{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[155.8584604371182, 362.9810135493727, 1, 0, 0.3003982315369788, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003982315369789, 0.001859832211931607],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858923363409456],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 0, 1, 0.3002655069573911, 0, 0.002754239524390113, 0.01240980394430535, 0.6997344930426089, 1, 0.001859238051785748],
[155.8584604371182, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3004948808539075, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6995051191460926, 1, 0.001859092614162624],
[155.8584604371182, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3004948808539075, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6995051191460926, 1, 0.001858923363409456],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001858944442778018],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859755811239432],
[155.9502559867815, 362.8697060637231, 0, 1, 0.3005864604176516, 0, 0.002755810097369746, 0.01241688049033008, 0.6994135395823484, 1, 0.001858775018506695],
[155.8584604371182, 362.8498098877549, 1, 0, 0.3004742151874736, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3004742151874736, 0.001859090855623008],
[156.1826966434645, 362.6266396483297, 0.5, 1.5, 0.3010406438708007, 0.003201378966720016, 0.004136485949997163, 0.004213320674057884, 0.6989593561291993, 0.5114558184794551, 0.003729586018248515],
[155.8010773226369, 363.0574767881469, 0, 1, 0.3002765900037009, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.6997234099962991, 1, 0.001858657650585685],
[155.7107356093481, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3001768576703011, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.300176857670301, 0.001858924474887197],
[155.9189417374885, 362.9587638683895, 1, 0, 0.3004926595476415, 0.006413588938306425, 0, -0.0288977703641707, 1, 0.3004926595476416, 0.001859387657484939],
[155.8564490029522, 363.1906918839307, 0, 1, 0.3002741691951991, 0, 0.002753374528440784, 0.0124059065236022, 0.6997258308048009, 1, 0.001858944442814702],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858776296556632],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858925756263949],
[155.7979791367478, 363.0797264691302, 1, 0, 0.3002595360207801, 0.006418568491971739, 0, -0.02892020678778944, 1, 0.30025953602078, 0.001858905455888244],
[155.8010773226369, 363.057476788147, 0, 1, 0.3002765900037008, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.6997234099962992, 1, 0.001859092614161057],
[156.2979791367478, 362.6505562464326, 0, 2, 0.3011820411466057, 0, 0.005514950868132507, 0.02484876802832024, 0.4883465396160243, 1, 0.003725598236529801],
[155.8584604371182, 363.0574767881469, 0, 1, 0.3003539672928929, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.699646032707107, 1, 0.001859500272757719],
[156.0615569452035, 362.9855839416794, 0, 1, 0.3006693316498094, 0, 0.002754930345004195, 0.01241291658149813, 0.6993306683501905, 1, 0.001859500243751093],
[155.8584604371182, 363.0663621880351, 0, 1, 0.300348824418644, 0, 0.002754317403500167, 0.01241015484497269, 0.6996511755813559, 1, 0.001859238084543475],
[155.8010773226369, 363.057476788147, 0, 1, 0.3002765900037008, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.6997234099962992, 1, 0.001859240759259413],
[155.7979791367478, 363.0797264691302, 1, 0, 0.3002595360207801, 0.006418568491971739, 0, -0.02892020678778944, 1, 0.30025953602078, 0.001859500205742713],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.300091397119345, 0.00642216476652471, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001859102939481662],
[155.6533524948668, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192023, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807977, 1, 0.001859092614124123],
[155.8584604371182, 363.1886804497648, 1, 0, 0.3002780444389053, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3002780444389053, 0.001859501325253419],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859680181542061],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859322874731168],
[155.6533524948669, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192024, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807976, 1, 0.001858776296556632],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218544, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.001859603777133592],
[155.3402731006843, 362.9577813396861, 0, 1, 0.2997122442769193, 0, 0.002755141372941436, 0.01241386741213749, 0.7002877557230807, 1, 0.001860907573947586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.5681204016331, 363.1044772619936, 1, 0, 0.299935105695565, 0.006428052209014812, 0, -0.02896293766436193, 1, 0.299935105695565, 0.001857200945416387],
[155.9209531716544, 362.7873171532186, 0, 1, 0.3005946928010216, 0, 0.002756435941165117, 0.01241970036083572, 0.6994053071989784, 1, 0.001861431186402119],
[155.7361421753885, 363.1886804497648, 0, 1, 0.3001131096168142, 0, 0.002753389777351051, 0.01240597523076623, 0.6998868903831859, 1, 0.001859270016986164],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859102437889848],
[155.7302475453344, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3001290012325599, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6998709987674401, 1, 0.001869280609266964],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858776296556632],
[155.5076391012628, 363.2931714541476, 1, 0, 0.2997444027405848, 0.00643055225955057, 0, -0.02897420216649578, 1, 0.2997444027405849, 0.001858923363409456],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859387665150283],
[155.8564490029522, 363.1906918839307, 0, 1, 0.3002741691951991, 0, 0.002753374528440784, 0.0124059065236022, 0.6997258308048009, 1, 0.001859092614162624],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001858956342442779],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859112132575496],
[155.8584604371182, 360.0663621880351, 0, 1, 0.3020952929616212, 0, 0.002777265818232075, 0.01251355374152242, 0.6979047070383788, 1, 0.001881592071618134],
[155.8584604371182, 360.0192451687598, 0, 0, 0.3021228844422896, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006922515005800767],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001178690611810212],
[155.7107356093481, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3001768576703011, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.300176857670301, 0.001858656499717387],
[155.5010756448332, 363.5817379032961, 0, 1, 0.2995689157610978, 0, 0.002750413169172913, 0.01239256349820535, 0.7004310842389021, 1, 0.001860114975698354],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[156.3016349204283, 362.5760706854497, 1, 1, 0.3012301997788082, 0.006397885732347527, 0.002758041914099574, -0.01640007986681953, 0.9092603667412191, 0.5117207662988358, 0.003745873245264299],
[156.3016349204283, 362.5760706854497, 1, 0, 0.3012301997788082, 0.006397885732347527, 0, -0.02882701627560241, 1, 0.3012301997788083, 0.00186031427090279],
[154.2686763216208, 355.6090292842571, 1, 0, 0.3025601524159726, 0.006482197318626046, 0, -0.02920689981393828, 1, 0.3025601524159726, 0.002054237361716255],
[154.2686763216208, 355.6090292842571, 0, 0, 0.3025601524159726, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001769909773093665],
[156.1539100926582, 356.7237955132197, 1, 1, 0.3044661688076086, 0.006403938264540558, 0.00280328930275396, -0.01622347921898069, 0.9073003520516166, 0.5162326896668341, 0.00202026690449394],
[156.1539100926582, 356.7237955132197, 0, 0, 0.3044661688076086, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001340634309302257],
[156.4577999996173, 362.2723666444211, 0.5, 1.5, 0.3016169293022462, 0.003195749908289795, 0.004140531097897085, 0.004256909840072924, 0.6983830706977538, 0.5122610865627761, 0.002444194377532903],
[156.1539100926582, 362.7237955132197, 1, 0, 0.3009454991139425, 0.006403938264540558, 0, -0.02885428722906051, 1, 0.3009454991139424, 0.00185989922153796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218544, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.001859190231856921],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 2, 0, 0.3006607984490766, 0.01282000451843709, 0, -0.05776321965829823, 1, 0.09039691572403608, 0.003721350031815143],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.7979791367479, 363.2079393609139, 1, 0, 0.3001853612531584, 0.006418568491971737, 0, -0.02892020678778943, 1, 0.3001853612531584, 0.001858196120044145],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858944275223511],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 1, 1, 0.3002655069573911, 0.006418440855381085, 0.002754239524390113, -0.0165098277500501, 0.9098406253316209, 0.5103716392464031, 0.003725092192383486],
[155.9158435515995, 362.9618620542785, 0, 1, 0.3004866886110306, 0, 0.002755110397385102, 0.01241372784527057, 0.6995133113889693, 1, 0.001859502610723154],
[155.7979791367478, 363.0797264691302, 1, 0, 0.3002595360207801, 0.006418568491971739, 0, -0.02892020678778944, 1, 0.30025953602078, 0.001859502610723154],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859240440782393],
[155.8584604371182, 362.9618620542785, 0, 1, 0.3004093202993271, 0, 0.002755110397385102, 0.01241372784527057, 0.6995906797006729, 1, 0.001859483478453492],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.3000913971193451, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001858923837284986],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859240440782393],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001868721669714216],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859268127773392],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 0, 1, 0.3002655069573911, 0, 0.002754239524390113, 0.01240980394430535, 0.6997344930426089, 1, 0.001859653192962251],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001864161391648592],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859156370928044],
[155.6533524948668, 363.2243531110112, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927597, 0.01240475682636121, 0.7000191937074747, 1, 0.001858944442778018],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 0, 1, 0.3002655069573911, 0, 0.002754239524390113, 0.01240980394430535, 0.6997344930426089, 1, 0.001859387623406032],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859343929568629],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859276188487573],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859341011271894],
[155.8584604371182, 362.5766282832411, 1, 1, 0.3006325455744514, 0.006416077748974396, 0.002758037672573893, -0.01648206692502322, 0.9096200725414254, 0.5108851636903282, 0.00374067896157551],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859424562315185],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001858530599380291],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859506603825406],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859351470983013],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.3000913971193451, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001858925756247339],
[155.9189417374885, 362.9587638683895, 1, 0, 0.3004926595476416, 0.006413588938306423, 0, -0.02889777036417069, 1, 0.3004926595476416, 0.001859238084543475],
[155.8564490029522, 363.1435748646554, 0, 1, 0.3003014293554442, 0, 0.002753731772268593, 0.01240751616060877, 0.6996985706445558, 1, 0.001859092614124123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.6458004620997, 363.1095868820486, 0, 1, 0.3000369813197574, 0, 0.002753989528579527, 0.01240867753573819, 0.6999630186802426, 1, 0.001859567838680506],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.300091397119345, 0.00642216476652471, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001857747921565182],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218544, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.00185915875850476],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858923363409456],
[155.5615569452035, 363.393043711142, 0, 1, 0.2997594717311645, 0, 0.002751841339029295, 0.01239899841708583, 0.7002405282688355, 1, 0.0018593888781053],
[155.4543098257806, 363.4233957800973, 1, 0, 0.2995972040160432, 0.006432758288404555, 0, -0.02898414189226436, 1, 0.2995972040160433, 0.00185924335226285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.7302475453344, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3001290012325599, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6998709987674401, 1, 0.001859476112683295],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.300091397119345, 0.00642216476652471, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001857131949422375],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001858290181604882],
[155.6533524948669, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192024, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807976, 1, 0.001858811302953545],
[155.8584604371182, 362.9423501182922, 0, 1, 0.3004206185997694, 0, 0.002755258513298529, 0.01241439521258934, 0.6995793814002307, 1, 0.001859677969722742],
[155.7107356093481, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3001768576703011, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.300176857670301, 0.001858948891501204],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001858912363982774],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.00185993378056818],
[156.3010773226369, 362.5766282832411, 1, 0, 0.3012291251560496, 0.006397908556546919, 0, -0.02882711911482069, 1, 0.3012291251560496, 0.002091576671043586],
[155.8584604371182, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3004948808539075, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6995051191460926, 1, 0.0009536813751406955],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 0, 0.3003760977842109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000904266042635811],
[155.9484417095148, 362.9292638963632, 1, 0, 0.3005495129674505, 0.006412375712369734, 0, -0.02889230392020998, 1, 0.3005495129674505, 0.001859525020720089],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218543, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.001859344518775462],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.3000913971193451, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001858923371483653],
[155.3584604371182, 363.5192451687598, 0, 1, 0.2994124795855523, 0, 0.002750885993768393, 0.01239469390860648, 0.7005875204144476, 1, 0.001859388131212421],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859092614162624],
[155.7302475453344, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3001290012325599, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6998709987674401, 1, 0.001859267663353149],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859092614161057],
[156.0635683793695, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3007713892758964, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6992286107241037, 1, 0.001858907835107442],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.00185926762478097],
[155.9353554875857, 362.9423501182923, 0, 1, 0.3005242927242455, 0, 0.002755258513298529, 0.01241439521258934, 0.6994757072757545, 1, 0.0018593888781053],
[155.4482445526155, 363.2756709523273, 0, 1, 0.2996743352411217, 0, 0.0027527304467665, 0.01240300447850728, 0.7003256647588783, 1, 0.001857572428155752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.6533524948669, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192024, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807976, 1, 0.001858796906357923],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001857131949422375]
],
"NAMES": [
["epi_isl_423844_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_426179_India_20200302_null_61"],
["epi_isl_422092_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_425241_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2"],
["epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1"],
["epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_5"],
["epi_isl_423213_England_20200325_null_10"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_424650_Li_ge_20200404_null_7"],
["epi_isl_425628_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_422357_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424131_England_20200321_null_4"],
["epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_424993_Toulouse_20200301_null_15"],
["epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1"],
["epi_isl_420008_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1"],
["epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2"],
["epi_isl_423762_England_20200324_null_3"],
["epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4"],
["epi_isl_425413_England_20200316_null_3"],
["epi_isl_425968_Scotland_20200328_null_1"],
["epi_isl_425281_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_421893_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_2"],
["Node59"],
["epi_isl_418897_Washington_20200316_null_55"],
["epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1"],
["epi_isl_420617_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3"],
["epi_isl_426051_Prague_20200320_null_6"],
["epi_isl_425258_England_20200101_null_2"],
["epi_isl_423388_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_4"],
["epi_isl_424214_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_418900_Washington_20200316_null_8212"],
["epi_isl_422418_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423369_England_20200329_null_3"],
["Node147"],
["epi_isl_418902_Minnesota_20200313_null_2"],
["epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_424301_Washington_20200324_null_4"],
["Node137"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_3"],
["Node133"],
["epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1"],
["Node132"],
["epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1"],
["epi_isl_426307_New_York_20200326_null_178"],
["Node127"],
["epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1"],
["epi_isl_421668_India_20200310_null_3"],
["epi_isl_425293_England_20200319_null_3"],
["Node140"],
["epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1"],
["epi_isl_426092_Washington_20200325_null_4"],
["epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_420217_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_425518_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3"],
["epi_isl_419959_Victoria_20200322_null_4"],
["epi_isl_426100_Washington_20200325_null_13"],
["epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1"],
["epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1"],
["epi_isl_425512_England_20200319_null_16"],
["epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_423813_England_20200323_null_4"],
["epi_isl_424148_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423459_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_422961_Illinois_20200313_null_1"],
["epi_isl_419522_Connecticut_20200318_null_1"],
["epi_isl_423804_England_20200324_null_4"],
["epi_isl_424096_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2"],
["epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_422547_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1"],
["epi_isl_420344_Havelange_20200305_null_1"],
["Node42"],
["epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1"],
["epi_isl_425430_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_425625_England_20200328_null_30"],
["Node49"],
["epi_isl_425951_Scotland_20200327_null_1"],
["epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2"],
["epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1"],
["epi_isl_416650_USA_20200310_null_1"],
["epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_413747_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_425420_England_20200316_null_1"],
["Node87"],
["epi_isl_422000_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2"],
["epi_isl_425559_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422295_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_424518_Reykjavik_20200321_null_1"],
["epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2"],
["epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_422062_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_425302_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_424146_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_425450_England_20200331_null_4"],
["Node26"],
["epi_isl_423295_England_20200326_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[155.8584604371182, 362.9810135493727, 1, 0, 0.3003982315369788, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003982315369789, 0.001859832211931607],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858923363409456],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 0, 1, 0.3002655069573911, 0, 0.002754239524390113, 0.01240980394430535, 0.6997344930426089, 1, 0.001859238051785748],
[155.8584604371182, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3004948808539075, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6995051191460926, 1, 0.001859092614162624],
[155.8584604371182, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3004948808539075, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6995051191460926, 1, 0.001858923363409456],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001858944442778018],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859755811239432],
[155.9502559867815, 362.8697060637231, 0, 1, 0.3005864604176516, 0, 0.002755810097369746, 0.01241688049033008, 0.6994135395823484, 1, 0.001858775018506695],
[155.8584604371182, 362.8498098877549, 1, 0, 0.3004742151874736, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3004742151874736, 0.001859090855623008],
[156.1826966434645, 362.6266396483297, 0.5, 1.5, 0.3010406438708007, 0.003201378966720016, 0.004136485949997163, 0.004213320674057884, 0.6989593561291993, 0.5114558184794551, 0.003729586018248515],
[155.8010773226369, 363.0574767881469, 0, 1, 0.3002765900037009, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.6997234099962991, 1, 0.001858657650585685],
[155.7107356093481, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3001768576703011, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.300176857670301, 0.001858924474887197],
[155.9189417374885, 362.9587638683895, 1, 0, 0.3004926595476415, 0.006413588938306425, 0, -0.0288977703641707, 1, 0.3004926595476416, 0.001859387657484939],
[155.8564490029522, 363.1906918839307, 0, 1, 0.3002741691951991, 0, 0.002753374528440784, 0.0124059065236022, 0.6997258308048009, 1, 0.001858944442814702],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858776296556632],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858925756263949],
[155.7979791367478, 363.0797264691302, 1, 0, 0.3002595360207801, 0.006418568491971739, 0, -0.02892020678778944, 1, 0.30025953602078, 0.001858905455888244],
[155.8010773226369, 363.057476788147, 0, 1, 0.3002765900037008, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.6997234099962992, 1, 0.001859092614161057],
[156.2979791367478, 362.6505562464326, 0, 2, 0.3011820411466057, 0, 0.005514950868132507, 0.02484876802832024, 0.4883465396160243, 1, 0.003725598236529801],
[155.8584604371182, 363.0574767881469, 0, 1, 0.3003539672928929, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.699646032707107, 1, 0.001859500272757719],
[156.0615569452035, 362.9855839416794, 0, 1, 0.3006693316498094, 0, 0.002754930345004195, 0.01241291658149813, 0.6993306683501905, 1, 0.001859500243751093],
[155.8584604371182, 363.0663621880351, 0, 1, 0.300348824418644, 0, 0.002754317403500167, 0.01241015484497269, 0.6996511755813559, 1, 0.001859238084543475],
[155.8010773226369, 363.057476788147, 0, 1, 0.3002765900037008, 0, 0.002754384812142362, 0.01241045856875066, 0.6997234099962992, 1, 0.001859240759259413],
[155.7979791367478, 363.0797264691302, 1, 0, 0.3002595360207801, 0.006418568491971739, 0, -0.02892020678778944, 1, 0.30025953602078, 0.001859500205742713],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.300091397119345, 0.00642216476652471, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001859102939481662],
[155.6533524948668, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192023, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807977, 1, 0.001859092614124123],
[155.8584604371182, 363.1886804497648, 1, 0, 0.3002780444389053, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3002780444389053, 0.001859501325253419],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859680181542061],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859322874731168],
[155.6533524948669, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192024, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807976, 1, 0.001858776296556632],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218544, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.001859603777133592],
[155.3402731006843, 362.9577813396861, 0, 1, 0.2997122442769193, 0, 0.002755141372941436, 0.01241386741213749, 0.7002877557230807, 1, 0.001860907573947586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.5681204016331, 363.1044772619936, 1, 0, 0.299935105695565, 0.006428052209014812, 0, -0.02896293766436193, 1, 0.299935105695565, 0.001857200945416387],
[155.9209531716544, 362.7873171532186, 0, 1, 0.3005946928010216, 0, 0.002756435941165117, 0.01241970036083572, 0.6994053071989784, 1, 0.001861431186402119],
[155.7361421753885, 363.1886804497648, 0, 1, 0.3001131096168142, 0, 0.002753389777351051, 0.01240597523076623, 0.6998868903831859, 1, 0.001859270016986164],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859102437889848],
[155.7302475453344, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3001290012325599, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6998709987674401, 1, 0.001869280609266964],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858776296556632],
[155.5076391012628, 363.2931714541476, 1, 0, 0.2997444027405848, 0.00643055225955057, 0, -0.02897420216649578, 1, 0.2997444027405849, 0.001858923363409456],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859387665150283],
[155.8564490029522, 363.1906918839307, 0, 1, 0.3002741691951991, 0, 0.002753374528440784, 0.0124059065236022, 0.6997258308048009, 1, 0.001859092614162624],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001858956342442779],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859112132575496],
[155.8584604371182, 360.0663621880351, 0, 1, 0.3020952929616212, 0, 0.002777265818232075, 0.01251355374152242, 0.6979047070383788, 1, 0.001881592071618134],
[155.8584604371182, 360.0192451687598, 0, 0, 0.3021228844422896, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006922515005800767],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001178690611810212],
[155.7107356093481, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3001768576703011, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.300176857670301, 0.001858656499717387],
[155.5010756448332, 363.5817379032961, 0, 1, 0.2995689157610978, 0, 0.002750413169172913, 0.01239256349820535, 0.7004310842389021, 1, 0.001860114975698354],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[156.3016349204283, 362.5760706854497, 1, 1, 0.3012301997788082, 0.006397885732347527, 0.002758041914099574, -0.01640007986681953, 0.9092603667412191, 0.5117207662988358, 0.003745873245264299],
[156.3016349204283, 362.5760706854497, 1, 0, 0.3012301997788082, 0.006397885732347527, 0, -0.02882701627560241, 1, 0.3012301997788083, 0.00186031427090279],
[154.2686763216208, 355.6090292842571, 1, 0, 0.3025601524159726, 0.006482197318626046, 0, -0.02920689981393828, 1, 0.3025601524159726, 0.002054237361716255],
[154.2686763216208, 355.6090292842571, 0, 0, 0.3025601524159726, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001769909773093665],
[156.1539100926582, 356.7237955132197, 1, 1, 0.3044661688076086, 0.006403938264540558, 0.00280328930275396, -0.01622347921898069, 0.9073003520516166, 0.5162326896668341, 0.00202026690449394],
[156.1539100926582, 356.7237955132197, 0, 0, 0.3044661688076086, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001340634309302257],
[156.4577999996173, 362.2723666444211, 0.5, 1.5, 0.3016169293022462, 0.003195749908289795, 0.004140531097897085, 0.004256909840072924, 0.6983830706977538, 0.5122610865627761, 0.002444194377532903],
[156.1539100926582, 362.7237955132197, 1, 0, 0.3009454991139425, 0.006403938264540558, 0, -0.02885428722906051, 1, 0.3009454991139424, 0.00185989922153796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218544, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.001859190231856921],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 2, 0, 0.3006607984490766, 0.01282000451843709, 0, -0.05776321965829823, 1, 0.09039691572403608, 0.003721350031815143],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.7979791367479, 363.2079393609139, 1, 0, 0.3001853612531584, 0.006418568491971737, 0, -0.02892020678778943, 1, 0.3001853612531584, 0.001858196120044145],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858944275223511],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 1, 1, 0.3002655069573911, 0.006418440855381085, 0.002754239524390113, -0.0165098277500501, 0.9098406253316209, 0.5103716392464031, 0.003725092192383486],
[155.9158435515995, 362.9618620542785, 0, 1, 0.3004866886110306, 0, 0.002755110397385102, 0.01241372784527057, 0.6995133113889693, 1, 0.001859502610723154],
[155.7979791367478, 363.0797264691302, 1, 0, 0.3002595360207801, 0.006418568491971739, 0, -0.02892020678778944, 1, 0.30025953602078, 0.001859502610723154],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859240440782393],
[155.8584604371182, 362.9618620542785, 0, 1, 0.3004093202993271, 0, 0.002755110397385102, 0.01241372784527057, 0.6995906797006729, 1, 0.001859483478453492],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.3000913971193451, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001858923837284986],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859240440782393],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001868721669714216],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859268127773392],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 0, 1, 0.3002655069573911, 0, 0.002754239524390113, 0.01240980394430535, 0.6997344930426089, 1, 0.001859653192962251],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001864161391648592],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859156370928044],
[155.6533524948668, 363.2243531110112, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927597, 0.01240475682636121, 0.7000191937074747, 1, 0.001858944442778018],
[155.8010773226369, 363.0766282832411, 0, 1, 0.3002655069573911, 0, 0.002754239524390113, 0.01240980394430535, 0.6997344930426089, 1, 0.001859387623406032],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859343929568629],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859276188487573],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859341011271894],
[155.8584604371182, 362.5766282832411, 1, 1, 0.3006325455744514, 0.006416077748974396, 0.002758037672573893, -0.01648206692502322, 0.9096200725414254, 0.5108851636903282, 0.00374067896157551],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001859424562315185],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001858530599380291],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859506603825406],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859351470983013],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.3000913971193451, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001858925756247339],
[155.9189417374885, 362.9587638683895, 1, 0, 0.3004926595476416, 0.006413588938306423, 0, -0.02889777036417069, 1, 0.3004926595476416, 0.001859238084543475],
[155.8564490029522, 363.1435748646554, 0, 1, 0.3003014293554442, 0, 0.002753731772268593, 0.01240751616060877, 0.6996985706445558, 1, 0.001859092614124123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.6458004620997, 363.1095868820486, 0, 1, 0.3000369813197574, 0, 0.002753989528579527, 0.01240867753573819, 0.6999630186802426, 1, 0.001859567838680506],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.300091397119345, 0.00642216476652471, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001857747921565182],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218544, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.00185915875850476],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001858923363409456],
[155.5615569452035, 363.393043711142, 0, 1, 0.2997594717311645, 0, 0.002751841339029295, 0.01239899841708583, 0.7002405282688355, 1, 0.0018593888781053],
[155.4543098257806, 363.4233957800973, 1, 0, 0.2995972040160432, 0.006432758288404555, 0, -0.02898414189226436, 1, 0.2995972040160433, 0.00185924335226285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.7302475453344, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3001290012325599, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6998709987674401, 1, 0.001859476112683295],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.300091397119345, 0.00642216476652471, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001857131949422375],
[155.6533524948669, 363.2243531110111, 0, 1, 0.2999808062925253, 0, 0.002753119363927598, 0.01240475682636122, 0.7000191937074747, 1, 0.001858290181604882],
[155.6533524948669, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192024, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807976, 1, 0.001858811302953545],
[155.8584604371182, 362.9423501182922, 0, 1, 0.3004206185997694, 0, 0.002755258513298529, 0.01241439521258934, 0.6995793814002307, 1, 0.001859677969722742],
[155.7107356093481, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3001768576703011, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.300176857670301, 0.001858948891501204],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001858912363982774],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.00185993378056818],
[156.3010773226369, 362.5766282832411, 1, 0, 0.3012291251560496, 0.006397908556546919, 0, -0.02882711911482069, 1, 0.3012291251560496, 0.002091576671043586],
[155.8584604371182, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3004948808539075, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6995051191460926, 1, 0.0009536813751406955],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 0, 0.3003760977842109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000904266042635811],
[155.9484417095148, 362.9292638963632, 1, 0, 0.3005495129674505, 0.006412375712369734, 0, -0.02889230392020998, 1, 0.3005495129674505, 0.001859525020720089],
[156.0061852648882, 362.8715203409898, 1, 0, 0.3006607984490766, 0.006410002259218543, 0, -0.02888160982914911, 1, 0.3006607984490766, 0.001859344518775462],
[155.7107356093481, 363.1669699965299, 1, 0, 0.3000913971193451, 0.006422164766524708, 0, -0.02893641055719186, 1, 0.3000913971193451, 0.001858923371483653],
[155.3584604371182, 363.5192451687598, 0, 1, 0.2994124795855523, 0, 0.002750885993768393, 0.01239469390860648, 0.7005875204144476, 1, 0.001859388131212421],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 1, 0, 0.3003760977842109, 0.006416077748974396, 0, -0.0289089842227224, 1, 0.3003760977842109, 0.001859092614162624],
[155.7302475453344, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3001290012325599, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6998709987674401, 1, 0.001859267663353149],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001859092614161057],
[156.0635683793695, 362.8141372265085, 0, 1, 0.3007713892758964, 0, 0.002756232178945359, 0.01241878226741063, 0.6992286107241037, 1, 0.001858907835107442],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.00185926762478097],
[155.9353554875857, 362.9423501182923, 0, 1, 0.3005242927242455, 0, 0.002755258513298529, 0.01241439521258934, 0.6994757072757545, 1, 0.0018593888781053],
[155.4482445526155, 363.2756709523273, 0, 1, 0.2996743352411217, 0, 0.0027527304467665, 0.01240300447850728, 0.7003256647588783, 1, 0.001857572428155752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[155.6533524948669, 363.1474580605436, 0, 1, 0.3000252685192024, 0, 0.002753702326158871, 0.0124073834849844, 0.6999747314807976, 1, 0.001858796906357923],
[155.8584604371182, 363.0192451687598, 0, 1, 0.3003760977842109, 0, 0.002754674892057366, 0.01241176558465886, 0.6996239022157891, 1, 0.001857131949422375]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.009934154919053514, 2.988775049054702, 0, 1, 0.003312810360500851, 0, 0.334585234280607, 1.507543960252054, 0.9966871896394991, 1, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.067322454160865, 0, 0, 0.2231409623869121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8822154359721258, 2.11675969931266, 1, 1, 0.2941723075967916, 1.133509978657408, 0.4724201808664031, -2.978678763236284, 0.9134626534431787, 0.5018072686367618, 0.2219406153998096],
[0.9989201351359789, 2.00107986486402, 0, 1, 0.3329733783786597, 0, 0.4997301794688505, 2.251639153872866, 0.6670266216213403, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982819068071395, 2.001073979360295, 0, 2, 0.332832096188072, 0, 0.999463298523007, 4.503291552663976, 0.445113011876802, 1, 0.2219406153998096],
[0.883996342452981, 2.116003657547017, 1, 0, 0.2946654474843272, 1.131226399902429, 0, -5.096977846369435, 1, 0.2946654474843271, 0.2219406153998096],
[0.8827601323103069, 2.117239867689691, 2, 0, 0.2942533774367692, 2.265621120389431, 0, -10.20823122576317, 1, 0.08658505013294571, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.067322454160865, 0, 0, 0.2231409623869121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.399996644392688, 0, 0, 0.3379898802907091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.5904283319755373, 2.40957166802446, 0, 1, 0.1968094439918459, 0, 0.4150115197942511, 1.869921460957646, 0.803190556008154, 1, 0.2219406153998096],
[1.183591099326604, 1.662618799738254, 0, 0, 0.4158481423718894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[1.301997510147127, 1.290266382910716, 0, 1, 0.5022627185580579, 0, 0.7750337552344013, 3.492077165949258, 0.4977372814419421, 1, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 1.520959245133328, 0, 0, 0.2807908390520094, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982820437407053, 2.001717956259293, 0, 1, 0.3327606812469019, 0, 0.4995708795402666, 2.250921394627687, 0.6672393187530981, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995194409795024, 2.000320173447028, 1, 1, 0.333190960000899, 1.000480790068502, 0.4999199694500716, -2.255381781819011, 0.8889837841736792, 0.5553657041754774, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9990368712308744, 2.000963128769124, 0, 1, 0.3330122904102916, 0, 0.4997593337040356, 2.251770514395286, 0.6669877095897083, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995192522438181, 2.000480747756181, 0, 1, 0.3331730840812728, 0, 0.4998798419438128, 2.252313489549068, 0.6668269159187272, 1, 0.2219406153998096],
[0.5952327208354021, 2.403618371663259, 0.5, 1.5, 0.1984869213160733, 0.8400075844255602, 0.6240591342135683, -0.9730010427472987, 0.8015130786839268, 0.3575767846986134, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.662549030023813, 1, 0, 0.3755799381433574, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3755799381433573, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9958110683619962, 2.004188931638002, 1, 1, 0.3319370227873322, 1.004206552599274, 0.4989549558996469, -2.276517057454552, 0.889817812903082, 0.5536918584777465, 0.2219406153998096],
[0.5943136470051206, 2.066815790985003, 1, 0, 0.2233313564236052, 1.682613221216144, 0, -7.58136683628204, 1, 0.2233313564236052, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.067717162252077, 0, 1, 0.2231078702417724, 0, 0.483625138996689, 2.179074515610737, 0.7768921297582276, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[1.304553700067244, 1.2852304154301, 0, 0, 0.5037306747928355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.88523377103741, 0, 0, 0.3465923662887258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5937901363299483, 2.068758468555219, 0, 1, 0.2230156982826452, 0, 0.4833817070478898, 2.177977681899788, 0.7769843017173548, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982821991341894, 2.001073796626774, 0, 1, 0.3328321814899856, 0, 0.4997316948958643, 2.251645981947174, 0.6671678185100145, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.399996644392688, 0, 0, 0.3379898802907091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5910215812352068, 2.407260481986139, 1, 1, 0.1971200736865346, 1.691985591981342, 0.4154099680874327, -5.751879265515474, 0.9611436765498153, 0.3553838239228844, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.7142630120390665, 2.041100464501599, 1, 0, 0.2592264208044949, 1.40004449781771, 0, -6.3081941775084, 1, 0.2592264208044949, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995192909158088, 2.00048070908419, 0, 1, 0.3331730969719364, 0, 0.4998798516071644, 2.252313533089326, 0.6668269030280636, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.256425783567511, 0, 0, 0.2072173649916413, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[1.304553700067244, 1.2852304154301, 0, 0, 0.5037306747928355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9967776662159452, 2.003222333784054, 0, 1, 0.3322592220719818, 0, 0.4991957123955465, 2.24923100035693, 0.6677407779280182, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.998925919515501, 2.001074080484498, 1, 1, 0.3329753065051672, 1.00107523537383, 0.4997316240075835, -2.258908809742251, 0.88912744525779, 0.5550780582681243, 0.2219406153998096],
[1.18110368146601, 1.665750434077041, 0, 1, 0.4148802971734676, 0, 0.6003300251601497, 2.704912861842343, 0.5851197028265325, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.399996644392688, 0, 0, 0.3379898802907091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.7142628493076941, 1.946866588682432, 1, 0, 0.26840590281364, 1.400044816791548, 0, -6.308195614711941, 1, 0.2684059028136401, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 1.520959245133328, 0, 0, 0.2807908390520094, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2277348571134016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9235367612257511, 2.076463238774248, 0, 0, 0.3078455870752504, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[1.000768796978493, 1.960124228960557, 1, 1, 0.3379955939681739, 0.999231793616254, 0.5101717458644417, -2.20356263710816, 0.8857589784581015, 0.561750166394449, 0.2219406153998096],
[0.5937879141485976, 2.401652261717463, 1, 4, 0.1982306036130125, 1.684102987232149, 1.665520052074288, -0.08372931256582065, 0.7408996631354943, 0.6686802111975301, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[1.048003094461543, 1.086519846297344, 0, 0, 0.4909776673981056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.495372101320852, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.2198863780380934],
[0.5952940364674902, 2.432732766011745, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.007608105207405, 2.020418697271832, 1, 2, 0.3327606295896763, 0.9924493410006471, 0.989893828789348, -0.01162196691809807, 0.7415040173670235, 0.7029394425451643, 0.2198863780380934],
[0.6226676548159483, 2.35108532151645, 3.5, 1.5, 0.2093878206332725, 5.620976090422667, 0.638003217608666, -22.65808010448901, 0.9957981592710666, 0.03669255756308576, 0.2199203484953157],
[0.9868609050530124, 1.973721810106025, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.013314029241316, 0, -4.656456704386963, 1, 0.3333333333333333, 0.2176148289506586],
[0, 2.915682428725443, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2183177304104665],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[0.5993374812628816, 2.088488664625477, 0, 2, 0.2229822349855866, 0, 0.957630287334432, 4.355114199791545, 0.6037566071479942, 1, 0.2198863780380934],
[1.899880279380334, 1.127496450970196, 2, 0, 0.6275665199951355, 1.052697910340078, 0, -4.787463051293278, 1, 0.3938397370188047, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9907442026417039, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2198863780380934],
[0.7214471532248682, 1.96454326780867, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.013552474420043, 2.014474328059194, 2, 0, 0.334723746034937, 1.973257478498492, 0, -8.973986911352199, 1, 0.112039986159661, 0.2198863780380934],
[0.7283755189416097, 1.983409617429566, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2177948013670498],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[0.7514094333688794, 2.277131651229045, 1, 0, 0.2481093742430237, 1.330832373925073, 0, -6.053391825683436, 1, 0.2481093742430237, 0.219849038728766],
[0.5994562822826958, 1.535429187295112, 0, 0, 0.2807908390520094, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[0.8924065174283422, 2.019027389731951, 1, 0, 0.3065178691618533, 1.12056554997123, 0, -5.09697725516873, 1, 0.3065178691618533, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4952879812753612, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.219849038728766],
[1.007779518707704, 2.020111422547423, 0, 1, 0.3328321720497494, 0, 0.4950221996858812, 2.251645959192044, 0.6671678279502506, 1, 0.219849038728766],
[0.595395141608986, 2.432495496518206, 0, 1, 0.1966369373159558, 0, 0.4111004527783781, 1.869921538686209, 0.8033630626840442, 1, 0.219849038728766],
[1.007779084993207, 2.02076199960472, 0, 1, 0.3327605790518775, 0, 0.494862829069237, 2.250921049874425, 0.6672394209481225, 1, 0.219849038728766],
[0.5994562822826958, 2.086990329179332, 0, 0, 0.2231409623869121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4952879812753612, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.219849038728766],
[1.007780004887349, 2.020761079710578, 1, 1, 0.3327608827935523, 0.9922800563122719, 0.494863054341498, -2.262538898723371, 0.8892701948824557, 0.5547919604695604, 0.219849038728766],
[1.007778946567992, 2.017879237132716, 1, 1, 0.3330775934958288, 0.9922810983554644, 0.4955697950591629, -2.259328974865832, 0.8890593167110274, 0.555214503702685, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9905759625507224, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.219849038728766],
[1.007779780589824, 2.020761304008103, 1, 1, 0.3327608087323069, 0.9922802771600847, 0.4948629994134083, -2.262540153110945, 0.8892702441718212, 0.5547918616364348, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[0.595395141608986, 2.43225620689753, 0, 1, 0.1966524784641017, 0, 0.4111408975601104, 1.870105504838466, 0.8033475215358983, 1, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9905759625507224, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.219849038728766],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.2852304154301007, 2.714769584569896, 0, 0, 0.095076805143367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 9.011419547508908, 0.1975308641975309, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964612399431, 2.000320318597613, 1, 1, 0.3064838326425885, 1.131226247893961, 0.4999199331740435, -2.844483032466435, 0.9060676603287099, 0.5190353256138868, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5937901349870808, 2.162597944358008, 0, 1, 0.2154232705607129, 0, 0.4624068022486082, 2.083470848342096, 0.7845767294392871, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9948488034823619, 2.003220010860737, 0, 1, 0.3318298761932659, 0, 0.4991962912602513, 2.249233608553288, 0.6681701238067341, 1, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.161556492711406, 0, 0, 0.2155094922629874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982817446049963, 2.001718255395002, 0, 1, 0.3327605815349989, 0, 0.4995708048846606, 2.250921058251194, 0.667239418465001, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.661129437990125, 0, 0, 0.3757802930304928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.999519290215787, 2.000320273893667, 1, 1, 0.3331909153323367, 1.000480940977246, 0.4999199443464513, -2.255382574879643, 0.8889838139399997, 0.5553656446046731, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5960088957737651, 2.403991104226232, 1, 1, 0.1986696319245886, 1.677827306087027, 0.4159749169795152, -5.685540642637122, 0.9605303773509486, 0.3578696412001255, 0.2219406153998096],
[0.899172712724992, 2.034335137577339, 1, 0, 0.3065179159593256, 1.112133393115818, 0, -5.096976133036717, 1, 0.3065179159593256, 0.2181947421545453],
[0.9995191835803685, 2.00048081641963, 0, 2, 0.3331730611934563, 0, 0.9997596495724009, 4.504626824483693, 0.4446581663181061, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.252854886877227, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 1, 0.1965947051657818, 0, 0.4149005931086334, 1.869421657506089, 0.8034052948342183, 1, 0.2219406153998096],
[1.877935369491637, 1.11690874451325, 1, 0, 0.6270561331422182, 0.5324996888847688, 0, -2.399289052729308, 1, 0.6270561331422182, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.161556492711406, 0, 0, 0.2155094922629874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.88523377103741, 0, 0, 0.3465923662887258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964619743742, 2.116003538025624, 1, 0, 0.2946654873247916, 1.131226246954129, 0, -5.096977157228787, 1, 0.2946654873247916, 0.2219406153998096],
[1.301052029494242, 1.291524585482984, 1, 1, 0.5018374469545507, 0.7686087699265418, 0.7742787177574604, 0.02554713935844763, 0.7481591768341385, 0.7518340707432399, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5943136877654203, 2.066815750224704, 1, 0, 0.2233313717405226, 1.682613105816111, 0, -7.581366316322984, 1, 0.2233313717405225, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995193285189481, 2.000320248374106, 0, 1, 0.3331909266808708, 0, 0.4999199507242987, 2.252494208073317, 0.6668090733191292, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5910217048782089, 2.408978295121788, 1, 0, 0.1970072349594031, 1.691985238014345, 0, -7.623594423969485, 1, 0.1970072349594032, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2277348571134016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.7142628499630781, 1.400503378999509, 1, 0, 0.3377502629751491, 1.400044815506914, 0, -6.308195608923749, 1, 0.3377502629751491, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964603870631, 2.116003539612935, 1, 0, 0.2946654867956879, 1.131226248985368, 0, -5.09697716638096, 1, 0.2946654867956879, 0.2219406153998096],
[0, 1.812386032341483, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114285456422925, 0, 1, 0.2951252197129371, 0, 0.4729730306577714, 2.131079206956985, 0.704874780287063, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8857145485237541, 2.114285451476245, 0, 1, 0.2952381828412515, 0, 0.4729730317643609, 2.131079211942956, 0.7047618171587485, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.941755537626774, 0, 1, 0.2690618577620897, 0, 0.514997887541604, 2.320431015359101, 0.7309381422379103, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5955086011993349, 2.06704042799883, 0, 1, 0.2236610836716401, 0, 0.4837834744084484, 2.179787929023033, 0.7763389163283598, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964616643344, 2.116003538335664, 1, 0, 0.2946654872214449, 1.131226247350879, 0, -5.096977159016426, 1, 0.2946654872214449, 0.2219406153998096],
[0.9989752994234327, 1.662548853437021, 0, 1, 0.3753395581061292, 0, 0.6014860844135074, 2.710121729319236, 0.6246604418938708, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.998580721329582, 1, 0, 0.3334911056043193, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3334911056043193, 0.2219406153998096]
],
"RESOLVED": [
[0.009934154919053514, 2.988775049054702, 0, 1, 0.003312810360500851, 0, 0.334585234280607, 1.507543960252054, 0.9966871896394991, 1, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.067322454160865, 0, 0, 0.2231409623869121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8822154359721258, 2.11675969931266, 1, 1, 0.2941723075967916, 1.133509978657408, 0.4724201808664031, -2.978678763236284, 0.9134626534431787, 0.5018072686367618, 0.2219406153998096],
[0.9989201351359789, 2.00107986486402, 0, 1, 0.3329733783786597, 0, 0.4997301794688505, 2.251639153872866, 0.6670266216213403, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982819068071395, 2.001073979360295, 0, 2, 0.332832096188072, 0, 0.999463298523007, 4.503291552663976, 0.445113011876802, 1, 0.2219406153998096],
[0.883996342452981, 2.116003657547017, 1, 0, 0.2946654474843272, 1.131226399902429, 0, -5.096977846369435, 1, 0.2946654474843271, 0.2219406153998096],
[0.8827601323103069, 2.117239867689691, 2, 0, 0.2942533774367692, 2.265621120389431, 0, -10.20823122576317, 1, 0.08658505013294571, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.067322454160865, 0, 0, 0.2231409623869121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.399996644392688, 0, 0, 0.3379898802907091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.5904283319755373, 2.40957166802446, 0, 1, 0.1968094439918459, 0, 0.4150115197942511, 1.869921460957646, 0.803190556008154, 1, 0.2219406153998096],
[1.183591099326604, 1.662618799738254, 0, 0, 0.4158481423718894, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[1.301997510147127, 1.290266382910716, 0, 1, 0.5022627185580579, 0, 0.7750337552344013, 3.492077165949258, 0.4977372814419421, 1, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 1.520959245133328, 0, 0, 0.2807908390520094, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982820437407053, 2.001717956259293, 0, 1, 0.3327606812469019, 0, 0.4995708795402666, 2.250921394627687, 0.6672393187530981, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995194409795024, 2.000320173447028, 1, 1, 0.333190960000899, 1.000480790068502, 0.4999199694500716, -2.255381781819011, 0.8889837841736792, 0.5553657041754774, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9990368712308744, 2.000963128769124, 0, 1, 0.3330122904102916, 0, 0.4997593337040356, 2.251770514395286, 0.6669877095897083, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995192522438181, 2.000480747756181, 0, 1, 0.3331730840812728, 0, 0.4998798419438128, 2.252313489549068, 0.6668269159187272, 1, 0.2219406153998096],
[0.5952327208354021, 2.403618371663259, 0.5, 1.5, 0.1984869213160733, 0.8400075844255602, 0.6240591342135683, -0.9730010427472987, 0.8015130786839268, 0.3575767846986134, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.662549030023813, 1, 0, 0.3755799381433574, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3755799381433573, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9958110683619962, 2.004188931638002, 1, 1, 0.3319370227873322, 1.004206552599274, 0.4989549558996469, -2.276517057454552, 0.889817812903082, 0.5536918584777465, 0.2219406153998096],
[0.5943136470051206, 2.066815790985003, 1, 0, 0.2233313564236052, 1.682613221216144, 0, -7.58136683628204, 1, 0.2233313564236052, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.067717162252077, 0, 1, 0.2231078702417724, 0, 0.483625138996689, 2.179074515610737, 0.7768921297582276, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[1.304553700067244, 1.2852304154301, 0, 0, 0.5037306747928355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.88523377103741, 0, 0, 0.3465923662887258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5937901363299483, 2.068758468555219, 0, 1, 0.2230156982826452, 0, 0.4833817070478898, 2.177977681899788, 0.7769843017173548, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982821991341894, 2.001073796626774, 0, 1, 0.3328321814899856, 0, 0.4997316948958643, 2.251645981947174, 0.6671678185100145, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.399996644392688, 0, 0, 0.3379898802907091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5910215812352068, 2.407260481986139, 1, 1, 0.1971200736865346, 1.691985591981342, 0.4154099680874327, -5.751879265515474, 0.9611436765498153, 0.3553838239228844, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.7142630120390665, 2.041100464501599, 1, 0, 0.2592264208044949, 1.40004449781771, 0, -6.3081941775084, 1, 0.2592264208044949, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995192909158088, 2.00048070908419, 0, 1, 0.3331730969719364, 0, 0.4998798516071644, 2.252313533089326, 0.6668269030280636, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.256425783567511, 0, 0, 0.2072173649916413, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[1.304553700067244, 1.2852304154301, 0, 0, 0.5037306747928355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9967776662159452, 2.003222333784054, 0, 1, 0.3322592220719818, 0, 0.4991957123955465, 2.24923100035693, 0.6677407779280182, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.998925919515501, 2.001074080484498, 1, 1, 0.3329753065051672, 1.00107523537383, 0.4997316240075835, -2.258908809742251, 0.88912744525779, 0.5550780582681243, 0.2219406153998096],
[1.18110368146601, 1.665750434077041, 0, 1, 0.4148802971734676, 0, 0.6003300251601497, 2.704912861842343, 0.5851197028265325, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.399996644392688, 0, 0, 0.3379898802907091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.7142628493076941, 1.946866588682432, 1, 0, 0.26840590281364, 1.400044816791548, 0, -6.308195614711941, 1, 0.2684059028136401, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 1.520959245133328, 0, 0, 0.2807908390520094, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2277348571134016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9235367612257511, 2.076463238774248, 0, 0, 0.3078455870752504, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[1.000768796978493, 1.960124228960557, 1, 1, 0.3379955939681739, 0.999231793616254, 0.5101717458644417, -2.20356263710816, 0.8857589784581015, 0.561750166394449, 0.2219406153998096],
[0.5937879141485976, 2.401652261717463, 1, 4, 0.1982306036130125, 1.684102987232149, 1.665520052074288, -0.08372931256582065, 0.7408996631354943, 0.6686802111975301, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[1.048003094461543, 1.086519846297344, 0, 0, 0.4909776673981056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.495372101320852, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.2198863780380934],
[0.5952940364674902, 2.432732766011745, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.007608105207405, 2.020418697271832, 1, 2, 0.3327606295896763, 0.9924493410006471, 0.989893828789348, -0.01162196691809807, 0.7415040173670235, 0.7029394425451643, 0.2198863780380934],
[0.6226676548159483, 2.35108532151645, 3.5, 1.5, 0.2093878206332725, 5.620976090422667, 0.638003217608666, -22.65808010448901, 0.9957981592710666, 0.03669255756308576, 0.2199203484953157],
[0.9868609050530124, 1.973721810106025, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.013314029241316, 0, -4.656456704386963, 1, 0.3333333333333333, 0.2176148289506586],
[0, 2.915682428725443, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2183177304104665],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[0.5993374812628816, 2.088488664625477, 0, 2, 0.2229822349855866, 0, 0.957630287334432, 4.355114199791545, 0.6037566071479942, 1, 0.2198863780380934],
[1.899880279380334, 1.127496450970196, 2, 0, 0.6275665199951355, 1.052697910340078, 0, -4.787463051293278, 1, 0.3938397370188047, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.009342267493079, 2.018684534986158, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9907442026417039, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2198863780380934],
[0.7214471532248682, 1.96454326780867, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2198863780380934],
[1.013552474420043, 2.014474328059194, 2, 0, 0.334723746034937, 1.973257478498492, 0, -8.973986911352199, 1, 0.112039986159661, 0.2198863780380934],
[0.7283755189416097, 1.983409617429566, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2177948013670498],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[0.7514094333688794, 2.277131651229045, 1, 0, 0.2481093742430237, 1.330832373925073, 0, -6.053391825683436, 1, 0.2481093742430237, 0.219849038728766],
[0.5994562822826958, 1.535429187295112, 0, 0, 0.2807908390520094, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[0.8924065174283422, 2.019027389731951, 1, 0, 0.3065178691618533, 1.12056554997123, 0, -5.09697725516873, 1, 0.3065178691618533, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4952879812753612, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.219849038728766],
[1.007779518707704, 2.020111422547423, 0, 1, 0.3328321720497494, 0, 0.4950221996858812, 2.251645959192044, 0.6671678279502506, 1, 0.219849038728766],
[0.595395141608986, 2.432495496518206, 0, 1, 0.1966369373159558, 0, 0.4111004527783781, 1.869921538686209, 0.8033630626840442, 1, 0.219849038728766],
[1.007779084993207, 2.02076199960472, 0, 1, 0.3327605790518775, 0, 0.494862829069237, 2.250921049874425, 0.6672394209481225, 1, 0.219849038728766],
[0.5994562822826958, 2.086990329179332, 0, 0, 0.2231409623869121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4952879812753612, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.219849038728766],
[1.007780004887349, 2.020761079710578, 1, 1, 0.3327608827935523, 0.9922800563122719, 0.494863054341498, -2.262538898723371, 0.8892701948824557, 0.5547919604695604, 0.219849038728766],
[1.007778946567992, 2.017879237132716, 1, 1, 0.3330775934958288, 0.9922810983554644, 0.4955697950591629, -2.259328974865832, 0.8890593167110274, 0.555214503702685, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9905759625507224, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.219849038728766],
[1.007779780589824, 2.020761304008103, 1, 1, 0.3327608087323069, 0.9922802771600847, 0.4948629994134083, -2.262540153110945, 0.8892702441718212, 0.5547918616364348, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.219849038728766],
[0.595395141608986, 2.43225620689753, 0, 1, 0.1966524784641017, 0, 0.4111408975601104, 1.870105504838466, 0.8033475215358983, 1, 0.219849038728766],
[1.009513694865976, 2.019027389731951, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9905759625507224, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.219849038728766],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.2852304154301007, 2.714769584569896, 0, 0, 0.095076805143367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 9.011419547508908, 0.1975308641975309, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964612399431, 2.000320318597613, 1, 1, 0.3064838326425885, 1.131226247893961, 0.4999199331740435, -2.844483032466435, 0.9060676603287099, 0.5190353256138868, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5937901349870808, 2.162597944358008, 0, 1, 0.2154232705607129, 0, 0.4624068022486082, 2.083470848342096, 0.7845767294392871, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9948488034823619, 2.003220010860737, 0, 1, 0.3318298761932659, 0, 0.4991962912602513, 2.249233608553288, 0.6681701238067341, 1, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.161556492711406, 0, 0, 0.2155094922629874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9982817446049963, 2.001718255395002, 0, 1, 0.3327605815349989, 0, 0.4995708048846606, 2.250921058251194, 0.667239418465001, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.661129437990125, 0, 0, 0.3757802930304928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.999519290215787, 2.000320273893667, 1, 1, 0.3331909153323367, 1.000480940977246, 0.4999199443464513, -2.255382574879643, 0.8889838139399997, 0.5553656446046731, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5960088957737651, 2.403991104226232, 1, 1, 0.1986696319245886, 1.677827306087027, 0.4159749169795152, -5.685540642637122, 0.9605303773509486, 0.3578696412001255, 0.2219406153998096],
[0.899172712724992, 2.034335137577339, 1, 0, 0.3065179159593256, 1.112133393115818, 0, -5.096976133036717, 1, 0.3065179159593256, 0.2181947421545453],
[0.9995191835803685, 2.00048081641963, 0, 2, 0.3331730611934563, 0, 0.9997596495724009, 4.504626824483693, 0.4446581663181061, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.252854886877227, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 1, 0.1965947051657818, 0, 0.4149005931086334, 1.869421657506089, 0.8034052948342183, 1, 0.2219406153998096],
[1.877935369491637, 1.11690874451325, 1, 0, 0.6270561331422182, 0.5324996888847688, 0, -2.399289052729308, 1, 0.6270561331422182, 0.2219406153998096],
[0.5938069838292587, 2.161556492711406, 0, 0, 0.2155094922629874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.88523377103741, 0, 0, 0.3465923662887258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964619743742, 2.116003538025624, 1, 0, 0.2946654873247916, 1.131226246954129, 0, -5.096977157228787, 1, 0.2946654873247916, 0.2219406153998096],
[1.301052029494242, 1.291524585482984, 1, 1, 0.5018374469545507, 0.7686087699265418, 0.7742787177574604, 0.02554713935844763, 0.7481591768341385, 0.7518340707432399, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3333333333333333, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114766228962587, 0, 0, 0.2950779236791371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5943136877654203, 2.066815750224704, 1, 0, 0.2233313717405226, 1.682613105816111, 0, -7.581366316322984, 1, 0.2233313717405225, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9995193285189481, 2.000320248374106, 0, 1, 0.3331909266808708, 0, 0.4999199507242987, 2.252494208073317, 0.6668090733191292, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5910217048782089, 2.408978295121788, 1, 0, 0.1970072349594031, 1.691985238014345, 0, -7.623594423969485, 1, 0.1970072349594032, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2277348571134016, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.7142628499630781, 1.400503378999509, 1, 0, 0.3377502629751491, 1.400044815506914, 0, -6.308195608923749, 1, 0.3377502629751491, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.946359853420227, 0, 0, 0.2685963239389602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964603870631, 2.116003539612935, 1, 0, 0.2946654867956879, 1.131226248985368, 0, -5.09697716638096, 1, 0.2946654867956879, 0.2219406153998096],
[0, 1.812386032341483, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8852337710374109, 2.114285456422925, 0, 1, 0.2951252197129371, 0, 0.4729730306577714, 2.131079206956985, 0.704874780287063, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 2.040593891970766, 0, 0, 0.2594102704254779, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8857145485237541, 2.114285451476245, 0, 1, 0.2952381828412515, 0, 0.4729730317643609, 2.131079211942956, 0.7047618171587485, 1, 0.2219406153998096],
[0.5897841154973448, 2.410215884502652, 0, 0, 0.1965947051657818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.252854886877227, 0.6666666666666667, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.714769584569899, 1.941755537626774, 0, 1, 0.2690618577620897, 0, 0.514997887541604, 2.320431015359101, 0.7309381422379103, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.5955086011993349, 2.06704042799883, 0, 1, 0.2236610836716401, 0, 0.4837834744084484, 2.179787929023033, 0.7763389163283598, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2219406153998096],
[0.8839964616643344, 2.116003538335664, 1, 0, 0.2946654872214449, 1.131226247350879, 0, -5.096977159016426, 1, 0.2946654872214449, 0.2219406153998096],
[0.9989752994234327, 1.662548853437021, 0, 1, 0.3753395581061292, 0, 0.6014860844135074, 2.710121729319236, 0.6246604418938708, 1, 0.2219406153998096],
[0.9999999999999997, 1.998580721329582, 1, 0, 0.3334911056043193, 1, 0, -4.505709773754454, 1, 0.3334911056043193, 0.2219406153998096]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node123":{
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node127":{
"Global MG94xREV":0.001859190231856921,
"Nucleotide GTR":0.00185389941983579,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node132":{
"Global MG94xREV":0.002444194377532903,
"Nucleotide GTR":0.002437238783224667,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node133":{
"Global MG94xREV":0.00202026690449394,
"Nucleotide GTR":0.002014517706675971,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "V", "-", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GTG", "---", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node137":{
"Global MG94xREV":0.00186031427090279,
"Nucleotide GTR":0.001855020260134601,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node140":{
"Global MG94xREV":0.001858944275223511,
"Nucleotide GTR":0.001853654163136305,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.001178690611810212,
"Nucleotide GTR":0.001175336339422534,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node26":{
"Global MG94xREV":0.001858796906357923,
"Nucleotide GTR":0.001853507213647363,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node42":{
"Global MG94xREV":0.001857747921565182,
"Nucleotide GTR":0.00185246121401518,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node49":{
"Global MG94xREV":0.001859476112683295,
"Nucleotide GTR":0.00185418448711351,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node59":{
"Global MG94xREV":0.001857200945416387,
"Nucleotide GTR":0.001851915794430066,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node87":{
"Global MG94xREV":0.000904266042635811,
"Nucleotide GTR":0.0009016927171273741,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859387657484939,
"Nucleotide GTR":0.001854096283637555,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAA", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003725092192383486,
"Nucleotide GTR":0.003714491468362039,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTA", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003729586018248515,
"Nucleotide GTR":0.003718972505870344,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "V", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "GTA", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002091576671043586,
"Nucleotide GTR":0.002085624542635931,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413747_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002054237361716255,
"Nucleotide GTR":0.002048391492078288,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859500243751093,
"Nucleotide GTR":0.001854208549510044,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "G", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GGG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859092614161057,
"Nucleotide GTR":0.001853802079936613,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "V", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GTT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858948891501204,
"Nucleotide GTR":0.00185365876627717,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAT", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859238084543475,
"Nucleotide GTR":0.001853947136345013,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAA", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859502610723154,
"Nucleotide GTR":0.001854210909746268,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAG", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859270016986164,
"Nucleotide GTR":0.001853978977915584,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "R", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "AGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858944442778018,
"Nucleotide GTR":0.001853654330213992,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "V", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GTT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858944442778018,
"Nucleotide GTR":0.001853654330213992,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "F", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "TTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001859387623406032,
"Nucleotide GTR":0.001854096249655629,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "D", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GAC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00374067896157551,
"Nucleotide GTR":0.00373003388132607,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "Q", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGA", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "CAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001858923837284986,
"Nucleotide GTR":0.00185363378335928,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAT", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001881592071618134,
"Nucleotide GTR":0.001876237509303424,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "-", "-", "V", "K", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "---", "---", "GTT", "AAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418897_Washington_20200316_null_55":{
"Global MG94xREV":0.001861431186402119,
"Nucleotide GTR":0.001856133997158774,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418897_Washington_20200316_null_55",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418900_Washington_20200316_null_8212":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418900_Washington_20200316_null_8212",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418902_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001858656499717387,
"Nucleotide GTR":0.001853367206570643,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAT", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418902_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001858290181604882,
"Nucleotide GTR":0.001853001930912125,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "F", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "TTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859090855623008,
"Nucleotide GTR":0.001853800326402941,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0018593888781053,
"Nucleotide GTR":0.001854097500784323,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "F", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTT", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419522_Connecticut_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858530599380291,
"Nucleotide GTR":0.00185324166451588,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "F", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "TTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419522_Connecticut_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860907573947586,
"Nucleotide GTR":0.001855611874780419,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858944442814702,
"Nucleotide GTR":0.001853654330250571,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "D", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAT", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419959_Victoria_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859240440782393,
"Nucleotide GTR":0.001853949485878635,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTA", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419959_Victoria_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420008_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001859238084543475,
"Nucleotide GTR":0.001853947136345013,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "K", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "AAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420008_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420217_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859240440782393,
"Nucleotide GTR":0.001853949485878635,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420217_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001858811302953545,
"Nucleotide GTR":0.001853521569273711,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "C", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "TGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420344_Havelange_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859567838680506,
"Nucleotide GTR":0.001854275952080411,
"amino-acid": [
["M", "E", "R", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGA", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420344_Havelange_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420617_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001859102437889848,
"Nucleotide GTR":0.001853811875709414,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420617_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001340634309302257,
"Nucleotide GTR":0.001336819183771767,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859677969722742,
"Nucleotide GTR":0.001854385769715958,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "C", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "TGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001859102939481662,
"Nucleotide GTR":0.001853812375873816,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00185993378056818,
"Nucleotide GTR":0.00185464085258474,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "V", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GTT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859653192962251,
"Nucleotide GTR":0.001854361063464224,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "D", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GAC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001864161391648592,
"Nucleotide GTR":0.001858856432892215,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "A", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GCC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421668_India_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421668_India_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859603777133592,
"Nucleotide GTR":0.001854311788261226,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAC", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001858657650585685,
"Nucleotide GTR":0.001853368354163843,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "C", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "TGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859525020720089,
"Nucleotide GTR":0.001854233255969697,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATC", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422062_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858907835107442,
"Nucleotide GTR":0.001853617826720117,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "G", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GGT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422062_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859755811239432,
"Nucleotide GTR":0.001854463389714258,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTC", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422092_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859238051785748,
"Nucleotide GTR":0.001853947103680507,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422092_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422295_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859388131212421,
"Nucleotide GTR":0.001854096756016921,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "M", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "ATG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422295_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858912363982774,
"Nucleotide GTR":0.001853622342707349,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "A", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "GCA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0018593888781053,
"Nucleotide GTR":0.001854097500784323,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "I", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "ATT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422357_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858905455888244,
"Nucleotide GTR":0.001853615454271608,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAG", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422357_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00185924335226285,
"Nucleotide GTR":0.001853952389073715,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001858925756247339,
"Nucleotide GTR":0.001853635696860722,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAT", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422418_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859112132575496,
"Nucleotide GTR":0.001853821542806295,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "D", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GAT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422418_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422547_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859092614124123,
"Nucleotide GTR":0.001853802079899782,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "N", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAT", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422547_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858775018506695,
"Nucleotide GTR":0.00185348538808374,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "L", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TTG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001869280609266964,
"Nucleotide GTR":0.001863961082438074,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "I", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "ATT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00185989922153796,
"Nucleotide GTR":0.001854606391901279,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCG", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003721350031815143,
"Nucleotide GTR":0.003710759957090253,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422961_Illinois_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859424562315185,
"Nucleotide GTR":0.001854133083445453,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "S", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "AGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422961_Illinois_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003725598236529801,
"Nucleotide GTR":0.0037149960724274,
"amino-acid": [
["L", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "S", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["TTG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TCA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423213_England_20200325_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001858924474887197,
"Nucleotide GTR":0.001853634419147023,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423213_England_20200325_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001857131949422375,
"Nucleotide GTR":0.001851846994782196,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423295_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423369_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006922515005800767,
"Nucleotide GTR":0.0006902815178972092,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423369_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423388_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859387665150283,
"Nucleotide GTR":0.001854096291281083,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTA", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423388_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859341011271894,
"Nucleotide GTR":0.001854049770168507,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTC", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423459_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001859092614124123,
"Nucleotide GTR":0.001853802079899782,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "C", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "TGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423762_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859506603825406,
"Nucleotide GTR":0.001854214891485102,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTT", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423813_England_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859343929568629,
"Nucleotide GTR":0.001854052680160468,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTC", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423813_England_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423844_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859832211931607,
"Nucleotide GTR":0.001854539572988283,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCA", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423844_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424096_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859351470983013,
"Nucleotide GTR":0.001854060200113782,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCG", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424096_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859092614161057,
"Nucleotide GTR":0.001853802079936613,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "C", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "TGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001857572428155752,
"Nucleotide GTR":0.001852286220018142,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859276188487573,
"Nucleotide GTR":0.001853985131854372,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "S", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "AGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424214_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858956342442779,
"Nucleotide GTR":0.001853666196015141,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "S", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "TCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424214_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003745873245264299,
"Nucleotide GTR":0.00373521338332221,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001859344518775462,
"Nucleotide GTR":0.001854053267690554,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAC", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859268127773392,
"Nucleotide GTR":0.001853977094079062,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "D", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GAT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859092614162624,
"Nucleotide GTR":0.001853802079938173,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "D", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAT", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424518_Reykjavik_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859092614162624,
"Nucleotide GTR":0.001853802079938173,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTT", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424518_Reykjavik_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424650_Li_ge_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001858776296556632,
"Nucleotide GTR":0.001853486662496653,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCT", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424650_Li_ge_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859501325253419,
"Nucleotide GTR":0.001854209627934672,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGG", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424993_Toulouse_20200301_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001859500272757719,
"Nucleotide GTR":0.001854208578434126,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424993_Toulouse_20200301_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001858923363409456,
"Nucleotide GTR":0.001853633310832285,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "Y", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "TAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859092614162624,
"Nucleotide GTR":0.001853802079938173,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "Y", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "TAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425241_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425258_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001858923363409456,
"Nucleotide GTR":0.001853633310832285,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "TTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425258_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425281_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858776296556632,
"Nucleotide GTR":0.001853486662496653,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "C", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "TGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425281_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425293_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001858196120044145,
"Nucleotide GTR":0.00185290813702816,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTG", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425293_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425302_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00185926762478097,
"Nucleotide GTR":0.001853976592518035,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425302_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425413_England_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001859680181542061,
"Nucleotide GTR":0.00185438797524097,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "T", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "ACT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425413_England_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425420_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009536813751406955,
"Nucleotide GTR":0.0009509674253804924,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Y", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "TAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425420_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425430_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858923363409456,
"Nucleotide GTR":0.001853633310832285,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGT", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425430_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425450_England_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425450_England_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425512_England_20200319_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001859156370928044,
"Nucleotide GTR":0.001853865655267041,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCC", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425512_England_20200319_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859483478453492,
"Nucleotide GTR":0.001854191831922481,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "Y", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "TAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425518_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858923371483653,
"Nucleotide GTR":0.001853633318883505,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAT", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425559_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425625_England_20200328_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425625_England_20200328_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425628_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001858925756263949,
"Nucleotide GTR":0.001853635696877283,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGT", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425628_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001769909773093665,
"Nucleotide GTR":0.001764873031966617,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "V", "-", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GTG", "---", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001859267663353149,
"Nucleotide GTR":0.001853976630980448,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "I", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "ATT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001860114975698354,
"Nucleotide GTR":0.001854821532076783,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "F", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTT", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425951_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001857131949422375,
"Nucleotide GTR":0.001851846994782196,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425951_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425968_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859322874731168,
"Nucleotide GTR":0.001854031685240049,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "S", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "TCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425968_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859240759259413,
"Nucleotide GTR":0.001853949803449346,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "C", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "TGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001858776296556632,
"Nucleotide GTR":0.001853486662496653,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00185915875850476,
"Nucleotide GTR":0.001853868036049287,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAC", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426092_Washington_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001859502610723154,
"Nucleotide GTR":0.001854210909746268,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "G", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "GGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426092_Washington_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426100_Washington_20200325_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001868721669714216,
"Nucleotide GTR":0.001863403733493998,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426100_Washington_20200325_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001859500205742713,
"Nucleotide GTR":0.001854208511609827,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAG", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426179_India_20200302_null_61":{
"Global MG94xREV":0.001858923363409456,
"Nucleotide GTR":0.001853633310832285,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426179_India_20200302_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_178":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_178",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":3577.349559881842,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01558293044187273],
[0.01536908643312142],
[0.01087911524534919],
[0.02432097078141158],
[0.006269211857308705],
[0.006183179682533946],
[0.004376806952170062],
[0.009784637040692587],
[0.009951601985190135],
[0.009815036499644993],
[0.006947642183001249],
[0.01553190665984643],
[0.01276321211664536],
[0.01258806300372673],
[0.008910548374438805],
[0.01992011131178385],
[0.0214574118785403],
[0.02116295256675352],
[0.014980343881039],
[0.03348953454482438],
[0.008632590736247616],
[0.008514125995880929],
[0.006026783590922909],
[0.01347326729380759],
[0.01370317498650541],
[0.01351512679604048],
[0.009566776959023804],
[0.02138715305844076],
[0.0175747110148252],
[0.01733353387102192],
[0.01226966309367761],
[0.02742963107470224],
[0.03519798339532529],
[0.03471496270179816],
[0.02457322896935244],
[0.05493505402693934],
[0.01416059807739277],
[0.01396627268587021],
[0.009886123730172542],
[0.0221010735671482],
[0.0224782060561847],
[0.02216973842164556],
[0.01569300428479297],
[0.0350827332991237],
[0.02882893752419965],
[0.02843331902412278],
[0.0201267235900623],
[0.04499460161236121],
[0.01236792624141128],
[0.01957175360116219],
[0.005045007078356802],
[0.004975774622892867],
[0.003522136842218366],
[0.007873966337873517],
[0.007898429617960997],
[0.005590958606745589],
[0.01249895215264599],
[0.01027090756168626],
[0.0101299602568967],
[0.007170563165555959],
[0.01603026103711019]
],
"Log Likelihood":-1649.716685939622,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.588838340587122, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":138
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":3840.600513231376,
"Equilibrium frequencies": [
[0.250343856160411],
[0.2144833871903223],
[0.2698980860054686],
[0.2652746706437982]
],
"Log Likelihood":-1690.426065744319,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.07146621359732633,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3482244437249932,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1323298792621996,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.558716816833476,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.5385545450819925
},
"display order":0,
"estimated parameters":229
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-16/sequences.leader.compressed.fas",
"number of sequences":112,
"number of sites":180,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_423844_England_20200323_null_1,epi_isl_426179_India_20200302_null_61,epi_isl_422092_Wales_20200327_null_1,epi_isl_425241_England_20200401_null_1,epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2,epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1,epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,epi_isl_421969_England_20200401_null_5,epi_isl_423213_England_20200325_null_10,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_424650_Li_ge_20200404_null_7,epi_isl_425628_England_20200330_null_1,epi_isl_422357_Wales_20200327_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_4,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_424993_Toulouse_20200301_null_15,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_420008_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1,epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2,epi_isl_423762_England_20200324_null_3,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4,epi_isl_425413_England_20200316_null_3,epi_isl_425968_Scotland_20200328_null_1,epi_isl_425281_England_20200330_null_1,epi_isl_421893_England_20200327_null_1,(epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_2)Node59,epi_isl_418897_Washington_20200316_null_55,epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1,epi_isl_420617_ARA_20200323_null_2,epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3,epi_isl_426051_Prague_20200320_null_6,epi_isl_425258_England_20200101_null_2,epi_isl_423388_England_20200330_null_1,epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_4,epi_isl_424214_Washington_20200320_null_1,epi_isl_418900_Washington_20200316_null_8212,epi_isl_422418_Taipei_20200319_null_1,(epi_isl_418768_England_20200318_null_1,epi_isl_423369_England_20200329_null_3)Node147,epi_isl_418902_Minnesota_20200313_null_2,epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1,((epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_424301_Washington_20200324_null_4)Node137,((epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_3)Node133,epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1)Node132,epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1,epi_isl_426307_New_York_20200326_null_178)Node127,(epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_421668_India_20200310_null_3,epi_isl_425293_England_20200319_null_3)Node140,epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_426092_Washington_20200325_null_4,epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1,epi_isl_420217_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_425518_England_20200320_null_1,epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3,epi_isl_419959_Victoria_20200322_null_4,epi_isl_426100_Washington_20200325_null_13,epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1,epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1,epi_isl_425512_England_20200319_null_16,epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1,epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2,epi_isl_423813_England_20200323_null_4,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_423459_England_20200330_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_422961_Illinois_20200313_null_1,epi_isl_419522_Connecticut_20200318_null_1,epi_isl_423804_England_20200324_null_4,epi_isl_424096_England_20200311_null_1,epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2,epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1,epi_isl_422547_New_York_20200320_null_1,(epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1,epi_isl_420344_Havelange_20200305_null_1)Node42,epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_425430_England_20200330_null_1,epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1,(epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1,epi_isl_425625_England_20200328_null_30)Node49,epi_isl_425951_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1,epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1,(epi_isl_413747_China_20200201_null_1,epi_isl_425420_England_20200316_null_1)Node87,epi_isl_422000_England_20200402_null_1,epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2,epi_isl_425559_England_20200323_null_1,epi_isl_422295_Wales_20200325_null_1,epi_isl_424518_Reykjavik_20200321_null_1,epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2,epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_422062_Wales_20200330_null_1,epi_isl_425302_England_20200327_null_3,epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1,(epi_isl_424146_England_20200321_null_1,epi_isl_425450_England_20200331_null_4)Node26,epi_isl_423295_England_20200326_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node127":"test",
"Node132":"test",
"Node133":"test",
"Node137":"test",
"Node140":"test",
"Node147":"test",
"Node26":"test",
"Node42":"test",
"Node49":"test",
"Node59":"test",
"Node87":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"test",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_416366_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417366_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417798_Reykjavik_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418897_Washington_20200316_null_55":"test",
"epi_isl_418900_Washington_20200316_null_8212":"test",
"epi_isl_418902_Minnesota_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419522_Connecticut_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419959_Victoria_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_420008_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420217_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_420344_Havelange_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420617_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":"test",
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421668_India_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_5":"test",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_422062_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422092_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422295_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422357_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422418_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422547_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422961_Illinois_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423213_England_20200325_null_10":"test",
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423369_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423388_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_423813_England_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_423844_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424096_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424214_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_424518_Reykjavik_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424650_Li_ge_20200404_null_7":"test",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":"test",
"epi_isl_424993_Toulouse_20200301_null_15":"test",
"epi_isl_425218_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425258_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_425281_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425293_England_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_425302_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_425413_England_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_425420_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425430_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425450_England_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_425512_England_20200319_null_16":"test",
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425625_England_20200328_null_30":"test",
"epi_isl_425628_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_425951_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_425968_Scotland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_426092_Washington_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_426100_Washington_20200325_null_13":"test",
"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426179_India_20200302_null_61":"test",
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_178":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":4
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":7
}
}
}