{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4916096404976, 580.3081626231713, 1, 0, 0.2671023875592516, 0.004728319963613887, 0, -0.01375754577762091, 1, 0.2671023875592515, 0.001219499633541296],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220854556752071],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9929334187957, 579.805314618662, 0, 1, 0.2677360475907077, 0, 0.001724716857170756, 0.00501824565565689, 0.7322639524092923, 1, 0.001220483509877561],
[211.6305982267327, 579.9679718481163, 0, 1, 0.2673458571390827, 0, 0.001724233144829389, 0.005016838243567444, 0.7326541428609173, 1, 0.001220371928875091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.3271954699555, 1, 0, 0.2672245919051907, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672245919051907, 0.001257976483444369],
[211.6305982267327, 579.9679718481163, 0, 0, 0.2673458571390827, 0, 0, 0, 1, 1, 7.661369620957863e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.0007954350757175552],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003473816275697875],
[211.3321897178884, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2670016747859333, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7329983252140666, 1, 0.001220297479092864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3321897178884, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2670016747859333, 0, 0, 0, 1, 1, 3.912353695850781e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723105, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.001181319154708383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4063171449425, 580.4426613570894, 0, 1, 0.2669780764822948, 0, 0.001722823056565097, 0.005012735442996466, 0.7330219235177051, 1, 0.001220508479607912],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.00122030596874572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1309875290686, 580.6195784962373, 0, 1, 0.266663513218531, 0, 0.001722298105396183, 0.005011208042187527, 0.7333364867814689, 1, 0.001220508489022126],
[211.3807928779006, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669707274431168, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330292725568832, 1, 0.001220305970015701],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4293960379129, 580.2264901234821, 0, 1, 0.2670723476371762, 0, 0.001723464917617227, 0.005014603005444759, 0.7329276523628238, 1, 0.001220247666466133],
[211.5299971323228, 580.1978320802091, 0, 1, 0.2671751444466903, 0, 0.001723550045705368, 0.005014850694598322, 0.7328248555533097, 1, 0.001220118395470941],
[211.9067064472783, 580.0688366482016, 0, 1, 0.2675672352444488, 0, 0.001723933327944795, 0.005015965894710675, 0.7324327647555513, 1, 0.001220591509718053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.1190053425689, 0, 1, 0.2674225949644672, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956017, 0.7325774050355327, 1, 0.001220305981179344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220569380703951],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001221398330629716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001226352198333023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220400655925824],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.1190053425689, 0, 1, 0.2674225949644672, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956017, 0.7325774050355327, 1, 0.001218775339917809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.0012194986227297],
[211.6305982267327, 580.209349320687, 0, 1, 0.2672643617971283, 0, 0.001723515832984778, 0.005014751149078281, 0.7327356382028717, 1, 0.001226107771148145],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 1, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0.001723635182203485, -0.008733412088803225, 0.9285625121034919, 0.4631183572553641, 0.002442627988223902],
[211.75619174266, 580.0435805210088, 1, 1, 0.2674365403481643, 0.00472241208991549, 0.001724008391062231, -0.00872417189703748, 0.9284776968866044, 0.4633507775829334, 0.002441782374486408],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8271424131103, 579.9726298505586, 1, 0, 0.2675261471817801, 0.004720830336509834, 0, -0.01373575391739693, 1, 0.2675261471817801, 0.001220348445090172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723106, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.26708948572656, 0.001220548660819148],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220548648568632],
[211.6305982267327, 579.9439718072856, 0, 1, 0.2673539628965567, 0, 0.001724304499422055, 0.005017045857282802, 0.7326460371034433, 1, 0.001221162008042185],
[211.7798024811549, 580.019969782514, 1, 0, 0.2674663594253123, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253123, 0.001220192757265069],
[211.7311993211426, 580.0685729425262, 0, 1, 0.2674049762805896, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.7325950237194103, 1, 0.001220216711627319],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220236960442701],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220428217184929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.001220569380739478],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001219890762237362],
[211.1305982267327, 580.6691740369361, 0, 1, 0.2666464498002235, 0, 0.001722151002175277, 0.005010780029846734, 0.7333535501997765, 1, 0.001220443895844088],
[211.8804035755648, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2675934131299658, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7324065868700342, 1, 0.001225944739268562],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220734916794115],
[211.8794690996025, 579.9203031640664, 0, 1, 0.2675922329377063, 0, 0.001724374874519763, 0.005017250621054244, 0.7324077670622937, 1, 0.001219744977155757],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001223008113464632],
[211.9929334187958, 580.0065168074818, 0, 1, 0.2676680310298555, 0, 0.001724118559053922, 0.005016504844164786, 0.7323319689701444, 1, 0.00122080371968947],
[211.7025412778696, 580.3470363346313, 0, 2, 0.2672844570108995, 0, 0.003446213859610009, 0.0100271228042739, 0.5368720669378123, 1, 0.002450084669340384],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220499975413404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220737827140245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 5.970621740869459e-07],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001219990418145198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.633245783329, 579.8681179714955, 0, 1, 0.2673820355524801, 0, 0.001724530059521494, 0.005017702148188985, 0.7326179644475199, 1, 0.001220297468906511],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001220118395598672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3794690996025, 580.4203031640664, 0, 1, 0.2669607601619937, 0, 0.001722889420905271, 0.00501292853704572, 0.7330392398380063, 1, 0.00122009861739237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220098617358826],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 581.4489401191312, 0, 2, 0.2666156225988714, 0, 0.003439682940328735, 0.01000812040560513, 0.537852645016041, 1, 0.002445271376035281],
[211.6305982267327, 580.8876212806146, 0, 1, 0.2670356251977255, 0, 0.001721503374087087, 0.005008895687598596, 0.7329643748022745, 1, 0.001220957903070419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2671567189490328, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7328432810509672, 1, 0.001220267258540676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220098617352701],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2673622728475234, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7326377271524767, 1, 0.001220230809654078],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7712998936018, 580.1294627668128, 0, 1, 0.2674215127437808, 0, 0.001723753169216226, 0.005015441703882937, 0.7325784872562192, 1, 0.001220297474846971],
[211.633245783329, 579.8681179714955, 0, 0, 0.2673820355524801, 0, 0, 0, 1, 1, 4.627584249093816e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001174165093588515],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001219742814811095],
[211.2690416393414, 580.9301295299175, 0, 1, 0.2666867743972965, 0, 0.001721377406968355, 0.005008529172976961, 0.7333132256027035, 1, 0.001220297473600715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220191604548062],
[212.2801917834907, 579.8715964734401, 1, 0, 0.2679791864771232, 0.004710755118498867, 0, -0.01370643900764631, 1, 0.2679791864771233, 0.001220339420404565],
[212.2690416393414, 580.329485455135, 0, 1, 0.26781407532699, 0, 0.00172315904165326, 0.005013713027057312, 0.73218592467301, 1, 0.001220591691928788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8807928779006, 580.1186573483769, 0, 1, 0.2675264393395291, 0, 0.001723785276224055, 0.005015535122609546, 0.7324735606604709, 1, 0.001219985411641973],
[211.7686523370055, 580.2293166434335, 0, 1, 0.2673853477296428, 0, 0.001723456521957381, 0.005014578577386684, 0.7326146522703572, 1, 0.001220299180201515],
[211.6305982267327, 579.9679718481163, 0, 1, 0.2673458571390827, 0, 0.001724233144829389, 0.005016838243567444, 0.7326541428609173, 1, 0.001221431189199533],
[211.6305982267327, 579.7181664992843, 0, 1, 0.2674302503018426, 0, 0.001724976131140846, 0.005019000040626585, 0.7325697496981574, 1, 0.001220149861218037],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.001220117810494356],
[211.3182478777044, 580.8809232915545, 0, 1, 0.2667488878659213, 0, 0.001721523224301312, 0.005008953443891105, 0.7332511121340788, 1, 0.001220297479329404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220118391934545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4702438281612, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2670413438139907, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7329586561860093, 1, 0.001220297471928869],
[211.4813939723106, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.00122011839146132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3182478777044, 579.8809232915545, 0, 1, 0.2680111966847049, 0, 0.001724491977290339, 0.005017591343919717, 0.7319888033152951, 1, 0.001220508479382756],
[211.9053959970821, 579.8943762665867, 0, 1, 0.2676249771975405, 0, 0.001724451970784907, 0.005017474940771429, 0.7323750228024595, 1, 0.001220305968062197],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220297476246399],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220118377319491],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3182478777044, 580.8809232915545, 0, 1, 0.2667488878659213, 0, 0.001721523224301312, 0.005008953443891105, 0.7332511121340788, 1, 0.001220293958763227],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220118382545961],
[211.5443712552153, 580.7040061524066, 0, 1, 0.2670177400014706, 0, 0.001722047703141811, 0.005010479470410691, 0.7329822599985294, 1, 0.001220508479589426],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.00122030598047866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2690416393414, 580.9301295299175, 0, 1, 0.2666867743972965, 0, 0.001721377406968355, 0.005008529172976961, 0.7333132256027035, 1, 0.001220302725633623],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220118391391137],
[211.2690416393414, 580.8809232915545, 0, 1, 0.2667033402668543, 0, 0.001721523224301312, 0.005008953443891105, 0.7332966597331457, 1, 0.00122059149343562],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669707274431168, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330292725568832, 1, 0.001220305967844254],
[211.4702438281612, 580.7289273410977, 0, 1, 0.2669407536946023, 0, 0.0017219738038168, 0.005010264452528102, 0.7330592463053978, 1, 0.001220301887007833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220118395168356],
[211.7686523370055, 580.2293166434335, 0, 1, 0.2673853477296428, 0, 0.001723456521957381, 0.005014578577386684, 0.7326146522703572, 1, 0.001220591514857863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.001220305967839815],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.00122029746588971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220118387425087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9178565914277, 580.2813145778313, 0, 1, 0.2675057792330736, 0, 0.001723302086208866, 0.005014129230283221, 0.7324942207669264, 1, 0.001226217248272101],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 0, 1, 0.2670417397781307, 0, 0.001721343214650039, 0.005008429686819491, 0.7329582602218693, 1, 0.001219977023832508],
[211.5955000493466, 578.5324681893073, 1, 3.5, 0.2677990256705295, 0.004725998425140365, 0.006049790102454078, 0.003851711546770476, 0.6507320130783359, 0.7540559269548909, 0.003684794652632946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6815042176278, 580.9170658572211, 0, 1, 0.2670727808626221, 0, 0.001721416117332283, 0.005008641804864801, 0.7329272191373779, 1, 0.001220236959938666],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001221316076238887],
[212.3061053528685, 580.2924647219805, 0, 1, 0.2678608230807423, 0, 0.001723268973480644, 0.005014032885307025, 0.7321391769192578, 1, 0.001219777675053463],
[211.7575021928562, 580.8410678819928, 1, 0, 0.26716866543534, 0.004722382865515949, 0, -0.01374027116433391, 1, 0.26716866543534, 0.001220520629582478],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.00121998028359807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220443896420209],
[211.9080302255765, 580.4407345004404, 0, 1, 0.2674428732136048, 0, 0.00172282877572446, 0.005012752083494012, 0.7325571267863953, 1, 0.001220350640212894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.001220160267551457],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.001220269074694784],
[212.1578355744086, 580.4407345004405, 0, 1, 0.2676737551448944, 0, 0.00172282877572446, 0.00501275208349401, 0.7323262448551056, 1, 0.001220366386455658],
[212.0073075416882, 580.5912625331607, 0, 1, 0.2674838380312336, 0, 0.001722382103438707, 0.005011452443354146, 0.7325161619687663, 1, 0.001219890779058207],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 0, 1, 0.2670417397781307, 0, 0.001721343214650039, 0.005008429686819491, 0.7329582602218693, 1, 0.001220443880148266],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220423463679078],
[212.3061053528684, 580.2924647219805, 1, 0, 0.2678608230807423, 0.004710180135130481, 0, -0.01370476603287455, 1, 0.2678608230807422, 0.001221246706879186],
[211.9067064472784, 581.0510872494099, 0, 1, 0.2672357950596475, 0, 0.00172101906690136, 0.005007486544746727, 0.7327642049403525, 1, 0.001219980286758843],
[212.0447605575512, 580.9532084228879, 0, 1, 0.2673963475974321, 0, 0.001721309023690044, 0.005008330204614198, 0.7326036524025679, 1, 0.001221035303640275],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 1, 1, 0.2670417397781307, 0.004724627426794263, 0.001721343214650039, -0.00873837226535761, 0.9286887092162691, 0.4627721887725306, 0.002442622623465475],
[211.8061053528685, 580.7205216708436, 0, 1, 0.267254245006624, 0, 0.001721998728618733, 0.005010336973868923, 0.732745754993376, 1, 0.001220423464765019],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220443896576979],
[212.0559107017005, 580.5426593731485, 1, 0, 0.2675451593127086, 0.00471573745193409, 0, -0.01372093563241831, 1, 0.2675451593127085, 0.001220348434057139],
[211.9067064472784, 580.4420582787386, 0, 1, 0.2674412025120689, 0, 0.001722824846575439, 0.005012740651220406, 0.7325587974879311, 1, 0.001219980283627995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220944118616313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001219969583283668],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 0, 1, 0.2670417397781307, 0, 0.001721343214650039, 0.005008429686819491, 0.7329582602218693, 1, 0.001221653460403117],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.001220223984917698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220614121265227],
[211.7686523370055, 581.0535458116224, 0, 1, 0.2671073701411498, 0, 0.001721011784900458, 0.005007465356996843, 0.7328926298588503, 1, 0.001221396025763524],
[211.6305982267327, 580.7922010163052, 0, 1, 0.2670677805193047, 0, 0.001721786205548456, 0.00500971861557451, 0.7329322194806953, 1, 0.001221778835590106],
[211.4813939723105, 580.9414052707273, 1, 0, 0.2668794918247282, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2668794918247281, 0.001221305736753428],
[211.6305982267327, 580.4806875266207, 0, 1, 0.2671728102263524, 0, 0.001722710197751652, 0.005012407068372008, 0.7328271897736476, 1, 0.001221310094490342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0447605575512, 580.8728578553862, 0, 1, 0.2674234442942117, 0, 0.001721547127700292, 0.005009022993352275, 0.7325765557057883, 1, 0.001220508479781051],
[211.7686523370055, 580.3903435485026, 0, 1, 0.2673309947080532, 0, 0.001722978356059487, 0.005013187303259679, 0.7326690052919469, 1, 0.001220589748394608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.0192362905093, 581.1397595949987, 0, 2, 0.26638495224639, 0, 0.003441512935535192, 0.01001344496972503, 0.5381910382905316, 1, 0.002443615187793439],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220400536058805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4702438281612, 580.7289273410977, 0, 1, 0.2669407536946023, 0, 0.0017219738038168, 0.005010264452528102, 0.7330592463053978, 1, 0.001220297479746936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220364053057585],
[211.9067064472783, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220511936010794],
[211.7575021928562, 580.8410678819927, 1, 0, 0.26716866543534, 0.004722382865515949, 0, -0.01374027116433391, 1, 0.26716866543534, 0.001220337486488093],
[212.0456950335135, 580.46498962543, 1, 0, 0.2675619384548326, 0.004715964640743834, 0, -0.01372159666222895, 1, 0.2675619384548326, 0.001221746662740673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220305975411244],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2671567189490328, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7328432810509672, 1, 0.001220196963782147],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220030026035868],
[209.1014694486597, 570.8327555360198, 1.5, 3.5, 0.26810141515814, 0.007173550735702946, 0.006131393067507929, -0.003032267684510365, 0.7355764720014963, 0.597654856520294, 0.002461908434824628],
[211.7325230994408, 579.817443815396, 1, 1, 0.267491039036606, 0.004722939987497089, 0.001724680777831829, -0.008723751490501214, 0.9284485440351169, 0.463430622108329, 0.002474900663762454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001220758349853012],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 4.205569400779498e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001178386220905641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001221000831289906],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220307126536606],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0313209106209, 579.5186460042158, 1, 0, 0.2678685234957928, 0.004716284347544753, 0, -0.01372252688289568, 1, 0.2678685234957927, 0.0007471378125777015],
[211.633245783329, 579.6669157826757, 0, 0, 0.2674500222071243, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000472737790781419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3821166561988, 579.918044909806, 0, 1, 0.2671326595433365, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7328673404566635, 1, 0.001220400652939174],
[211.133245783329, 580.1669157826757, 0, 1, 0.2668181507324484, 0, 0.001723641891318376, 0.00501511792909919, 0.7331818492675517, 1, 0.00122035315913073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9540597073357, 579.346101858669, 0, 1, 0.2678554485416416, 0, 0.001726083936340956, 0.005022223316731097, 0.7321445514583584, 1, 0.001220132126677631],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001220197052454953],
[211.1323113073667, 580.4176556074701, 0, 1, 0.2667327649955957, 0, 0.001722897279810331, 0.005012951403359119, 0.7332672350044043, 1, 0.001219924387056778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1309875290686, 580.6687847346002, 0, 1, 0.2666469414678767, 0, 0.001722152156770505, 0.005010783389263361, 0.7333530585321233, 1, 0.001220538246866271],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220118388025092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5299971323228, 580.269775131346, 0, 1, 0.2671508688712826, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.7328491311287174, 1, 0.001220727544768332],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220460259298548],
[211.2375098539775, 580.5622624096914, 0, 1, 0.2667814733642479, 0, 0.001722468139505629, 0.005011702774367765, 0.733218526635752, 1, 0.001219964952918732],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4340540403551, 580.3657182233137, 1, 0, 0.267029697970092, 0.004729607085002193, 0, -0.01376129079309305, 1, 0.2670296979700919, 0.001220088712826105],
[211.4823284482729, 579.918044909806, 0, 1, 0.2672254595368823, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7327745404631176, 1, 0.001220855019118258],
[211.3807928779006, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669707274431168, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330292725568832, 1, 0.001220460260912176],
[211.6319220050308, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.00122072754445402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1322535224142, 578.4260911370476, 0.5, 1, 0.267405512145497, 0.002368183883126691, 0.001728829344530844, -0.00186026948272326, 0.7986980835784809, 0.3729596768216003, 0.001222116069762469],
[211.4813939723106, 580.3657182233137, 1, 0, 0.2670735180001067, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670735180001067, 0.001219733454632602],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.001220353181453738],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220118392003126],
[212.1639116046898, 579.9909898946937, 5, 13, 0.2678313435959405, 0.02356668465519316, 0.02241414129960941, -0.003353446487791672, 0.654105942597578, 0.5510722445649724, 0.0224304904599006],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220400536270949],
[211.5299971323228, 580.269775131346, 0, 1, 0.2671508688712826, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.7328491311287174, 1, 0.001220400537278321],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3817273538629, 580.3301594939004, 0, 1, 0.2669932469947986, 0, 0.001723157040247726, 0.005013707203756758, 0.7330067530052014, 1, 0.001221314131915704],
[211.3794690996025, 580.4203031640664, 0, 1, 0.2669607601619937, 0, 0.001722889420905271, 0.00501292853704572, 0.7330392398380063, 1, 0.001220037260960681],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.001220098810297784],
[211.4548273949216, 580.8876212806146, 0, 0, 0.2668730266166924, 0, 0, 0, 1, 1, 1.86758276744076e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5427128108272, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2670754052441174, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7329245947558827, 1, 0.00120257691753216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220098617393058],
[211.4293960379129, 580.298433174619, 0, 2, 0.2670480791968683, 0, 0.00344650249882404, 0.01002796263051891, 0.5372185182090001, 1, 0.002442364842943744],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004520242898675009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.0007675940092779677],
[211.6292744484346, 580.3197020696565, 0, 1, 0.2672258955102017, 0, 0.00172318809172529, 0.005013797551306699, 0.7327741044897983, 1, 0.001220684879496038],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001226171875330194],
[211.4813939723106, 580.3657182233137, 1, 0, 0.2670735180001067, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670735180001067, 0.001220715613415861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220513938061641],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220067140393196],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220423601751347],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001219888200728422],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220589744727788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1676619402598, 579.6567134425907, 1, 0, 0.267947879020112, 0.004713253616762629, 0, -0.01371370865193932, 1, 0.267947879020112, 0.00122068487918808],
[211.6305982267327, 580.209349320687, 0, 1, 0.2672643617971283, 0, 0.001723515832984778, 0.005014751149078281, 0.7327356382028717, 1, 0.001225869933924369],
[211.5299971323228, 580.269775131346, 0, 1, 0.2671508688712826, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.7328491311287174, 1, 0.001220640733600523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0559107017005, 579.9196323937795, 1, 0, 0.267755630272203, 0.00471573745193409, 0, -0.01372093563241831, 1, 0.2677556302722031, 0.001220016251677007],
[211.7686523370055, 580.1190053425688, 0, 1, 0.2674225949644673, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956019, 0.7325774050355327, 1, 0.00122058974854184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2059565220519, 581.0486067375789, 0, 1, 0.266588501116449, 0, 0.001721026413977159, 0.005007507921838891, 0.7334114988835509, 1, 0.001222324063678598],
[211.5427128108272, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2670754052441174, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7329245947558827, 1, 0.00122078138362715],
[211.7904266937752, 579.6978320802091, 1, 0, 0.2675850517629139, 0.00472164873366012, 0, -0.01373813513024758, 1, 0.2675850517629139, 0.001219862630888458],
[211.4813939723105, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.001220727544634053],
[211.6305982267327, 580.1445709177547, 0, 1, 0.2672862278004998, 0, 0.001723708279158863, 0.005015311091525087, 0.7327137721995002, 1, 0.001219954791591911],
[211.4813939723106, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.0012207275448673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220460260912176],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.00122072754445402],
[211.6305982267327, 579.8978358310025, 0, 1, 0.2673695462105106, 0, 0.00172444168301988, 0.005017445007433711, 0.7326304537894894, 1, 0.001219661808922207],
[211.8807928779006, 580.1186573483769, 0, 1, 0.2675264393395291, 0, 0.001723785276224055, 0.005015535122609546, 0.7324735606604709, 1, 0.001220460259298548],
[211.7798024811549, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2674159684027536, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674159684027535, 0.00122068487918808],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220460248991173],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220727544608803],
[212.0299971323228, 579.7697751313461, 0, 1, 0.2677823416469952, 0, 0.001724822581124466, 0.005018553270654216, 0.7322176583530048, 1, 0.001226171875347468],
[211.4340540403551, 580.3657182233137, 1, 0, 0.267029697970092, 0.004729607085002193, 0, -0.01376129079309305, 1, 0.2670296979700919, 0.001220727544612232],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001220459992566082],
[211.6305982267327, 580.269775131346, 0, 1, 0.267243968239725, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.732756031760275, 1, 0.001220684879525391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7798024811549, 580.0199697825141, 1, 0, 0.2674663594253122, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253122, 0.001220746722776696],
[212.1190587802475, 580.0399371052607, 0, 2, 0.267773338284358, 0, 0.003448038440217017, 0.01003243161404545, 0.5361558841272334, 1, 0.002453379012559671],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.00122032665090526],
[211.7788680051926, 580.1087896743818, 0, 1, 0.2674354953652855, 0, 0.001723814597881383, 0.00501562043706501, 0.7325645046347145, 1, 0.001219862630792191],
[211.6305982267327, 579.9439718072856, 0, 1, 0.2673539628965567, 0, 0.001724304499422055, 0.005017045857282802, 0.7326460371034433, 1, 0.001220968040637757],
[211.6565251242124, 580.1432471394565, 1, 0, 0.2673106668357703, 0.004724635819345242, 0, -0.0137468263711896, 1, 0.2673106668357703, 0.0012228366985104],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220968040637757],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220810387426113],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6676619402598, 580.1567134425907, 0, 1, 0.2673164258651643, 0, 0.001723672202405626, 0.005015206122405401, 0.7326835741348356, 1, 0.001225387957701704],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001219848035123244],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001220727830662755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.2847677735199, 575.684938825037, 1.25, 1.25, 0.2675481841196779, 0.005944320234104023, 0.002171326563712485, -0.01097792313940881, 0.9071456203572053, 0.4360357764970108, 0.001224094447352959],
[211.7798024811549, 580.019969782514, 1, 0, 0.2674663594253123, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253123, 0.00122068487918808],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220460260859602],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220460259298548],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001220727544612232],
[211.8804035755648, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2675934131299658, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7324065868700342, 1, 0.001219661798952829],
[211.4916096404976, 580.5333648528218, 1, 0, 0.2670264403919772, 0.004728319963613887, 0, -0.01375754577762091, 1, 0.2670264403919772, 0.001219657822059577],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707913, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292087, 1, 0.001220460259333258],
[211.6305982267327, 580.5283976587754, 1, 0, 0.2671567189490328, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2671567189490328, 0.001219862630793532],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220727555724727],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001219955080369897],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001219657822070394],
[211.6592562700057, 580.1405159936631, 0, 1, 0.2673141161242003, 0, 0.001723720327112825, 0.005015346146318211, 0.7326858838757997, 1, 0.001219665523891456],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220324064874634],
[211.6296637507704, 580.5695074184885, 0, 2, 0.2671419908688017, 0, 0.003444893289165378, 0.01002328046524346, 0.5370808615477435, 1, 0.002440825350496676],
[211.9929334187958, 580.0065168074818, 0, 1, 0.2676680310298555, 0, 0.001724118559053922, 0.005016504844164786, 0.7323319689701444, 1, 0.001220460169103744],
[211.6305982267327, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2672019254975119, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.732798074502488, 1, 0.001219657822070394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2311993211426, 580.5685729425262, 1, 0, 0.2667735035048769, 0.004734149137124686, 0, -0.01377450637293545, 1, 0.2667735035048769, 0.001220460131762838],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220684879350103],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220640744179945],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001221314130950804],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220204483158635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220968040637757],
[211.6319220050308, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350585, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649415, 1, 0.001220460111497418],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220968040605353],
[211.7686523370055, 580.1190053425689, 0, 1, 0.2674225949644672, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956017, 0.7325774050355327, 1, 0.00122046027131603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2673622728475234, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7326377271524767, 1, 0.001220460250773805],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220684879496038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.269775131346, 0, 1, 0.267243968239725, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.732756031760275, 1, 0.00121965991871248],
[211.3794690996025, 580.4203031640664, 0, 1, 0.2669607601619937, 0, 0.001722889420905271, 0.00501292853704572, 0.7330392398380063, 1, 0.001219929258639003],
[210.6305982267327, 581.1691740369362, 1, 0, 0.2660149770245107, 0.004747648292407891, 0, -0.01381378358940917, 1, 0.2660149770245107, 0.001287477939977857],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1305982267327, 580.6691740369362, 0, 1, 0.2666464498002234, 0, 0.001722151002175277, 0.005010780029846733, 0.7333535501997765, 1, 0.001220145215712207],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220982483340668],
[211.7798024811549, 580.019969782514, 1, 0, 0.2674663594253123, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253123, 0.001220671928178281],
[211.1309875290686, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2667310926080605, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7332689073919395, 1, 0.001235240774190171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.00122087533592612],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0299971323228, 579.769775131346, 1, 0, 0.2677823416469952, 0.004716313792976775, 0, -0.01372261255748668, 1, 0.2677823416469952, 0.001223825838472523],
[211.2325230994408, 580.317443815396, 1, 0, 0.2668593669743244, 0.004734119468568936, 0, -0.01377442004914242, 1, 0.2668593669743244, 0.001220727555629774],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.9303884185995, 580.8693838450693, 0, 1, 0.2663935957136899, 0, 0.001721557423771404, 0.005009052950857422, 0.7336064042863101, 1, 0.001220480734569079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220216464925266],
[210.954991537781, 580.8447807258877, 0, 1, 0.2664246681136114, 0, 0.001721630344599619, 0.005009265121700349, 0.7335753318863887, 1, 0.001220064529376215],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001219885237313533]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2"],
["epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2"],
["Node536"],
["epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115"],
["epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1"],
["Node461"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["Node460"],
["epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15"],
["Node458"],
["epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6"],
["Node439"],
["epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1"],
["Node438"],
["epi_isl_424155_England_20200320_null_19"],
["epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1"],
["epi_isl_423919_England_20200320_null_1"],
["Node434"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_425325_England_20200329_null_1"],
["Node431"],
["epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423926_England_20200318_null_1"],
["Node428"],
["epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1"],
["Node425"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424013_England_20200321_null_9"],
["Node413"],
["epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2"],
["epi_isl_423840_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1"],
["Node409"],
["epi_isl_420518_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1"],
["Node406"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423957_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_418698_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_420685_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1"],
["epi_isl_425627_England_20200329_null_4"],
["Node401"],
["epi_isl_423998_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_423995_England_20200321_null_2"],
["epi_isl_424037_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1183"],
["epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424021_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_422006_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1"],
["epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_423047_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_421893_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423914_England_20200318_null_1"],
["Node377"],
["epi_isl_426107_Washington_20200325_null_5"],
["epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1"],
["epi_isl_418713_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_423080_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_423341_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423846_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422436_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423663_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425928_Scotland_20200324_null_20"],
["Node417"],
["epi_isl_423647_England_20200322_null_1"],
["Node334"],
["epi_isl_423364_England_20200328_null_1"],
["Node333"],
["epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1"],
["Node422"],
["epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_423505_England_20200330_null_7"],
["Node315"],
["epi_isl_418728_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424103_England_20200313_null_3"],
["Node305"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1"],
["epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2"],
["epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_77"],
["Node308"],
["epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["Node301"],
["epi_isl_423726_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_424282_Washington_20200323_null_1"],
["Node298"],
["epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_426124_Washington_20200323_null_1"],
["Node285"],
["epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1"],
["Node284"],
["epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2"],
["epi_isl_422731_Netherlands_20200323_null_1"],
["epi_isl_424978_Taoyuan_20200318_null_1"],
["Node279"],
["epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3"],
["Node274"],
["epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1"],
["epi_isl_421858_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_421990_England_20200331_null_1"],
["Node269"],
["epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_425876_Scotland_20200321_null_2"],
["Node266"],
["epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_423187_England_20200329_null_3"],
["Node263"],
["epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1"],
["Node146"],
["epi_isl_420669_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426056_Connecticut_20200330_null_1"],
["Node149"],
["epi_isl_421854_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["Node260"],
["epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2"],
["epi_isl_425609_England_20200325_null_4"],
["Node257"],
["epi_isl_423586_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2"],
["Node254"],
["epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1"],
["epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5"],
["Node251"],
["epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2"],
["Node248"],
["epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2"],
["Node245"],
["epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_424258_Washington_20200322_null_1"],
["Node242"],
["epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1"],
["epi_isl_423651_England_20200321_null_4"],
["Node239"],
["epi_isl_423619_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1"],
["epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1"],
["epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1"],
["epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_422532_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_426051_Prague_20200320_null_1453"],
["epi_isl_425643_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_420704_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1"],
["epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1"],
["epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1"],
["epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1"],
["epi_isl_424341_Washington_20200324_null_3"],
["epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1"],
["epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_424136_England_20200320_null_3"],
["epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1"],
["epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_423633_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_423863_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_423562_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423564_England_20200401_null_1"],
["Node223"],
["epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_68"],
["Node222"],
["epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2"],
["epi_isl_423558_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424012_England_20200320_null_28"],
["Node229"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["Node161"],
["epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_418730_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1"],
["Node234"],
["epi_isl_423897_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424106_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1"],
["Node291"],
["epi_isl_421891_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423517_England_20200330_null_1"],
["Node294"],
["epi_isl_423821_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["epi_isl_423960_England_20200319_null_2"],
["epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_425431_England_20200330_null_1"],
["Node453"],
["epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_423175_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17"],
["Node445"],
["epi_isl_421872_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1"],
["epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_423712_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1"],
["epi_isl_425639_England_20200330_null_3"],
["Node521"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2"],
["Node520"],
["epi_isl_423203_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_421932_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1"],
["Node516"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1"],
["Node489"],
["epi_isl_423340_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423567_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423670_England_20200320_null_12"],
["epi_isl_423952_England_20200319_null_3"],
["Node504"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_156"],
["epi_isl_423431_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423363_England_20200329_null_1"],
["Node488"],
["epi_isl_425602_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423540_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_420689_England_20200328_null_4"],
["epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1"],
["Node509"],
["epi_isl_423575_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425611_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_426015_Scotland_20200331_null_29"],
["Node25"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_10"],
["epi_isl_423309_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423166_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_425987_Scotland_20200330_null_10"],
["epi_isl_423319_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_425632_England_20200330_null_3"],
["epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_424117_England_20200312_null_2"],
["Node120"],
["epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2"],
["epi_isl_423239_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_4"],
["epi_isl_424115_England_20200312_null_6"],
["epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3"],
["Node529"],
["epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_424122_England_20200312_null_1"],
["Node532"],
["epi_isl_421830_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423542_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424574_Reykjavik_20200327_null_3"],
["Node540"],
["epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1"],
["epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26"],
["epi_isl_423291_England_20200326_null_1"],
["Node107"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2"],
["Node106"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5"],
["epi_isl_423572_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2"],
["epi_isl_425174_Wisconsin_20200330_null_6"],
["Node549"],
["epi_isl_420671_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423396_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_6"],
["Node555"],
["epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1"],
["epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5"],
["epi_isl_423389_England_20200330_null_3"],
["Node567"],
["epi_isl_423005_Washington_20200319_null_5"],
["epi_isl_424296_Washington_20200323_null_3"],
["Node572"],
["epi_isl_423876_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3"],
["epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2"],
["epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1"],
["epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_423561_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2"],
["epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1"],
["epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423922_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1"],
["epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1"],
["epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_423511_England_20200401_null_9"],
["epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_418738_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2"],
["epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1"],
["epi_isl_421663_India_20200310_null_1"],
["Node616"],
["epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425608_England_20200325_null_4"],
["epi_isl_425228_Prague_20200322_null_1"],
["epi_isl_425373_England_20200319_null_3"],
["epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2"],
["epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1"],
["epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_3"],
["epi_isl_423410_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1"],
["epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1"],
["epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2"],
["epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29"],
["epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2"],
["epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1"],
["epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1"],
["epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2"],
["epi_isl_423338_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_425439_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_4"],
["epi_isl_421993_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2"],
["epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_423802_England_20200223_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_425280_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node80"],
["epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1"],
["epi_isl_413752_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2"],
["Node75"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1"],
["Node88"],
["epi_isl_426364_Mexico_City_20200312_null_5157"],
["epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1"],
["epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_423290_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_421972_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_426016_Scotland_20200331_null_26"],
["Node96"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["Node99"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4916096404976, 580.3081626231713, 1, 0, 0.2671023875592516, 0.004728319963613887, 0, -0.01375754577762091, 1, 0.2671023875592515, 0.001219499633541296],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220854556752071],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9929334187957, 579.805314618662, 0, 1, 0.2677360475907077, 0, 0.001724716857170756, 0.00501824565565689, 0.7322639524092923, 1, 0.001220483509877561],
[211.6305982267327, 579.9679718481163, 0, 1, 0.2673458571390827, 0, 0.001724233144829389, 0.005016838243567444, 0.7326541428609173, 1, 0.001220371928875091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.3271954699555, 1, 0, 0.2672245919051907, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672245919051907, 0.001257976483444369],
[211.6305982267327, 579.9679718481163, 0, 0, 0.2673458571390827, 0, 0, 0, 1, 1, 7.661369620957863e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.0007954350757175552],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003473816275697875],
[211.3321897178884, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2670016747859333, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7329983252140666, 1, 0.001220297479092864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3321897178884, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2670016747859333, 0, 0, 0, 1, 1, 3.912353695850781e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723105, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.001181319154708383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4063171449425, 580.4426613570894, 0, 1, 0.2669780764822948, 0, 0.001722823056565097, 0.005012735442996466, 0.7330219235177051, 1, 0.001220508479607912],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.00122030596874572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1309875290686, 580.6195784962373, 0, 1, 0.266663513218531, 0, 0.001722298105396183, 0.005011208042187527, 0.7333364867814689, 1, 0.001220508489022126],
[211.3807928779006, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669707274431168, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330292725568832, 1, 0.001220305970015701],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4293960379129, 580.2264901234821, 0, 1, 0.2670723476371762, 0, 0.001723464917617227, 0.005014603005444759, 0.7329276523628238, 1, 0.001220247666466133],
[211.5299971323228, 580.1978320802091, 0, 1, 0.2671751444466903, 0, 0.001723550045705368, 0.005014850694598322, 0.7328248555533097, 1, 0.001220118395470941],
[211.9067064472783, 580.0688366482016, 0, 1, 0.2675672352444488, 0, 0.001723933327944795, 0.005015965894710675, 0.7324327647555513, 1, 0.001220591509718053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.1190053425689, 0, 1, 0.2674225949644672, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956017, 0.7325774050355327, 1, 0.001220305981179344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220569380703951],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001221398330629716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001226352198333023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220400655925824],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.1190053425689, 0, 1, 0.2674225949644672, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956017, 0.7325774050355327, 1, 0.001218775339917809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.0012194986227297],
[211.6305982267327, 580.209349320687, 0, 1, 0.2672643617971283, 0, 0.001723515832984778, 0.005014751149078281, 0.7327356382028717, 1, 0.001226107771148145],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 1, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0.001723635182203485, -0.008733412088803225, 0.9285625121034919, 0.4631183572553641, 0.002442627988223902],
[211.75619174266, 580.0435805210088, 1, 1, 0.2674365403481643, 0.00472241208991549, 0.001724008391062231, -0.00872417189703748, 0.9284776968866044, 0.4633507775829334, 0.002441782374486408],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8271424131103, 579.9726298505586, 1, 0, 0.2675261471817801, 0.004720830336509834, 0, -0.01373575391739693, 1, 0.2675261471817801, 0.001220348445090172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723106, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.26708948572656, 0.001220548660819148],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220548648568632],
[211.6305982267327, 579.9439718072856, 0, 1, 0.2673539628965567, 0, 0.001724304499422055, 0.005017045857282802, 0.7326460371034433, 1, 0.001221162008042185],
[211.7798024811549, 580.019969782514, 1, 0, 0.2674663594253123, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253123, 0.001220192757265069],
[211.7311993211426, 580.0685729425262, 0, 1, 0.2674049762805896, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.7325950237194103, 1, 0.001220216711627319],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220236960442701],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220428217184929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.001220569380739478],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001219890762237362],
[211.1305982267327, 580.6691740369361, 0, 1, 0.2666464498002235, 0, 0.001722151002175277, 0.005010780029846734, 0.7333535501997765, 1, 0.001220443895844088],
[211.8804035755648, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2675934131299658, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7324065868700342, 1, 0.001225944739268562],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220734916794115],
[211.8794690996025, 579.9203031640664, 0, 1, 0.2675922329377063, 0, 0.001724374874519763, 0.005017250621054244, 0.7324077670622937, 1, 0.001219744977155757],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001223008113464632],
[211.9929334187958, 580.0065168074818, 0, 1, 0.2676680310298555, 0, 0.001724118559053922, 0.005016504844164786, 0.7323319689701444, 1, 0.00122080371968947],
[211.7025412778696, 580.3470363346313, 0, 2, 0.2672844570108995, 0, 0.003446213859610009, 0.0100271228042739, 0.5368720669378123, 1, 0.002450084669340384],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220499975413404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220737827140245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 5.970621740869459e-07],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001219990418145198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.633245783329, 579.8681179714955, 0, 1, 0.2673820355524801, 0, 0.001724530059521494, 0.005017702148188985, 0.7326179644475199, 1, 0.001220297468906511],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001220118395598672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3794690996025, 580.4203031640664, 0, 1, 0.2669607601619937, 0, 0.001722889420905271, 0.00501292853704572, 0.7330392398380063, 1, 0.00122009861739237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220098617358826],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 581.4489401191312, 0, 2, 0.2666156225988714, 0, 0.003439682940328735, 0.01000812040560513, 0.537852645016041, 1, 0.002445271376035281],
[211.6305982267327, 580.8876212806146, 0, 1, 0.2670356251977255, 0, 0.001721503374087087, 0.005008895687598596, 0.7329643748022745, 1, 0.001220957903070419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2671567189490328, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7328432810509672, 1, 0.001220267258540676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220098617352701],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2673622728475234, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7326377271524767, 1, 0.001220230809654078],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7712998936018, 580.1294627668128, 0, 1, 0.2674215127437808, 0, 0.001723753169216226, 0.005015441703882937, 0.7325784872562192, 1, 0.001220297474846971],
[211.633245783329, 579.8681179714955, 0, 0, 0.2673820355524801, 0, 0, 0, 1, 1, 4.627584249093816e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001174165093588515],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001219742814811095],
[211.2690416393414, 580.9301295299175, 0, 1, 0.2666867743972965, 0, 0.001721377406968355, 0.005008529172976961, 0.7333132256027035, 1, 0.001220297473600715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220191604548062],
[212.2801917834907, 579.8715964734401, 1, 0, 0.2679791864771232, 0.004710755118498867, 0, -0.01370643900764631, 1, 0.2679791864771233, 0.001220339420404565],
[212.2690416393414, 580.329485455135, 0, 1, 0.26781407532699, 0, 0.00172315904165326, 0.005013713027057312, 0.73218592467301, 1, 0.001220591691928788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.8807928779006, 580.1186573483769, 0, 1, 0.2675264393395291, 0, 0.001723785276224055, 0.005015535122609546, 0.7324735606604709, 1, 0.001219985411641973],
[211.7686523370055, 580.2293166434335, 0, 1, 0.2673853477296428, 0, 0.001723456521957381, 0.005014578577386684, 0.7326146522703572, 1, 0.001220299180201515],
[211.6305982267327, 579.9679718481163, 0, 1, 0.2673458571390827, 0, 0.001724233144829389, 0.005016838243567444, 0.7326541428609173, 1, 0.001221431189199533],
[211.6305982267327, 579.7181664992843, 0, 1, 0.2674302503018426, 0, 0.001724976131140846, 0.005019000040626585, 0.7325697496981574, 1, 0.001220149861218037],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.001220117810494356],
[211.3182478777044, 580.8809232915545, 0, 1, 0.2667488878659213, 0, 0.001721523224301312, 0.005008953443891105, 0.7332511121340788, 1, 0.001220297479329404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220118391934545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4702438281612, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2670413438139907, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7329586561860093, 1, 0.001220297471928869],
[211.4813939723106, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.00122011839146132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.3182478777044, 579.8809232915545, 0, 1, 0.2680111966847049, 0, 0.001724491977290339, 0.005017591343919717, 0.7319888033152951, 1, 0.001220508479382756],
[211.9053959970821, 579.8943762665867, 0, 1, 0.2676249771975405, 0, 0.001724451970784907, 0.005017474940771429, 0.7323750228024595, 1, 0.001220305968062197],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220297476246399],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220118377319491],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3182478777044, 580.8809232915545, 0, 1, 0.2667488878659213, 0, 0.001721523224301312, 0.005008953443891105, 0.7332511121340788, 1, 0.001220293958763227],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220118382545961],
[211.5443712552153, 580.7040061524066, 0, 1, 0.2670177400014706, 0, 0.001722047703141811, 0.005010479470410691, 0.7329822599985294, 1, 0.001220508479589426],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.00122030598047866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2690416393414, 580.9301295299175, 0, 1, 0.2666867743972965, 0, 0.001721377406968355, 0.005008529172976961, 0.7333132256027035, 1, 0.001220302725633623],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220118391391137],
[211.2690416393414, 580.8809232915545, 0, 1, 0.2667033402668543, 0, 0.001721523224301312, 0.005008953443891105, 0.7332966597331457, 1, 0.00122059149343562],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669707274431168, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330292725568832, 1, 0.001220305967844254],
[211.4702438281612, 580.7289273410977, 0, 1, 0.2669407536946023, 0, 0.0017219738038168, 0.005010264452528102, 0.7330592463053978, 1, 0.001220301887007833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220118395168356],
[211.7686523370055, 580.2293166434335, 0, 1, 0.2673853477296428, 0, 0.001723456521957381, 0.005014578577386684, 0.7326146522703572, 1, 0.001220591514857863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.001220305967839815],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.00122029746588971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220118387425087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9178565914277, 580.2813145778313, 0, 1, 0.2675057792330736, 0, 0.001723302086208866, 0.005014129230283221, 0.7324942207669264, 1, 0.001226217248272101],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 0, 1, 0.2670417397781307, 0, 0.001721343214650039, 0.005008429686819491, 0.7329582602218693, 1, 0.001219977023832508],
[211.5943731262116, 578.5306150671086, 1, 2, 0.2677986094453714, 0.004726023595171507, 0.003457033989062106, -0.003692259138916605, 0.8232626554873805, 0.6074530132484925, 0.003684794652632946],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6815042176278, 580.9170658572211, 0, 1, 0.2670727808626221, 0, 0.001721416117332283, 0.005008641804864801, 0.7329272191373779, 1, 0.001220236959938666],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001221316076238887],
[212.3061053528685, 580.2924647219805, 0, 1, 0.2678608230807423, 0, 0.001723268973480644, 0.005014032885307025, 0.7321391769192578, 1, 0.001219777675053463],
[211.7575021928562, 580.8410678819928, 1, 0, 0.26716866543534, 0.004722382865515949, 0, -0.01374027116433391, 1, 0.26716866543534, 0.001220520629582478],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.00121998028359807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220443896420209],
[211.9080302255765, 580.4407345004404, 0, 1, 0.2674428732136048, 0, 0.00172282877572446, 0.005012752083494012, 0.7325571267863953, 1, 0.001220350640212894],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.001220160267551457],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.001220269074694784],
[212.1578355744086, 580.4407345004405, 0, 1, 0.2676737551448944, 0, 0.00172282877572446, 0.00501275208349401, 0.7323262448551056, 1, 0.001220366386455658],
[212.0073075416882, 580.5912625331607, 0, 1, 0.2674838380312336, 0, 0.001722382103438707, 0.005011452443354146, 0.7325161619687663, 1, 0.001219890779058207],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 0, 1, 0.2670417397781307, 0, 0.001721343214650039, 0.005008429686819491, 0.7329582602218693, 1, 0.001220443880148266],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220423463679078],
[212.3061053528684, 580.2924647219805, 1, 0, 0.2678608230807423, 0.004710180135130481, 0, -0.01370476603287455, 1, 0.2678608230807422, 0.001221246706879186],
[211.9067064472784, 581.0510872494099, 0, 1, 0.2672357950596475, 0, 0.00172101906690136, 0.005007486544746727, 0.7327642049403525, 1, 0.001219980286758843],
[212.0447605575512, 580.9532084228879, 0, 1, 0.2673963475974321, 0, 0.001721309023690044, 0.005008330204614198, 0.7326036524025679, 1, 0.001221035303640275],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 1, 1, 0.2670417397781307, 0.004724627426794263, 0.001721343214650039, -0.00873837226535761, 0.9286887092162691, 0.4627721887725306, 0.002442622623465475],
[211.8061053528685, 580.7205216708436, 0, 1, 0.267254245006624, 0, 0.001721998728618733, 0.005010336973868923, 0.732745754993376, 1, 0.001220423464765019],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220443896576979],
[212.0559107017005, 580.5426593731485, 1, 0, 0.2675451593127086, 0.00471573745193409, 0, -0.01372093563241831, 1, 0.2675451593127085, 0.001220348434057139],
[211.9067064472784, 580.4420582787386, 0, 1, 0.2674412025120689, 0, 0.001722824846575439, 0.005012740651220406, 0.7325587974879311, 1, 0.001219980283627995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220944118616313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001219969583283668],
[211.6569010984463, 580.9416689764026, 0, 1, 0.2670417397781307, 0, 0.001721343214650039, 0.005008429686819491, 0.7329582602218693, 1, 0.001221653460403117],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9067064472784, 580.6918636275706, 1, 0, 0.2673569123740243, 0.004719057819195526, 0, -0.01373059659126822, 1, 0.2673569123740243, 0.001220223984917698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220614121265227],
[211.7686523370055, 581.0535458116224, 0, 1, 0.2671073701411498, 0, 0.001721011784900458, 0.005007465356996843, 0.7328926298588503, 1, 0.001221396025763524],
[211.6305982267327, 580.7922010163052, 0, 1, 0.2670677805193047, 0, 0.001721786205548456, 0.00500971861557451, 0.7329322194806953, 1, 0.001221778835590106],
[211.4813939723105, 580.9414052707273, 1, 0, 0.2668794918247282, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2668794918247281, 0.001221305736753428],
[211.6305982267327, 580.4806875266207, 0, 1, 0.2671728102263524, 0, 0.001722710197751652, 0.005012407068372008, 0.7328271897736476, 1, 0.001221310094490342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0447605575512, 580.8728578553862, 0, 1, 0.2674234442942117, 0, 0.001721547127700292, 0.005009022993352275, 0.7325765557057883, 1, 0.001220508479781051],
[211.7686523370055, 580.3903435485026, 0, 1, 0.2673309947080532, 0, 0.001722978356059487, 0.005013187303259679, 0.7326690052919469, 1, 0.001220589748394608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.0192362905093, 581.1397595949987, 0, 2, 0.26638495224639, 0, 0.003441512935535192, 0.01001344496972503, 0.5381910382905316, 1, 0.002443615187793439],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220400536058805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4702438281612, 580.7289273410977, 0, 1, 0.2669407536946023, 0, 0.0017219738038168, 0.005010264452528102, 0.7330592463053978, 1, 0.001220297479746936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220364053057585],
[211.9067064472783, 580.6918636275706, 0, 1, 0.2673569123740243, 0, 0.001722083711924289, 0.005010584241762281, 0.7326430876259757, 1, 0.001220511936010794],
[211.7575021928562, 580.8410678819927, 1, 0, 0.26716866543534, 0.004722382865515949, 0, -0.01374027116433391, 1, 0.26716866543534, 0.001220337486488093],
[212.0456950335135, 580.46498962543, 1, 0, 0.2675619384548326, 0.004715964640743834, 0, -0.01372159666222895, 1, 0.2675619384548326, 0.001221746662740673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7686523370055, 580.4305188322534, 0, 1, 0.2673174373869165, 0, 0.001722859097781183, 0.005012840308717061, 0.7326825626130835, 1, 0.001220305975411244],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2671567189490328, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7328432810509672, 1, 0.001220196963782147],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220030026035868],
[209.0992791967223, 570.8353050199579, 1, 1, 0.2680984834218233, 0.0047824172509901, 0.001751818766649406, -0.008817846022002059, 0.9281232031869184, 0.4643201700305649, 0.002461908434824628],
[211.7325230994408, 579.817443815396, 1, 1, 0.267491039036606, 0.004722939987497089, 0.001724680777831829, -0.008723751490501214, 0.9284485440351169, 0.463430622108329, 0.002474900663762454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001220758349853012],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 4.205569400779498e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001178386220905641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001221000831289906],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220307126536606],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0313209106209, 579.5186460042158, 1, 0, 0.2678685234957928, 0.004716284347544753, 0, -0.01372252688289568, 1, 0.2678685234957927, 0.0007471378125777015],
[211.633245783329, 579.6669157826757, 0, 0, 0.2674500222071243, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000472737790781419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3821166561988, 579.918044909806, 0, 1, 0.2671326595433365, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7328673404566635, 1, 0.001220400652939174],
[211.133245783329, 580.1669157826757, 0, 1, 0.2668181507324484, 0, 0.001723641891318376, 0.00501511792909919, 0.7331818492675517, 1, 0.00122035315913073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.9540597073357, 579.346101858669, 0, 1, 0.2678554485416416, 0, 0.001726083936340956, 0.005022223316731097, 0.7321445514583584, 1, 0.001220132126677631],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001220197052454953],
[211.1323113073667, 580.4176556074701, 0, 1, 0.2667327649955957, 0, 0.001722897279810331, 0.005012951403359119, 0.7332672350044043, 1, 0.001219924387056778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1309875290686, 580.6687847346002, 0, 1, 0.2666469414678767, 0, 0.001722152156770505, 0.005010783389263361, 0.7333530585321233, 1, 0.001220538246866271],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220118388025092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5299971323228, 580.269775131346, 0, 1, 0.2671508688712826, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.7328491311287174, 1, 0.001220727544768332],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220460259298548],
[211.2375098539775, 580.5622624096914, 0, 1, 0.2667814733642479, 0, 0.001722468139505629, 0.005011702774367765, 0.733218526635752, 1, 0.001219964952918732],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4340540403551, 580.3657182233137, 1, 0, 0.267029697970092, 0.004729607085002193, 0, -0.01376129079309305, 1, 0.2670296979700919, 0.001220088712826105],
[211.4823284482729, 579.918044909806, 0, 1, 0.2672254595368823, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7327745404631176, 1, 0.001220855019118258],
[211.3807928779006, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669707274431168, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330292725568832, 1, 0.001220460260912176],
[211.6319220050308, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.00122072754445402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1319882465274, 578.4260911370476, 0, 1, 0.2674052660082495, 0, 0.001728829344530844, 0.005030211371503466, 0.7325947339917505, 1, 0.001222116069762469],
[211.4813939723106, 580.3657182233137, 1, 0, 0.2670735180001067, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670735180001067, 0.001219733454632602],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707914, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292086, 1, 0.001220353181453738],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220118392003126],
[212.1639116046898, 579.9909898946937, 5, 13, 0.2678313435959405, 0.02356668465519316, 0.02241414129960941, -0.003353446487791672, 0.654105942597578, 0.5510722445649724, 0.0224304904599006],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220400536270949],
[211.5299971323228, 580.269775131346, 0, 1, 0.2671508688712826, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.7328491311287174, 1, 0.001220400537278321],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3817273538629, 580.3301594939004, 0, 1, 0.2669932469947986, 0, 0.001723157040247726, 0.005013707203756758, 0.7330067530052014, 1, 0.001221314131915704],
[211.3794690996025, 580.4203031640664, 0, 1, 0.2669607601619937, 0, 0.001722889420905271, 0.00501292853704572, 0.7330392398380063, 1, 0.001220037260960681],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.0685729425262, 0, 1, 0.267311885541292, 0, 0.00172393411166421, 0.005015968175024995, 0.732688114458708, 1, 0.001220098810297784],
[211.4548273949216, 580.8876212806146, 0, 0, 0.2668730266166924, 0, 0, 0, 1, 1, 1.86758276744076e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.5427128108272, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2670754052441174, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7329245947558827, 1, 0.00120257691753216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220098617393058],
[211.4293960379129, 580.298433174619, 0, 2, 0.2670480791968683, 0, 0.00344650249882404, 0.01002796263051891, 0.5372185182090001, 1, 0.002442364842943744],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 0, 0.2672779225759361, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004520242898675009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.0007675940092779677],
[211.6292744484346, 580.3197020696565, 0, 1, 0.2672258955102017, 0, 0.00172318809172529, 0.005013797551306699, 0.7327741044897983, 1, 0.001220684879496038],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001226171875330194],
[211.4813939723106, 580.3657182233137, 1, 0, 0.2670735180001067, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670735180001067, 0.001220715613415861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220513938061641],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220067140393196],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220423601751347],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001219888200728422],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220589744727788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.1676619402598, 579.6567134425907, 1, 0, 0.267947879020112, 0.004713253616762629, 0, -0.01371370865193932, 1, 0.267947879020112, 0.00122068487918808],
[211.6305982267327, 580.209349320687, 0, 1, 0.2672643617971283, 0, 0.001723515832984778, 0.005014751149078281, 0.7327356382028717, 1, 0.001225869933924369],
[211.5299971323228, 580.269775131346, 0, 1, 0.2671508688712826, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.7328491311287174, 1, 0.001220640733600523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0559107017005, 579.9196323937795, 1, 0, 0.267755630272203, 0.00471573745193409, 0, -0.01372093563241831, 1, 0.2677556302722031, 0.001220016251677007],
[211.7686523370055, 580.1190053425688, 0, 1, 0.2674225949644673, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956019, 0.7325774050355327, 1, 0.00122058974854184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2059565220519, 581.0486067375789, 0, 1, 0.266588501116449, 0, 0.001721026413977159, 0.005007507921838891, 0.7334114988835509, 1, 0.001222324063678598],
[211.5427128108272, 580.5283976587754, 0, 1, 0.2670754052441174, 0, 0.001722568618577352, 0.005011995128827605, 0.7329245947558827, 1, 0.00122078138362715],
[211.7904266937752, 579.6978320802091, 1, 0, 0.2675850517629139, 0.00472164873366012, 0, -0.01373813513024758, 1, 0.2675850517629139, 0.001219862630888458],
[211.4813939723105, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.001220727544634053],
[211.6305982267327, 580.1445709177547, 0, 1, 0.2672862278004998, 0, 0.001723708279158863, 0.005015311091525087, 0.7327137721995002, 1, 0.001219954791591911],
[211.4813939723106, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2671398247134718, 0.004728548366438944, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2671398247134718, 0.0012207275448673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220460260912176],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.00122072754445402],
[211.6305982267327, 579.8978358310025, 0, 1, 0.2673695462105106, 0, 0.00172444168301988, 0.005017445007433711, 0.7326304537894894, 1, 0.001219661808922207],
[211.8807928779006, 580.1186573483769, 0, 1, 0.2675264393395291, 0, 0.001723785276224055, 0.005015535122609546, 0.7324735606604709, 1, 0.001220460259298548],
[211.7798024811549, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2674159684027536, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674159684027535, 0.00122068487918808],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220460248991173],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220727544608803],
[212.0299971323228, 579.7697751313461, 0, 1, 0.2677823416469952, 0, 0.001724822581124466, 0.005018553270654216, 0.7322176583530048, 1, 0.001226171875347468],
[211.4340540403551, 580.3657182233137, 1, 0, 0.267029697970092, 0.004729607085002193, 0, -0.01376129079309305, 1, 0.2670296979700919, 0.001220727544612232],
[211.6319220050309, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350586, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649414, 1, 0.001220459992566082],
[211.6305982267327, 580.269775131346, 0, 1, 0.267243968239725, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.732756031760275, 1, 0.001220684879525391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.7798024811549, 580.0199697825141, 1, 0, 0.2674663594253122, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253122, 0.001220746722776696],
[212.1190587802475, 580.0399371052607, 0, 2, 0.267773338284358, 0, 0.003448038440217017, 0.01003243161404545, 0.5361558841272334, 1, 0.002453379012559671],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.00122032665090526],
[211.7788680051926, 580.1087896743818, 0, 1, 0.2674354953652855, 0, 0.001723814597881383, 0.00501562043706501, 0.7325645046347145, 1, 0.001219862630792191],
[211.6305982267327, 579.9439718072856, 0, 1, 0.2673539628965567, 0, 0.001724304499422055, 0.005017045857282802, 0.7326460371034433, 1, 0.001220968040637757],
[211.6565251242124, 580.1432471394565, 1, 0, 0.2673106668357703, 0.004724635819345242, 0, -0.0137468263711896, 1, 0.2673106668357703, 0.0012228366985104],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220968040637757],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220810387426113],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6676619402598, 580.1567134425907, 0, 1, 0.2673164258651643, 0, 0.001723672202405626, 0.005015206122405401, 0.7326835741348356, 1, 0.001225387957701704],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001219848035123244],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001220727830662755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.2847570132777, 575.6855892964414, 1, 0, 0.2675479526684496, 0.00475545643061926, 0, -0.01383650219130319, 1, 0.2675479526684497, 0.001224094447352959],
[211.7798024811549, 580.019969782514, 1, 0, 0.2674663594253123, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253123, 0.00122068487918808],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001220460260859602],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220460259298548],
[211.6319220050309, 580.0186460042158, 0, 1, 0.2673299692529987, 0, 0.00172408250474198, 0.005016399940340415, 0.7326700307470013, 1, 0.001220727544612232],
[211.8804035755648, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2675934131299658, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7324065868700342, 1, 0.001219661798952829],
[211.4916096404976, 580.5333648528218, 1, 0, 0.2670264403919772, 0.004728319963613887, 0, -0.01375754577762091, 1, 0.2670264403919772, 0.001219657822059577],
[211.5184576858376, 580.3059176970128, 0, 1, 0.2671279948707913, 0, 0.001723229023699387, 0.005013916647203707, 0.7328720051292087, 1, 0.001220460259333258],
[211.6305982267327, 580.5283976587754, 1, 0, 0.2671567189490328, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2671567189490328, 0.001219862630793532],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220727555724727],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001219955080369897],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001219657822070394],
[211.6592562700057, 580.1405159936631, 0, 1, 0.2673141161242003, 0, 0.001723720327112825, 0.005015346146318211, 0.7326858838757997, 1, 0.001219665523891456],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220324064874634],
[211.6296637507704, 580.5695074184885, 0, 2, 0.2671419908688017, 0, 0.003444893289165378, 0.01002328046524346, 0.5370808615477435, 1, 0.002440825350496676],
[211.9929334187958, 580.0065168074818, 0, 1, 0.2676680310298555, 0, 0.001724118559053922, 0.005016504844164786, 0.7323319689701444, 1, 0.001220460169103744],
[211.6305982267327, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2672019254975119, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.732798074502488, 1, 0.001219657822070394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.2311993211426, 580.5685729425262, 1, 0, 0.2667735035048769, 0.004734149137124686, 0, -0.01377450637293545, 1, 0.2667735035048769, 0.001220460131762838],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220684879350103],
[211.4813939723105, 580.3183782913583, 1, 0, 0.2670894857265599, 0.004728548366438945, 0, -0.01375821033973719, 1, 0.2670894857265599, 0.001220640744179945],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.001221314130950804],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 0, 1, 0.2672779225759361, 0, 0.001723635182203485, 0.005015098408221596, 0.7327220774240639, 1, 0.001220204483158635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220968040637757],
[211.6319220050308, 579.918044909806, 0, 1, 0.2673639452350585, 0, 0.001724381589394289, 0.005017270158690103, 0.7326360547649415, 1, 0.001220460111497418],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220968040605353],
[211.7686523370055, 580.1190053425689, 0, 1, 0.2674225949644672, 0, 0.001723784242182318, 0.005015532113956017, 0.7325774050355327, 1, 0.00122046027131603],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 579.9193686881041, 0, 1, 0.2673622728475234, 0, 0.001724377653159273, 0.005017258705799046, 0.7326377271524767, 1, 0.001220460250773805],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220684879496038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.6305982267327, 580.269775131346, 0, 1, 0.267243968239725, 0, 0.001723336356393277, 0.00501422894300031, 0.732756031760275, 1, 0.00121965991871248],
[211.3794690996025, 580.4203031640664, 0, 1, 0.2669607601619937, 0, 0.001722889420905271, 0.00501292853704572, 0.7330392398380063, 1, 0.001219929258639003],
[210.6305982267327, 581.1691740369362, 1, 0, 0.2660149770245107, 0.004747648292407891, 0, -0.01381378358940917, 1, 0.2660149770245107, 0.001287477939977857],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.1305982267327, 580.6691740369362, 0, 1, 0.2666464498002234, 0, 0.001722151002175277, 0.005010780029846733, 0.7333535501997765, 1, 0.001220145215712207],
[211.6305982267327, 580.1691740369362, 1, 0, 0.2672779225759361, 0.004725214635213758, 0, -0.01374851049702482, 1, 0.2672779225759361, 0.001220982483340668],
[211.7798024811549, 580.019969782514, 1, 0, 0.2674663594253123, 0.004721885601385357, 0, -0.01373882432188398, 1, 0.2674663594253123, 0.001220671928178281],
[211.1309875290686, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2667310926080605, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7332689073919395, 1, 0.001235240774190171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.3807928779006, 580.4189793857682, 0, 1, 0.2669624320219063, 0, 0.001722893350348839, 0.005012939970176343, 0.7330375679780936, 1, 0.00122087533592612],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[212.0299971323228, 579.769775131346, 1, 0, 0.2677823416469952, 0.004716313792976775, 0, -0.01372261255748668, 1, 0.2677823416469952, 0.001223825838472523],
[211.2325230994408, 580.317443815396, 1, 0, 0.2668593669743244, 0.004734119468568936, 0, -0.01377442004914242, 1, 0.2668593669743244, 0.001220727555629774],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[210.9303884185995, 580.8693838450693, 0, 1, 0.2663935957136899, 0, 0.001721557423771404, 0.005009052950857422, 0.7336064042863101, 1, 0.001220480734569079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001220216464925266],
[210.954991537781, 580.8447807258877, 0, 1, 0.2664246681136114, 0, 0.001721630344599619, 0.005009265121700349, 0.7335753318863887, 1, 0.001220064529376215],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[211.4053959970821, 580.3943762665867, 0, 1, 0.2669935044218278, 0, 0.001722966384396323, 0.005013152470442679, 0.7330064955781721, 1, 0.001219885237313533]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.001781860585791515, 2.998218139414207, 0, 0.75, 0.0005939535285971718, 0, 0.2501485766297629, 0.7278336746822789, 0.999554501772165, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7252298167200147, 2.225696122388324, 0.25, 0.5, 0.2457634761715344, 0.3447183144381336, 0.2246488165974185, -0.3493548714450921, 0.8728929163662194, 0.190660625450671, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.001952334677617614, 2.998047665322381, 0, 1, 0.0006507782258725383, 0, 0.3335504006713215, 0.9705000807247026, 0.9993492217741274, 1, 0.3436892044586426],
[0.824229168188925, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2918421697051849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9426839134540533, 2.057316086545947, 0, 0, 0.3142279711513511, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7992081568236119, 2.198501589237881, 1.25, 2.5, 0.2666062509466244, 1.56404810102042, 1.137138136373436, -1.242139581659033, 0.7920387981587513, 0.5808400885196989, 0.3436892044586426],
[0.9991148955139955, 2.000572541689982, 1, 1, 0.3330730005807789, 1.00088588858997, 0.4998569055412762, -1.457796685345071, 0.8890623762841163, 0.5552083774456743, 0.3436892044586426],
[0.553394809095493, 2.468364835528758, 1, 0, 0.1831366072016977, 1.80702815343438, 0, -5.295874567206506, 1, 0.1831366072016977, 0.3412143037948802],
[1.007253214874749, 1.29345710547494, 1, 1, 0.4378009721457046, 0.9927990154137647, 0.7731218884392875, -0.643809841883227, 0.8083303087882761, 0.6839322530796852, 0.3412143037948802],
[1.0109804608631, 2.021960921726201, 0, 0.75, 0.3333333333333334, 0, 0.3709270500439274, 1.091102062954455, 0.7377879464668811, 1, 0.3399563273114358],
[1.004598815629748, 1.996284771721309, 1, 4, 0.3347676730494328, 0.9954222366598503, 2.003722142583383, 2.944532576323798, 0.4580751471343303, 0.8697233063272317, 0.3424312279751982],
[1.000463479333211, 2.010557505734792, 0, 2, 0.3322671892008138, 0, 0.9947489660431605, 2.904959842375149, 0.4458671066177818, 1, 0.3424312279751982],
[0.7261335554930942, 2.235763484155287, 0, 1, 0.2451582704506489, 0, 0.4472745024627767, 1.306173228147206, 0.754841729549351, 1, 0.3424312279751982],
[0.2260884135347202, 2.609142050114021, 0, 2, 0.07974251703114126, 0, 0.7665354977175731, 2.238509327113975, 0.8468738349601794, 1, 0.3424312279751982],
[0.5041033811672553, 1.705329103347107, 0, 1, 0.228159667561898, 0, 0.5863970761052901, 1.712452101908655, 0.771840332438102, 1, 0.3424312279751982],
[1.003673661689334, 2.007347323378668, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424312279751982],
[0.5036084013986682, 1.786326007875919, 1, 0, 0.219922631564894, 1.985669812542258, 0, -5.798740448654635, 1, 0.219922631564894, 0.3424312279751982],
[0.9461470152320618, 2.064873969835943, 0, 0, 0.3142279711513511, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424312279751982],
[0.2257518396717468, 2.599413614788253, 0, 1, 0.07990747561894455, 0, 0.3847021475577905, 1.11933148486217, 0.9200925243810555, 1, 0.3436892044586426],
[0.5004000625780959, 2.498960226259686, 0.25, 0.5, 0.166835596390454, 0.4996002572661215, 0.2000832165097617, -0.8714764294914062, 0.914708893529483, 0.1279366597057754, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1.75, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.8750000000000007, -0.3637006876514853, 0.7787761657150412, 0.6720942460147195, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.000014279351072, 1.79753139925719, 0, 2, 0.3574612872267967, 0, 1.112637031445725, 3.237334827546532, 0.4128559974122452, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009192327931467, 2.49730701307998, 1, 3, 0.1670718590642154, 1.996329816333779, 1.201294027641415, -2.313240504439627, 0.8674923782836085, 0.5186841750796696, 0.3436892044586426],
[0.5009190867337294, 2.49908091326627, 1, 0, 0.1669730289112432, 1.996330398429326, 0, -5.808533909506464, 1, 0.1669730289112432, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9989285035942003, 2.000305235152204, 1, 1, 0.3330612385054472, 1.001072645741857, 0.4999237028562342, -1.458145721146524, 0.8890702114052177, 0.555192688416112, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.45480275060594, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3436892044586426],
[0.9976013234917548, 2.002398676508243, 0, 1, 0.3325337744972519, 0, 0.499401049217525, 1.453060040114294, 0.6674662255027481, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9982244948633648, 2.001775505136633, 2, 1, 0.3327414982877885, 2.003557326324432, 0.4995565174186424, -4.376049027419399, 0.963159891250058, 0.2584704965485234, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 4, 0, 0.3333333333333333, 4.000000000000004, 0, -11.63842200484752, 1, 0.01234567901234551, 0.3436892044586426],
[0.4986334512148509, 2.501366548785147, 0, 1, 0.1662111504049504, 0, 0.3997814716462391, 1.163206369184477, 0.8337888495950496, 1, 0.3436892044586426],
[0.518500532653912, 1.70876797778822, 0, 1, 0.2327965982651033, 0, 0.5852169592353733, 1.702750483993729, 0.7672034017348968, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[1.00001409986931, 1.79719450223336, 0, 1, 0.357504298791873, 0, 0.5564228016262611, 1.618970844611494, 0.642495701208127, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.90960550121188, 0.4444444444444445, 1, 0.3436892044586426],
[0.7971915819738568, 2.202808418026142, 2, 1, 0.265730527324619, 2.508807224291022, 0.4539659426651658, -5.978777497135854, 0.9812360464982385, 0.1743102324531374, 0.3436892044586426],
[0.999682935521665, 1.284123850666296, 0, 2, 0.4377265807105757, 0, 1.55748216884396, 4.531658686507792, 0.3161513980394208, 1, 0.3436892044586426],
[0.001286697752575095, 2.550860220178678, 0, 1, 0.0005041628847989992, 0, 0.3920246166722353, 1.140636981280013, 0.999495837115201, 1, 0.3436892044586426],
[0.995565547829483, 2.004434452170514, 0, 1, 0.331855182609828, 0, 0.4988938395651421, 1.451584260119453, 0.6681448173901721, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991129267453128, 2.000887073254685, 0, 1, 0.3330376422484378, 0, 0.4997783300050906, 1.454157778369296, 0.6669623577515622, 1, 0.3436892044586426],
[0.9992850966135648, 2.000203653173998, 1, 1, 0.33315180684853, 1.000715414838926, 0.4999490918902995, -1.457032448072968, 0.8890098735935599, 0.5553134872906197, 0.3436892044586426],
[0.9991999611232565, 2.000800038876741, 0, 3, 0.3330666537077524, 0, 1.499400210769795, 4.362663101774043, 0.2966520113854153, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9973392577228782, 2.002660742277119, 0, 1, 0.3324464192409596, 0, 0.4993356981986639, 1.452869894430306, 0.6675535807590404, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 4, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 2.000000000000002, 2.90960550121188, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.3436892044586426],
[0.9973371728918704, 2.002662827108127, 0, 2, 0.3324457242972904, 0, 0.9986703567509801, 2.905736763899879, 0.4456287110089693, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009190191504611, 2.49899364993328, 1, 1, 0.1669778671601984, 1.996330667771331, 0.4001610808521658, -4.644223810967091, 0.9721183918786309, 0.3060741261990281, 0.3436892044586426],
[0.2645442631026992, 2.051601679455242, 0, 21, 0.1142174412422983, 0, 10.2359050542287, 29.78244565566628, 0.07831944809041112, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991123061226304, 2.000887693877367, 0, 2, 0.3330374353742104, 0, 0.9995563499740223, 2.908314654655679, 0.4448390626122105, 1, 0.3436892044586426],
[0.9996427068639668, 2.000357293136031, 1, 1, 0.3332142356213225, 1.000357420840046, 0.4999106926704401, -1.45610255334577, 0.8889682731792978, 0.5553967444219428, 0.3436892044586426],
[0.5027845110053943, 2.321756590561897, 0, 1, 0.1780057336487005, 0, 0.4307083714395686, 1.253191446958577, 0.8219942663512996, 1, 0.3436892044586426],
[0.9420875209225942, 2.057912479077406, 1, 1, 0.3140291736408647, 1.061472504190154, 0.4859293143741056, -1.674603631273805, 0.9013856781024356, 0.529444025384165, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.2262811317025442, 2.598884101119503, 1, 1, 0.08009483094074214, 4.41928141544979, 0.384780529293029, -11.7388059730059, 0.9935848180565741, 0.1537744799380582, 0.3436892044586426],
[0.824796450407185, 1.99832705702733, 1, 0, 0.2921574094208547, 1.212420348688844, 0, -3.527664916326283, 1, 0.2921574094208548, 0.3436892044586426],
[0, 2.551437836419561, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.698943934559401, 0, 0, 0.228174520637612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.797383913767068, 1.201728818699047, 1, 0, 0.5993052192770066, 0.5563641647955659, 0, -1.61880023456633, 1, 0.5993052192770066, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999642865490064, 0, 1, 0.3333730196700018, 0, 0.5000892995734637, 1.455062577136144, 0.6666269803299982, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9996426814535134, 2.000357318546484, 1, 2, 0.3332142271511714, 1.000357446268668, 0.9998213726401921, -0.001559762778467307, 0.7408995347939613, 0.7035448670865662, 0.3436892044586426],
[0.2242810817902187, 2.598985179089466, 0, 1, 0.07944028691092574, 0, 0.3847655646694923, 1.119516003639249, 0.9205597130890742, 1, 0.3436892044586426],
[1.000914342110902, 2.009906739598008, 0, 1, 0.3324389975185087, 0, 0.4975355225685771, 1.452853741903311, 0.6675610024814913, 1, 0.3424539636844524],
[1.003607027236303, 2.007214054472607, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424539636844524],
[0.7980949401591861, 2.199404185523287, 1, 2, 0.266253602318391, 1.25298376130607, 0.9093371801164211, -0.9998759831020568, 0.825077015749262, 0.6049628437085242, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.057316086545947, 0, 0, 0.2796799566768435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7248025309250875, 2.226078950563367, 0, 1, 0.2456223794388007, 0, 0.4492203655880776, 1.307054046971481, 0.7543776205611994, 1, 0.3436892044586426],
[1.797379522695638, 1.202620477304362, 1, 0, 0.5991265075652127, 0.5563655240158961, 0, -1.61880418936128, 1, 0.5991265075652127, 0.3436892044586426],
[0.7188609702183894, 2.233713229013023, 1, 2, 0.2434692311561609, 1.391089572850507, 0.8953700833314712, -1.442348153762529, 0.8510325814498994, 0.5670080844137739, 0.3436892044586426],
[0.7242721309695025, 2.226609005579333, 0, 1, 0.2454426652428859, 0, 0.4491134265128033, 1.306742896449768, 0.7545573347571142, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.498712881414794, 0, 1, 0.1668463665716371, 0, 0.4002060450554011, 1.164441710311443, 0.8331536334283629, 1, 0.3436892044586426],
[1.000004700812335, 1.999108226127982, 0, 2, 0.3334334935605562, 0, 1.000446085839858, 2.910903435025539, 0.4443109075068851, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991084901800119, 2.000891509819986, 0, 1, 0.3330361633933375, 0, 0.4997772218494579, 1.454154554073571, 0.6669638366066625, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678622006232, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2852721403064134, 1.252712337990474, 0, -3.644898710053074, 1, 0.2852721403064133, 0.3436892044586426],
[1.000004701842858, 1.798263160357876, 0, 1, 0.3573656101158204, 0, 0.5560921349247836, 1.618008734957808, 0.6426343898841795, 1, 0.3436892044586426],
[0.7977412671600238, 2.198396936476736, 1, 2, 0.2662564985125562, 1.253539262874066, 0.9097538150709501, -1.000280030164536, 0.8250736208889902, 0.6049675214819132, 0.3436892044586426],
[0.9991127324742368, 2.000887267525761, 0, 1, 0.3330375774914126, 0, 0.4997782814803809, 1.454157637181534, 0.6669624225085875, 1, 0.3436892044586426],
[0.7324602896323212, 2.215505981600992, 0, 2, 0.2484629138330978, 0, 0.9027283232856538, 2.626583295531712, 0.5648079918842377, 1, 0.3436892044586426],
[0.9948535849619705, 2.005146415038027, 1, 1, 0.3316178616539904, 1.005173037636715, 0.4987166984417121, -1.47358815064541, 0.8900295938320348, 0.5532653171400157, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991120594861022, 2.000887940513896, 0, 5, 0.3330373531620343, 0, 2.498890566912923, 7.270785740416307, 0.1319798285769133, 1, 0.3436892044586426],
[0.9996427704606184, 2.000101763302456, 1, 2, 0.3332426342341231, 1.000357357197929, 0.9999491209375828, -0.001187806468896646, 0.7408616646452021, 0.7035827551180242, 0.3436892044586426],
[1.02429093796578, 1.975709062034218, 1, 1, 0.3414303126552602, 0.9762851187436834, 0.5061473975173176, -1.36791530000745, 0.8834253416001311, 0.5662859669106517, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991129118643038, 2.000887088135694, 0, 1, 0.3330376372881015, 0, 0.4997783262881364, 1.454157767554426, 0.6669623627118985, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9833395112526211, 2.016660488747377, 1, 2, 0.3277798370842073, 1.016942763467478, 0.9917385753128306, -0.07333424450834233, 0.7481142185313365, 0.6962371881198661, 0.3436892044586426],
[0.5015162254708166, 2.019044664872505, 0, 3.5, 0.1989700893131393, 0, 1.733493102402968, 5.043781067064519, 0.4600134879708053, 1, 0.3436892044586426],
[0.9996448908869474, 2.00035510911305, 1, 1, 0.3332149636289827, 1.000355235260331, 0.4999112384817494, -1.456094606075419, 0.8889677880137357, 0.5553977152717011, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.90960550121188, 0.4444444444444445, 1, 0.3436892044586426],
[1.002149622909946, 1.499568790239816, 1, 1, 0.4005845012941325, 0.997854988056869, 0.6668583705586969, -0.963069579155205, 0.8395320573229312, 0.6407010599111962, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000002, 0, -5.819211002423759, 1, 0.1111111111111109, 0.3436892044586426],
[0.7972086021018417, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2850014838016779, 1.254376831062157, 0, -3.649741728251172, 1, 0.2850014838016779, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7246703841260768, 2.226123377510908, 0, 0, 0.2455848977137792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.2247715509125214, 1.977849594795199, 0, 1, 0.1020473045718902, 0, 0.5055996182073426, 1.471095430546709, 0.8979526954281098, 1, 0.3436892044586426],
[0.5166925682549494, 2.48330743174505, 0, 1, 0.1722308560849831, 0, 0.4026887638705643, 1.171665442634004, 0.8277691439150169, 1, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.8156345472621658, 1.990886037239384, 0, 2, 0.290621259564724, 0, 1.004577842523449, 2.922925217001787, 0.5032181973815387, 1, 0.3436892044586426],
[0.4978339929248362, 2.502166007075162, 1, 0, 0.1659446643082788, 2.008701724293427, 0, -5.844529587297938, 1, 0.1659446643082788, 0.3436892044586426],
[0.4994338356249337, 2.500566164375064, 1, 0, 0.1664779452083114, 2.002267224744026, 0, -5.825807732011455, 1, 0.1664779452083114, 0.3436892044586426],
[0.002927422112097788, 2.997072577887901, 0, 1, 0.0009758073706992633, 0, 0.3336589201669319, 0.9708158296461196, 0.9990241926293008, 1, 0.3436892044586426],
[0.5467460724577853, 2.452941512394478, 1, 0, 0.1822676718798077, 1.829002621829004, 0, -5.321676090204617, 1, 0.1822676718798077, 0.3436892044586426],
[0.9992000354835323, 2.000799964516466, 0, 1, 0.333066678494511, 0, 0.4998000888318041, 1.454221087971202, 0.666933321505489, 1, 0.3436892044586426],
[0.002175491023240591, 2.550680680948297, 0, 2, 0.0008521792363885848, 0, 0.7841044215916655, 2.281434538587666, 0.9982963677366737, 1, 0.3436892044586426],
[1.025179260273693, 1.974820739726305, 1, 1, 0.3417264200912312, 0.9754391634230186, 0.5063750749035543, -1.364791452377168, 0.8832230538116314, 0.5666758939940938, 0.3436892044586426],
[0.8540039005080501, 2.201705447364619, 1, 0, 0.2794781189194556, 1.17095483920518, 0, -3.64489673954732, 1, 0.2794781189194556, 0.321258713998742],
[0.00625840182374963, 2.549265488800703, 1, 2, 0.002448970188347707, 159.7852020631147, 0.78453970713772, -462.6292018872828, 0.9999820370102268, 0.007328932887681217, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678673803708, 2.058014172356978, 1, 0, 0.2794779564043949, 1.252712329861957, 0, -3.644898686402297, 1, 0.2794779564043949, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.002647556596285, 1.497741745739573, 0, 0, 0.4009965790765517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9964526603539395, 2.003547339646058, 0, 2, 0.3321508867846468, 0, 0.9982294705116951, 2.904453958872647, 0.4460224380225337, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.7982679398587537, 2.201732060141245, 1, 1, 0.2660893132862513, 1.252712216122498, 0.4541878724043507, -2.323390823333924, 0.9291964773548511, 0.4613751039273539, 0.3436892044586426],
[0.5009192327931467, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2002940463749788, 1.996329816333779, 0, -5.808532215838059, 1, 0.2002940463749788, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.999113189600448, 2.00088681039955, 0, 1, 0.3330377298668162, 0, 0.499778395660629, 1.454157969401012, 0.6669622701331838, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.057316086545947, 0, 0, 0.2796799566768435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0, 2.551437836419561, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9976013188719034, 2.002398681128094, 0, 1, 0.3325337729573014, 0, 0.4994010480653276, 1.453060036761854, 0.6674662270426986, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.449604420424385, 0, 1, 0.1696238532560861, 0, 0.4082291784184295, 1.187785863281467, 0.8303761467439139, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.200130436214434, 0, 1, 0.2663610947924969, 0, 0.4545185065121001, 1.322469546950213, 0.7336389052075031, 1, 0.3436892044586426],
[0.5006545782226784, 1.999999999999998, 0.5, 0, 0.2002094102011143, 0.9986925552044241, 0, -2.905801352642138, 1, 0.1056898805230448, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.450404459301128, 0, 0, 0.1695778637061582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9945414801161393, 2.004571526305297, 0, 3, 0.3316118725725622, 0, 1.49657917446798, 4.354454999031164, 0.298597509266383, 1, 0.3436892044586426],
[0.9836967340809087, 2.016303265919089, 0, 1, 0.3278989113603031, 0, 0.4959571394356549, 1.443039621267287, 0.6721010886396969, 1, 0.3436892044586426],
[0.9955607599813189, 2.004439240018679, 0, 2, 0.3318535866604398, 0, 0.9977852957924345, 2.903161585665987, 0.4464196296585184, 1, 0.3436892044586426],
[1.00000470184396, 1.798263160232593, 0, 1, 0.3573656101320733, 0, 0.5560921349635261, 1.618008735070533, 0.6426343898679268, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.000004701842857, 1.798263160357946, 0, 1, 0.3573656101158113, 0, 0.5560921349247621, 1.618008734957745, 0.6426343898841886, 1, 0.3436892044586426],
[0.997338701612643, 2.002399189342421, 0, 1, 0.3324752821304357, 0, 0.4994009213159917, 1.453059667971289, 0.6675247178695642, 1, 0.3436892044586426],
[0.5012757952404715, 2.497837480369101, 0, 2, 0.1671413345128109, 0, 0.8006926053909896, 2.329699609425294, 0.6936535566771016, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9973324313208044, 2.002355264134732, 1, 3, 0.3324787553156757, 1.002674703634838, 1.498235629678021, 1.441886796600897, 0.5941118399037563, 0.8014543534553172, 0.3436892044586426],
[1.002865400767895, 2.008415014956652, 0, 1, 0.3330362046427331, 0, 0.4979050607334676, 1.454154644007983, 0.6669637953572669, 1, 0.3424017265186647],
[0.5022708354540137, 2.509009580270534, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.5516620960920201, 2.459618319632529, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.5041468148968076, 1.785984895954283, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.5022708354540137, 2.509009580270534, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.801801401643495, 2.209479014081052, 0, 0, 0.2662659370600572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.801801401643495, 2.007878625584087, 0, 1, 0.2853710721055531, 0, 0.4980380722510566, 1.454543110266437, 0.7146289278944469, 1, 0.3424017265186647],
[0.2285698980396547, 1.990877122458576, 0, 1, 0.102985066067648, 0, 0.5022911704189353, 1.46696447919796, 0.897014933932352, 1, 0.3424017265186647],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5009207129736973, 2.002579987689255, 1, 2, 0.2000881057636806, 1.996323917339207, 0.998711668095599, -2.902658088475556, 0.8959154044955084, 0.4881691444366493, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.503141491188457, 1.778411265133035, 0, 1, 0.2205259071018209, 0, 0.5622996320399456, 1.63607010271284, 0.779474092898179, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0, 2.551437836419561, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.291767056250991, 1, 1, 0.4363445216966594, 1.000000000000001, 0.7741333819908934, -0.6571827542994206, 0.8096034583853138, 0.6822925017786323, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.449604293327312, 0, 1, 0.1696238605641343, 0, 0.4082291995992928, 1.187785924909424, 0.8303761394358657, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991999611232777, 2.00080003887672, 0, 1, 0.3330666537077595, 0, 0.4998000702566037, 1.454221033924697, 0.6669333462922405, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.002647556596285, 1.497741745739573, 0, 0, 0.4009965790765517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 1, 0.2662659370600571, 0, 0.454297204081988, 1.321825644182127, 0.7337340629399429, 1, 0.3436892044586426],
[0.5012803619015038, 2.498719638098496, 0, 1, 0.167093453967168, 0, 0.4002049628749032, 1.164438561593113, 0.832906546032832, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7972085982668355, 2.202791401733163, 1, 0, 0.2657361994222786, 1.25437683709639, 0, -3.649741745808412, 1, 0.2657361994222787, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.798797811180172, 0, 0, 0.3572962634190172, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678998830167, 2.201732100116982, 1, 0, 0.2660892999610057, 1.252712278855941, 0, -3.644898537994913, 1, 0.2660892999610056, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7971914767828208, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2849971063474382, 1.254403777666617, 0, -3.64982013223975, 1, 0.2849971063474381, 0.3436892044586426],
[0.2247714302522323, 1.987815521330331, 0, 3, 0.1015876144851453, 0, 1.509194373325082, 4.39116025102467, 0.7251488982028175, 1, 0.3436892044586426],
[1.798797811180172, 1.201202188819827, 0, 0, 0.5995992703933908, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678622007245, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2852721403064393, 1.252712337990315, 0, -3.644898710052612, 1, 0.2852721403064393, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.798797811180172, 0, 0, 0.3572962634190172, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.999200440163626, 2.000799559836372, 0, 1, 0.3330668133878756, 0, 0.4998001899209641, 1.454221382100778, 0.6669331866121244, 1, 0.3436892044586426],
[0.5033971767819606, 1.69794833695752, 0, 2, 0.2286770403101452, 0, 1.177892139865523, 3.427201449986955, 0.5949391081447173, 1, 0.3436892044586426],
[0.7246703841260768, 2.226123377510908, 0, 0, 0.2455848977137792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982676111927703, 2.201732388807228, 1, 1, 0.2660892037309235, 1.25271273189426, 0.4541878046049649, -2.323392521295746, 0.9291965356578431, 0.4613749431196901, 0.3436892044586426],
[0.9976017769271353, 2.002398223072862, 0, 1, 0.3325339256423787, 0, 0.499401162304973, 1.453060369154155, 0.6674660743576213, 1, 0.3436892044586426],
[0.9973388222720933, 2.002399080566619, 0, 2, 0.3324753210366451, 0, 0.9988018968896351, 2.90611949381094, 0.4455891970251299, 1, 0.3436892044586426],
[0.9982259226644036, 2.001774077335594, 0, 1, 0.3327419742214681, 0, 0.4995568737362321, 1.453513427991148, 0.6672580257785319, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9405908730786212, 2.059409126921379, 1, 0, 0.3135302910262071, 1.063161496269817, 0, -3.093380538223309, 1, 0.313530291026207, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009192271707827, 2.499080772829217, 1, 0, 0.1669730757235943, 1.99632983874077, 0, -5.808532281033564, 1, 0.1669730757235943, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.2295021280446481, 2.060996069612432, 0, 3, 0.1001974715716445, 0, 1.455606851576455, 4.235241702948554, 0.7285202493597618, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5040256950983126, 1.700012960392792, 0, 1, 0.2286827836901097, 0, 0.5882308095868559, 1.711519599556232, 0.7713172163098903, 1, 0.3436892044586426],
[0.5522521030309027, 2.447747896969098, 2, 2, 0.1840840343436342, 3.621534420644995, 0.8170776093716522, -8.159862965992037, 0.978492800024547, 0.1568622178302959, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9426839134540533, 2.057316086545947, 0, 0, 0.3142279711513511, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7995159385186618, 2.200484061481337, 0, 1, 0.266505312839554, 0, 0.4544454638434478, 1.322257021599679, 0.733494687160446, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991129267452746, 2.000799706154256, 0, 11, 0.3330473413752699, 0, 5.497801687077983, 15.99643403329404, 0.01161569203068617, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.798797811180172, 0, 0, 0.3572962634190172, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9992850966135648, 2.000714903386433, 0, 1, 0.3330950322045219, 0, 0.4998213380164203, 1.454282914715657, 0.6669049677954781, 1, 0.3436892044586426],
[0.9990627060935681, 1.285383859677228, 0, 1, 0.4373324905310156, 0, 0.7779777165173906, 2.263608243799254, 0.5626675094689844, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[1.000004700812793, 1.99910822604108, 0, 1, 0.3334334935703195, 0, 0.5002230429416735, 1.455451717576038, 0.6665665064296804, 1, 0.3436892044586426],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.001417495406196, 1.998582504593801, 0, 1, 0.3338058318020656, 0, 0.5003546251913394, 1.455834570013528, 0.6661941681979344, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009192596410267, 2.498193667111617, 1, 1, 0.1670224736030224, 1.99632970933605, 0.4002892222347952, -4.643848181426693, 0.9721034933115278, 0.3061484405175724, 0.3436892044586426],
[0.5041468148968076, 1.785984895954283, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.001978089793234, 2.009302325931312, 1, 1, 0.3327415422891287, 0.9980258153213291, 0.4976851850985141, -1.461267836789196, 0.889283066035052, 0.5547661506133093, 0.3424017265186647],
[0.9982182548725463, 2.013062160851999, 1, 1, 0.3314929588290649, 1.001784925409605, 0.4967556489049322, -1.474961244031996, 0.8901124182467519, 0.5530983359048818, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.9984007142955409, 2.001599285704457, 0, 2, 0.3328002380985139, 0, 0.9992009960655568, 2.907280714968731, 0.4451555222813996, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.001424926063215, 1.998575073936782, 1, 1, 0.3338083086877388, 0.9985771014619969, 0.5003564854985435, -1.449625445024434, 0.8885720130510312, 0.5561886304265089, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7242721665741516, 2.226608962163187, 0, 1, 0.2454426779583841, 0, 0.4491134352699647, 1.306742921929654, 0.754557322041616, 1, 0.3436892044586426]
],
"RESOLVED": [
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7246703841260768, 2.226123377510908, 0, 0, 0.2455848977137792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.001952334677617614, 2.998047665322381, 0, 1, 0.0006507782258725383, 0, 0.3335504006713215, 0.9705000807247026, 0.9993492217741274, 1, 0.3436892044586426],
[0.824229168188925, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2918421697051849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9426839134540533, 2.057316086545947, 0, 0, 0.3142279711513511, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7993591980658881, 2.198841957467611, 1, 2, 0.2666129310872239, 1.251002055671065, 0.9095696910856585, -0.9934334862894779, 0.8246556382963108, 0.605542929875446, 0.3436892044586426],
[0.9991148955139955, 2.000572541689982, 1, 1, 0.3330730005807789, 1.00088588858997, 0.4998569055412762, -1.457796685345071, 0.8890623762841163, 0.5552083774456743, 0.3436892044586426],
[0.553394809095493, 2.468364835528758, 1, 0, 0.1831366072016977, 1.80702815343438, 0, -5.295874567206506, 1, 0.1831366072016977, 0.3412143037948802],
[1.007253214874749, 1.29345710547494, 1, 1, 0.4378009721457046, 0.9927990154137647, 0.7731218884392875, -0.643809841883227, 0.8083303087882761, 0.6839322530796852, 0.3412143037948802],
[1.0109804608631, 2.021960921726201, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3399563273114358],
[1.004598815629748, 1.996284771721309, 1, 4, 0.3347676730494328, 0.9954222366598503, 2.003722142583383, 2.944532576323798, 0.4580751471343303, 0.8697233063272317, 0.3424312279751982],
[1.000463479333211, 2.010557505734792, 0, 2, 0.3322671892008138, 0, 0.9947489660431605, 2.904959842375149, 0.4458671066177818, 1, 0.3424312279751982],
[0.7261335554930942, 2.235763484155287, 0, 1, 0.2451582704506489, 0, 0.4472745024627767, 1.306173228147206, 0.754841729549351, 1, 0.3424312279751982],
[0.2260884135347202, 2.609142050114021, 0, 2, 0.07974251703114126, 0, 0.7665354977175731, 2.238509327113975, 0.8468738349601794, 1, 0.3424312279751982],
[0.5041033811672553, 1.705329103347107, 0, 1, 0.228159667561898, 0, 0.5863970761052901, 1.712452101908655, 0.771840332438102, 1, 0.3424312279751982],
[1.003673661689334, 2.007347323378668, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424312279751982],
[0.5036084013986682, 1.786326007875919, 1, 0, 0.219922631564894, 1.985669812542258, 0, -5.798740448654635, 1, 0.219922631564894, 0.3424312279751982],
[0.9461470152320618, 2.064873969835943, 0, 0, 0.3142279711513511, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424312279751982],
[0.2257518396717468, 2.599413614788253, 0, 1, 0.07990747561894455, 0, 0.3847021475577905, 1.11933148486217, 0.9200925243810555, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.45480275060594, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.000014279351072, 1.79753139925719, 0, 2, 0.3574612872267967, 0, 1.112637031445725, 3.237334827546532, 0.4128559974122452, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009192327931467, 2.49730701307998, 1, 3, 0.1670718590642154, 1.996329816333779, 1.201294027641415, -2.313240504439627, 0.8674923782836085, 0.5186841750796696, 0.3436892044586426],
[0.5009190867337294, 2.49908091326627, 1, 0, 0.1669730289112432, 1.996330398429326, 0, -5.808533909506464, 1, 0.1669730289112432, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9989285035942003, 2.000305235152204, 1, 1, 0.3330612385054472, 1.001072645741857, 0.4999237028562342, -1.458145721146524, 0.8890702114052177, 0.555192688416112, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.45480275060594, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3436892044586426],
[0.9976013234917548, 2.002398676508243, 0, 1, 0.3325337744972519, 0, 0.499401049217525, 1.453060040114294, 0.6674662255027481, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9982244948633648, 2.001775505136633, 2, 1, 0.3327414982877885, 2.003557326324432, 0.4995565174186424, -4.376049027419399, 0.963159891250058, 0.2584704965485234, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 4, 0, 0.3333333333333333, 4.000000000000004, 0, -11.63842200484752, 1, 0.01234567901234551, 0.3436892044586426],
[0.4986334512148509, 2.501366548785147, 0, 1, 0.1662111504049504, 0, 0.3997814716462391, 1.163206369184477, 0.8337888495950496, 1, 0.3436892044586426],
[0.518500532653912, 1.70876797778822, 0, 1, 0.2327965982651033, 0, 0.5852169592353733, 1.702750483993729, 0.7672034017348968, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[1.00001409986931, 1.79719450223336, 0, 1, 0.357504298791873, 0, 0.5564228016262611, 1.618970844611494, 0.642495701208127, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.90960550121188, 0.4444444444444445, 1, 0.3436892044586426],
[0.7971915819738568, 2.202808418026142, 2, 1, 0.265730527324619, 2.508807224291022, 0.4539659426651658, -5.978777497135854, 0.9812360464982385, 0.1743102324531374, 0.3436892044586426],
[0.999682935521665, 1.284123850666296, 0, 2, 0.4377265807105757, 0, 1.55748216884396, 4.531658686507792, 0.3161513980394208, 1, 0.3436892044586426],
[0.001286697752575095, 2.550860220178678, 0, 1, 0.0005041628847989992, 0, 0.3920246166722353, 1.140636981280013, 0.999495837115201, 1, 0.3436892044586426],
[0.995565547829483, 2.004434452170514, 0, 1, 0.331855182609828, 0, 0.4988938395651421, 1.451584260119453, 0.6681448173901721, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991129267453128, 2.000887073254685, 0, 1, 0.3330376422484378, 0, 0.4997783300050906, 1.454157778369296, 0.6669623577515622, 1, 0.3436892044586426],
[0.9992850966135648, 2.000203653173998, 1, 1, 0.33315180684853, 1.000715414838926, 0.4999490918902995, -1.457032448072968, 0.8890098735935599, 0.5553134872906197, 0.3436892044586426],
[0.9991999611232565, 2.000800038876741, 0, 3, 0.3330666537077524, 0, 1.499400210769795, 4.362663101774043, 0.2966520113854153, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9973392577228782, 2.002660742277119, 0, 1, 0.3324464192409596, 0, 0.4993356981986639, 1.452869894430306, 0.6675535807590404, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 4, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 2.000000000000002, 2.90960550121188, 0.4609053497942389, 0.868312757201646, 0.3436892044586426],
[0.9973371728918704, 2.002662827108127, 0, 2, 0.3324457242972904, 0, 0.9986703567509801, 2.905736763899879, 0.4456287110089693, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009190191504611, 2.49899364993328, 1, 1, 0.1669778671601984, 1.996330667771331, 0.4001610808521658, -4.644223810967091, 0.9721183918786309, 0.3060741261990281, 0.3436892044586426],
[0.2645442631026992, 2.051601679455242, 0, 21, 0.1142174412422983, 0, 10.2359050542287, 29.78244565566628, 0.07831944809041112, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991123061226304, 2.000887693877367, 0, 2, 0.3330374353742104, 0, 0.9995563499740223, 2.908314654655679, 0.4448390626122105, 1, 0.3436892044586426],
[0.9996427068639668, 2.000357293136031, 1, 1, 0.3332142356213225, 1.000357420840046, 0.4999106926704401, -1.45610255334577, 0.8889682731792978, 0.5553967444219428, 0.3436892044586426],
[0.5027845110053943, 2.321756590561897, 0, 1, 0.1780057336487005, 0, 0.4307083714395686, 1.253191446958577, 0.8219942663512996, 1, 0.3436892044586426],
[0.9420875209225942, 2.057912479077406, 1, 1, 0.3140291736408647, 1.061472504190154, 0.4859293143741056, -1.674603631273805, 0.9013856781024356, 0.529444025384165, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.2262811317025442, 2.598884101119503, 1, 1, 0.08009483094074214, 4.41928141544979, 0.384780529293029, -11.7388059730059, 0.9935848180565741, 0.1537744799380582, 0.3436892044586426],
[0.824796450407185, 1.99832705702733, 1, 0, 0.2921574094208547, 1.212420348688844, 0, -3.527664916326283, 1, 0.2921574094208548, 0.3436892044586426],
[0, 2.551437836419561, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.698943934559401, 0, 0, 0.228174520637612, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.797383913767068, 1.201728818699047, 1, 0, 0.5993052192770066, 0.5563641647955659, 0, -1.61880023456633, 1, 0.5993052192770066, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999642865490064, 0, 1, 0.3333730196700018, 0, 0.5000892995734637, 1.455062577136144, 0.6666269803299982, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.9996426814535134, 2.000357318546484, 1, 2, 0.3332142271511714, 1.000357446268668, 0.9998213726401921, -0.001559762778467307, 0.7408995347939613, 0.7035448670865662, 0.3436892044586426],
[0.2242810817902187, 2.598985179089466, 0, 1, 0.07944028691092574, 0, 0.3847655646694923, 1.119516003639249, 0.9205597130890742, 1, 0.3436892044586426],
[1.000914342110902, 2.009906739598008, 0, 1, 0.3324389975185087, 0, 0.4975355225685771, 1.452853741903311, 0.6675610024814913, 1, 0.3424539636844524],
[1.003607027236303, 2.007214054472607, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424539636844524],
[0.7980949401591861, 2.199404185523287, 1, 2, 0.266253602318391, 1.25298376130607, 0.9093371801164211, -0.9998759831020568, 0.825077015749262, 0.6049628437085242, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.057316086545947, 0, 0, 0.2796799566768435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7248025309250875, 2.226078950563367, 0, 1, 0.2456223794388007, 0, 0.4492203655880776, 1.307054046971481, 0.7543776205611994, 1, 0.3436892044586426],
[1.797379522695638, 1.202620477304362, 1, 0, 0.5991265075652127, 0.5563655240158961, 0, -1.61880418936128, 1, 0.5991265075652127, 0.3436892044586426],
[0.7188609702183894, 2.233713229013023, 1, 2, 0.2434692311561609, 1.391089572850507, 0.8953700833314712, -1.442348153762529, 0.8510325814498994, 0.5670080844137739, 0.3436892044586426],
[0.7242721309695025, 2.226609005579333, 0, 1, 0.2454426652428859, 0, 0.4491134265128033, 1.306742896449768, 0.7545573347571142, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.498712881414794, 0, 1, 0.1668463665716371, 0, 0.4002060450554011, 1.164441710311443, 0.8331536334283629, 1, 0.3436892044586426],
[1.000004700812335, 1.999108226127982, 0, 2, 0.3334334935605562, 0, 1.000446085839858, 2.910903435025539, 0.4443109075068851, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991084901800119, 2.000891509819986, 0, 1, 0.3330361633933375, 0, 0.4997772218494579, 1.454154554073571, 0.6669638366066625, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678622006232, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2852721403064134, 1.252712337990474, 0, -3.644898710053074, 1, 0.2852721403064133, 0.3436892044586426],
[1.000004701842858, 1.798263160357876, 0, 1, 0.3573656101158204, 0, 0.5560921349247836, 1.618008734957808, 0.6426343898841795, 1, 0.3436892044586426],
[0.7977412671600238, 2.198396936476736, 1, 2, 0.2662564985125562, 1.253539262874066, 0.9097538150709501, -1.000280030164536, 0.8250736208889902, 0.6049675214819132, 0.3436892044586426],
[0.9991127324742368, 2.000887267525761, 0, 1, 0.3330375774914126, 0, 0.4997782814803809, 1.454157637181534, 0.6669624225085875, 1, 0.3436892044586426],
[0.7324602896323212, 2.215505981600992, 0, 2, 0.2484629138330978, 0, 0.9027283232856538, 2.626583295531712, 0.5648079918842377, 1, 0.3436892044586426],
[0.9948535849619705, 2.005146415038027, 1, 1, 0.3316178616539904, 1.005173037636715, 0.4987166984417121, -1.47358815064541, 0.8900295938320348, 0.5532653171400157, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991120594861022, 2.000887940513896, 0, 5, 0.3330373531620343, 0, 2.498890566912923, 7.270785740416307, 0.1319798285769133, 1, 0.3436892044586426],
[0.9996427704606184, 2.000101763302456, 1, 2, 0.3332426342341231, 1.000357357197929, 0.9999491209375828, -0.001187806468896646, 0.7408616646452021, 0.7035827551180242, 0.3436892044586426],
[1.02429093796578, 1.975709062034218, 1, 1, 0.3414303126552602, 0.9762851187436834, 0.5061473975173176, -1.36791530000745, 0.8834253416001311, 0.5662859669106517, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991129118643038, 2.000887088135694, 0, 1, 0.3330376372881015, 0, 0.4997783262881364, 1.454157767554426, 0.6669623627118985, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9833395112526211, 2.016660488747377, 1, 2, 0.3277798370842073, 1.016942763467478, 0.9917385753128306, -0.07333424450834233, 0.7481142185313365, 0.6962371881198661, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.017191542673668, 0, 2, 0.1987579875846907, 0, 0.9914774862426392, 2.884808348299306, 0.6419887624593346, 1, 0.3436892044586426],
[0.9996448908869474, 2.00035510911305, 1, 1, 0.3332149636289827, 1.000355235260331, 0.4999112384817494, -1.456094606075419, 0.8889677880137357, 0.5553977152717011, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.90960550121188, 0.4444444444444445, 1, 0.3436892044586426],
[1.002149622909946, 1.499568790239816, 1, 1, 0.4005845012941325, 0.997854988056869, 0.6668583705586969, -0.963069579155205, 0.8395320573229312, 0.6407010599111962, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000002, 0, -5.819211002423759, 1, 0.1111111111111109, 0.3436892044586426],
[0.7972086021018417, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2850014838016779, 1.254376831062157, 0, -3.649741728251172, 1, 0.2850014838016779, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7246703841260768, 2.226123377510908, 0, 0, 0.2455848977137792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.2247715509125214, 1.977849594795199, 0, 1, 0.1020473045718902, 0, 0.5055996182073426, 1.471095430546709, 0.8979526954281098, 1, 0.3436892044586426],
[0.5166925682549494, 2.48330743174505, 0, 1, 0.1722308560849831, 0, 0.4026887638705643, 1.171665442634004, 0.8277691439150169, 1, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.8156345472621658, 1.990886037239384, 0, 2, 0.290621259564724, 0, 1.004577842523449, 2.922925217001787, 0.5032181973815387, 1, 0.3436892044586426],
[0.4978339929248362, 2.502166007075162, 1, 0, 0.1659446643082788, 2.008701724293427, 0, -5.844529587297938, 1, 0.1659446643082788, 0.3436892044586426],
[0.4994338356249337, 2.500566164375064, 1, 0, 0.1664779452083114, 2.002267224744026, 0, -5.825807732011455, 1, 0.1664779452083114, 0.3436892044586426],
[0.002927422112097788, 2.997072577887901, 0, 1, 0.0009758073706992633, 0, 0.3336589201669319, 0.9708158296461196, 0.9990241926293008, 1, 0.3436892044586426],
[0.5467460724577853, 2.452941512394478, 1, 0, 0.1822676718798077, 1.829002621829004, 0, -5.321676090204617, 1, 0.1822676718798077, 0.3436892044586426],
[0.9992000354835323, 2.000799964516466, 0, 1, 0.333066678494511, 0, 0.4998000888318041, 1.454221087971202, 0.666933321505489, 1, 0.3436892044586426],
[0.002175491023240591, 2.550680680948297, 0, 2, 0.0008521792363885848, 0, 0.7841044215916655, 2.281434538587666, 0.9982963677366737, 1, 0.3436892044586426],
[1.025179260273693, 1.974820739726305, 1, 1, 0.3417264200912312, 0.9754391634230186, 0.5063750749035543, -1.364791452377168, 0.8832230538116314, 0.5666758939940938, 0.3436892044586426],
[0.8540039005080501, 2.201705447364619, 1, 0, 0.2794781189194556, 1.17095483920518, 0, -3.64489673954732, 1, 0.2794781189194556, 0.321258713998742],
[0.00625840182374963, 2.549265488800703, 1, 2, 0.002448970188347707, 159.7852020631147, 0.78453970713772, -462.6292018872828, 0.9999820370102268, 0.007328932887681217, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678673803708, 2.058014172356978, 1, 0, 0.2794779564043949, 1.252712329861957, 0, -3.644898686402297, 1, 0.2794779564043949, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.002647556596285, 1.497741745739573, 0, 0, 0.4009965790765517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9964526603539395, 2.003547339646058, 0, 2, 0.3321508867846468, 0, 0.9982294705116951, 2.904453958872647, 0.4460224380225337, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.7982679398587537, 2.201732060141245, 1, 1, 0.2660893132862513, 1.252712216122498, 0.4541878724043507, -2.323390823333924, 0.9291964773548511, 0.4613751039273539, 0.3436892044586426],
[0.5009192327931467, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2002940463749788, 1.996329816333779, 0, -5.808532215838059, 1, 0.2002940463749788, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.999113189600448, 2.00088681039955, 0, 1, 0.3330377298668162, 0, 0.499778395660629, 1.454157969401012, 0.6669622701331838, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.057316086545947, 0, 0, 0.2796799566768435, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0, 2.551437836419561, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9976013188719034, 2.002398681128094, 0, 1, 0.3325337729573014, 0, 0.4994010480653276, 1.453060036761854, 0.6674662270426986, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.449604420424385, 0, 1, 0.1696238532560861, 0, 0.4082291784184295, 1.187785863281467, 0.8303761467439139, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.200130436214434, 0, 1, 0.2663610947924969, 0, 0.4545185065121001, 1.322469546950213, 0.7336389052075031, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.450404459301128, 0, 0, 0.1695778637061582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.497741745739573, 2.502258254260425, 0, 0, 0.1659139152465245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9945414801161393, 2.004571526305297, 0, 3, 0.3316118725725622, 0, 1.49657917446798, 4.354454999031164, 0.298597509266383, 1, 0.3436892044586426],
[0.9836967340809087, 2.016303265919089, 0, 1, 0.3278989113603031, 0, 0.4959571394356549, 1.443039621267287, 0.6721010886396969, 1, 0.3436892044586426],
[0.9955607599813189, 2.004439240018679, 0, 2, 0.3318535866604398, 0, 0.9977852957924345, 2.903161585665987, 0.4464196296585184, 1, 0.3436892044586426],
[1.00000470184396, 1.798263160232593, 0, 1, 0.3573656101320733, 0, 0.5560921349635261, 1.618008735070533, 0.6426343898679268, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.000004701842857, 1.798263160357946, 0, 1, 0.3573656101158113, 0, 0.5560921349247621, 1.618008734957745, 0.6426343898841886, 1, 0.3436892044586426],
[0.997338701612643, 2.002399189342421, 0, 1, 0.3324752821304357, 0, 0.4994009213159917, 1.453059667971289, 0.6675247178695642, 1, 0.3436892044586426],
[0.5012757952404715, 2.497837480369101, 0, 2, 0.1671413345128109, 0, 0.8006926053909896, 2.329699609425294, 0.6936535566771016, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9973324313208044, 2.002355264134732, 1, 3, 0.3324787553156757, 1.002674703634838, 1.498235629678021, 1.441886796600897, 0.5941118399037563, 0.8014543534553172, 0.3436892044586426],
[1.002865400767895, 2.008415014956652, 0, 1, 0.3330362046427331, 0, 0.4979050607334676, 1.454154644007983, 0.6669637953572669, 1, 0.3424017265186647],
[0.5022708354540137, 2.509009580270534, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.5516620960920201, 2.459618319632529, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.5041468148968076, 1.785984895954283, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.5022708354540137, 2.509009580270534, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.801801401643495, 2.209479014081052, 0, 0, 0.2662659370600572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.801801401643495, 2.007878625584087, 0, 1, 0.2853710721055531, 0, 0.4980380722510566, 1.454543110266437, 0.7146289278944469, 1, 0.3424017265186647],
[0.2285698980396547, 1.990877122458576, 0, 1, 0.102985066067648, 0, 0.5022911704189353, 1.46696447919796, 0.897014933932352, 1, 0.3424017265186647],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5009207129736973, 2.002579987689255, 1, 2, 0.2000881057636806, 1.996323917339207, 0.998711668095599, -2.902658088475556, 0.8959154044955084, 0.4881691444366493, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.503141491188457, 1.778411265133035, 0, 1, 0.2205259071018209, 0, 0.5622996320399456, 1.63607010271284, 0.779474092898179, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0, 2.551437836419561, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.45480275060594, 0.6666666666666667, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.291767056250991, 1, 1, 0.4363445216966594, 1.000000000000001, 0.7741333819908934, -0.6571827542994206, 0.8096034583853138, 0.6822925017786323, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.449604293327312, 0, 1, 0.1696238605641343, 0, 0.4082291995992928, 1.187785924909424, 0.8303761394358657, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991999611232777, 2.00080003887672, 0, 1, 0.3330666537077595, 0, 0.4998000702566037, 1.454221033924697, 0.6669333462922405, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.002647556596285, 1.497741745739573, 0, 0, 0.4009965790765517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 1, 0.2662659370600571, 0, 0.454297204081988, 1.321825644182127, 0.7337340629399429, 1, 0.3436892044586426],
[0.5012803619015038, 2.498719638098496, 0, 1, 0.167093453967168, 0, 0.4002049628749032, 1.164438561593113, 0.832906546032832, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7972085982668355, 2.202791401733163, 1, 0, 0.2657361994222786, 1.25437683709639, 0, -3.649741745808412, 1, 0.2657361994222787, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.798797811180172, 0, 0, 0.3572962634190172, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678998830167, 2.201732100116982, 1, 0, 0.2660892999610057, 1.252712278855941, 0, -3.644898537994913, 1, 0.2660892999610056, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7971914767828208, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2849971063474382, 1.254403777666617, 0, -3.64982013223975, 1, 0.2849971063474381, 0.3436892044586426],
[0.2247714302522323, 1.987815521330331, 0, 3, 0.1015876144851453, 0, 1.509194373325082, 4.39116025102467, 0.7251488982028175, 1, 0.3436892044586426],
[1.798797811180172, 1.201202188819827, 0, 0, 0.5995992703933908, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982678622007245, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2852721403064393, 1.252712337990315, 0, -3.644898710052612, 1, 0.2852721403064393, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.798797811180172, 0, 0, 0.3572962634190172, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.999200440163626, 2.000799559836372, 0, 1, 0.3330668133878756, 0, 0.4998001899209641, 1.454221382100778, 0.6669331866121244, 1, 0.3436892044586426],
[0.5033971767819606, 1.69794833695752, 0, 2, 0.2286770403101452, 0, 1.177892139865523, 3.427201449986955, 0.5949391081447173, 1, 0.3436892044586426],
[0.7246703841260768, 2.226123377510908, 0, 0, 0.2455848977137792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7982676111927703, 2.201732388807228, 1, 1, 0.2660892037309235, 1.25271273189426, 0.4541878046049649, -2.323392521295746, 0.9291965356578431, 0.4613749431196901, 0.3436892044586426],
[0.9976017769271353, 2.002398223072862, 0, 1, 0.3325339256423787, 0, 0.499401162304973, 1.453060369154155, 0.6674660743576213, 1, 0.3436892044586426],
[0.9973388222720933, 2.002399080566619, 0, 2, 0.3324753210366451, 0, 0.9988018968896351, 2.90611949381094, 0.4455891970251299, 1, 0.3436892044586426],
[0.9982259226644036, 2.001774077335594, 0, 1, 0.3327419742214681, 0, 0.4995568737362321, 1.453513427991148, 0.6672580257785319, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9405908730786212, 2.059409126921379, 1, 0, 0.3135302910262071, 1.063161496269817, 0, -3.093380538223309, 1, 0.313530291026207, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2854074731619652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009192271707827, 2.499080772829217, 1, 0, 0.1669730757235943, 1.99632983874077, 0, -5.808532281033564, 1, 0.1669730757235943, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 2.321970913928499, 0, 0, 0.1778390577923626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.2295021280446481, 2.060996069612432, 0, 3, 0.1001974715716445, 0, 1.455606851576455, 4.235241702948554, 0.7285202493597618, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[0.5040256950983126, 1.700012960392792, 0, 1, 0.2286827836901097, 0, 0.5882308095868559, 1.711519599556232, 0.7713172163098903, 1, 0.3436892044586426],
[0.5522521030309027, 2.447747896969098, 2, 2, 0.1840840343436342, 3.621534420644995, 0.8170776093716522, -8.159862965992037, 0.978492800024547, 0.1568622178302959, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9426839134540533, 2.057316086545947, 0, 0, 0.3142279711513511, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7995159385186618, 2.200484061481337, 0, 1, 0.266505312839554, 0, 0.4544454638434478, 1.322257021599679, 0.733494687160446, 1, 0.3436892044586426],
[0.9991129267452746, 2.000799706154256, 0, 11, 0.3330473413752699, 0, 5.497801687077983, 15.99643403329404, 0.01161569203068617, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.798797811180172, 0, 0, 0.3572962634190172, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9992850966135648, 2.000714903386433, 0, 1, 0.3330950322045219, 0, 0.4998213380164203, 1.454282914715657, 0.6669049677954781, 1, 0.3436892044586426],
[0.9990627060935681, 1.285383859677228, 0, 1, 0.4373324905310156, 0, 0.7779777165173906, 2.263608243799254, 0.5626675094689844, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 2.499610697664141, 0, 0, 0.1667964341119529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.90960550121188, 1, 0.3333333333333333, 0.3436892044586426],
[1.000004700812793, 1.99910822604108, 0, 1, 0.3334334935703195, 0, 0.5002230429416735, 1.455451717576038, 0.6665665064296804, 1, 0.3436892044586426],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5022582542604265, 1.779294502061066, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.001417495406196, 1.998582504593801, 0, 1, 0.3338058318020656, 0, 0.5003546251913394, 1.455834570013528, 0.6661941681979344, 1, 0.3436892044586426],
[0.5495955406988731, 2.450404459301128, 0, 0, 0.183198513566291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5003893023358588, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2001245573512878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.5009192596410267, 2.498193667111617, 1, 1, 0.1670224736030224, 1.99632970933605, 0.4002892222347952, -4.643848181426693, 0.9721034933115278, 0.3061484405175724, 0.3436892044586426],
[0.5041468148968076, 1.785984895954283, 0, 0, 0.2201387861266065, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[1.001978089793234, 2.009302325931312, 1, 1, 0.3327415422891287, 0.9980258153213291, 0.4976851850985141, -1.461267836789196, 0.889283066035052, 0.5547661506133093, 0.3424017265186647],
[0.9982182548725463, 2.013062160851999, 1, 1, 0.3314929588290649, 1.001784925409605, 0.4967556489049322, -1.474961244031996, 0.8901124182467519, 0.5530983359048818, 0.3424017265186647],
[1.003760138574848, 2.007520277149697, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3424017265186647],
[0.9984007142955409, 2.001599285704457, 0, 2, 0.3328002380985139, 0, 0.9992009960655568, 2.907280714968731, 0.4451555222813996, 1, 0.3436892044586426],
[0.7987978111801712, 2.201202188819828, 0, 0, 0.2662659370600571, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[1.001424926063215, 1.998575073936782, 1, 1, 0.3338083086877388, 0.9985771014619969, 0.5003564854985435, -1.449625445024434, 0.8885720130510312, 0.5561886304265089, 0.3436892044586426],
[0.9999999999999992, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3436892044586426],
[0.7242721665741516, 2.226608962163187, 0, 1, 0.2454426779583841, 0, 0.4491134352699647, 1.306742921929654, 0.754557322041616, 1, 0.3436892044586426]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node106":{
"Global MG94xREV":0.0007675940092779677,
"Nucleotide GTR":0.0007630094515110183,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node107":{
"Global MG94xREV":0.0004520242898675009,
"Nucleotide GTR":0.0004493245144081912,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.001220400536270949,
"Nucleotide GTR":0.001213111531028956,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.001220305968062197,
"Nucleotide GTR":0.001213017527641462,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node149":{
"Global MG94xREV":0.001220118377319491,
"Nucleotide GTR":0.00121283105730953,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node161":{
"Global MG94xREV":0.001220614121265227,
"Nucleotide GTR":0.001213323840358321,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node222":{
"Global MG94xREV":0.001219969583283668,
"Nucleotide GTR":0.001212683151965963,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node223":{
"Global MG94xREV":0.001220944118616313,
"Nucleotide GTR":0.001213651866756143,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node229":{
"Global MG94xREV":0.001220223984917698,
"Nucleotide GTR":0.001212936034152248,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"Global MG94xREV":0.001221310094490342,
"Nucleotide GTR":0.001214015656790372,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":0.001226217248272101,
"Nucleotide GTR":0.001218893501940598,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAC", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001220118387425087,
"Nucleotide GTR":0.001212831067354771,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.001220305967839815,
"Nucleotide GTR":0.00121301752742041,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.001220118395168356,
"Nucleotide GTR":0.001212831075051789,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node25":{
"Global MG94xREV":0.001220088712826105,
"Nucleotide GTR":0.001212801569991293,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node251":{
"Global MG94xREV":0.001220305967844254,
"Nucleotide GTR":0.001213017527424823,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.001220118391391137,
"Nucleotide GTR":0.00121283107129713,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node257":{
"Global MG94xREV":0.00122030598047866,
"Nucleotide GTR":0.001213017539983767,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node260":{
"Global MG94xREV":0.001220118382545961,
"Nucleotide GTR":0.001212831062504783,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node263":{
"Global MG94xREV":0.00122011839146132,
"Nucleotide GTR":0.001212831071366895,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node266":{
"Global MG94xREV":0.001220118391934545,
"Nucleotide GTR":0.001212831071837293,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node269":{
"Global MG94xREV":0.001220117810494356,
"Nucleotide GTR":0.001212830493869834,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.001219985411641973,
"Nucleotide GTR":0.001212698885787285,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node279":{
"Global MG94xREV":0.001220191604548062,
"Nucleotide GTR":0.001212903847178695,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node284":{
"Global MG94xREV":0.001174165093588515,
"Nucleotide GTR":0.001167152235704754,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node285":{
"Global MG94xREV":4.627584249093816e-05,
"Nucleotide GTR":4.599945383945102e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node291":{
"Global MG94xREV":0.001220589748394608,
"Nucleotide GTR":0.001213299613057928,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.001220400536058805,
"Nucleotide GTR":0.001213111530818079,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node298":{
"Global MG94xREV":0.001220230809654078,
"Nucleotide GTR":0.001212942818126979,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.001220098617352701,
"Nucleotide GTR":0.001212811415361781,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node305":{
"Global MG94xREV":0.001220098617358826,
"Nucleotide GTR":0.00121281141536787,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node308":{
"Global MG94xREV":0.001220267258540676,
"Nucleotide GTR":0.001212979049317729,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node315":{
"Global MG94xREV":0.00122009861739237,
"Nucleotide GTR":0.001212811415401213,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node333":{
"Global MG94xREV":0.001219990418145198,
"Nucleotide GTR":0.001212703862388499,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":5.970621740869459e-07,
"Nucleotide GTR":5.93496140487835e-07,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node377":{
"Global MG94xREV":0.001220569380739478,
"Nucleotide GTR":0.00121327936705134,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node401":{
"Global MG94xREV":0.0012194986227297,
"Nucleotide GTR":0.001212215004286823,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.001220400655925824,
"Nucleotide GTR":0.001213111649969174,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406_1":{
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node409":{
"Global MG94xREV":0.001226352198333023,
"Nucleotide GTR":0.001219027645994253,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node413":{
"Global MG94xREV":0.001220569380703951,
"Nucleotide GTR":0.001213279367016026,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node417":{
"Global MG94xREV":0.001220737827140245,
"Nucleotide GTR":0.001213446807383474,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.001220118395598672,
"Nucleotide GTR":0.001212831075479535,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node425":{
"Global MG94xREV":0.001220305981179344,
"Nucleotide GTR":0.001213017540680266,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node428":{
"Global MG94xREV":0.001220118395470941,
"Nucleotide GTR":0.001212831075352568,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.001220305970015701,
"Nucleotide GTR":0.0012130175295833,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node434":{
"Global MG94xREV":0.00122030596874572,
"Nucleotide GTR":0.001213017528320903,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node438":{
"Global MG94xREV":0.001181319154708383,
"Nucleotide GTR":0.00117426356823884,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node439":{
"Global MG94xREV":3.912353695850781e-05,
"Nucleotide GTR":3.888986640732367e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node445":{
"Global MG94xREV":0.001220305975411244,
"Nucleotide GTR":0.001213017534946616,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node453":{
"Global MG94xREV":0.001220364053057585,
"Nucleotide GTR":0.001213075265716456,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.0003473816275697875,
"Nucleotide GTR":0.0003453068443907618,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node460":{
"Global MG94xREV":0.0007954350757175552,
"Nucleotide GTR":0.0007906842334618753,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node461":{
"Global MG94xREV":7.661369620957863e-05,
"Nucleotide GTR":7.615611067377859e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node488":{
"Global MG94xREV":0.001220197052454953,
"Nucleotide GTR":0.001212909262547236,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node489":{
"Global MG94xREV":0.000472737790781419,
"Nucleotide GTR":0.0004699143011706852,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node504":{
"Global MG94xREV":0.001220400652939174,
"Nucleotide GTR":0.001213111647000365,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node509":{
"Global MG94xREV":0.001220118388025092,
"Nucleotide GTR":0.001212831067951189,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node516":{
"Global MG94xREV":0.001220307126536606,
"Nucleotide GTR":0.001213018679196729,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node520":{
"Global MG94xREV":0.001178386220905641,
"Nucleotide GTR":0.001171348151775058,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node521":{
"Global MG94xREV":4.205569400779498e-05,
"Nucleotide GTR":4.180451075691313e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.001220098810297784,
"Nucleotide GTR":0.001212811607154474,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node532":{
"Global MG94xREV":0.00120257691753216,
"Nucleotide GTR":0.001195394366234225,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node536":{
"Global MG94xREV":0.001219499633541296,
"Nucleotide GTR":0.001212216009061211,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.001220098617393058,
"Nucleotide GTR":0.001212811415401896,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node549":{
"Global MG94xREV":0.001220067140393196,
"Nucleotide GTR":0.001212780126402622,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.001219888200728422,
"Nucleotide GTR":0.001212602255478901,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node567":{
"Global MG94xREV":0.00122058974854184,
"Nucleotide GTR":0.001213299613204281,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node572":{
"Global MG94xREV":0.00122078138362715,
"Nucleotide GTR":0.001213490103723442,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node616":{
"Global MG94xREV":0.001219848035123244,
"Nucleotide GTR":0.001212562329768166,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node75":{
"Global MG94xREV":0.001220145215712207,
"Nucleotide GTR":0.00121285773540636,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.00121965991871248,
"Nucleotide GTR":0.001212375336907797,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node88":{
"Global MG94xREV":0.00122087533592612,
"Nucleotide GTR":0.001213583494879754,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node96":{
"Global MG94xREV":0.001220216464925266,
"Nucleotide GTR":0.001212928559073974,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node99":{
"Global MG94xREV":0.001219885237313533,
"Nucleotide GTR":0.001212599309763403,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219744977155757,
"Nucleotide GTR":0.001212459887328157,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "G", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GGA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002453379012559671,
"Nucleotide GTR":0.002438725878648579,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "V", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "V", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GTG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GTC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122068487918808,
"Nucleotide GTR":0.001213394175670026,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "CTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001235240774190171,
"Nucleotide GTR":0.001227863133644627,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "-", "-", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "Y", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "NNN", "NNN", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TAT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220855019118258,
"Nucleotide GTR":0.001213563299416743,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Q", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAA", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220459992566082,
"Nucleotide GTR":0.001213170632213422,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "L", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "TTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122080371968947,
"Nucleotide GTR":0.001213512306380646,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "L", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TTG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219929258639003,
"Nucleotide GTR":0.001212643068165626,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "I", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ATA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220746722776696,
"Nucleotide GTR":0.001213455649889547,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAC", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219657822059577,
"Nucleotide GTR":0.001212373252777434,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTG", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "S", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "AGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTN", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "HPRL", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CNT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0]
],
"original name":"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001287477939977857,
"Nucleotide GTR":0.001279788305981033,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACG", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221314131915704,
"Nucleotide GTR":0.001214019670101671,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "K", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "AAA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220727830662755,
"Nucleotide GTR":0.001213436870611281,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "L", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TTA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219742814811095,
"Nucleotide GTR":0.001212457737898388,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "V", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "GTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220957903070419,
"Nucleotide GTR":0.001213665568880753,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219890779058207,
"Nucleotide GTR":0.001212604818409267,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "CTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "H", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "CAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460260912176,
"Nucleotide GTR":0.001213170898956783,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "V", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GTT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "I", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ATA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460260912176,
"Nucleotide GTR":0.001213170898956783,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "C", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "TGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220030026035868,
"Nucleotide GTR":0.001212743233715751,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTT", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "M", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ATG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219661808922207,
"Nucleotide GTR":0.001212377215827992,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "E", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "GAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220810387426113,
"Nucleotide GTR":0.001213518934293341,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "T", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "ACT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "SRGC", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "NGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220348434057139,
"Nucleotide GTR":0.001213059740002578,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTC", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001226171875347468,
"Nucleotide GTR":0.001218848400011819,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "L", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "CTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220196963782147,
"Nucleotide GTR":0.001212909174404039,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "V", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GTA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460259333258,
"Nucleotide GTR":0.001213170897387296,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "F"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "ILVF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "NTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCN", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002442364842943744,
"Nucleotide GTR":0.002427777492632121,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "C", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "F", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "TGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TTC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001220715613415861,
"Nucleotide GTR":0.001213424726333527,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGT", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219665523891456,
"Nucleotide GTR":0.001212380908609093,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "V", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "GTC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220443895844088,
"Nucleotide GTR":0.001213154631631252,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "M", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ATG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220591691928788,
"Nucleotide GTR":0.001213301544984089,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00121998028359807,
"Nucleotide GTR":0.001212693788371309,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACT", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220443880148266,
"Nucleotide GTR":0.001213154616029173,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "F", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "TTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "NHDY", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "NAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220854556752071,
"Nucleotide GTR":0.001213562839812099,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "I", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "ATT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297479092864,
"Nucleotide GTR":0.001213009089373634,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220064529376215,
"Nucleotide GTR":0.001212777530980289,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220480734569079,
"Nucleotide GTR":0.001213191250332036,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "H", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CAT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "KTRI", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "NTSI", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "ANA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ANT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418698_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223008113464632,
"Nucleotide GTR":0.00121570353411949,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCT", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418713_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "DAGV", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GNT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418728_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221778835590106,
"Nucleotide GTR":0.001214481598271294,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012228366985104,
"Nucleotide GTR":0.001215533142963973,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATT", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418738_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220684879525391,
"Nucleotide GTR":0.001213394176005324,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "P", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "CCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002440825350496676,
"Nucleotide GTR":0.002426247195009359,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "F", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "P", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "TTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CCA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220423463679078,
"Nucleotide GTR":0.001213134321500077,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "V", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GTC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220968040637757,
"Nucleotide GTR":0.001213675645900117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "Y", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TAT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220460259298548,
"Nucleotide GTR":0.001213170897352792,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221314130950804,
"Nucleotide GTR":0.001214019669142532,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "D", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GAT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219980283627995,
"Nucleotide GTR":0.001212693788401056,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "Y", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "TAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220423464765019,
"Nucleotide GTR":0.001213134322579532,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "C", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "TGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221398330629716,
"Nucleotide GTR":0.001214103365927614,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCA", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "NHDY", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "NAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "ILVF", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "NTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCN", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "EAGV", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GNA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAN", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTN", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "SL", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TNA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "KQE", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "NAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":1.86758276744076e-05,
"Nucleotide GTR":1.856428379862949e-05,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "R", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "AGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225944739268562,
"Nucleotide GTR":0.001218622620533488,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "T", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001222116069762469,
"Nucleotide GTR":0.001214816818267511,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "D", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "GAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAN", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "I", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ATT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "TPAS", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "NCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220269074694784,
"Nucleotide GTR":0.001212980854624617,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGC", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "KN", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAN", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220640733600523,
"Nucleotide GTR":0.00121335029374789,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "F", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TTC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "QH", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAN", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "KN", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAN", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297479746936,
"Nucleotide GTR":0.0012130090900238,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220671928178281,
"Nucleotide GTR":0.001213381302011865,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAC", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAG", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221246706879186,
"Nucleotide GTR":0.00121395264777019,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTA", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221305736753428,
"Nucleotide GTR":0.001214011325080623,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAT", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122059149343562,
"Nucleotide GTR":0.001213301347676449,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001218775339917809,
"Nucleotide GTR":0.001211496041378151,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219661798952829,
"Nucleotide GTR":0.001212377205918159,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "G", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GGT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220508479607912,
"Nucleotide GTR":0.001213218829659915,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220640744179945,
"Nucleotide GTR":0.001213350304264124,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAT", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "NTSI", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ANT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "HPRL", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "NTSI", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CNT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ANT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "ED", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAN", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220301887007833,
"Nucleotide GTR":0.001213013470961741,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220443896420209,
"Nucleotide GTR":0.001213154632203932,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "V", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GTT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420669_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "SWL"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TNG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2]
],
"original name":"epi_isl_420671_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "YSCF", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TNC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420685_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420689_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420689_England_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220366386455658,
"Nucleotide GTR":0.001213077585177998,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "V", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "GTA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420704_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "ILV", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "NTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219955080369897,
"Nucleotide GTR":0.001212668735672783,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCG", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220548648568632,
"Nucleotide GTR":0.001213258758706154,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "V", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GTC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "C", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "TGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "HPRL", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CNT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220483509877561,
"Nucleotide GTR":0.001213194009064617,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "L", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TTG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221162008042185,
"Nucleotide GTR":0.00121386845480831,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "Y", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TAT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCT", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220684879496038,
"Nucleotide GTR":0.001213394175976145,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "S", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TCA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220324064874634,
"Nucleotide GTR":0.001213035516368272,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGT", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220299180201515,
"Nucleotide GTR":0.001213010780322187,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001220589744727788,
"Nucleotide GTR":0.001213299609413009,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221316076238887,
"Nucleotide GTR":0.001214021602812124,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "T", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "ACT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221653460403117,
"Nucleotide GTR":0.00121435697190436,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "D", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GAT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219964952918732,
"Nucleotide GTR":0.001212678549256501,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460131762838,
"Nucleotide GTR":0.001213170770578808,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTT", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAT", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220684879350103,
"Nucleotide GTR":0.001213394175831081,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCC", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225387957701704,
"Nucleotide GTR":0.001218069164418921,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "A", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "F", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "GCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTC", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421663_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001219862630793532,
"Nucleotide GTR":0.001212576838263863,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGC", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCN", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220460169103744,
"Nucleotide GTR":0.00121317080769669,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "L", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TTG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "NHDY", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "NAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421830_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421854_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421854_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421858_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001221431189199533,
"Nucleotide GTR":0.001214136028245233,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "N", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "AAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421858_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "KQE", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "NAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122035315913073,
"Nucleotide GTR":0.001213064436855036,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "M", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ATG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "QPRL", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CNA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTN", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421891_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421891_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "F", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTT", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421893_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002461908434824628,
"Nucleotide GTR":0.002447204357799572,
"amino-acid": [
["IM", "D", "MLV", "F", "M", "R", "I", "LF", "T", "I", "G", "TPAS", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "GAT", "NTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTN", "ACA", "ATA", "GGA", "NCT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "TPAS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "NCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421932_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220460250773805,
"Nucleotide GTR":0.001213170888878964,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "Y", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "TAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["IM", "NHDY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATN", "NAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "HPRL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CNT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421972_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220149861218037,
"Nucleotide GTR":0.001212862353166285,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "Y", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "TAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421993_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220968040605353,
"Nucleotide GTR":0.001213675645867907,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "I", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "ATT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421993_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220548660819148,
"Nucleotide GTR":0.001213258770883502,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAT", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220591509718053,
"Nucleotide GTR":0.001213301363861634,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "TPAS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "NCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220511936010794,
"Nucleotide GTR":0.001213222265418972,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220371928875091,
"Nucleotide GTR":0.001213083094494591,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "V", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GTT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220968040637757,
"Nucleotide GTR":0.001213675645900117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "N", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "AAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001226171875330194,
"Nucleotide GTR":0.001218848399994648,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "P", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "CCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "NHDY", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "NAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220192757265069,
"Nucleotide GTR":0.001212904993010947,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTC", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "TCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001257976483444369,
"Nucleotide GTR":0.001250463050837933,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGC", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "NNN", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220236960442701,
"Nucleotide GTR":0.001212948932179195,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "L", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CTT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "Y", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "TAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220400537278321,
"Nucleotide GTR":0.001213111532030309,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "ILVF", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "NTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "QPRL", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGN", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CNA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422532_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220350640212894,
"Nucleotide GTR":0.001213061932981774,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "L", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "TTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422532_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221035303640275,
"Nucleotide GTR":0.001213742507165365,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "H", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAT", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122029746588971,
"Nucleotide GTR":0.00121300907624934,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219657822070394,
"Nucleotide GTR":0.001212373252788186,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTG", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0224304904599006,
"Nucleotide GTR":0.02229652135903285,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "P", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "S", "F", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "F", "H", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "G", "I", "N", "F", "V", "E", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "-", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "T", "N", "A", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CCA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TCG", "TTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGT", "CTG", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "TTT", "CAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "GGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "GAA", "ATA", "ATT", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTG", "NNN", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "ACA", "AAT", "GCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220982483340668,
"Nucleotide GTR":0.001213690002342054,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACA", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAC", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422731_Netherlands_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297473600715,
"Nucleotide GTR":0.001213009083914286,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422731_Netherlands_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00122032665090526,
"Nucleotide GTR":0.001213038086953484,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTT", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002474900663762454,
"Nucleotide GTR":0.002460118988914376,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "L", "T", "-", "-", "-", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTA", "ACT", "NNN", "NNN", "NNN", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423005_Washington_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423005_Washington_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220428217184929,
"Nucleotide GTR":0.001213139046614978,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "P", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "CCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423047_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460248991173,
"Nucleotide GTR":0.00121317088710698,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "S", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "TCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002450084669340384,
"Nucleotide GTR":0.002435451211334276,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "I", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "H", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "ATC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "CAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423080_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "ILV", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "NTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCN", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423166_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220337486488093,
"Nucleotide GTR":0.00121304885781935,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423175_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220297471928869,
"Nucleotide GTR":0.001213009082252426,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAT", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "ILV", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "NTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["MLV", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["NTG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423239_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "TPAS", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "HPRL", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "NCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CNT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423290_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "NHDY", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "TPAS", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "NAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "NCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423291_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "ILV", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "NTA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423309_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220353181453738,
"Nucleotide GTR":0.001213064459044717,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTT", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220204483158635,
"Nucleotide GTR":0.001212916648870046,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "V", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GTT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423338_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "ILV", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "KTRI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "NTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ANA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423340_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "ILV", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "NTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423341_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220132126677631,
"Nucleotide GTR":0.001212844724547791,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "R", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CGA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423363_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACN", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423364_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423389_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220016251677007,
"Nucleotide GTR":0.001212729541626089,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "N", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAC", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423389_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423396_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220727555724727,
"Nucleotide GTR":0.00121343659731536,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGT", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423410_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCN", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423431_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "KTRI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ANA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423505_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423511_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001219862630792191,
"Nucleotide GTR":0.00121257683826253,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "N", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAC", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423511_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002443615187793439,
"Nucleotide GTR":0.002429020369630159,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "F", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TTT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423517_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "TPAS", "S", "D", "YSCF", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "NCT", "TCA", "GAT", "TNT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423540_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "ILVF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "NTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423540_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423542_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "ILVF", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "NTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423542_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "KQE", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "NAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122072754445402,
"Nucleotide GTR":0.001213436586111966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "F", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "TTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423561_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423562_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "ILVF", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "EAGV", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "ACT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "NTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GNA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423564_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "IM", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "ILVF", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATN", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "NTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423567_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTN", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423572_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTN", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423586_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCN", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423619_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "KN", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "YSCF", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "IMLVF", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAN", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TNT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "NTN", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423633_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423647_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423647_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423651_England_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "QH", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAN", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423651_England_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001224094447352959,
"Nucleotide GTR":0.00121678337973354,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "ED", "TPAS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAN", "NCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAC", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "DAGV", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GNC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423663_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423670_England_20200320_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423670_England_20200320_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACN", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "DAGV", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GNT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423712_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "NHDY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "NAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423726_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_10":{
"Global MG94xREV":0.00122072754445402,
"Nucleotide GTR":0.001213436586111966,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "L", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TTA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "NTSI", "KNQHEDY", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ANT", "NAN", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "KTRI", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "ANA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423821_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "NHDY", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "NAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423840_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "CW", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGN", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423846_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTN", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001219862630888458,
"Nucleotide GTR":0.001212576838358222,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "CGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423876_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "ILVF", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "NTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423897_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "KTRI", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ANA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "LF", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTN", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423914_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "F", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTT", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423919_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423922_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220727544608803,
"Nucleotide GTR":0.001213436586265823,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "S", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "TCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423922_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220247666466133,
"Nucleotide GTR":0.00121295957425947,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "C", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "TGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423926_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "KTRI", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ANA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "LF"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTN"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2]
],
"original name":"epi_isl_423957_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_423960_England_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "LF", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTN", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423960_England_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002442627988223902,
"Nucleotide GTR":0.002428039066241939,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "A", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GCT", "GCA", "CTC", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423995_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001226107771148145,
"Nucleotide GTR":0.00121878467868339,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "E", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "GAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423998_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424012_England_20200320_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCC", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424012_England_20200320_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424013_England_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACT", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424013_England_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "IM", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATN", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424021_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002441782374486408,
"Nucleotide GTR":0.00242719850304546,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "I", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATT", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAT", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424037_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424103_England_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424103_England_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424106_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424106_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "TPAS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "NCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424115_England_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424117_England_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTT", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424117_England_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "TPAS", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "RG", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "TPAS", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "NCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "NGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "NCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424122_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424136_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220443896576979,
"Nucleotide GTR":0.001213154632359764,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "V", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GTT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424136_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCN", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424155_England_20200320_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "DAGV", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GNT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424155_England_20200320_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220302725633623,
"Nucleotide GTR":0.001213014304578728,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "F", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "TTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "N", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAT", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220339420404565,
"Nucleotide GTR":0.001213050780185247,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGC", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220727544634053,
"Nucleotide GTR":0.001213436586290924,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAT", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424258_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCT", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424258_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220508479589426,
"Nucleotide GTR":0.001213218829641542,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424282_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "Y", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "ED", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "TAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAN", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424282_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424296_Washington_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001222324063678598,
"Nucleotide GTR":0.001215023569912189,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "K", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "R", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "AAA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "AGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424296_Washington_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297479329404,
"Nucleotide GTR":0.001213009089608761,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001219980286758843,
"Nucleotide GTR":0.001212693791513205,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "V", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GTA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001223825838472523,
"Nucleotide GTR":0.001216516375155527,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTA", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220727555629774,
"Nucleotide GTR":0.001213436597220971,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "TTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219977023832508,
"Nucleotide GTR":0.001212690548075132,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "F", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "TTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424574_Reykjavik_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "F", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "TTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424574_Reykjavik_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001219657822070394,
"Nucleotide GTR":0.001212373252788186,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "C", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220216711627319,
"Nucleotide GTR":0.001212928804302566,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "R", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CGC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460259298548,
"Nucleotide GTR":0.001213170897352792,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "C", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGT", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122068487918808,
"Nucleotide GTR":0.001213394175670026,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAC", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220236959938666,
"Nucleotide GTR":0.001212948931678169,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "I", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ATT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001219954791591911,
"Nucleotide GTR":0.001212668448619561,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "C", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TGT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220508479781051,
"Nucleotide GTR":0.001213218829832022,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "D", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAT", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220293958763227,
"Nucleotide GTR":0.001213005590069635,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "I", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ATT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220591514857863,
"Nucleotide GTR":0.001213301368970746,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221396025763524,
"Nucleotide GTR":0.001214101074827542,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220508479382756,
"Nucleotide GTR":0.001213218829436106,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "I", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATT", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "C", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGT", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424978_Taoyuan_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "F", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "TTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424978_Taoyuan_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAN", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "Y", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "TAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220520629582478,
"Nucleotide GTR":0.001213230907067137,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAT", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001220423601751347,
"Nucleotide GTR":0.001213134458747689,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTT", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425174_Wisconsin_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001220513938061641,
"Nucleotide GTR":0.001213224255512303,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCT", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTT", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425174_Wisconsin_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00122046027131603,
"Nucleotide GTR":0.001213170909298499,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "N", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAT", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425228_Prague_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220460260859602,
"Nucleotide GTR":0.001213170898904523,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "F", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "TTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425228_Prague_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220684879496038,
"Nucleotide GTR":0.001213394175976145,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACC", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425280_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425325_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220508489022126,
"Nucleotide GTR":0.001213218839017904,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "C", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425325_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425373_England_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220460259298548,
"Nucleotide GTR":0.001213170897352792,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "L", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CTT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425373_England_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425431_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTT", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425431_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220968040637757,
"Nucleotide GTR":0.001213675645900117,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "I", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "ATT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220499975413404,
"Nucleotide GTR":0.001213210376257847,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219924387056778,
"Nucleotide GTR":0.001212638225679577,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425602_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425608_England_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00122068487918808,
"Nucleotide GTR":0.001213394175670026,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAC", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425608_England_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425609_England_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "F", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTT", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425609_England_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220727544768332,
"Nucleotide GTR":0.001213436586424401,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "F", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TTC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425611_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425627_England_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "D", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "GAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425627_England_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425632_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220118392003126,
"Nucleotide GTR":0.001212831071905462,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTT", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425632_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001220758349853012,
"Nucleotide GTR":0.001213467207521599,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTT", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425639_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425643_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220160267551457,
"Nucleotide GTR":0.001212872697346489,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCT", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425643_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001225869933924369,
"Nucleotide GTR":0.001218548261974206,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "E", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "GAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "I", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ATT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_68":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "V", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GTT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_68",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002445271376035281,
"Nucleotide GTR":0.00243066666606647,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "F", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "K", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "TTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "AAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "H", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "CAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001220037260960681,
"Nucleotide GTR":0.001212750425429008,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "I", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ATA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "DAGV", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GNT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220727544612232,
"Nucleotide GTR":0.001213436586269233,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "L", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TTA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0012207275448673,
"Nucleotide GTR":0.001213436586522777,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAT", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425876_Scotland_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "I", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ATT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425876_Scotland_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001220348445090172,
"Nucleotide GTR":0.001213059750969715,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221746662740673,
"Nucleotide GTR":0.001214449617578505,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGA", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425928_Scotland_20200324_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCT", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425928_Scotland_20200324_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "H", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAT", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220734916794115,
"Nucleotide GTR":0.001213443914419776,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "H", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAT", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001220727544612232,
"Nucleotide GTR":0.001213436586269233,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATT", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220538246866271,
"Nucleotide GTR":0.001213248419129349,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "F", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "S", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "TTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "TCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAT", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425987_Scotland_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001219733454632602,
"Nucleotide GTR":0.001212448433624813,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGT", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425987_Scotland_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_156":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_156",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "S", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "TCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426015_Scotland_20200331_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATT", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426015_Scotland_20200331_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426016_Scotland_20200331_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "I", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ATT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426016_Scotland_20200331_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007471378125777015,
"Nucleotide GTR":0.000742675432178385,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "CTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001221000831289906,
"Nucleotide GTR":0.001213708240705716,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "L", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "S", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "TTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "TCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297468906511,
"Nucleotide GTR":0.00121300907924812,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "L", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TTA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002442622623465475,
"Nucleotide GTR":0.002428033733525246,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "F", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTT", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "TTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_1453":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_1453",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426056_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297476246399,
"Nucleotide GTR":0.001213009086544171,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACT", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426056_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003684794652632946,
"Nucleotide GTR":0.003662786724300841,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "NTSIHPRLDAGVYCF", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "H", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "NNT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "CAC", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426107_Washington_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001219890762237362,
"Nucleotide GTR":0.001212604801688887,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "A", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GCA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426107_Washington_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426124_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001220297474846971,
"Nucleotide GTR":0.0012130090851531,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "L", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TTA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426124_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001220460111497418,
"Nucleotide GTR":0.001213170750434425,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "L", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "TTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001219777675053463,
"Nucleotide GTR":0.001212492389933301,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "H", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "L", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAT", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CTA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1183":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "V", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GTT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1183",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_77":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "V", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GTA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_77",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426364_Mexico_City_20200312_null_5157":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "D", "L", "F", "M", "R", "I", "F", "T", "I", "G", "T", "V", "T", "L", "K", "Q", "G", "E", "I", "K", "D", "A", "T", "P", "S", "D", "F", "V", "R", "A", "T", "A", "T", "I", "P", "I", "Q", "A", "S", "L", "P", "F", "G", "W", "L", "I", "V", "G", "V", "A", "L", "L", "A", "V", "F", "Q", "S", "A", "S", "K", "I", "I", "T", "L", "K", "K", "R", "W", "Q", "L", "A", "L", "S", "K", "G", "V", "H", "F", "V", "C", "N", "L", "L", "L", "L", "F", "V", "T", "V", "Y", "S", "H", "L", "L", "L", "V", "A", "A", "G", "L", "E", "A", "P", "F", "L", "Y", "L", "Y", "A", "L", "V", "Y", "F", "L", "Q", "S", "I", "N", "F", "V", "R", "I", "I", "M", "R", "L", "W", "L", "C", "W", "K", "C", "R", "S", "K", "N", "P", "L", "L", "Y", "D", "A", "N", "Y", "F", "L", "C", "W", "H", "T", "N", "C", "Y", "D", "Y", "C", "I", "P", "Y", "N", "S", "V", "T", "S", "S", "I", "V", "I", "T", "S", "G", "D", "G", "T", "T", "S", "P", "I", "S", "E", "H", "D", "Y", "Q", "I", "G", "G", "Y", "T", "E", "K", "W", "E", "S", "G", "V", "K", "D", "C", "V", "V", "L", "H", "S", "Y", "F", "T", "S", "D", "Y", "Y", "Q", "L", "Y", "S", "T", "Q", "L", "S", "T", "D", "T", "G", "V", "E", "H", "V", "T", "F", "F", "I", "Y", "N", "K", "I", "V", "D", "E", "P", "E", "E", "H", "V", "Q", "I", "H", "T", "I", "D", "G", "S", "S", "G", "V", "V", "N", "P", "V", "M", "E", "P", "I", "Y", "D", "E", "P", "T", "T", "T", "T", "S", "V", "P", "L"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "TTG", "TTT", "ATG", "AGA", "ATC", "TTC", "ACA", "ATT", "GGA", "ACT", "GTA", "ACT", "TTG", "AAG", "CAA", "GGT", "GAA", "ATC", "AAG", "GAT", "GCT", "ACT", "CCT", "TCA", "GAT", "TTT", "GTT", "CGC", "GCT", "ACT", "GCA", "ACG", "ATA", "CCG", "ATA", "CAA", "GCC", "TCA", "CTC", "CCT", "TTC", "GGA", "TGG", "CTT", "ATT", "GTT", "GGC", "GTT", "GCA", "CTT", "CTT", "GCT", "GTT", "TTT", "CAG", "AGC", "GCT", "TCC", "AAA", "ATC", "ATA", "ACC", "CTC", "AAA", "AAG", "AGA", "TGG", "CAA", "CTA", "GCA", "CTC", "TCC", "AAG", "GGT", "GTT", "CAC", "TTT", "GTT", "TGC", "AAC", "TTG", "CTG", "TTG", "TTG", "TTT", "GTA", "ACA", "GTT", "TAC", "TCA", "CAC", "CTT", "TTG", "CTC", "GTT", "GCT", "GCT", "GGC", "CTT", "GAA", "GCC", "CCT", "TTT", "CTC", "TAT", "CTT", "TAT", "GCT", "TTA", "GTC", "TAC", "TTC", "TTG", "CAG", "AGT", "ATA", "AAC", "TTT", "GTA", "AGA", "ATA", "ATA", "ATG", "AGG", "CTT", "TGG", "CTT", "TGC", "TGG", "AAA", "TGC", "CGT", "TCC", "AAA", "AAC", "CCA", "TTA", "CTT", "TAT", "GAT", "GCC", "AAC", "TAT", "TTT", "CTT", "TGC", "TGG", "CAT", "ACT", "AAT", "TGT", "TAC", "GAC", "TAT", "TGT", "ATA", "CCT", "TAC", "AAT", "AGT", "GTA", "ACT", "TCT", "TCA", "ATT", "GTC", "ATT", "ACT", "TCA", "GGT", "GAT", "GGC", "ACA", "ACA", "AGT", "CCT", "ATT", "TCT", "GAA", "CAT", "GAC", "TAC", "CAG", "ATT", "GGT", "GGT", "TAT", "ACT", "GAA", "AAA", "TGG", "GAA", "TCT", "GGA", "GTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "GTA", "TTA", "CAC", "AGT", "TAC", "TTC", "ACT", "TCA", "GAC", "TAT", "TAC", "CAG", "CTG", "TAC", "TCA", "ACT", "CAA", "TTG", "AGT", "ACA", "GAC", "ACT", "GGT", "GTT", "GAA", "CAT", "GTT", "ACC", "TTC", "TTC", "ATC", "TAC", "AAT", "AAA", "ATT", "GTT", "GAT", "GAG", "CCT", "GAA", "GAA", "CAT", "GTC", "CAA", "ATT", "CAC", "ACA", "ATC", "GAC", "GGT", "TCA", "TCC", "GGA", "GTT", "GTT", "AAT", "CCA", "GTA", "ATG", "GAA", "CCA", "ATT", "TAT", "GAT", "GAA", "CCG", "ACG", "ACG", "ACT", "ACT", "AGC", "GTG", "CCT", "TTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426364_Mexico_City_20200312_null_5157",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":7512.702441706816,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02330705150283992],
[0.01835527157349524],
[0.01215758110169447],
[0.03324590022070024],
[0.01699250211114998],
[0.01338230152901771],
[0.008863743340158152],
[0.02423863136950183],
[0.0115100470354644],
[0.009064640335733161],
[0.006003948217170488],
[0.01641828762552782],
[0.0251200167741611],
[0.01978305706169227],
[0.01310327225091414],
[0.0358319700419556],
[0.01442908988032542],
[0.01136350787569476],
[0.007526598996115841],
[0.02058210075943595],
[0.01051983517621382],
[0.008284807348723821],
[0.005487427241309091],
[0.01500581875678276],
[0.007125719149041762],
[0.005611799936220155],
[0.00371696559094215],
[0.01016434651980365],
[0.01555147290018593],
[0.01224743114400303],
[0.008112063982515183],
[0.02218310266579653],
[0.02236643703426499],
[0.01761449859264229],
[0.01166693145063356],
[0.03190417860633907],
[0.01630672710691617],
[0.01284222521608329],
[0.008506024765997386],
[0.02326042066096028],
[0.01104553024430287],
[0.008698814059887861],
[0.005761643841563084],
[0.01575568648578629],
[0.02410623554894942],
[0.01898466221957319],
[0.0125744568637175],
[0.03438588109952116],
[0.01976975145884696],
[0.03580787033072003],
[0.01830196529951955],
[0.01441355820406687],
[0.00954679434342841],
[0.02610649022320154],
[0.009763172709471333],
[0.006466619878108698],
[0.01768350113682025],
[0.02705579627513324],
[0.02130756385923461],
[0.01411302658535661],
[0.03859322588466719]
],
"Log Likelihood":-3331.389503180098,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.9569538799510893, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":423
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":8109.190076958071,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2703890861304117],
[0.2105486702533162],
[0.1846797789926887],
[0.3343824646235833]
],
"Log Likelihood":-3379.944832568006,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.5622848740752223,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1932838540672578,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3279320728521125,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.524178610386507,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.59028710896703
},
"display order":0,
"estimated parameters":673
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-16/sequences.ORF3a.compressed.fas",
"number of sequences":334,
"number of sites":275,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2,epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2)Node536,epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1,(epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2,((epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1,epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115,epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1,epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1)Node461,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1)Node460,epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15)Node458,((epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6)Node439,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1)Node438,epi_isl_424155_England_20200320_null_19,(epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1,epi_isl_423919_England_20200320_null_1)Node434,(epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,epi_isl_425325_England_20200329_null_1)Node431,(epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423926_England_20200318_null_1)Node428,(epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1,epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1)Node425,(((epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424013_England_20200321_null_9)Node413,epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2,(epi_isl_423840_England_20200324_null_1,epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1)Node409,(epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1)Node406,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_423957_England_20200319_null_1,epi_isl_418698_England_20200317_null_1,epi_isl_420685_England_20200329_null_1,(epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1,epi_isl_425627_England_20200329_null_4)Node401,epi_isl_423998_England_20200321_null_1,epi_isl_423995_England_20200321_null_2,epi_isl_424037_England_20200320_null_1,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1183,epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_424021_England_20200320_null_1,epi_isl_422006_England_20200403_null_1,epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1,epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1,epi_isl_423047_England_20200324_null_1,(epi_isl_421893_England_20200327_null_1,epi_isl_423914_England_20200318_null_1)Node377,epi_isl_426107_Washington_20200325_null_5,epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1,epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1,epi_isl_418713_England_20200317_null_1,epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_423080_England_20200323_null_2,epi_isl_423341_England_20200327_null_1,epi_isl_423846_England_20200324_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_423663_England_20200323_null_1,(epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_425928_Scotland_20200324_null_20)Node417,epi_isl_423647_England_20200322_null_1)Node334,epi_isl_423364_England_20200328_null_1)Node333,(epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1)Node422,(epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1,epi_isl_423505_England_20200330_null_7)Node315,(epi_isl_418728_England_20200318_null_1,epi_isl_424103_England_20200313_null_3)Node305,(epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1,epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1,epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2,epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_77)Node308,(epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2,epi_isl_424154_England_20200320_null_1)Node301,(epi_isl_423726_England_20200322_null_1,epi_isl_424282_Washington_20200323_null_1)Node298,((epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1,epi_isl_426124_Washington_20200323_null_1)Node285,epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1)Node284,(epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2,epi_isl_422731_Netherlands_20200323_null_1,epi_isl_424978_Taoyuan_20200318_null_1)Node279,(epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3)Node274,(epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1,epi_isl_421858_England_20200326_null_2,epi_isl_421990_England_20200331_null_1)Node269,(epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1,epi_isl_425876_Scotland_20200321_null_2)Node266,(epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1,epi_isl_423187_England_20200329_null_3)Node263,(epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1)Node146,(epi_isl_420669_England_20200327_null_1,epi_isl_426056_Connecticut_20200330_null_1)Node149,(epi_isl_421854_England_20200327_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1)Node260,(epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2,epi_isl_425609_England_20200325_null_4)Node257,(epi_isl_423586_England_20200402_null_2,epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2)Node254,(epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1,epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5)Node251,(epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2,epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2)Node248,(epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2)Node245,(epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1,epi_isl_424258_Washington_20200322_null_1)Node242,(epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1,epi_isl_423651_England_20200321_null_4)Node239,(epi_isl_423619_England_20200320_null_1,epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1,epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1,epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1,epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1,epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1,epi_isl_422532_New_York_20200319_null_1,epi_isl_426051_Prague_20200320_null_1453,epi_isl_425643_England_20200330_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_420704_England_20200328_null_1,epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1,epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1,epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1,epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1,epi_isl_424341_Washington_20200324_null_3,epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1,epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1,epi_isl_424136_England_20200320_null_3,epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1,epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1,epi_isl_423633_England_20200321_null_1,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,((epi_isl_423562_England_20200401_null_1,epi_isl_423564_England_20200401_null_1)Node223,epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_68)Node222,epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2,(epi_isl_423558_England_20200331_null_1,epi_isl_424012_England_20200320_null_28)Node229,epi_isl_421775_England_20200325_null_1)Node161,(epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1,epi_isl_418730_England_20200318_null_1,epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1)Node234,epi_isl_423897_England_20200318_null_1,(epi_isl_424106_England_20200321_null_1,epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1)Node291,(epi_isl_421891_England_20200327_null_2,epi_isl_423517_England_20200330_null_1)Node294,epi_isl_423821_England_20200323_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1,(epi_isl_423960_England_20200319_null_2,epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_425431_England_20200330_null_1)Node453,(epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1,epi_isl_423175_England_20200324_null_1,epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17)Node445,epi_isl_421872_England_20200327_null_1,epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1,epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_423712_England_20200322_null_1,((epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1,epi_isl_425639_England_20200330_null_3)Node521,epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2)Node520,epi_isl_423203_England_20200324_null_2,(epi_isl_421932_England_20200331_null_1,epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1)Node516,((epi_isl_423155_England_20200323_null_2,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1)Node489,epi_isl_423340_England_20200327_null_2,epi_isl_423567_England_20200401_null_1,(epi_isl_423670_England_20200320_null_12,epi_isl_423952_England_20200319_null_3)Node504,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_156,epi_isl_423431_England_20200329_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_423363_England_20200329_null_1)Node488,(epi_isl_425602_England_20200325_null_1,epi_isl_423540_England_20200331_null_2,epi_isl_420689_England_20200328_null_4,epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1)Node509,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,epi_isl_425611_England_20200329_null_2,epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2,(epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1,epi_isl_426015_Scotland_20200331_null_29)Node25,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1,epi_isl_423772_England_20200322_null_10,epi_isl_423309_England_20200325_null_1,epi_isl_423166_England_20200319_null_1,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_425987_Scotland_20200330_null_10,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,epi_isl_425632_England_20200330_null_3,(epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_424117_England_20200312_null_2)Node120,epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2,epi_isl_423239_England_20200324_null_1,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_4,(epi_isl_424115_England_20200312_null_6,epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3)Node529,(epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1,epi_isl_424122_England_20200312_null_1)Node532,epi_isl_421830_England_20200325_null_1,(epi_isl_423542_England_20200330_null_1,epi_isl_424574_Reykjavik_20200327_null_3)Node540,epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1,((epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26,epi_isl_423291_England_20200326_null_1)Node107,epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2)Node106,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1,epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5,(epi_isl_423572_England_20200401_null_1,epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2,epi_isl_425174_Wisconsin_20200330_null_6)Node549,epi_isl_420671_England_20200328_null_1,(epi_isl_423396_England_20200328_null_2,epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_6)Node555,epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1,epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1,(epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5,epi_isl_423389_England_20200330_null_3)Node567,(epi_isl_423005_Washington_20200319_null_5,epi_isl_424296_Washington_20200323_null_3)Node572,epi_isl_423876_England_20200318_null_3,epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2,epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1,epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1,epi_isl_423561_England_20200331_null_2,epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2,epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1,epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_423922_England_20200319_null_1,epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1,epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1,epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_423511_England_20200401_null_9,epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1,epi_isl_418738_England_20200317_null_1,epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1,epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2,(epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1,epi_isl_421663_India_20200310_null_1)Node616,epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_425608_England_20200325_null_4,epi_isl_425228_Prague_20200322_null_1,epi_isl_425373_England_20200319_null_3,epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1,epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_3,epi_isl_423410_England_20200330_null_1,epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1,epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1,epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2,epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29,epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2,epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1,epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1,epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2,epi_isl_423338_England_20200327_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_425439_England_20200101_null_1,epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_4,epi_isl_421993_England_20200331_null_3,epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_2,epi_isl_425280_England_20200101_null_1,(epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node80,epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2)Node75,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1)Node88,epi_isl_426364_Mexico_City_20200312_null_5157,epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1,epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_423290_England_20200326_null_1,epi_isl_421972_England_20200401_null_1,(epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_426016_Scotland_20200331_null_26)Node96,(epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1)Node99)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node106":"test",
"Node107":"test",
"Node120":"test",
"Node146":"test",
"Node149":"test",
"Node161":"test",
"Node222":"test",
"Node223":"test",
"Node229":"test",
"Node234":"test",
"Node239":"test",
"Node242":"test",
"Node245":"test",
"Node248":"test",
"Node25":"test",
"Node251":"test",
"Node254":"test",
"Node257":"test",
"Node260":"test",
"Node263":"test",
"Node266":"test",
"Node269":"test",
"Node274":"test",
"Node279":"test",
"Node284":"test",
"Node285":"test",
"Node291":"test",
"Node294":"test",
"Node298":"test",
"Node301":"test",
"Node305":"test",
"Node308":"test",
"Node315":"test",
"Node333":"test",
"Node334":"test",
"Node377":"test",
"Node401":"test",
"Node406":"test",
"Node409":"test",
"Node413":"test",
"Node417":"test",
"Node422":"test",
"Node425":"test",
"Node428":"test",
"Node431":"test",
"Node434":"test",
"Node438":"test",
"Node439":"test",
"Node445":"test",
"Node453":"test",
"Node458":"test",
"Node460":"test",
"Node461":"test",
"Node488":"test",
"Node489":"test",
"Node504":"test",
"Node509":"test",
"Node516":"test",
"Node520":"test",
"Node521":"test",
"Node529":"test",
"Node532":"test",
"Node536":"test",
"Node540":"test",
"Node549":"test",
"Node555":"test",
"Node567":"test",
"Node572":"test",
"Node616":"test",
"Node75":"test",
"Node80":"test",
"Node88":"test",
"Node96":"test",
"Node99":"test",
"epi_isl_406031_Kaohsiung_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_407896_Queensland_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_411902_Sihanoukville_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_411950_Jiangsu_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_412971_Helsinki_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_412982_Hubei_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413490_Auckland_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413592_Taipei_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_413599_NSW_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413896_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414367_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414511_Japan_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_414543_Noord_Brabant_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_414623_Grand_Est_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_415487_Netherlands_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416330_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416423_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416436_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416581_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416615_unknown_20200217_null_2":"test",
"epi_isl_416713_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417178_Hong_Kong_20200125_null_2":"test",
"epi_isl_417396_New_South_Wales_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_417402_New_South_Wales_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417496_Minnesota_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417516_Wisconsin_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417617_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417633_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417794_Reykjavik_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418004_Portugal_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418016_Portugal_20200310_null_5":"test",
"epi_isl_418113_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418149_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418239_Hauts_de_France_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418241_Boufarik_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418264_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418300_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418663_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418698_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418713_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418728_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418738_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418854_British_Columbia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418888_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418915_Illinois_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418995_Singapore_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_419177_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419179_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419224_Hong_Kong_20200213_null_2":"test",
"epi_isl_419417_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_419452_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419483_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419576_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419671_Austria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419825_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419874_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419938_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419967_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420015_Victoria_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420072_Mbour_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420142_Tbilisi_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420238_South_Yorkshire_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420291_South_Yorkshire_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_420369_La_Louviere_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420378_Frameries_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420583_Abruzzo_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420615_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420625_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420669_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420671_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420685_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420689_England_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_420704_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420787_Georgia_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_420928_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420930_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_420959_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420986_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421197_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421214_Li_ge_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_2":"test",
"epi_isl_421312_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421331_Wisconsin_20200324_null_7":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421350_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421431_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421488_Portugal_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_421576_KZN_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421830_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421854_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421858_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421891_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421893_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421932_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421972_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421993_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_422046_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422108_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422135_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422163_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422180_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422273_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422350_Wales_20200325_null_15":"test",
"epi_isl_422353_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_26":"test",
"epi_isl_422363_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422368_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_115":"test",
"epi_isl_422397_Greater_Accra_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422401_Greater_Accra_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422532_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422548_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422563_Pichincha_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422677_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_422731_Netherlands_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422963_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423005_Washington_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423047_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423080_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423166_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423175_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423239_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423290_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423291_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423309_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423340_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423341_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423363_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423364_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423389_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_423396_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423410_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423431_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423505_England_20200330_null_7":"test",
"epi_isl_423511_England_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_423517_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423540_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423542_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423561_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423567_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423572_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423586_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_423619_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423633_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423647_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423651_England_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423663_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423670_England_20200320_null_12":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423712_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_10":"test",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_423821_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423840_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423846_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423876_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423897_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423914_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423919_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423922_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423926_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_423957_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423960_England_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_423995_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424012_England_20200320_null_28":"test",
"epi_isl_424013_England_20200321_null_9":"test",
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424037_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424103_England_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_424106_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424115_England_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_424117_England_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424136_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424155_England_20200320_null_19":"test",
"epi_isl_424170_Washington_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424177_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424233_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424250_Washington_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424258_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424260_Washington_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_424282_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424296_Washington_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_424299_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424574_Reykjavik_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_29":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424647_Li_ge_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424656_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424914_Massachusetts_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424944_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_424974_Taoyuan_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_424978_Taoyuan_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425158_Wisconsin_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_425168_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_425174_Wisconsin_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_425200_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425228_Prague_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425280_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425325_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425373_England_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_425431_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425602_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425608_England_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_425609_England_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_425627_England_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_425632_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425639_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425643_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425655_Scotland_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_425667_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425694_Scotland_20200317_null_68":"test",
"epi_isl_425713_Scotland_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425731_Scotland_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425780_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425793_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425876_Scotland_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_425878_Scotland_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425928_Scotland_20200324_null_20":"test",
"epi_isl_425932_Scotland_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425969_Scotland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425984_Scotland_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_425987_Scotland_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_156":"test",
"epi_isl_426012_Scotland_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_426015_Scotland_20200331_null_29":"test",
"epi_isl_426016_Scotland_20200331_null_26":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426024_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426032_New_York_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_1453":"test",
"epi_isl_426056_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426107_Washington_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_426124_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_4":"test",
"epi_isl_426321_New_York_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1183":"test",
"epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_77":"test",
"epi_isl_426364_Mexico_City_20200312_null_5157":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":13
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":5
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":18
}
}
}