epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3"],
["epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1"],
["epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2"],
["epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46"],
["epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3"],
["epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_420725_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["Node329"],
["epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_425240_England_20200331_null_4"],
["epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1"],
["epi_isl_425485_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_421669_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1"],
["epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1"],
["epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2"],
["epi_isl_423346_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1"],
["epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5"],
["epi_isl_425404_England_20200319_null_1"],
["Node284"],
["epi_isl_423354_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1"],
["epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1"],
["epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1"],
["epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1"],
["epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7"],
["epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24"],
["epi_isl_425501_England_20200315_null_3"],
["epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1"],
["epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1"],
["epi_isl_427588_New_York_20200316_null_6"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2"],
["epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2"],
["epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3"],
["epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1"],
["epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1"],
["Node258"],
["epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7"],
["epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4"],
["epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2"],
["epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2"],
["epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3"],
["epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_421954_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_1"],
["epi_isl_423548_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_426808_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78"],
["Node225"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_421895_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425336_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46"],
["epi_isl_423446_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_1"],
["Node228"],
["epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2"],
["epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3"],
["epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1"],
["epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1"],
["epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1"],
["Node171"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["Node185"],
["epi_isl_423412_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_425549_England_20200322_null_4"],
["epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1"],
["epi_isl_423752_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_417236_England_20200301_null_1"],
["epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10"],
["epi_isl_418677_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2"],
["epi_isl_421964_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3"],
["Node203"],
["epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4"],
["epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5"],
["epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23"],
["epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1"],
["epi_isl_420726_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3"],
["Node165"],
["epi_isl_423373_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5"],
["Node162"],
["epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1"],
["Node159"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10"],
["Node156"],
["epi_isl_423324_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423465_England_20200330_null_4"],
["Node152"],
["epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2"],
["epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_423579_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423740_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423328_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423481_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423173_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423227_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423130_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423164_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423780_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423825_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423933_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_424138_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_425023_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423068_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_414010_England_20200226_null_1"],
["epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421953_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421947_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1"],
["epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_423927_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_421948_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421847_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346"],
["epi_isl_420697_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_420696_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1"],
["epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2"],
["Node62"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1"],
["Node73"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_418715_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_8051"],
["epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1"],
["epi_isl_422002_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_424062_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76"],
["epi_isl_423639_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_417288_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1"],
["Node102"],
["epi_isl_424007_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2"],
["epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1"],
["epi_isl_423052_England_20200319_null_5"],
["epi_isl_417312_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_423648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[286.2121569285899, 709.4038613728407, 1, 0, 0.2874724308040782, 0.003493911686810357, 0, -0.0221622394472378, 1, 0.2874724308040781, 0.0009725942641376282],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.0009729300689736662],
[285.8879821247353, 709.7280361766951, 1, 0, 0.2871468285659708, 0.003497873511743811, 0, -0.02218736970830156, 1, 0.2871468285659708, 0.0009733365738684775],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009730163171572351],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009722500124568399],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 0, 1, 0.287501643730167, 0, 0.001409682598136395, 0.008941761007423782, 0.712498356269833, 1, 0.0009725942641748778],
[286.2431659091417, 709.2707711324105, 0, 1, 0.2875330573068552, 0, 0.00140989878717745, 0.008943132316639122, 0.7124669426931447, 1, 0.0009724975359504073],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.00097285882141667],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729740916890622],
[286.395429963782, 709.1085852604126, 0, 1, 0.2876888747648936, 0, 0.001410221256357742, 0.008945177771655906, 0.7123111252351064, 1, 0.0009732381320917625],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009745621808395461],
[286.1044501911307, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873642498030906, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126357501969094, 1, 0.0009730215256584304],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009724760396628939],
[286.3818816271527, 709.2341366742778, 0, 1, 0.287642902848966, 0, 0.001409971613449366, 0.008943594261135992, 0.712357097151034, 1, 0.0009724394048215967],
[286.3818816271527, 709.2341366742777, 0, 1, 0.287642902848966, 0, 0.001409971613449367, 0.008943594261135994, 0.712357097151034, 1, 0.0009726575059957246],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009725942641748778],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009724760397010901],
[286.2431659091417, 709.2984516519002, 0, 1, 0.2875250625989934, 0, 0.00140984376558426, 0.008942783309041807, 0.7124749374010066, 1, 0.0009727589339986435],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009725577737542819],
[286.0885263462612, 709.5274919551694, 0, 1, 0.2873482558409839, 0, 0.001409388658421686, 0.008939896517727312, 0.7126517441590161, 1, 0.0009731486713073214],
[286.2431659091417, 709.3184717278207, 0, 1, 0.2875192806630844, 0, 0.001409803973614435, 0.008942530904504321, 0.7124807193369156, 1, 0.0009741457619035222],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.0009729594179702103],
[286.3477211473309, 709.6872038488564, 0, 1, 0.2874876311675788, 0, 0.001409071481881999, 0.008937884634471604, 0.7125123688324212, 1, 0.0009825739994325014],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009731486713073214],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729740916890622],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009728588213750909],
[286.2431659091417, 709.474933652167, 0, 1, 0.287474101389996, 0, 0.001409493066727948, 0.008940558790300592, 0.712525898610004, 1, 0.0009731633513925188],
[286.2431659091417, 709.552162862246, 1, 0, 0.2874518062484874, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2874518062484874, 0.0009725942641748778],
[286.324259214385, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875850267082566, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124149732917434, 1, 0.0009724760396628939],
[286.395429963782, 709.0274919551694, 0, 1, 0.2877123116792168, 0, 0.001410382547004579, 0.008946200854737626, 0.7122876883207832, 1, 0.00097285882141667],
[286.1044501911308, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873642498030906, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126357501969094, 1, 0.0009729740916900349],
[286.2431659091417, 709.474933652167, 0, 1, 0.287474101389996, 0, 0.001409493066727948, 0.008940558790300592, 0.712525898610004, 1, 0.0009731633513925188],
[286.2816227287403, 709.2571663626112, 0, 1, 0.2875645086516773, 0, 0.001409925831456097, 0.008943303861266688, 0.7124354913483226, 1, 0.0009745622130790055],
[286.2431659091417, 709.3184717278207, 0, 1, 0.2875192806630844, 0, 0.001409803973614435, 0.008942530904504321, 0.7124807193369156, 1, 0.0009741302274765034],
[286.3818816271527, 709.2341366742777, 0, 1, 0.287642902848966, 0, 0.001409971613449367, 0.008943594261135994, 0.712357097151034, 1, 0.0009724760397032111],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.000972048337941382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.011612707064, 709.4956442654302, 0, 1, 0.2873023885098273, 0, 0.001409451922760344, 0.008940297809902811, 0.7126976114901726, 1, 0.0009725387492356698],
[286.0500695266626, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873253234281136, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126746765718864, 1, 0.000973016317119167],
[286.1111427559854, 709.5048755454451, 1, 0, 0.2873709718372199, 0.003495145244492859, 0, -0.02217006402987817, 1, 0.2873709718372199, 0.000973018109846054],
[286.2121569285898, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494567, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874323838494568, 0.0009725942641376282],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.00097285882141667],
[286.3551689863776, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875837204921637, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2875837204921636, 0.0009724760397032111],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009725942641748778],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 1, 0, 0.287501643730167, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.287501643730167, 0.0009724824715282985],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009728745960795797],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729740916890622],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009724975359504073],
[286.2357180700951, 709.4575294414144, 0, 1, 0.2874737965588005, 0, 0.001409527644011815, 0.008940778117551307, 0.7125262034411995, 1, 0.00097285882141667],
[286.3551689863776, 709.2608493150528, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009720333927047418],
[286.4362622916208, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2876975229670321, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7123024770329679, 1, 0.0009725942641376282],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009732381320917625],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009728588214141434],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729740916496316],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009728745960795797],
[286.2121569285898, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494567, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874323838494568, 0.0009724975359886491],
[286.2741748896936, 709.3418434117369, 1, 0, 0.2875347218479784, 0.003493154771593761, 0, -0.02215743825654521, 1, 0.2875347218479785, 0.0009730215256179906],
[286.3978054720223, 709.2182128294082, 0, 1, 0.2876588968110727, 0, 0.001410003271081442, 0.00894379506873655, 0.7123411031889273, 1, 0.0009724975359907416],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009741302275899066],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.000972048337941382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.6644481121387, 709.9515701892918, 1, 0, 0.2869223102692705, 0.00350061061713723, 0, -0.02220473144796723, 1, 0.2869223102692704, 0.0009729955922286263],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.000973192568915006],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149754, 1, 0.0009730638508421149],
[286.1044501911307, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873642498030906, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126357501969094, 1, 0.0009730068529106785],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009724824714901102],
[286.2357180700951, 709.5596107012926, 0, 1, 0.2874443269614979, 0, 0.001409324861390646, 0.008939491846629505, 0.7125556730385021, 1, 0.0009728745960405938],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009729594179702103],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009732234674901357],
[286.2431659091417, 709.7145298769666, 0, 1, 0.287404944125875, 0, 0.001409017228621987, 0.008937540500490285, 0.712595055874125, 1, 0.0009735520944747737],
[286.1311628319059, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2874234141260265, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2874234141260265, 0.0009729594179308331],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009735417529764768],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009725667583538542],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729153937353005],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009722047930788148],
[286.4362622916208, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2876975229670321, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7123024770329679, 1, 0.0009724975359100754],
[285.324259214385, 710.2917590870455, 0, 1, 0.2865806234226345, 0, 0.001407872169719839, 0.008930277274671956, 0.7134193765773655, 1, 0.000973536351726993],
[286.2121569285899, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494568, 0.003493911686810357, 0, -0.0221622394472378, 1, 0.2874323838494568, 0.0009725792396177915],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.0009745777014266944],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009724824715304239],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009729594179712159],
[286.0885263462612, 709.4502627450903, 0, 1, 0.2873705469652066, 0, 0.001409542081400717, 0.008940869695386842, 0.7126294530347934, 1, 0.000973223612088759],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.0009726663986851731],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.0009729300689736662],
[286.3818816271527, 709.0719500637912, 0, 1, 0.2876897677320559, 0, 0.001410294117416485, 0.008945639936809174, 0.7123102322679441, 1, 0.0009730180972909551],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.2917590870455, 0, 1, 0.2875269955097135, 0, 0.00140985706824951, 0.008942867689209081, 0.7124730044902865, 1, 0.0009731925634921329],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009730638508421149],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149754, 1, 0.0009729740916890622],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009741302275899066],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009731633513520573],
[286.3551689863776, 709.260849315053, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0009725577737542819],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009731486713073214],
[286.3644209832302, 709.1972166537322, 0, 1, 0.2876410763103898, 0, 0.001410045015007797, 0.008944059854734104, 0.7123589236896102, 1, 0.0009728745960795797],
[286.0500695266626, 709.5659487747679, 0, 1, 0.2873096296850245, 0, 0.001409312272843327, 0.008939411996185366, 0.7126903703149755, 1, 0.0009730068528693091],
[286.316712166779, 709.4786166046086, 0, 1, 0.2875256630496918, 0, 0.001409485749952205, 0.008940512379243154, 0.7124743369503082, 1, 0.0009731984003051936],
[286.2121569285898, 709.4038613728407, 1, 0, 0.2874724308040782, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874724308040781, 0.0009724819091448118],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729300689736662],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009730034376071923],
[287.0074330410179, 708.6085852604126, 0, 1, 0.2882712087443777, 0, 0.001411216319983622, 0.008951489562084164, 0.7117287912556223, 1, 0.0009725636839671554],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009728775100805042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3551689863776, 709.2608493150528, 1, 0, 0.2876160725848038, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2876160725848038, 0.0005122969861171178],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 0, 0.2875035763260283, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004597180519530439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.831036494438, 708.6762204780563, 0, 1, 0.2881255103722092, 0, 0.00141108163517244, 0.008950635242541232, 0.7118744896277908, 1, 0.0009728754334852241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2925796748394, 709.2146772976548, 0, 1, 0.2875846234868277, 0, 0.001410010300139775, 0.008943839654773014, 0.7124153765131722, 1, 0.0009738212716019967],
[286.3644209832302, 709.1972166537322, 0, 1, 0.2876410763103898, 0, 0.001410045015007797, 0.008944059854734104, 0.7123589236896102, 1, 0.0009730767822020272],
[285.9765232690253, 709.4463986499261, 1, 0, 0.2872914787995106, 0.003496790535701683, 0, -0.0221805002804188, 1, 0.2872914787995107, 0.0009729594179712159],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.000973541752254596],
[286.395429963782, 709.0274919551694, 0, 1, 0.2877123116792168, 0, 0.001410382547004579, 0.008946200854737626, 0.7122876883207832, 1, 0.0009725667583538542],
[286.6620726038984, 708.953945697532, 0, 1, 0.2879243275866111, 0, 0.001410528858847257, 0.008947128925731419, 0.712075672413389, 1, 0.0009729594179712159],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.000973223612088759],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009726663981113158],
[285.9831166253207, 709.213994981353, 0, 1, 0.2873632904376316, 0, 0.001410011656673939, 0.00894384825940806, 0.7126367095623684, 1, 0.000972977505853342],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 1, 0, 0.287501643730167, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.287501643730167, 0.0009720846752756594],
[286.2121569285898, 709.2107649903616, 1, 1, 0.2875281959318731, 0.003493911686810357, 0.001410018078354451, -0.01321835045445297, 0.9173275365441623, 0.4923839284079086, 0.00194668021130913],
[286.2431659091417, 709.1797560098096, 0, 1, 0.2875593474955644, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538237, 0.7124406525044356, 1, 0.0009729479383447089],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009727364797917112],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009734728672088001],
[286.1657555563401, 709.4502627450904, 0, 1, 0.2874258251133332, 0, 0.001409542081400717, 0.008940869695386841, 0.7125741748866667, 1, 0.0009731242207526221],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009720846752783787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.01915975467, 709.5968585467605, 0, 1, 0.2872785838084773, 0, 0.001409250883731333, 0.008939022598764532, 0.7127214161915227, 1, 0.0009733445096626816],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009728422704329628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009729428244921592],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009731328655978737],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729300689736662],
[286.2975465736098, 709.3184717278206, 0, 1, 0.2875581964440945, 0, 0.001409803973614435, 0.008942530904504323, 0.7124418035559055, 1, 0.0009740033460603523],
[286.3551689863776, 709.2608493150528, 2, 0, 0.2876160725848038, 0.006984333501223243, 0, -0.04430234227665409, 1, 0.08272300520910703, 0.001946376381366972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009731938398224944],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0009734036563734463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3795449571435, 0, 1, 0.287501643730167, 0, 0.001409682598136395, 0.008941761007423782, 0.712498356269833, 1, 0.0009720846752756594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2282702310484, 710.2255614598955, 0, 0, 0.2872468960707693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003686959886940649],
[286.2357180700951, 709.7992069260921, 0, 1, 0.2873751822218391, 0, 0.001408849136829375, 0.008936474277044784, 0.7126248177781609, 1, 0.0006040295950030789],
[286.1311628319058, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2874234141260265, 0.003494900695550846, 0, -0.02216851283090828, 1, 0.2874234141260265, 0.0009730767935773895],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009729594179712159],
[286.2431659091417, 709.1797560098097, 0, 1, 0.2875593474955643, 0, 0.001410079731585242, 0.008944280065538235, 0.7124406525044358, 1, 0.0009728745960821537],
[286.3551689863776, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875837204921637, 0.003492166750611622, 0, -0.02215117113832705, 1, 0.2875837204921636, 0.0009724609748227747],
[285.7431659091417, 709.8728523922888, 0, 1, 0.2870013746832172, 0, 0.001408702976356929, 0.008935547166207865, 0.7129986253167828, 1, 0.0009731937310553442],
[286.0575173657093, 709.4812717256423, 0, 1, 0.2873393990271336, 0, 0.001409480475175533, 0.008940478920794826, 0.7126606009728664, 1, 0.000973403656378926],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009729594179308331],
[286.2741748896937, 709.3418434117369, 1, 0, 0.2875347218479785, 0.00349315477159376, 0, -0.02215743825654521, 1, 0.2875347218479785, 0.0009735417515143587],
[286.2357180700951, 709.4575294414144, 0, 1, 0.2874737965588005, 0, 0.001409527644011815, 0.008940778117551307, 0.7125262034411995, 1, 0.0009725667583538542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.8569731441835, 709.6502838283108, 0, 0, 0.2871470510556827, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003671470963080281],
[286.0500695266626, 709.5115681102998, 0, 1, 0.2873253234281136, 0, 0.001409420289881082, 0.008940097159311882, 0.7126746765718864, 1, 0.0006054779279063433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 0, 0.2875035763260283, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000367147096028271],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0006054779279063433],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 0, 0.2875035763260283, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003671618839945918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 1, 0, 0.2875035763260283, 0.003493533188203404, 0, -0.02215983859183284, 1, 0.2875035763260283, 0.0006054653819994106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.01915975467, 709.5968585467605, 0, 0, 0.2872785838084773, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003671766704203998],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0006054528360924898],
[285.0562535491171, 707.5783168196767, 0, 1, 0.2871713942455278, 0, 0.001413271119576783, 0.008964523366221697, 0.7128286057544722, 1, 0.0009749208051139952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009730715690013571],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.000972829955584701],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2580686002973, 709.6140438710557, 0.5, 2.5, 0.2874446076112325, 0.001746675656846378, 0.003523041886772855, 0.01126767281561072, 0.5807080580530769, 0.6382105544392223, 0.002931403358609093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.542432230027, 709.3510175074255, 0, 1, 0.2877239852371438, 0, 0.001409739290307752, 0.0089421206116694, 0.7122760147628562, 1, 0.0009723258653139309],
[286.181147948038, 709.7123017894145, 0, 1, 0.2873612112053593, 0, 0.001409021652123933, 0.008937568559215891, 0.7126387887946407, 1, 0.0009722168763620531],
[286.181147948038, 709.7123017894145, 0, 1, 0.2873612112053593, 0, 0.001409021652123933, 0.008937568559215891, 0.7126387887946407, 1, 0.0009719181577099446],
[286.181147948038, 709.7123017894145, 0, 1, 0.2873612112053593, 0, 0.001409021652123933, 0.008937568559215891, 0.7126387887946407, 1, 0.000972066968622805],
[286.2121569285898, 709.5425770908516, 1, 0, 0.2874323838494567, 0.003493911686810357, 0, -0.02216223944723781, 1, 0.2874323838494568, 0.0009725168070547008],
[285.9881507741181, 709.7665832453234, 1, 0, 0.287207422674964, 0.003496648365651448, 0, -0.02217959848123841, 1, 0.287207422674964, 0.0009732236197669532],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.1311628319059, 709.4848554695246, 1, 0, 0.2873910800672528, 0.003494900695550845, 0, -0.02216851283090827, 1, 0.2873910800672528, 0.0009730600232252916],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.1370976636996, 707.5159988943702, 1, 1, 0.2872474771422014, 0.003507084866170006, 0.001413395600329452, -0.01328048531187401, 0.9174888868754404, 0.4919838411598434, 0.001948481703261897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[284.8536972343326, 707.8889556577274, 0, 1, 0.2869360920521509, 0, 0.001412650941941679, 0.008960589516004223, 0.7130639079478491, 1, 0.0009745814722034507],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.8978054720223, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2871566951682616, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7128433048317384, 1, 0.000973778585162845],
[286.0909018545014, 709.7182128294082, 0, 1, 0.2872949219241808, 0, 0.001409009916785615, 0.008937494120763776, 0.7127050780758193, 1, 0.0009734486014491525],
[286.2431659091417, 709.3728523922888, 0, 1, 0.2875035763260283, 0, 0.001409695897760395, 0.00894184536830009, 0.7124964236739717, 1, 0.0009727675756424814],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.745541417382, 710.0635732665277, 0, 1, 0.286948108029804, 0, 0.00140832460310514, 0.008933147105943541, 0.713051891970196, 1, 0.0009817932068265894]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6138072350417612, 2.385856741053128, 0, 1, 0.2046253313482285, 0, 0.4191366492351069, 2.658626666646354, 0.7953746686517715, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6140449654043418, 2.385477623090869, 0, 1, 0.2047142327780881, 0, 0.4192032615691854, 2.659049195499491, 0.7952857672219119, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9964238764071368, 2.003576123592862, 0, 2, 0.3321412921357124, 0, 0.998215129662032, 6.331780739318458, 0.4460352536701558, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.6286569529442771, 2.217361203957365, 0, 1, 0.2208900007962962, 0, 0.4509865141571349, 2.860653619825746, 0.7791099992037038, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.641379060085547, 0, 0, 0.3785901141987597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8357392173170726, 2.164260782682925, 1, 0, 0.2785797391056911, 1.196545500413687, 0, -7.5898105810144, 1, 0.278579739105691, 0.1576515629265896],
[0.614498496824667, 2.385501503175331, 1, 0, 0.2048328322748891, 1.627343281012658, 0, -10.32240499747173, 1, 0.2048328322748891, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.641379060085547, 0, 0, 0.3785901141987597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6286395411533828, 1.537111451865965, 0, 1, 0.2902639976523685, 0, 0.6505709125945665, 4.126637887488021, 0.7097360023476316, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.000939612814434, 1.997868800400181, 0, 1, 0.3337791131983197, 0, 0.5005333682570628, 3.174934386728129, 0.6662208868016803, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9866148702906361, 2.013385129709361, 0, 0, 0.3288716234302124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7234242339732183, 2.276575766026779, 0, 1, 0.2411414113244063, 0, 0.4392561912161886, 2.786246980759259, 0.7588585886755936, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 1, 0.27927112983782, 0, 0.4624947704097468, 2.933651667158589, 0.7207288701621799, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 1.999999999999999, 0, 0, 0.295232023574708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9936050708386183, 2.006394929161381, 1, 1, 0.3312016902795396, 1.006436087484924, 0.4984063633065367, -3.222484539623317, 0.8903054403559758, 0.5527088209150551, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.38500115885157, 0, 1, 0.2046837124678245, 0, 0.4192870080119884, 2.65958040775802, 0.7953162875321755, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.241759528741113, 1.649432848787618, 0.25, 0.5, 0.4294973722234688, 0.2013272249687894, 0.3031344988475977, 0.6457739586521879, 0.7709581862482765, 0.3435627206275853, 0.1576515629265896],
[0.6144978132329183, 2.38550218676708, 1, 0, 0.2048326044109729, 1.627345091333891, 0, -10.32241648052461, 1, 0.204832604410973, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6151900322695552, 2.384809967730443, 1, 0, 0.2050633440898519, 1.625513983558554, 0, -10.31080157648341, 1, 0.2050633440898518, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9969145921705432, 2.002608652068862, 0, 2, 0.3323576818699843, 0, 0.9986973730158576, 6.334839658271581, 0.4457462649580211, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6286569521990459, 2.013828640532211, 0, 1, 0.237903644178158, 0, 0.4965665796349594, 3.149772640479216, 0.762096355821842, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 1.742594173729781, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6288943617597166, 2.216647218082354, 1, 0, 0.2210104277564696, 1.59009216937784, 0, -10.08611738355088, 1, 0.2210104277564696, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.002585316671453, 1.995913081286937, 1, 2, 0.334362465344017, 0.9974213499554972, 1.002047643633072, 0.02934505431912075, 0.7393675077937339, 0.7050737625825245, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.012676146950438, 0, 0, 0.2380207076809139, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.000748270293275, 1.998916144280251, 0, 1, 0.3336200761095989, 0, 0.5002711108524615, 3.173270861167501, 0.6663799238904011, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6141711948899137, 2.385828805110084, 1, 0, 0.2047237316299713, 1.628210519021889, 0, -10.32790597693005, 1, 0.2047237316299714, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.242510148176869, 1.648728522886892, 0, 0, 0.4297501138913993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988080402171789, 2.00119195978282, 0, 1, 0.3329360134057264, 0, 0.4997021875445298, 3.169662122393395, 0.6670639865942736, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221742813524, 2.162877825718645, 1, 0, 0.2790407247604511, 1.194568762747772, 0, -7.577271931671382, 1, 0.2790407247604511, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.9866148702906361, 2.013385129709361, 0, 0, 0.3288716234302124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 1.742594173729781, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221534304744, 2.000041288205897, 1, 1, 0.2950560200887309, 1.194568792501862, 0.4999896781616108, -4.405786415601103, 0.9129419450093986, 0.5030539851868602, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.845541579842071, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2971460989471815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001178172856, 0, 1, 0.2046837111490498, 0, 0.4192870046152756, 2.659580386212324, 0.7953162888509502, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.837122143005575, 2.162877856994422, 1, 0, 0.279040714335192, 1.194568807378137, 0, -7.577272214766356, 1, 0.279040714335192, 0.1576515629265896],
[0.3161251799469947, 2.683874820053002, 0, 2, 0.1053750599823317, 0, 0.7451912380773792, 4.726824296847455, 0.8003537833016167, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.21620896299927, 0, 1, 0.2209920519539539, 0, 0.4512209889480217, 2.862140917423905, 0.7790079480460461, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988072343766413, 2.001192765623358, 0, 1, 0.3329357447922139, 0, 0.4997019863243943, 3.16966084603348, 0.6670642552077861, 1, 0.1576515629265896],
[0.6909836019080809, 1.95150235911318, 1, 1, 0.2614899803066622, 1.447212346629648, 0.5124257192568443, -5.929447257101322, 0.9316229901992215, 0.4546029508125458, 0.1576515629265896],
[0.9957671980910394, 2.003755957949568, 2, 3, 0.3319751661478951, 2.0085015893616, 1.497188311829093, -3.243312454635167, 0.792131448838806, 0.5364091292225964, 0.1576515629265896],
[0.7234242017386256, 2.276575798261371, 0, 1, 0.2411414005795421, 0, 0.439256184996653, 2.786246941308108, 0.758858599420458, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6141432098216471, 2.385856790178351, 0, 1, 0.2047144032738825, 0, 0.4191366406050074, 2.65862661190475, 0.7952855967261175, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.845541579842071, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2971460989471815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988081620884003, 2.001191837911599, 0, 1, 0.3329360540294669, 0, 0.4997022179760531, 3.169662315423662, 0.6670639459705332, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.997614119536114, 2.002385880463885, 0, 3, 0.3325380398453714, 0, 1.498212721768194, 9.503316643082293, 0.2973579531000594, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.000349104010391, 1.999352367898328, 0, 0.75, 0.3334828860066085, 0, 0.3751214703531136, 2.379433881843523, 0.7376638125561312, 1, 0.1576515629265896],
[0.837122143005547, 2.16287785699445, 1, 0, 0.2790407143351826, 1.194568807378177, 0, -7.577272214766609, 1, 0.2790407143351826, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8450637546442117, 2.000477825197859, 0, 1, 0.2969781782950131, 0, 0.4998805722333335, 3.170793634732963, 0.7030218217049868, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -12.68620470912363, 1, 0.1111111111111109, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.7234243936432311, 2.276575606356766, 0, 1, 0.2411414645477439, 0, 0.4392562220238813, 2.786247176175607, 0.7588585354522561, 1, 0.1576515629265896],
[0.9978686443212498, 2.002131355678749, 1, 1, 0.3326228814404167, 1.00213590805852, 0.4994677283104568, -3.188475714523239, 0.8893620187422744, 0.554607781623108, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385856746411606, 0, 1, 0.2046253309826941, 0, 0.4191366482937533, 2.658626660675252, 0.7953746690173059, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.303587926841033, 1.311411617366458, 0, 1, 0.4985040742085874, 0, 0.7625370911447114, 4.836850818280733, 0.5014959257914127, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.999045443747241, 1.642333616338306, 0, 1, 0.3782287286380187, 0, 0.608889686024675, 3.862249601091517, 0.6217712713619814, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9990440383206143, 1.642335021764933, 0, 1, 0.3782281965573915, 0, 0.6088891649679075, 3.862246295975109, 0.6217718034426085, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.951288320677765, 0, 1, 0.2614377253371646, 0, 0.51248192765929, 3.250725322006018, 0.7385622746628354, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -3.171551177280907, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1576515629265896],
[0.998806635065426, 2.000002135876824, 0, 2, 0.3330677983683477, 0, 0.9999989320627284, 6.343095580526389, 0.444798561573243, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 1.533483697351429, 0, 0, 0.2907718094663613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8368615282573423, 2.163138471742655, 1, 0, 0.2789538427524477, 1.194940819041321, 0, -7.579631922823021, 1, 0.2789538427524477, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.384999620916279, 0, 1, 0.204683817439675, 0, 0.41928727838364, 2.65958212275308, 0.795316182560325, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981170073439, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2350348286770703, 1.627344286863045, 0, -10.32241137768369, 1, 0.2350348286770704, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.216838666706962, 0, 0, 0.2209431475501414, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001069019755, 0, 1, 0.2046837185992966, 0, 0.4192870238045654, 2.659580507931953, 0.7953162814007034, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 1.999999999999999, 0, 0, 0.295232023574708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 1.533483697351429, 0, 0, 0.2907718094663613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6176537446443663, 2.401146178440654, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.156669769719763],
[0.8508402853974776, 2.012533282056681, 0, 0, 0.2971460989471815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.156669769719763],
[0.6176537446443663, 2.401146178440654, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.156669769719763],
[1.301429095629965, 1.313580669301519, 0, 1, 0.4976765720276627, 0, 0.7612779506961977, 4.828863961537042, 0.5023234279723373, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981857778529, 2.385501814222145, 1, 0, 0.2048327285926178, 1.627344104741604, 0, -10.32241022246875, 1, 0.2048327285926177, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 2, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 1, -6.343102354561814, 0.8888888888888891, 0.4074074074074072, 0.1576515629265896],
[0.7835236187382981, 2.216476381261698, 0, 0, 0.261174539579433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.473575711084998, 0, 1, 0.319143355362046, 0, 0.6786213918141315, 4.304564948272231, 0.680856644637954, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7234247109231837, 2.276575289076814, 0, 1, 0.2411415703077281, 0, 0.4392562832417967, 2.78624756448711, 0.7588584296922719, 1, 0.1576515629265896],
[0.6156890865983772, 2.384310913401621, 1, 1, 0.2052296955327925, 1.624196403293265, 0.419408389392192, -7.642093687723746, 0.9578807720715172, 0.3683401631371024, 0.1576515629265896],
[0.8357392343869816, 2.164260765613016, 1, 0, 0.2785797447956608, 1.196545475974338, 0, -7.589810425993108, 1, 0.2785797447956608, 0.1576515629265896],
[1.304336825689028, 1.310326098262276, 1, 0, 0.4988546759663773, 0.7666731325106461, 0, -4.863086152007559, 1, 0.4988546759663773, 0.1576515629265896],
[0.6909979777327829, 1.955142946402162, 0.5, 2.5, 0.2611342319036461, 0.723591119094933, 1.278678883608219, 3.520978506072677, 0.6172021657171296, 0.5966364616404136, 0.1576515629265896],
[1.302615701997603, 1.319746504690273, 2, 0, 0.4967337077523118, 1.535372249031649, 0, -9.739023327961515, 1, 0.246744376417359, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6156892719821555, 2.383119498960094, 1, 3, 0.2053112815822201, 1.624195914248418, 1.258854204041841, -2.317399862230979, 0.8109885455016734, 0.6011696580454604, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8383136147878696, 2.161686385212128, 0, 1, 0.2794378715959568, 0, 0.4626017940626801, 2.934330529143504, 0.7205621284040432, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6916747917965406, 1.949704268289006, 0, 1, 0.2618612384146558, 0, 0.512898297585185, 3.253366399063331, 0.7381387615853443, 1, 0.1576515629265896],
[1.147196535676257, 1.850218099589744, 0, 1, 0.3827286762995507, 0, 0.54047682282523, 3.428299807448803, 0.6172713237004492, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981277101429, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2350348318085579, 1.627344258519364, 0, -10.32241119789682, 1, 0.235034831808558, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221534304744, 2.162376540235745, 1, 1, 0.2790873538962202, 1.194568792501862, 0.4624541477364431, -4.64387812702071, 0.9221102488952059, 0.4802849566876464, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001054959163, 0, 1, 0.2046837195590026, 0, 0.4192870262764402, 2.659580523611307, 0.7953162804409974, 1, 0.1576515629265896],
[0.9858000295332381, 2.014199970466759, 1, 0, 0.3286000098444131, 1.014404514142169, 0, -6.43447166213332, 1, 0.3286000098444131, 0.1576515629265896],
[0.9991438629486088, 2.00085613705139, 0, 2, 0.3330479543162031, 0, 0.9995721146385609, 6.340388233918183, 0.4448250312418016, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.641379060085547, 0, 0, 0.3785901141987597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.629354560709304, 1.535442914007281, 0, 1, 0.290722142860823, 0, 0.6512778761602711, 4.131122229746231, 0.709277857139177, 1, 0.1576515629265896],
[1.304336806663265, 1.310326202397976, 1, 0, 0.4988546524515866, 0.7666731436937557, 0, -4.863086222943167, 1, 0.4988546524515867, 0.1576515629265896],
[0.9964258308064623, 2.002567595724005, 0, 1, 0.3322534227623254, 0, 0.4993589240808932, 3.167484767108966, 0.6677465772376745, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981277101141, 2.385501872289884, 1, 0, 0.2048327092367048, 1.62734425851944, 0, -10.3224111978973, 1, 0.2048327092367048, 0.1576515629265896],
[1.836167782815257, 1.162640507185666, 1, 0, 0.6122991552803437, 0.5446125399644991, 0, -3.454533084572703, 1, 0.6122991552803437, 0.1576515629265896],
[1.832138919469622, 1.167861080530375, 0, 1, 0.6107129731565413, 0, 0.8562662260701914, 5.431384314717587, 0.3892870268434587, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.642485273886092, 1, 0, 0.3784316264246876, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3784316264246876, 0.1576515629265896],
[1.837813389513459, 1.162186610486538, 0, 0, 0.6126044631711536, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9983590067550439, 2.001178849408273, 0, 1, 0.3328376085348149, 0, 0.4997054612563437, 3.169682887882509, 0.6671623914651851, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6288942997918877, 2.216647280050183, 1, 0, 0.2210104059793045, 1.590092326056887, 0, -10.08611837738211, 1, 0.2210104059793045, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.951288320677765, 0, 1, 0.2614377253371646, 0, 0.51248192765929, 3.250725322006018, 0.7385622746628354, 1, 0.1576515629265896],
[1.00093997916273, 1.836181976256109, 0, 1, 0.352801181934022, 0, 0.544608330182477, 3.454506381494446, 0.647198818065978, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001158851567, 0, 1, 0.2046837124678247, 0, 0.4192870080119889, 2.659580407758024, 0.7953162875321753, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.343102354561814, 0.4444444444444445, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.161686188315649, 0, 1, 0.2793177220981067, 0, 0.4626018361986131, 2.934330796416039, 0.7206822779018933, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9991438500382342, 2.000856149961765, 0, 1, 0.3330479500127449, 0, 0.4997860540944483, 3.170194096503652, 0.6669520499872551, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221847073312, 2.16241873969858, 1, 1, 0.2790834350336899, 1.194568747869958, 0.4624451229734488, -4.643935088911373, 0.922112436289796, 0.4802793063571761, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.997866785513658, 2.00213321448634, 0, 1, 0.3326222618378862, 0, 0.4994672645978535, 3.168171982097192, 0.6673777381621138, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.6903379756003104, 1.471848634886227, 1, 0, 0.3192777035303951, 1.448565826225062, 0, -9.188401303065962, 1, 0.3192777035303951, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.837854656086481, 1, 0, 0.352378864032114, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.352378864032114, 0.1576515629265896],
[0.9988079486234765, 2.001192051376522, 0, 1, 0.3329359828744923, 0, 0.499702164673375, 3.169661977319318, 0.6670640171255077, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.216838666706962, 0, 0, 0.2209431475501414, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988083938933333, 2.001191606106665, 0, 1, 0.3329361312977779, 0, 0.4997022758582864, 3.169662682576592, 0.6670638687022221, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304336809618485, 1.310326186222861, 1, 0, 0.4988546561040749, 0.7666731419567137, 0, -4.863086211924932, 1, 0.498854656104075, 0.1576515629265896],
[0.9988082720281143, 2.001191727971884, 0, 1, 0.3329360906760382, 0, 0.4997022454282548, 3.169662489555787, 0.6670639093239618, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9994033602311921, 2.000596639768806, 0, 0.75, 0.3331344534103976, 0, 0.3748881634064285, 2.377953992000669, 0.7379530129232691, 1, 0.1576515629265896],
[0.9985363028896913, 2.001463697110307, 1, 1, 0.332845434296564, 1.001465842659974, 0.4996343433277305, -3.183168565007639, 0.8892139168679316, 0.5549047854610597, 0.1576515629265896],
[0.6288484557236812, 2.217169558104215, 1, 1, 0.2209572998724205, 1.590208246355946, 0.4510254961533242, -7.225952785086451, 0.9511778716330893, 0.3930924713779302, 0.1576515629265896],
[0.9988081620884003, 2.001191837911598, 0, 1, 0.3329360540294669, 0, 0.4997022179760532, 3.169662315423662, 0.6670639459705331, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.003742964502042, 1.994578384948841, 2, 1, 0.3347683078352722, 1.992541986077284, 0.5013590879887376, -9.458725751947764, 0.9624825760223317, 0.2611746118373384, 0.1576515629265896],
[0.9991438917748136, 2.000856108225185, 0, 1, 0.333047963924938, 0, 0.499786064519666, 3.170194162631874, 0.666952036075062, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9978685800276766, 2.002131419972322, 0, 1, 0.3326228600092257, 0, 0.4994677122712675, 3.168174821735477, 0.6673771399907743, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.837854672973578, 1, 0, 0.3523788619352287, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3523788619352286, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.002228243384259068, 2.997771756615739, 0, 1, 0.0007427477947530232, 0, 0.3335810999596999, 2.115939060591691, 0.999257252205247, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 1.742594173729781, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -3.171551177280907, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.383808412404609, 0, 1, 0.2047651557879529, 0, 0.4194967996573493, 2.660911137637676, 0.7952348442120472, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6914835296050114, 1.949895530480535, 1, 1, 0.2617888284397228, 1.446166043276865, 0.5128479881963516, -5.920131952736252, 0.9314666093041576, 0.4550442661836028, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371220700413003, 2.000041266573021, 1, 1, 0.2950560016189498, 1.194568911497775, 0.4999896835696066, -4.405787136100887, 0.9129419559086382, 0.5030539591465379, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999499541180569, 0, 1, 0.3333889491466337, 0, 0.5001251460200725, 3.172344991295491, 0.6666110508533662, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896]
],
"RESOLVED": [
[0.6138072350417612, 2.385856741053128, 0, 1, 0.2046253313482285, 0, 0.4191366492351069, 2.658626666646354, 0.7953746686517715, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6140449654043418, 2.385477623090869, 0, 1, 0.2047142327780881, 0, 0.4192032615691854, 2.659049195499491, 0.7952857672219119, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9964238764071368, 2.003576123592862, 0, 2, 0.3321412921357124, 0, 0.998215129662032, 6.331780739318458, 0.4460352536701558, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.6286569529442771, 2.217361203957365, 0, 1, 0.2208900007962962, 0, 0.4509865141571349, 2.860653619825746, 0.7791099992037038, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.641379060085547, 0, 0, 0.3785901141987597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8357392173170726, 2.164260782682925, 1, 0, 0.2785797391056911, 1.196545500413687, 0, -7.5898105810144, 1, 0.278579739105691, 0.1576515629265896],
[0.614498496824667, 2.385501503175331, 1, 0, 0.2048328322748891, 1.627343281012658, 0, -10.32240499747173, 1, 0.2048328322748891, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.641379060085547, 0, 0, 0.3785901141987597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6286395411533828, 1.537111451865965, 0, 1, 0.2902639976523685, 0, 0.6505709125945665, 4.126637887488021, 0.7097360023476316, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.000939612814434, 1.997868800400181, 0, 1, 0.3337791131983197, 0, 0.5005333682570628, 3.174934386728129, 0.6662208868016803, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9866148702906361, 2.013385129709361, 0, 0, 0.3288716234302124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7234242339732183, 2.276575766026779, 0, 1, 0.2411414113244063, 0, 0.4392561912161886, 2.786246980759259, 0.7588585886755936, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 1, 0.27927112983782, 0, 0.4624947704097468, 2.933651667158589, 0.7207288701621799, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 1.999999999999999, 0, 0, 0.295232023574708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9936050708386183, 2.006394929161381, 1, 1, 0.3312016902795396, 1.006436087484924, 0.4984063633065367, -3.222484539623317, 0.8903054403559758, 0.5527088209150551, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.38500115885157, 0, 1, 0.2046837124678245, 0, 0.4192870080119884, 2.65958040775802, 0.7953162875321755, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.242510148176869, 1.648728522886892, 0, 0, 0.4297501138913993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144978132329183, 2.38550218676708, 1, 0, 0.2048326044109729, 1.627345091333891, 0, -10.32241648052461, 1, 0.204832604410973, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6151900322695552, 2.384809967730443, 1, 0, 0.2050633440898519, 1.625513983558554, 0, -10.31080157648341, 1, 0.2050633440898518, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9969145921705432, 2.002608652068862, 0, 2, 0.3323576818699843, 0, 0.9986973730158576, 6.334839658271581, 0.4457462649580211, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6286569521990459, 2.013828640532211, 0, 1, 0.237903644178158, 0, 0.4965665796349594, 3.149772640479216, 0.762096355821842, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 1.742594173729781, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6288943617597166, 2.216647218082354, 1, 0, 0.2210104277564696, 1.59009216937784, 0, -10.08611738355088, 1, 0.2210104277564696, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.002585316671453, 1.995913081286937, 1, 2, 0.334362465344017, 0.9974213499554972, 1.002047643633072, 0.02934505431912075, 0.7393675077937339, 0.7050737625825245, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.012676146950438, 0, 0, 0.2380207076809139, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.000748270293275, 1.998916144280251, 0, 1, 0.3336200761095989, 0, 0.5002711108524615, 3.173270861167501, 0.6663799238904011, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6141711948899137, 2.385828805110084, 1, 0, 0.2047237316299713, 1.628210519021889, 0, -10.32790597693005, 1, 0.2047237316299714, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.242510148176869, 1.648728522886892, 0, 0, 0.4297501138913993, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988080402171789, 2.00119195978282, 0, 1, 0.3329360134057264, 0, 0.4997021875445298, 3.169662122393395, 0.6670639865942736, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221742813524, 2.162877825718645, 1, 0, 0.2790407247604511, 1.194568762747772, 0, -7.577271931671382, 1, 0.2790407247604511, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.9866148702906361, 2.013385129709361, 0, 0, 0.3288716234302124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 1.742594173729781, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221534304744, 2.000041288205897, 1, 1, 0.2950560200887309, 1.194568792501862, 0.4999896781616108, -4.405786415601103, 0.9129419450093986, 0.5030539851868602, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.845541579842071, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2971460989471815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001178172856, 0, 1, 0.2046837111490498, 0, 0.4192870046152756, 2.659580386212324, 0.7953162888509502, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.837122143005575, 2.162877856994422, 1, 0, 0.279040714335192, 1.194568807378137, 0, -7.577272214766356, 1, 0.279040714335192, 0.1576515629265896],
[0.3161251799469947, 2.683874820053002, 0, 2, 0.1053750599823317, 0, 0.7451912380773792, 4.726824296847455, 0.8003537833016167, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.21620896299927, 0, 1, 0.2209920519539539, 0, 0.4512209889480217, 2.862140917423905, 0.7790079480460461, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988072343766413, 2.001192765623358, 0, 1, 0.3329357447922139, 0, 0.4997019863243943, 3.16966084603348, 0.6670642552077861, 1, 0.1576515629265896],
[0.6909836019080809, 1.95150235911318, 1, 1, 0.2614899803066622, 1.447212346629648, 0.5124257192568443, -5.929447257101322, 0.9316229901992215, 0.4546029508125458, 0.1576515629265896],
[0.9957671980910394, 2.003755957949568, 2, 3, 0.3319751661478951, 2.0085015893616, 1.497188311829093, -3.243312454635167, 0.792131448838806, 0.5364091292225964, 0.1576515629265896],
[0.7234242017386256, 2.276575798261371, 0, 1, 0.2411414005795421, 0, 0.439256184996653, 2.786246941308108, 0.758858599420458, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6141432098216471, 2.385856790178351, 0, 1, 0.2047144032738825, 0, 0.4191366406050074, 2.65862661190475, 0.7952855967261175, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.845541579842071, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2971460989471815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988081620884003, 2.001191837911599, 0, 1, 0.3329360540294669, 0, 0.4997022179760531, 3.169662315423662, 0.6670639459705332, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.997614119536114, 2.002385880463885, 0, 3, 0.3325380398453714, 0, 1.498212721768194, 9.503316643082293, 0.2973579531000594, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.837122143005547, 2.16287785699445, 1, 0, 0.2790407143351826, 1.194568807378177, 0, -7.577272214766609, 1, 0.2790407143351826, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8450637546442117, 2.000477825197859, 0, 1, 0.2969781782950131, 0, 0.4998805722333335, 3.170793634732963, 0.7030218217049868, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -12.68620470912363, 1, 0.1111111111111109, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.7234243936432311, 2.276575606356766, 0, 1, 0.2411414645477439, 0, 0.4392562220238813, 2.786247176175607, 0.7588585354522561, 1, 0.1576515629265896],
[0.9978686443212498, 2.002131355678749, 1, 1, 0.3326228814404167, 1.00213590805852, 0.4994677283104568, -3.188475714523239, 0.8893620187422744, 0.554607781623108, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385856746411606, 0, 1, 0.2046253309826941, 0, 0.4191366482937533, 2.658626660675252, 0.7953746690173059, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.303587926841033, 1.311411617366458, 0, 1, 0.4985040742085874, 0, 0.7625370911447114, 4.836850818280733, 0.5014959257914127, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.999045443747241, 1.642333616338306, 0, 1, 0.3782287286380187, 0, 0.608889686024675, 3.862249601091517, 0.6217712713619814, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9990440383206143, 1.642335021764933, 0, 1, 0.3782281965573915, 0, 0.6088891649679075, 3.862246295975109, 0.6217718034426085, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.951288320677765, 0, 1, 0.2614377253371646, 0, 0.51248192765929, 3.250725322006018, 0.7385622746628354, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -3.171551177280907, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1576515629265896],
[0.998806635065426, 2.000002135876824, 0, 2, 0.3330677983683477, 0, 0.9999989320627284, 6.343095580526389, 0.444798561573243, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 1.533483697351429, 0, 0, 0.2907718094663613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8368615282573423, 2.163138471742655, 1, 0, 0.2789538427524477, 1.194940819041321, 0, -7.579631922823021, 1, 0.2789538427524477, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.384999620916279, 0, 1, 0.204683817439675, 0, 0.41928727838364, 2.65958212275308, 0.795316182560325, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981170073439, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2350348286770703, 1.627344286863045, 0, -10.32241137768369, 1, 0.2350348286770704, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.216838666706962, 0, 0, 0.2209431475501414, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001069019755, 0, 1, 0.2046837185992966, 0, 0.4192870238045654, 2.659580507931953, 0.7953162814007034, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3333333333333333, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 1.999999999999999, 0, 0, 0.295232023574708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 1.533483697351429, 0, 0, 0.2907718094663613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6176537446443663, 2.401146178440654, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.156669769719763],
[0.8508402853974776, 2.012533282056681, 0, 0, 0.2971460989471815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.156669769719763],
[0.6176537446443663, 2.401146178440654, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.156669769719763],
[1.301429095629965, 1.313580669301519, 0, 1, 0.4976765720276627, 0, 0.7612779506961977, 4.828863961537042, 0.5023234279723373, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981857778529, 2.385501814222145, 1, 0, 0.2048327285926178, 1.627344104741604, 0, -10.32241022246875, 1, 0.2048327285926177, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 2, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 1, -6.343102354561814, 0.8888888888888891, 0.4074074074074072, 0.1576515629265896],
[0.7835236187382981, 2.216476381261698, 0, 0, 0.261174539579433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.473575711084998, 0, 1, 0.319143355362046, 0, 0.6786213918141315, 4.304564948272231, 0.680856644637954, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7234247109231837, 2.276575289076814, 0, 1, 0.2411415703077281, 0, 0.4392562832417967, 2.78624756448711, 0.7588584296922719, 1, 0.1576515629265896],
[0.6156890865983772, 2.384310913401621, 1, 1, 0.2052296955327925, 1.624196403293265, 0.419408389392192, -7.642093687723746, 0.9578807720715172, 0.3683401631371024, 0.1576515629265896],
[0.8357392343869816, 2.164260765613016, 1, 0, 0.2785797447956608, 1.196545475974338, 0, -7.589810425993108, 1, 0.2785797447956608, 0.1576515629265896],
[1.304336825689028, 1.310326098262276, 1, 0, 0.4988546759663773, 0.7666731325106461, 0, -4.863086152007559, 1, 0.4988546759663773, 0.1576515629265896],
[0.6909979777327829, 1.955142946402162, 0.5, 2.5, 0.2611342319036461, 0.723591119094933, 1.278678883608219, 3.520978506072677, 0.6172021657171296, 0.5966364616404136, 0.1576515629265896],
[1.302615701997603, 1.319746504690273, 2, 0, 0.4967337077523118, 1.535372249031649, 0, -9.739023327961515, 1, 0.246744376417359, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6156892719821555, 2.383119498960094, 1, 3, 0.2053112815822201, 1.624195914248418, 1.258854204041841, -2.317399862230979, 0.8109885455016734, 0.6011696580454604, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8383136147878696, 2.161686385212128, 0, 1, 0.2794378715959568, 0, 0.4626017940626801, 2.934330529143504, 0.7205621284040432, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6916747917965406, 1.949704268289006, 0, 1, 0.2618612384146558, 0, 0.512898297585185, 3.253366399063331, 0.7381387615853443, 1, 0.1576515629265896],
[1.147196535676257, 1.850218099589744, 0, 1, 0.3827286762995507, 0, 0.54047682282523, 3.428299807448803, 0.6172713237004492, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981277101429, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2350348318085579, 1.627344258519364, 0, -10.32241119789682, 1, 0.235034831808558, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221534304744, 2.162376540235745, 1, 1, 0.2790873538962202, 1.194568792501862, 0.4624541477364431, -4.64387812702071, 0.9221102488952059, 0.4802849566876464, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001054959163, 0, 1, 0.2046837195590026, 0, 0.4192870262764402, 2.659580523611307, 0.7953162804409974, 1, 0.1576515629265896],
[0.9858000295332381, 2.014199970466759, 1, 0, 0.3286000098444131, 1.014404514142169, 0, -6.43447166213332, 1, 0.3286000098444131, 0.1576515629265896],
[0.9991438629486088, 2.00085613705139, 0, 2, 0.3330479543162031, 0, 0.9995721146385609, 6.340388233918183, 0.4448250312418016, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.641379060085547, 0, 0, 0.3785901141987597, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 1, 0.2046024116805872, 0, 0.4190776263700146, 2.658252278571815, 0.7953975883194128, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.629354560709304, 1.535442914007281, 0, 1, 0.290722142860823, 0, 0.6512778761602711, 4.131122229746231, 0.709277857139177, 1, 0.1576515629265896],
[1.304336806663265, 1.310326202397976, 1, 0, 0.4988546524515866, 0.7666731436937557, 0, -4.863086222943167, 1, 0.4988546524515867, 0.1576515629265896],
[0.9964258308064623, 2.002567595724005, 0, 1, 0.3322534227623254, 0, 0.4993589240808932, 3.167484767108966, 0.6677465772376745, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6144981277101141, 2.385501872289884, 1, 0, 0.2048327092367048, 1.62734425851944, 0, -10.3224111978973, 1, 0.2048327092367048, 0.1576515629265896],
[1.836167782815257, 1.162640507185666, 1, 0, 0.6122991552803437, 0.5446125399644991, 0, -3.454533084572703, 1, 0.6122991552803437, 0.1576515629265896],
[1.832138919469622, 1.167861080530375, 0, 1, 0.6107129731565413, 0, 0.8562662260701914, 5.431384314717587, 0.3892870268434587, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.642485273886092, 1, 0, 0.3784316264246876, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3784316264246876, 0.1576515629265896],
[1.837813389513459, 1.162186610486538, 0, 0, 0.6126044631711536, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9983590067550439, 2.001178849408273, 0, 1, 0.3328376085348149, 0, 0.4997054612563437, 3.169682887882509, 0.6671623914651851, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6288942997918877, 2.216647280050183, 1, 0, 0.2210104059793045, 1.590092326056887, 0, -10.08611837738211, 1, 0.2210104059793045, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.951288320677765, 0, 1, 0.2614377253371646, 0, 0.51248192765929, 3.250725322006018, 0.7385622746628354, 1, 0.1576515629265896],
[1.00093997916273, 1.836181976256109, 0, 1, 0.352801181934022, 0, 0.544608330182477, 3.454506381494446, 0.647198818065978, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.385001158851567, 0, 1, 0.2046837124678247, 0, 0.4192870080119889, 2.659580407758024, 0.7953162875321753, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.343102354561814, 0.4444444444444445, 1, 0.1576515629265896],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.161686188315649, 0, 1, 0.2793177220981067, 0, 0.4626018361986131, 2.934330796416039, 0.7206822779018933, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9991438500382342, 2.000856149961765, 0, 1, 0.3330479500127449, 0, 0.4997860540944483, 3.170194096503652, 0.6669520499872551, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371221847073312, 2.16241873969858, 1, 1, 0.2790834350336899, 1.194568747869958, 0.4624451229734488, -4.643935088911373, 0.922112436289796, 0.4802793063571761, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.997866785513658, 2.00213321448634, 0, 1, 0.3326222618378862, 0, 0.4994672645978535, 3.168171982097192, 0.6673777381621138, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.6903379756003104, 1.471848634886227, 1, 0, 0.3192777035303951, 1.448565826225062, 0, -9.188401303065962, 1, 0.3192777035303951, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.837854656086481, 1, 0, 0.352378864032114, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.352378864032114, 0.1576515629265896],
[0.9988079486234765, 2.001192051376522, 0, 1, 0.3329359828744923, 0, 0.499702164673375, 3.169661977319318, 0.6670640171255077, 1, 0.1576515629265896],
[0.6287029131351091, 2.216838666706962, 0, 0, 0.2209431475501414, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.171551177280907, 0.6666666666666667, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9988083938933333, 2.001191606106665, 0, 1, 0.3329361312977779, 0, 0.4997022758582864, 3.169662682576592, 0.6670638687022221, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.3092791257611172, 2.69072087423888, 0, 0, 0.1030930419203725, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304336809618485, 1.310326186222861, 1, 0, 0.4988546561040749, 0.7666731419567137, 0, -4.863086211924932, 1, 0.498854656104075, 0.1576515629265896],
[0.9988082720281143, 2.001191727971884, 0, 1, 0.3329360906760382, 0, 0.4997022454282548, 3.169662489555787, 0.6670639093239618, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9985363028896913, 2.001463697110307, 1, 1, 0.332845434296564, 1.001465842659974, 0.4996343433277305, -3.183168565007639, 0.8892139168679316, 0.5549047854610597, 0.1576515629265896],
[0.6288484557236812, 2.217169558104215, 1, 1, 0.2209572998724205, 1.590208246355946, 0.4510254961533242, -7.225952785086451, 0.9511778716330893, 0.3930924713779302, 0.1576515629265896],
[0.9988081620884003, 2.001191837911598, 0, 1, 0.3329360540294669, 0, 0.4997022179760532, 3.169662315423662, 0.6670639459705331, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.003742964502042, 1.994578384948841, 2, 1, 0.3347683078352722, 1.992541986077284, 0.5013590879887376, -9.458725751947764, 0.9624825760223317, 0.2611746118373384, 0.1576515629265896],
[0.9991438917748136, 2.000856108225185, 0, 1, 0.333047963924938, 0, 0.499786064519666, 3.170194162631874, 0.666952036075062, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8378133895134594, 2.162186610486538, 0, 0, 0.27927112983782, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2348326329550291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9978685800276766, 2.002131419972322, 0, 1, 0.3326228600092257, 0, 0.4994677122712675, 3.168174821735477, 0.6673771399907743, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.950658185846665, 0, 0, 0.2615000946575655, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.7225685639779976, 2.277431436022, 0, 0, 0.2408561879926661, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.837854672973578, 1, 0, 0.3523788619352287, 1, 0, -6.343102354561814, 1, 0.3523788619352286, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.002228243384259068, 2.997771756615739, 0, 1, 0.0007427477947530232, 0, 0.3335810999596999, 2.115939060591691, 0.999257252205247, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0, 1.742594173729781, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.277431436022, 0, 0, 0.2122990540991642, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -3.171551177280907, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.383808412404609, 0, 1, 0.2047651557879529, 0, 0.4194967996573493, 2.660911137637676, 0.7952348442120472, 1, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6914835296050114, 1.949895530480535, 1, 1, 0.2617888284397228, 1.446166043276865, 0.5128479881963516, -5.920131952736252, 0.9314666093041576, 0.4550442661836028, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6138072350417612, 2.386192764958237, 0, 0, 0.2046024116805872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.8371220700413003, 2.000041266573021, 1, 1, 0.2950560016189498, 1.194568911497775, 0.4999896835696066, -4.405787136100887, 0.9129419559086382, 0.5030539591465379, 0.1576515629265896],
[0.9999999999999997, 1.999499541180569, 0, 1, 0.3333889491466337, 0, 0.5001251460200725, 3.172344991295491, 0.6666110508533662, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 2.154820705603187, 0, 0, 0.2427379304987059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[1.304528109280643, 1.309279125761117, 0, 0, 0.4990911693072121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896],
[0.6907208742388817, 1.471465736247655, 0, 0, 0.3194547921483313, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1576515629265896]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node102":{
"Global MG94xREV":0.0009727675756424814,
"Nucleotide GTR":0.0009638632048132619,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node152":{
"Global MG94xREV":0.0009730715690013571,
"Nucleotide GTR":0.0009641644155242941,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.0006054528360924898,
"Nucleotide GTR":0.0005999107346623413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node159":{
"Global MG94xREV":0.0006054653819994106,
"Nucleotide GTR":0.0005999231657284614,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.0006054779279063433,
"Nucleotide GTR":0.0005999355967945919,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.0006054779279063433,
"Nucleotide GTR":0.0005999355967945919,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node171":{
"Global MG94xREV":0.0009734728672088001,
"Nucleotide GTR":0.000964562040389675,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.0009728422704329628,
"Nucleotide GTR":0.0009639372158740117,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node203":{
"Global MG94xREV":0.0006040295950030789,
"Nucleotide GTR":0.0005985005214192083,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node225":{
"Global MG94xREV":0.0004597180519530439,
"Nucleotide GTR":0.0004555099552668725,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.0009730767822020272,
"Nucleotide GTR":0.0009641695810051653,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node258":{
"Global MG94xREV":0.0009731925634921329,
"Nucleotide GTR":0.0009642843024742339,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node284":{
"Global MG94xREV":0.000973192568915006,
"Nucleotide GTR":0.0009642843078474666,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node329":{
"Global MG94xREV":0.000973016317119167,
"Nucleotide GTR":0.0009641096693983192,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.0009730163171572351,
"Nucleotide GTR":0.0009641096694360389,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node62":{
"Global MG94xREV":0.0009725168070547008,
"Nucleotide GTR":0.0009636147316725679,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node73":{
"Global MG94xREV":0.0009730600232252916,
"Nucleotide GTR":0.0009641529754341835,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745777014266944,
"Nucleotide GTR":0.0009656567613453392,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "Y", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TAC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731984003051936,
"Nucleotide GTR":0.0009642900858591682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "D", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAC", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724824714901102,
"Nucleotide GTR":0.0009635807104036088,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "D", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "GAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "ILVF", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "NTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973223612088759,
"Nucleotide GTR":0.0009643150668629717,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCA", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724819091448118,
"Nucleotide GTR":0.0009635801532058217,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAG", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731486713073214,
"Nucleotide GTR":0.0009642408120629794,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "E", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GAA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732234674901357,
"Nucleotide GTR":0.0009643149235879527,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "L", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CTC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009728745960795797,
"Nucleotide GTR":0.0009639692456230749,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "F", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "TTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00097285882141667,
"Nucleotide GTR":0.0009639536153558599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "S", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "TCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009731486713073214,
"Nucleotide GTR":0.0009642408120629794,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "N", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "AAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724824715282985,
"Nucleotide GTR":0.0009635807104414483,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCG", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724975359504073,
"Nucleotide GTR":0.0009635956369691572,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "E", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "GAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009741302274765034,
"Nucleotide GTR":0.0009652133834136509,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731633513925188,
"Nucleotide GTR":0.000964255357771861,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728588213750909,
"Nucleotide GTR":0.0009639536153146593,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973541752254596,
"Nucleotide GTR":0.0009646302948860891,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "I", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "ATA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724760396628939,
"Nucleotide GTR":0.000963574337451067,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAC", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009724760396628939,
"Nucleotide GTR":0.000963574337451067,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "L", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "CTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCN", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417236_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00097285882141667,
"Nucleotide GTR":0.0009639536153558599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "Y", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "TAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417240_England_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973778585162845,
"Nucleotide GTR":0.0009648649599095396,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "I", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ATA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCN", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417312_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724975359504073,
"Nucleotide GTR":0.0009635956369691572,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCG", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973223612088759,
"Nucleotide GTR":0.0009643150668629717,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "K", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "AAA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "NHDY", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "NAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724975359907416,
"Nucleotide GTR":0.0009635956370091212,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "G", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GGA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731938398224944,
"Nucleotide GTR":0.0009642855671215178,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCT", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732381320917625,
"Nucleotide GTR":0.000964329453954995,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009741302275899066,
"Nucleotide GTR":0.000965213383526016,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACT", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745622130790055,
"Nucleotide GTR":0.0009656414147725144,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "K", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAA", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "DAGV", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GNT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732381320917625,
"Nucleotide GTR":0.000964329453954995,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "KTRM", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ANG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418677_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "LF", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTN", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418715_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724975359100754,
"Nucleotide GTR":0.0009635956369291941,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "G", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GGT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009729479383447089,
"Nucleotide GTR":0.0009640419165390126,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972048337941382,
"Nucleotide GTR":0.0009631505507600599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAC", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCN", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001948481703261897,
"Nucleotide GTR":0.001930645989907314,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "DAGV", "F", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GNT", "TTC", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "ILVF", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "NTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "MLV", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "NTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "LF", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTN", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734486014491525,
"Nucleotide GTR":0.0009645379967502204,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "V", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "GTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACN", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719181577099446,
"Nucleotide GTR":0.0009630215621524858,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641376282,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797407135,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728745960405938,
"Nucleotide GTR":0.0009639692455844476,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "D", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAT", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009726663986851731,
"Nucleotide GTR":0.000963762953994087,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "I", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ATA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725577737542819,
"Nucleotide GTR":0.0009636553233774488,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTC", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179702103,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910840766,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009728745960821537,
"Nucleotide GTR":0.0009639692456256248,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "Y", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "TAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724760397032111,
"Nucleotide GTR":0.0009635743374910137,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAC", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009731633513925188,
"Nucleotide GTR":0.000964255357771861,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "K", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "AAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009731242207526221,
"Nucleotide GTR":0.000964216585320023,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "K", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AAA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "KN", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAN", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009723258653139309,
"Nucleotide GTR":0.0009634255377450573,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420696_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "QPRL", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CNA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420697_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724760397032111,
"Nucleotide GTR":0.0009635743374910137,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "T", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ACT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420725_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "SRGC", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "NGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420726_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009825739994325014,
"Nucleotide GTR":0.0009735798640633016,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAC", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009741457619035222,
"Nucleotide GTR":0.000965228775644011,
"amino-acid": [
["C", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729740916890622,
"Nucleotide GTR":0.0009640678304848866,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "L", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CTT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009728745960795797,
"Nucleotide GTR":0.0009639692456230749,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "L", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "TTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "NTSI", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ANT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735520944747737,
"Nucleotide GTR":0.0009646405424372374,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "K", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "AAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009722047930788148,
"Nucleotide GTR":0.0009633055737624217,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "A", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GCT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730215256179906,
"Nucleotide GTR":0.0009641148302203834,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAA", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730068529106785,
"Nucleotide GTR":0.0009641002918218517,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "I", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "ATT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973018109846054,
"Nucleotide GTR":0.0009641114457152175,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATT", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729740916496316,
"Nucleotide GTR":0.000964067830445818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641748778,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797776228,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "C", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TGC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728745960795797,
"Nucleotide GTR":0.0009639692456230749,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421669_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DAGV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GNT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972048337941382,
"Nucleotide GTR":0.0009631505507600599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "A", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GCT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00194668021130913,
"Nucleotide GTR":0.001928860988175637,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAG", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "KN", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAN", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "RS", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGN", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGN", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421895_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DAGV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GNT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421947_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGN", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421948_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "NHDY", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "NAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421953_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421954_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729300689736662,
"Nucleotide GTR":0.0009640242107378814,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421954_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "DAGV", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GNT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "KQE", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "NAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QH", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAN", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421964_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422002_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GNA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422002_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "KTRM", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "ANG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "TPAS", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "NCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "KN", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAN", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641376282,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797407135,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAG", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "LF", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTN", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726663981113158,
"Nucleotide GTR":0.000963762953425484,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "ED", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAN", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720333927047418,
"Nucleotide GTR":0.0009631357423268386,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTC", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGN", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009745621808395461,
"Nucleotide GTR":0.000965641382828164,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "T", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "ACT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009726575059957246,
"Nucleotide GTR":0.000963754142705177,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "V", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724760397010901,
"Nucleotide GTR":0.0009635743374889138,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAC", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009735417515143587,
"Nucleotide GTR":0.0009646302941526278,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAA", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003686959886940649,
"Nucleotide GTR":0.0003653210758281532,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730180972909551,
"Nucleotide GTR":0.000964111433275042,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "V", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "GTT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729300689736662,
"Nucleotide GTR":0.0009640242107378814,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAT", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009729300689736662,
"Nucleotide GTR":0.0009640242107378814,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "I", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ATA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009729300689736662,
"Nucleotide GTR":0.0009640242107378814,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "S", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972829955584701,
"Nucleotide GTR":0.0009639250137515201,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "V", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GTT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729428244921592,
"Nucleotide GTR":0.0009640368494968625,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTA", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009725667583538542,
"Nucleotide GTR":0.0009636642257351703,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "NTSI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ANT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423052_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "SL", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TNA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QPRL", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CNG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423068_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "TPAS", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "NCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423130_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423164_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "NTSI", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ANC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423164_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423173_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "KQE", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "NAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423173_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "ILVF", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "NTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423227_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009749208051139952,
"Nucleotide GTR":0.0009659967243826614,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "D", "Q", "ILV", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GAT", "CAA", "NTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423324_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "SRGC", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "NGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423328_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724975359886491,
"Nucleotide GTR":0.0009635956370070482,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTG", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423346_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009730638508421149,
"Nucleotide GTR":0.0009641567680143549,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423354_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423373_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "DAGV", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GNT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423373_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTN", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "NTSI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ANT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423446_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009738212716019967,
"Nucleotide GTR":0.0009649072556121029,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "N", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "AAT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423465_England_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423465_England_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTN", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423481_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009725636839671554,
"Nucleotide GTR":0.0009636611794903228,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "L", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "CTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "EAGV", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GNA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "KQE", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "NAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423639_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "NTSI", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "ANT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "KN", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAN", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009740033460603523,
"Nucleotide GTR":0.0009650876634251722,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "I", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423752_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "ED", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAN", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["RS", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGN", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423780_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "TPAS", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "NCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720846752783787,
"Nucleotide GTR":0.0009631865554779067,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACG", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002931403358609093,
"Nucleotide GTR":0.00290457032756585,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "I", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "ATT", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423927_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "KN", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAN", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423933_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GNA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424007_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009745814722034507,
"Nucleotide GTR":0.0009656604976057365,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "LF", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "E", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTN", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GAA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424062_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGN", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003671470963080281,
"Nucleotide GTR":0.0003637863614559861,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009730638508421149,
"Nucleotide GTR":0.0009641567680143549,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "F", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "TTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730767935773895,
"Nucleotide GTR":0.0009641695922764023,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAT", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009733365738684775,
"Nucleotide GTR":0.0009644269946304535,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009727364797917112,
"Nucleotide GTR":0.0009638323936029262,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACC", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729153937353005,
"Nucleotide GTR":0.0009640096698314651,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003671618839945918,
"Nucleotide GTR":0.0003638010137812899,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009722168763620531,
"Nucleotide GTR":0.0009633175464395509,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "P", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "CCA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24":{
"Global MG94xREV":0.0009735417529764768,
"Nucleotide GTR":0.0009646302956013626,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "N", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "AAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009724824715304239,
"Nucleotide GTR":0.0009635807104435535,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "A", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "GCG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009731633513520573,
"Nucleotide GTR":0.0009642553577317713,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "D", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GAT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731486713073214,
"Nucleotide GTR":0.0009642408120629794,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "N", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AAT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTN", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972977505853342,
"Nucleotide GTR":0.0009640712133971139,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "Q", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CAG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "NHDY", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "NAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425023_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728588214141434,
"Nucleotide GTR":0.0009639536153533552,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "Y", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "TAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724609748227747,
"Nucleotide GTR":0.0009635594105091753,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAC", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009729740916900349,
"Nucleotide GTR":0.0009640678304858523,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "I", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ATT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732236197669532,
"Nucleotide GTR":0.0009643150744708804,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425240_England_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641376282,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797407135,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425240_England_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425336_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728754334852241,
"Nucleotide GTR":0.0009639700753634043,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "V", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "GTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425336_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729955922286263,
"Nucleotide GTR":0.0009640891342161062,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTC", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425404_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641748778,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797776228,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCG", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425485_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425501_England_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009725667583538542,
"Nucleotide GTR":0.0009636642257351703,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "Y", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "TAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425501_England_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009731328655978737,
"Nucleotide GTR":0.0009642251510334138,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTT", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425549_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009727589339986435,
"Nucleotide GTR":0.0009638546422719783,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "C", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TGC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725577737542819,
"Nucleotide GTR":0.0009636553233774488,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTC", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725667583538542,
"Nucleotide GTR":0.0009636642257351703,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "N", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAT", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0009734036563734463,
"Nucleotide GTR":0.0009644934630858632,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179702103,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910840766,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009729740916890622,
"Nucleotide GTR":0.0009640678304848866,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009741302275899066,
"Nucleotide GTR":0.000965213383526016,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "Y", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "TAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641748778,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797776228,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGG", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720846752756594,
"Nucleotide GTR":0.0009631865554752145,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCG", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000973536351726993,
"Nucleotide GTR":0.0009646249437930085,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "M", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "ATG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730215256584304,
"Nucleotide GTR":0.0009641148302604533,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "I", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "ATT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000367147096028271,
"Nucleotide GTR":0.0003637863611787898,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179712159,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910850732,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426630_New_Taipei_city_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009725942641748778,
"Nucleotide GTR":0.0009636914797776228,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTG", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426630_New_Taipei_city_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00097285882141667,
"Nucleotide GTR":0.0009639536153558599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "N", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAT", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426808_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728775100805042,
"Nucleotide GTR":0.0009639721329502656,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426808_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0003671766704203998,
"Nucleotide GTR":0.000363815664857378,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000972066968622805,
"Nucleotide GTR":0.0009631690109028055,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "N", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "AAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009733445096626816,
"Nucleotide GTR":0.0009644348577832002,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "V", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GTC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009731937310553442,
"Nucleotide GTR":0.0009642854593499827,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "M", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ATG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009729740916890622,
"Nucleotide GTR":0.0009640678304848866,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730034376071923,
"Nucleotide GTR":0.0009640969077808489,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "V", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GTG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009722500124568399,
"Nucleotide GTR":0.0009633503792182309,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTC", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009817932068265894,
"Nucleotide GTR":0.0009728062185571471,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "-", "-", "-", "I", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "---", "---", "---", "ATA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724394048215967,
"Nucleotide GTR":0.0009635380379521699,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "L", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "CTT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009729740916890622,
"Nucleotide GTR":0.0009640678304848866,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179712159,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910850732,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "TTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001946376381366972,
"Nucleotide GTR":0.001928559939385463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAC", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTC", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "KTRI", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ANA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009720846752756594,
"Nucleotide GTR":0.0009631865554752145,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "C", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TGC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179308331,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910450583,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTT", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179308331,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910450583,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAT", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0009730068528693091,
"Nucleotide GTR":0.0009641002917808626,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "S", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "AGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427588_New_York_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009725792396177915,
"Nucleotide GTR":0.0009636765927500251,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTG", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427588_New_York_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "KN", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAN", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179712159,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910850732,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009729594179712159,
"Nucleotide GTR":0.0009640532910850732,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "L", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CTA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725387492356698,
"Nucleotide GTR":0.0009636364730025624,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "G", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GGA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78":{
"Global MG94xREV":0.0005122969861171178,
"Nucleotide GTR":0.0005076076004372287,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46":{
"Global MG94xREV":0.00097285882141667,
"Nucleotide GTR":0.0009639536153558599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000973403656378926,
"Nucleotide GTR":0.0009644934630912928,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "K", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AAG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_8051":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_8051",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5870.150930543218,
"Equilibrium frequencies": [
[0.04184923782899555],
[0.01154555304054062],
[0.0114149380310182],
[0.04678839343486953],
[0.01928985863569703],
[0.005321771615842017],
[0.005261566336126216],
[0.02156649778994722],
[0.01592667925300579],
[0.004393922795598728],
[0.004344214283085494],
[0.01780638725239347],
[0.03562028011078178],
[0.009827080603437021],
[0.009715906697597388],
[0.03982427796878032],
[0.0197123540535517],
[0.005438331522527981],
[0.005376807598892026],
[0.02203885721297397],
[0.009086151691067681],
[0.002506727761979354],
[0.002478369114338018],
[0.01015852288320596],
[0.00750198466255178],
[0.00206968074746638],
[0.002046266419058769],
[0.008387388352641221],
[0.01677831209016475],
[0.004628875033741337],
[0.004576508503139706],
[0.0187585320061371],
[0.04905765864540339],
[0.01353424409423313],
[0.01338113099388707],
[0.05484757077473767],
[0.02261248589842776],
[0.00623843273766596],
[0.006167857257342577],
[0.02528127014115017],
[0.01867000773924344],
[0.005150764405830822],
[0.005092493733169839],
[0.02087349048279543],
[0.04175577939241828],
[0.01151976931322406],
[0.01138944599538389],
[0.0466839047911754],
[0.01026762453167566],
[0.04160958375425419],
[0.01715474564492272],
[0.004732727189674419],
[0.004679185778121785],
[0.0191793932254996],
[0.003907578037012414],
[0.003863371549828835],
[0.01583547344429601],
[0.03167762173075567],
[0.008739362551478037],
[0.008640494015785288],
[0.03541629681945257]
],
"Log Likelihood":-2685.243601897651,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5948498443110194, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":249
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6396.324776397122,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3313598565067019],
[0.1443701523284363],
[0.1954630011942976],
[0.3288069899705643]
],
"Log Likelihood":-2758.3031584627,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3034684940460417,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1329329151670697,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.04627690133841543,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.721918155839687,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.5748427042874684
},
"display order":0,
"estimated parameters":439
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-19/sequences.endornase.compressed.fas",
"number of sequences":217,
"number of sites":346,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3)Node374,epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3,epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_417240_England_20200303_null_4,epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2,epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1,epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3,epi_isl_426630_New_Taipei_city_20200317_null_4,epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1,epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3,epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1,epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1,epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2,epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1,epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3,epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1,epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46,epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3,epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1,epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1,epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_420725_England_20200328_null_1,epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1,(epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1)Node329,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_425240_England_20200331_null_4,epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1,epi_isl_425485_England_20200317_null_1,epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_421669_India_20200312_null_1,epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1,epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1,epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2,epi_isl_423346_England_20200327_null_1,epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1,epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1,(epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5,epi_isl_425404_England_20200319_null_1)Node284,epi_isl_423354_England_20200329_null_2,epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1,epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1,epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1,epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1,epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1,epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7,epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24,epi_isl_425501_England_20200315_null_3,epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1,epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1,epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_427588_New_York_20200316_null_6,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2,epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2,epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3,(epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1)Node258,epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4,epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2,epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2,epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3,epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_421954_England_20200330_null_1,epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_1,epi_isl_423548_England_20200331_null_3,epi_isl_426808_Victoria_20200324_null_1,(epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2,epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78)Node225,(epi_isl_421775_England_20200325_null_1,epi_isl_421895_England_20200327_null_1,epi_isl_425336_England_20200328_null_1,epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46,epi_isl_423446_England_20200329_null_1,epi_isl_423453_England_20200329_null_1)Node228,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2,epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3,epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1,epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1,epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2,(epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1,epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1,epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1)Node171,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,(epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1)Node185,epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_425549_England_20200322_null_4,epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1,epi_isl_423752_England_20200323_null_1,epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2,epi_isl_417236_England_20200301_null_1,epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10,epi_isl_418677_England_20200315_null_1,epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,(epi_isl_421964_England_20200401_null_1,epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3)Node203,epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1,epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4,epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5,epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23,epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1,(epi_isl_420726_England_20200327_null_1,epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3)Node165,(epi_isl_423373_England_20200328_null_1,epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5)Node162,(epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1)Node159,(epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1,epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10)Node156,(epi_isl_423324_England_20200326_null_1,epi_isl_423465_England_20200330_null_4)Node152,epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2,epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_1,epi_isl_423328_England_20200327_null_2,epi_isl_423481_England_20200331_null_1,epi_isl_423173_England_20200324_null_1,epi_isl_423227_England_20200324_null_1,epi_isl_423130_England_20200324_null_1,epi_isl_423164_England_20200325_null_1,epi_isl_423772_England_20200322_null_1,epi_isl_423780_England_20200324_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_423933_England_20200319_null_1,epi_isl_424138_England_20200320_null_1,epi_isl_425023_England_20200324_null_1,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_423068_England_20200323_null_1,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_1,epi_isl_421953_England_20200331_null_1,epi_isl_421947_England_20200331_null_1,epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1,epi_isl_423927_England_20200318_null_1,epi_isl_421948_England_20200331_null_1,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346,epi_isl_420697_England_20200329_null_1,epi_isl_420696_England_20200329_null_1,epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1,epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2)Node62,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1)Node73,epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1,epi_isl_418715_England_20200317_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_8051,epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1,epi_isl_422002_England_20200330_null_2,(epi_isl_424062_England_20200311_null_1,epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76,epi_isl_423639_England_20200321_null_1,epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1)Node102,epi_isl_424007_England_20200320_null_1,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1,epi_isl_423052_England_20200319_null_5,epi_isl_417312_England_20200308_null_1,epi_isl_423648_England_20200323_null_1,epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node102":"test",
"Node152":"test",
"Node156":"test",
"Node159":"test",
"Node162":"test",
"Node165":"test",
"Node171":"test",
"Node185":"test",
"Node203":"test",
"Node225":"test",
"Node228":"test",
"Node258":"test",
"Node284":"test",
"Node329":"test",
"Node374":"test",
"Node62":"test",
"Node73":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":"test",
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":"test",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421954_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422002_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423164_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423173_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423373_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423465_England_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7":"test",
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24":"test",
"epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5":"test",
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425240_England_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_425336_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425501_England_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10":"test",
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76":"test",
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5":"test",
"epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4":"test",
"epi_isl_426630_New_Taipei_city_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426808_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10":"test",
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46":"test",
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23":"test",
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11":"test",
"epi_isl_427588_New_York_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78":"test",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46":"test",
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_8051":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":6
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":6
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":12
}
}
}