{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2530503458133, 845.6332206574732, 1, 0, 0.2899126967472282, 0.002896426256041409, 0, -0.009211641785323665, 1, 0.2899126967472283, 0.0008010379545290405],
[345.3259320626482, 845.4129591795963, 0, 1, 0.2900097868663592, 0, 0.001182853881220862, 0.003761886295381862, 0.7099902131336409, 1, 0.0008031459802983454],
[345.1821625424975, 845.8359983846728, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.0008015143089954408],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008013763534816157],
[345.2432794259541, 845.9067714251001, 0, 1, 0.2898402927316204, 0, 0.001182163370456651, 0.003759690231250914, 0.7101597072683796, 1, 0.0008018535978978702],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019557642111887],
[345.0748338807643, 846.3524607809615, 1, 0, 0.2896314659122689, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.289631465912269, 0.0008018055926834002],
[345.3962568470179, 846.0310378147079, 0, 1, 0.2899012456694506, 0, 0.001181989732413355, 0.003759138001947025, 0.7100987543305494, 1, 0.0008017950722420639],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019715042271927],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015371305568486],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008016186481723557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014109546318954],
[345.1889904948477, 846.0736226977718, 0, 1, 0.289767333140533, 0, 0.00118193024007937, 0.003758948795655823, 0.710232666859467, 1, 0.0008012962116232724],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 1, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0.001181928012950077, -0.005460981410308536, 0.9161201271141473, 0.4953605707499578, 0.001603300334586452],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008019855573977063],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019138373178619],
[344.9453239054434, 846.2047269456108, 1, 0, 0.2895901516849086, 0.002899010163924183, 0, -0.00921985951010528, 1, 0.2895901516849086, 0.0008017281139710122],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008015123243150557],
[345.1112747391818, 845.8913963508304, 0, 1, 0.2897653238874217, 0, 0.001182184857670846, 0.003759758568057253, 0.7102346761125783, 1, 0.0008036210716798947],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017282440087355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.5748338807643, 846.218062902797, 0, 1, 0.2893658795005344, 0, 0.001181728497462796, 0.003758307184044673, 0.7106341204994656, 1, 0.0008016398177388445],
[345.4326977054353, 846.1419767173326, 0, 1, 0.2898959713731518, 0, 0.001181834760024045, 0.003758645135907724, 0.7101040286268483, 1, 0.0008018245836390272],
[345.0358983108955, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896661911439065, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103338088560935, 1, 0.0008014322887890905],
[345.0748338807643, 846.0387761118724, 0, 1, 0.2897077415502771, 0, 0.00118197892133938, 0.003759103618975744, 0.7102922584497229, 1, 0.0008019947262560679],
[344.9690994915492, 846.4060760426357, 0, 1, 0.2895553865614776, 0, 0.001181465998773888, 0.003757472347015319, 0.7104446134385224, 1, 0.0008009931688903717],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1476765252957, 846.1149366673239, 0, 1, 0.2897326523160914, 0, 0.001181872528972007, 0.003758765254284123, 0.7102673476839086, 1, 0.0008016963297585042],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017282440087355],
[345.2067238046482, 845.9433270464061, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283164, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019039556516875],
[345.1136546877447, 846.0363961633096, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008014983089716037],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008019138373178619],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 1, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0.001181743797532369, -0.005461567279337902, 0.916138701260323, 0.4953150085784902, 0.001577719000032514],
[344.964805322954, 845.9080017174285, 0, 1, 0.2896739293092753, 0, 0.001182161651113031, 0.003759684763140861, 0.7103260706907247, 1, 0.000799620636880511],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 2.990281347570394e-05],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020637901105101],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.000801729202742521],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0008021114270655104],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020237731883485],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 2, 0.2896988785201451, 0, 0.002363856025900154, 0.007517883425221819, 0.5045276831755396, 1, 0.001604392916293555],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008021181525678442],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017282440087355],
[345.0748338807643, 846.1116578287074, 1, 0, 0.2896900160322902, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896900160322902, 0.0008014098956750865],
[345.0748338807643, 846.0362814004211, 1, 0, 0.2897083483259264, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2897083483259264, 0.0008019843510924424],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017282440087355],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015371304078895],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723686494556],
[345.4350370328149, 846.5642609616667, 1, 0, 0.289794664824051, 0.00289490032218418, 0, -0.009206788785509991, 1, 0.289794664824051, 0.000801426234740939],
[345.3785235372174, 846.6207744572641, 0, 1, 0.2897472541454604, 0, 0.001181166385435157, 0.003756519472504967, 0.7102527458545396, 1, 0.0008014565951648652],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1889904948478, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008014110207119179],
[344.760238866861, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.0008016987127799363],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017282440146838],
[344.760238866861, 846.3898119841932, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.0008014722459302142],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008014970057313374],
[345.0376479674853, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2896950358794155, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7103049641205845, 1, 0.0008000042823881484],
[345.1062470010893, 846.0438038499648, 1, 1, 0.2897252506134869, 0.002897658355042305, 0.001181971897258097, -0.005456479008251683, 0.9160592791569524, 0.4955097803839259, 0.001585165465748457],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 2.642432370006775e-05],
[344.9994574524781, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.7103644018602171, 1, 0.000802121440627235],
[345.499457452478, 845.6505933985762, 0, 1, 0.2900553605363365, 0, 0.001182521490325112, 0.003760829176852444, 0.7099446394636635, 1, 0.0008017282440146838],
[345.0748338807643, 846.1116578287074, 1, 0, 0.2896900160322902, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896900160322902, 0.0008014970058771902],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008016152687103434],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.2275834950065, 843.9301148172065, 0.5, 1, 0.2897154005600304, 0.001452527409115235, 0.001184932238395827, -0.0008510456121602276, 0.7817419747129124, 0.4013836184338175, 0.000801533096492685],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008013595225480568],
[345.8511993073568, 846.1480986871248, 0, 1, 0.2901437944546155, 0, 0.001181826209326228, 0.003758617941717939, 0.7098562055453845, 1, 0.0008011381632146312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4630165940606, 846.1116578287074, 0, 1, 0.2899214157613852, 0, 0.001181877108945882, 0.003758779820192242, 0.7100785842386148, 1, 0.0008016295736412126],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801353958518659],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014722454903772],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008015371305568486],
[345.2067238046482, 845.943327046406, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283166, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019039556516875],
[345.0748338807643, 845.9278372092479, 0, 1, 0.2897347270975891, 0, 0.001182133931540831, 0.003759596605270789, 0.7102652729024109, 1, 0.000804004650200176],
[345.0748338807643, 846.2398984393961, 0, 1, 0.289658831976928, 0, 0.001181698005310506, 0.003758210208406654, 0.710341168023072, 1, 0.0008019698511907907],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008014722454903772],
[344.8675675285942, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2895752608919033, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7104247391080967, 1, 0.0008025207050330862],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008010275520205923],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017657611825039],
[345.0358983108954, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896661911439065, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103338088560935, 1, 0.0008020457338455488],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017282440087355],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008015123243150557],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014970062962761],
[344.8675675285942, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895248732787216, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104751267212784, 1, 0.0008029326565041332],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008014322887890905],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0008017281135258252],
[345.2067238046482, 845.9433270464061, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283164, 1, 0.2898096033812066, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014970110615498],
[344.7379427903847, 846.4121080606695, 1, 0, 0.2894160500971947, 0.00290075409717242, 0, -0.009225405823720816, 1, 0.2894160500971947, 0.0008017020479125442],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008016545514055421],
[345.1889904948478, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008017220967510655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0008013763536840923],
[345.260238866861, 845.8898119841932, 0, 1, 0.289854530602739, 0, 0.001182187071924075, 0.003759765610151808, 0.710145469397261, 1, 0.0008020824131072223],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 2, 0, 0.2896988785201451, 0.005795844273857048, 0, -0.01843279841250244, 1, 0.08392544021582959, 0.001603300340349853],
[344.8728012084263, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2895019094775054, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7104980905224946, 1, 0.0008012962012864468],
[345.036013073784, 846.1140377772703, 0, 1, 0.2896662874901968, 0, 0.00118187378456335, 0.003758769247500818, 0.7103337125098033, 1, 0.0008019840619230507],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015380541042004],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017282440087355],
[345.5461445623407, 845.9222395492262, 0, 1, 0.2900170488535467, 0, 0.001182141753990152, 0.003759621483377346, 0.7099829511464533, 1, 0.0008015786421244508],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008021073460903184],
[344.8675675285942, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895248732787216, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104751267212784, 1, 0.000801961487331406],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015123243208996],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008014970057313374],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0008019841581569181],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.00080143228874448],
[345.2108518609213, 845.7707534449432, 1, 0, 0.2898540584699167, 0.002896780314434844, 0, -0.009212767814023554, 1, 0.2898540584699167, 0.0008019626712664363],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 846.3524607809615, 1, 0, 0.2896314659122689, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.289631465912269, 0.0008019443432807823],
[345.2966797252784, 845.8533711257759, 0, 1, 0.2898851236068625, 0, 0.00118223800263285, 0.003759927587500317, 0.7101148763931375, 1, 0.000801228565021842],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008016545899031628],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017220967452692],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.000801729202742521],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008015624059339913],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008017257062703701],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 2, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0.002363487595064738, -0.00170321143575636, 0.7969865811119208, 0.6414658034236957, 0.00240626652984151],
[344.9801298701595, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895920060360179, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104079939639821, 1, 0.0008019841577531509],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014722459302142],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801728114015405],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0008019938311578893],
[345.1889904948477, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008014099373953648],
[345.1821625424976, 845.835998384673, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.0008017282388784614],
[345.260238866861, 846.314435555907, 0, 1, 0.2897512394966892, 0, 0.001181593930089522, 0.003757879213045583, 0.7102487605033108, 1, 0.0008021114270655104],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014722454903772],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017475961573708],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 1, 1, 0.2897492964164205, 0.002897922136928524, 0.001182217625421613, -0.005456536425362191, 0.9160453452261891, 0.4955439380590304, 0.001606406962418041],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017890091205965],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.000800993235469189],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008016963241518496],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008019626715415665],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801729202742521],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008014970057313374],
[344.9388159006074, 846.2112349504467, 1, 0, 0.2895846880534952, 0.002899064859920391, 0, -0.00922003346237598, 1, 0.2895846880534951, 0.0008015781359083054],
[345.1889904948478, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008015371305568486],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723686494556],
[344.760238866861, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.000801729202742521],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008020114224793705],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008027854539949111],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008024729186102941],
[344.4402440608034, 846.2952740859106, 1, 1, 0.2892667925089675, 0.002903261210741309, 0.001181620683253971, -0.005475415018500756, 0.9163247227515741, 0.4948583077695089, 0.001602914174183345],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.7575389707839, 846.1852455281003, 1, 0, 0.2894828731137141, 0.002900589216947462, 0, -0.009224881447321923, 1, 0.2894828731137141, 0.000801687459560997],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014603272608899],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008017282440146838],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008015123243150557],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500937, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008014970057313374],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008036625695793908],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723686494556],
[345.2067238046482, 845.943327046406, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283166, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019039502767948],
[345.5748338807643, 845.5752169702899, 0, 1, 0.2901186409166986, 0, 0.00118262690288277, 0.00376116442540876, 0.7098813590833014, 1, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0008019443432807823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.4319879482573, 845.9563089292835, 0, 1, 0.2893442323414325, 0, 0.001182094145341487, 0.003759470071334151, 0.7106557676585674, 1, 0.0008018983486835571],
[344.7534109145108, 846.1193961258718, 0, 1, 0.2894964171457651, 0, 0.001181866299932021, 0.003758745443772841, 0.710503582854235, 1, 0.0008021958878626003],
[344.8962568470179, 846.2926148110168, 0, 1, 0.2895395222815936, 0, 0.001181624396218212, 0.003757976105919514, 0.7104604777184065, 1, 0.0008017220972069546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8728012084263, 846.3898119841932, 0, 1, 0.2895019094775055, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7104980905224945, 1, 0.0008013763534816157],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017475962023276],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 2, 0.2896988785201451, 0, 0.002363856025900154, 0.007517883425221819, 0.5045276831755396, 1, 0.001603433376704788],
[345.4063883355745, 845.7436625154796, 0, 1, 0.2899772267052234, 0, 0.001182391360788585, 0.003760415319716025, 0.7100227732947766, 1, 0.0008012961487670825],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801537239482522],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019715042214048],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017281141236751],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723687948068],
[344.6502103090506, 846.4998405420035, 1, 0, 0.2893423965039539, 0.002901492499027614, 0, -0.009227754198159651, 1, 0.2893423965039539, 0.0008014970057313374],
[344.9388159006074, 846.2112349504469, 1, 0, 0.2895846880534951, 0.002899064859920391, 0, -0.00922003346237598, 1, 0.2895846880534951, 0.000801759384059912],
[344.3692679468764, 847.4067200510748, 1, 5, 0.2889546956935907, 0.002903859586431689, 0.005900354436295526, 0.009529894680017796, 0.4443498001446464, 0.8707639617146298, 0.004858665855123206],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019399618254289],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008016050408244626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0004288808601401338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003728625643569787],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017432694316801],
[344.9994574524781, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.000801701297174653],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.00080129330161911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008013180663126418],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.000802111577141567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008016540078699899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.528187392085, 845.6218634589692, 0, 1, 0.290079480032941, 0, 0.001182561666404362, 0.003760956950742634, 0.7099205199670591, 1, 0.0008011144928342989],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4893665851047, 845.6606842659496, 1, 0, 0.2900468890029925, 0.002894445087801767, 0, -0.009205340982014077, 1, 0.2900468890029926, 0.0008012380841017083],
[345.4893665851047, 845.6606842659496, 1, 0, 0.2900468890029925, 0.002894445087801767, 0, -0.009205340982014077, 1, 0.2900468890029926, 0.0008010781195379898],
[345.6966329372748, 845.4534179137794, 0, 1, 0.2902208942444163, 0, 0.001182797276362755, 0.003761706272267132, 0.7097791057555838, 1, 0.0008011738007944667],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0008010780865270444],
[345.4893665851047, 845.6606842659496, 0, 0, 0.2900468890029925, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000135515242832271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0006663623050357573],
[344.849874839977, 846.3001760110773, 0, 1, 0.2895100198279706, 0, 0.001181613839091191, 0.003757942530587777, 0.7104899801720294, 1, 0.0008010586278790677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008016896920160052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0205855708412, 846.1294652802129, 1, 0, 0.2896533357189806, 0.00289837778330092, 0, -0.009217848320018415, 1, 0.2896533357189806, 0.0008010176751616981],
[345.0383188806417, 845.8344881597409, 0, 1, 0.2897356601316209, 0, 0.00118226439569244, 0.003760011526599423, 0.7102643398683791, 1, 0.0008013982727326023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.152475494725, 845.9975753563291, 1, 0, 0.2897640605800421, 0.002897270252999483, 0, -0.009214325988876049, 1, 0.289764060580042, 0.0008014292909426434],
[345.0229655194041, 846.1270853316499, 1, 0, 0.2896553337448055, 0.002898357790457749, 0, -0.009217784735831116, 1, 0.2896553337448056, 0.0008010429979800889],
[345.152475494725, 845.9975753563291, 0, 0, 0.2897640605800421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001801138299829553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0006216722500459924],
[344.849874839977, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2895741459421236, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7104258540578765, 1, 0.0008011137393625144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2896202218179051, 0.0008014450618579078],
[344.9388159006075, 846.3796804956365, 1, 0, 0.2895437424534686, 0.00289906485992039, 0, -0.00922003346237598, 1, 0.2895437424534686, 0.000801448373221669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020640591324429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008013226058526902],
[344.6991219834044, 846.4509288676498, 0, 1, 0.2893834590672463, 0, 0.001181403393741634, 0.003757273241262193, 0.7106165409327537, 1, 0.0008026829443892931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008015917857562105],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014432094249021],
[344.4456438529576, 846.6290305698103, 1, 1, 0.289188957879477, 0.002903215697008192, 0.001181154866998791, -0.00547675172654455, 0.916369746640582, 0.4947476623995362, 0.001601902312157136],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.760238866861, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.0008012088406445056],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008013554131812466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008013763537375835],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017476017975364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.7379427903847, 846.4121080606695, 0, 1, 0.2894160500971947, 0, 0.001181457578969702, 0.003757445569112755, 0.7105839499028053, 1, 0.0008011561653498995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008013202190578825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008013763534816157],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020814207634971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8675675285942, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895343095000735, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104656904999265, 1, 0.0008013223068209348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8728012084263, 846.3898119841932, 0, 1, 0.2895019094775055, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7104980905224945, 1, 0.0008014102365212127],
[345.001991236233, 846.1480596148211, 0, 1, 0.2896377253140657, 0, 0.001181826263899033, 0.003758618115278417, 0.7103622746859343, 1, 0.0008021323313665898],
[345.0461445623407, 846.1015263401507, 0, 1, 0.2896753719049051, 0, 0.00118189126111797, 0.003758824829016301, 0.710324628095095, 1, 0.0008009473826126488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008013729889878094],
[345.0461445623407, 846.1015263401507, 0, 1, 0.2896753719049051, 0, 0.00118189126111797, 0.003758824829016301, 0.710324628095095, 1, 0.0008013548844312667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9453239054434, 846.2047269456108, 1, 0, 0.2895901516849086, 0.002899010163924183, 0, -0.00921985951010528, 1, 0.2895901516849086, 0.0008022456975720131],
[343.687094733666, 841.5556339952849, 1.6875, 1.5625, 0.2899719073596296, 0.004909989423105041, 0.001856680576876459, -0.009710582927064684, 0.9024639108679275, 0.3715819755828258, 0.0008053451641202516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008021089892675413],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008016935866852107],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615688, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384312, 1, 0.0008016371584400363],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008027427308880541],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008014393919637763],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019667008706054],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008015026935150306],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8110540329967, 846.0752169702899, 0, 1, 0.289541547693302, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.710458452306698, 1, 0.0008009923881332751],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2896202218179051, 0.0008017025555866097],
[344.9240810241917, 846.1530881100276, 0, 0, 0.2895900366177896, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001869225996488227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0006143226088469893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014763651141895],
[345.0748338807643, 845.6606842659496, 0, 0, 0.2897997318647605, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000184636178926832],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0006171838277991066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4456438529576, 845.4971406459264, 0, 1, 0.2900606547595917, 0, 0.001182736111012794, 0.003761511745203879, 0.7099393452404084, 1, 0.0008018912838970684],
[345.260238866861, 845.8898119841933, 0, 1, 0.289854530602739, 0, 0.001182187071924075, 0.003759765610151808, 0.7101454693972611, 1, 0.0008018454068629918],
[345.4063883355745, 845.7436625154797, 0, 1, 0.2899772267052234, 0, 0.001182391360788585, 0.003760415319716024, 0.7100227732947766, 1, 0.0008014109652033835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.1505933985762, 0, 2, 0.2896805474249206, 0, 0.002363645449880228, 0.007517213720319067, 0.5045537247065603, 1, 0.001608084983424878],
[345.0748338807643, 846.1505933985762, 0, 1, 0.2896805474249206, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.7103194525750793, 1, 0.0008012460578339856],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001848340168304748],
[342.9011352311763, 842.3030927746545, 0.75, 1.75, 0.2893181842661207, 0.002187219355498391, 0.002077636915988609, -0.0003485102293284757, 0.7507875210505855, 0.5742173033981213, 0.0008047521095346531],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0006167136872497941],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008017234466478007],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008038562339751349],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.000801353958518659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[342.9114917418145, 842.253603140951, 0.75, 1.75, 0.289336475755502, 0.002187153297751512, 0.00207775899500324, -0.0003479118890634465, 0.7507681242002966, 0.5742446997981792, 0.0008025849843975129],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001934448208439088],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0006082652728806236],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008012804480083331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4651454112042, 845.9970527570737, 0, 3, 0.2899505716105077, 0, 0.003546111644506454, 0.01127786703763794, 0.3579857557574928, 1, 0.002406523025872331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.3524607809615, 1, 1, 0.2896314659122689, 0.002897922136928524, 0.001181540843016232, -0.005458688828542482, 0.9161136139535101, 0.4953765457780481, 0.001604598558610364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9994574524781, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008015493014615141],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9994574524781, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008017283531123339],
[345.0748338807643, 845.6606842659496, 0, 0, 0.2897997318647605, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001868376091309368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0006149256485062901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2894912042307, 845.5967797990558, 1, 0, 0.2899432965276647, 0.002896120575556478, 0, -0.009210669615180519, 1, 0.2899432965276647, 0.0008009960272859908],
[345.2894912042307, 845.5967797990558, 1, 0, 0.2899432965276647, 0.002896120575556478, 0, -0.009210669615180519, 1, 0.2899432965276647, 0.0008016227861261695],
[345.2894912042307, 845.5967797990558, 0, 0, 0.2899432965276647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000336322706225251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1821625424975, 845.8359983846728, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.0004649556798954309],
[345.4994574524781, 845.6505933985762, 1, 0, 0.2900553605363364, 0.002894360550877408, 0, -0.009205072125224371, 1, 0.2900553605363364, 0.0008024055728369076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008016631103834516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8962568470179, 846.2926148110167, 0, 1, 0.2895395222815936, 0, 0.001181624396218213, 0.003757976105919515, 0.7104604777184065, 1, 0.0008013742960524126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.152475494725, 845.9975753563291, 0, 0, 0.2897640605800421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001645630376222586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.000531445367775726],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001051729337911844],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.1488340248188, 0, 1, 0.2900431990880499, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709218, 0.7099568009119501, 1, 0.0008020541769904191],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008022607886849012],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008025514791834797],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008023529537770313],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008026237351202764],
[345.2453769504268, 845.3824097468498, 0, 1, 0.2899691917220534, 0, 0.001182896625799738, 0.003762022237993224, 0.7100308082779465, 1, 0.0008025575882871686],
[345.0667999166803, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938923, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008036340186233748],
[344.7740662688504, 845.4989463094961, 0, 1, 0.2896596517146999, 0, 0.001182733585139145, 0.003761503712048126, 0.7103403482853001, 1, 0.0008025619461716591],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008023198536750465],
[345.1421763449666, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899140495148953, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225931, 1, 0.2899140495148953, 0.0008023112469235028],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053957, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225931, 1, 0.2898819348053957, 0.0008022895525663372],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008026254075937136],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008024155727817629],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008025133693874417],
[345.3128870758308, 845.3172795700086, 0, 1, 0.2900253132747528, 0, 0.00118298776585837, 0.003762312095044018, 0.7099746867252472, 1, 0.0008020543520845014],
[345.0954892351039, 845.5006165008809, 0, 1, 0.2898510146073239, 0, 0.001182731248781955, 0.003761496281620553, 0.7101489853926761, 1, 0.0008032144120051366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.3196595185716, 0, 1, 0.2900015839076397, 0, 0.001182984435224803, 0.003762301502472127, 0.7099984160923603, 1, 0.0008032173288382956],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008024411256888909],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0150463182086, 845.779801796737, 0, 1, 0.2897350848169817, 0, 0.001182340838449493, 0.003760254641124983, 0.7102649151830183, 1, 0.0008023130693034721],
[345.1445562935295, 845.4856103523099, 1, 0, 0.2898839337036511, 0.002897336729684783, 0, -0.009214537407830969, 1, 0.2898839337036511, 0.0008025776688862199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008023280591148999],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008023689472903589],
[345.7453769504268, 845.2031229559253, 0, 1, 0.290310938699376, 0, 0.001183147545057221, 0.003762820248407664, 0.7096890613006239, 1, 0.0008024098337169489],
[345.2740662688504, 845.1488340248189, 0, 1, 0.2900431990880498, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709217, 0.7099568009119501, 1, 0.0008023748030552345],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008024879013009226],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008023877684505872],
[345.3882228829338, 845.3545061044709, 0, 1, 0.2900611647460139, 0, 0.001182935671104612, 0.003762146415628041, 0.7099388352539862, 1, 0.0008023582736635654],
[344.9594712549471, 845.6706953908924, 0, 1, 0.2897284823773136, 0, 0.001182493381230116, 0.003760739780164552, 0.7102715176226864, 1, 0.0008020509257102925],
[345.0667999166802, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938922, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008020480821245344],
[345.4813326210206, 845.1488340248188, 0, 1, 0.2901667892342142, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709218, 0.7098332107657859, 1, 0.000802149802882195],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008032234748406535],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008024831902081214],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008022930475373668],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008021321290279147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008028088663179457],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1421763449666, 845.0734575965325, 1, 0, 0.289982895958104, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.289982895958104, 0.0008019733602967032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.1488340248189, 0, 1, 0.2900431990880498, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709217, 0.7099568009119501, 1, 0.0008022872729299015],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.00080216681223134],
[345.3813949305836, 845.116881791372, 0, 1, 0.2901149893988872, 0, 0.001183268281045725, 0.003763204230797816, 0.7098850106011128, 1, 0.0008023112469235028],
[345.1056207236606, 845.5245459221788, 0, 1, 0.2898512320545919, 0, 0.001182697775981584, 0.003761389826486084, 0.7101487679454082, 1, 0.0008022895525663372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.6333441876607, 0, 1, 0.2899251975739209, 0, 0.001182545611373246, 0.003760905890165767, 0.7100748024260791, 1, 0.0008022463822002832],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008037046390873535],
[345.2740662688504, 845.2807239487028, 0, 1, 0.2900110680380847, 0, 0.001183038926202565, 0.003762474802712943, 0.7099889319619153, 1, 0.0008027728114988332],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008023281574714094],
[345.2740662688504, 845.3172795700086, 0, 1, 0.2900021636102012, 0, 0.00118298776585837, 0.003762312095044018, 0.7099978363897987, 1, 0.000803114233255707],
[345.095489235104, 845.573498217716, 0, 1, 0.2898332726153904, 0, 0.001182629306745991, 0.003761172070528967, 0.7101667273846096, 1, 0.0008022932628754358],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008050862920597207],
[345.2740662688504, 845.5034801380311, 0, 1, 0.2899568162925977, 0, 0.001182727242987512, 0.003761483541802509, 0.7100431837074023, 1, 0.0008044506746241799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9594712549471, 845.6706953908924, 0, 1, 0.2897284823773136, 0, 0.001182493381230116, 0.003760739780164552, 0.7102715176226864, 1, 0.0008026213530795406],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.000802409638187394],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053957, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225931, 1, 0.2898819348053957, 0.0008020452300661405],
[345.2351306989816, 845.3950359468579, 0, 1, 0.2899600063649941, 0, 0.001182878958923602, 0.003761966051189196, 0.7100399936350059, 1, 0.0008020452252060414],
[345.6986898405641, 844.9314768052753, 0, 1, 0.2903493456867823, 0, 0.001183527927946354, 0.003764029998149659, 0.7096506543132177, 1, 0.0008020452849740411],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008020480770261771],
[345.1380482886935, 845.6046806987113, 1, 0, 0.2898510651265495, 0.002897391362552824, 0, -0.009214711159332168, 1, 0.2898510651265495, 0.0008021498077779268],
[345.0667999166802, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938922, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008031826477178593],
[345.0667999166802, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938922, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008025229274111707],
[345.3130018387193, 845.3171648071201, 0, 1, 0.2900254096631124, 0, 0.00118298792646447, 0.003762312605827214, 0.7099745903368877, 1, 0.0008029774263765386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8682972358275, 843.6171470412738, 0.25, 1.5, 0.2901746074354275, 0.000724914415165988, 0.001778057742497039, 0.003349361669313225, 0.647102787320331, 0.4510722582213913, 0.000802420985543771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.3196595185716, 0, 1, 0.2900015839076397, 0, 0.001182984435224803, 0.003762301502472127, 0.7099984160923603, 1, 0.0008020452248736721],
[344.7376254104329, 845.5353871679135, 0, 1, 0.2896290361684912, 0, 0.00118268261172304, 0.003761341598875469, 0.7103709638315088, 1, 0.0008020452301172381],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008029737954191982],
[345.1986898405641, 845.4314768052753, 0, 1, 0.2899294000025498, 0, 0.001182827972976367, 0.003761803898163191, 0.7100705999974501, 1, 0.0008027240286355613],
[345.4594712549471, 845.1706953908923, 0, 1, 0.2901484280615462, 0, 0.001183192940140333, 0.003762964620543351, 0.7098515719384538, 1, 0.0008030422880344468],
[345.6056207236606, 845.0245459221788, 0, 1, 0.2902711777388245, 0, 0.00118339757682269, 0.003763615436289158, 0.7097288222611755, 1, 0.0008021250267778447],
[345.101607430276, 845.6759389766055, 1, 1, 0.2898119875300008, 0.00289769731136949, 0.001182486049218983, -0.005454967721041632, 0.9160090118839108, 0.4956329869439121, 0.001254782591486799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9291485917017, 845.9957775762218, 0, 0, 0.2896313117751184, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003494714419869267],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9680841615706, 845.956842006353, 0, 1, 0.2896640053303655, 0, 0.001182093400448542, 0.003759467702315794, 0.7103359946696345, 1, 0.0008024344139215066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.001991236233, 846.0354972732558, 0, 1, 0.2896650983404243, 0, 0.001181983502137873, 0.003759118187506437, 0.7103349016595757, 1, 0.0008018860006903049],
[344.962271539199, 846.3524607809615, 0, 1, 0.289564346163472, 0, 0.001181540843016232, 0.00375771037770874, 0.710435653836528, 1, 0.00080223225314176],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001843630045369809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0006178770698880861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0257113564631, 845.6532932946533, 0, 1, 0.2897722308100661, 0, 0.001182517714918385, 0.00376081716974738, 0.7102277691899339, 1, 0.0008007072653334548],
[345.0257113564631, 845.8605596468235, 0, 1, 0.2897217977547, 0, 0.001182227955418013, 0.00375989563386648, 0.7102782022453, 1, 0.0008007383436293885],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0257113564631, 846.1378034574951, 0, 1, 0.2896543648840276, 0, 0.001181840588984196, 0.003758663674026131, 0.7103456351159724, 1, 0.0008006161324562448],
[345.0257113564631, 845.8605596468235, 0, 1, 0.2897217977547, 0, 0.001182227955418013, 0.00375989563386648, 0.7102782022453, 1, 0.0008006094708478137],
[344.9183826947299, 846.0997782324406, 0, 1, 0.2895995997460036, 0, 0.001181893702996906, 0.003758832595039687, 0.7104004002539963, 1, 0.0008008260316401737],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008013587291482611],
[345.1821625424975, 845.8359983846728, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.000801355013175947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8110540329967, 846.6162406287292, 0, 1, 0.2894100677212508, 0, 0.001181172710858183, 0.003756539589547801, 0.7105899322787492, 1, 0.0008012389776170871],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008015038266353424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2896202218179051, 0.0008014375935065168],
[345.1502103090506, 846.277084352675, 0, 2, 0.2896947315673567, 0, 0.002363292161609006, 0.007516090140875374, 0.5045335743631695, 1, 0.001605102620791122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[343.8700248662857, 844.2876401898886, 0, 1.5, 0.2894144733308841, 0, 0.001776645693477918, 0.005650350556524771, 0.5989968467653229, 1, 0.0008029240597142613],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008014669661871605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.499457452478, 845.6505933985762, 0, 1, 0.2900553605363365, 0, 0.001182521490325112, 0.003760829176852444, 0.7099446394636635, 1, 0.0008016749072628442],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.077388613765, 844.3575583443247, 1.75, 0.75, 0.2895214327839005, 0.005086065106023042, 0.0008882492879801447, -0.01335051272785582, 0.9582937413098476, 0.2494280304787508, 0.000803287395731093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2896202218179051, 0.0008013210034953528],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[343.9741840272525, 841.6528182115989, 1, 2.333333333333333, 0.2901200659041308, 0.00290719491879301, 0.002772322842441564, -0.0004289400607389662, 0.7538484701462488, 0.6808832004795887, 0.001604753389988755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1889904948477, 846.0736226977718, 0, 1, 0.289767333140533, 0, 0.00118193024007937, 0.003758948795655823, 0.710232666859467, 1, 0.0008014824379331866],
[345.0748338807643, 845.9244641137172, 0, 0, 0.2897355476714674, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001994527892145434],
[345.0748338807643, 845.9244641137172, 0, 1, 0.2897355476714674, 0, 0.001182138645260377, 0.00375961159653661, 0.7102644523285326, 1, 0.0008131075796310882],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0006018689428542254],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008013860429162855],
[344.999457452478, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896539275504918, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103460724495082, 1, 0.0008026111346006039],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008019548593379433],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0008018677668944232],
[345.8001827312154, 845.3886889268191, 1, 0, 0.2902983657410187, 0.002891843468970295, 0, -0.009197066930262378, 1, 0.2902983657410187, 0.0008026283608340462],
[345.4610264551615, 846.1136479676065, 0, 1, 0.2899197455858252, 0, 0.001181874329059735, 0.003758770979188494, 0.7100802544141748, 1, 0.0008023336178987105],
[345.3468698410781, 845.8031810099762, 0, 0, 0.2899272594534452, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002018974907790888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0006000399953643938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.7354131230719, 845.3797170003777, 0, 1, 0.2902619607285478, 0, 0.001182900393622235, 0.0037620342209778, 0.7097380392714522, 1, 0.0008046238939431625],
[345.9060832327527, 845.3216092322622, 0, 1, 0.2903778055368803, 0, 0.001182981706700033, 0.003762292824815402, 0.7096221944631198, 1, 0.0008021263271317903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[346.1887260132092, 845.0389664518057, 0, 1, 0.2906150756929087, 0, 0.001183377382227535, 0.003763551210460459, 0.7093849243070913, 1, 0.0008030621463353049],
[345.9814596610391, 845.2462328039758, 0, 1, 0.2904410817927658, 0, 0.001183087201326709, 0.003762628334379711, 0.7095589182072342, 1, 0.0008020022682186594],
[345.9060832327527, 845.2851683738447, 0, 1, 0.2903866887590202, 0, 0.001183032705901838, 0.003762455019995542, 0.7096133112409798, 1, 0.0008024937780351082],
[345.9814596610391, 845.2462328039758, 0, 1, 0.2904410817927658, 0, 0.001183087201326709, 0.003762628334379711, 0.7095589182072342, 1, 0.0008018571106636116],
[345.9814596610391, 845.4109142730821, 0, 1, 0.2904009352675027, 0, 0.00118285674234504, 0.003761895394750774, 0.7095990647324973, 1, 0.0008023483585315019],
[345.8495697371552, 845.2462328039758, 1, 0, 0.2903625124018622, 0.002891430516336908, 0, -0.009195753597418106, 1, 0.2903625124018623, 0.0008018561173200093],
[345.9814596610391, 845.2462328039758, 1, 0, 0.2904410817927658, 0.002890328288052511, 0, -0.009192248128531979, 1, 0.2904410817927658, 0.0008022903977068263],
[345.9814596610391, 845.3216092322621, 0, 1, 0.2904227049313737, 0, 0.001182981706700033, 0.003762292824815403, 0.7095772950686263, 1, 0.0008022905070475612],
[345.5281467709017, 845.6607248871328, 1, 0, 0.2900699922506459, 0.002894120231145852, 0, -0.009204307824984921, 1, 0.2900699922506459, 0.000801897963583284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.264366923134, 845.9245047349004, 1, 0, 0.2898485497455623, 0.00289633132116014, 0, -0.009211339859418471, 1, 0.2898485497455623, 0.0008013848312850578],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008013547493322309],
[345.4994574524781, 845.6505933985762, 0, 1, 0.2900553605363364, 0, 0.001182521490325112, 0.003760829176852444, 0.7099446394636636, 1, 0.000801729202742521],
[344.8675675285942, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895248732787216, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104751267212784, 1, 0.0008019727594258214],
[345.1873962223297, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2897659948356955, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7102340051643046, 1, 0.000803619339606928],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008020814207634971],
[345.6198135502448, 846.0964020630943, 0.5, 1.5, 0.2900185539326283, 0.001446676320040639, 0.0017728476286419, 0.001037338081443672, 0.7099814460673717, 0.4959263462400838, 0.001609037322571272],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0008019193994742716],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008027054937819956],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008012525195836702],
[344.8894288946677, 846.2606219563866, 0, 1, 0.2895432264375514, 0, 0.00118166906748916, 0.003758118176081048, 0.7104567735624485, 1, 0.0008019626712664363],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008019039502767948],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008014983089716037],
[344.9453239054434, 846.2047269456108, 1, 0, 0.2895901516849086, 0.002899010163924183, 0, -0.00921985951010528, 1, 0.2895901516849086, 0.0008015132256326329],
[345.4994574524781, 845.9713066076517, 0, 1, 0.2899772851120011, 0, 0.001182073188758616, 0.003759403422119781, 0.710022714887999, 1, 0.0008036638823133957],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014322886011088],
[345.2067238046482, 845.943327046406, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283166, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019438558722571],
[345.3468698410782, 845.5959146578059, 0, 1, 0.2899777170961161, 0, 0.001182597955673282, 0.003761072363225602, 0.7100222829038839, 1, 0.0008019324270698516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2108518609213, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434844, 0, -0.009212767814023554, 1, 0.2898130689867953, 0.0008022387865722563],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008040123704959838]
],
"NAMES": [
["epi_isl_425886_Scotland_20200321_null_10"],
["epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2"],
["epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1"],
["Node666"],
["epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2"],
["epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3"],
["Node662"],
["epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2"],
["epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_423634_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1"],
["epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1"],
["epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1"],
["epi_isl_423469_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_423338_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423807_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node634"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1"],
["Node643"],
["epi_isl_418060_USA_20200314_null_1"],
["epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4"],
["epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1"],
["Node654"],
["epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6"],
["epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3"],
["epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1"],
["epi_isl_423921_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_413607_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2"],
["epi_isl_423805_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_425296_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_425457_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2"],
["Node723"],
["epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_425333_England_20200329_null_23"],
["epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_418898_Connecticut_20200314_null_1"],
["Node740"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3"],
["epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1"],
["epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3"],
["epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1"],
["epi_isl_421878_England_20200327_null_1"],
["Node754"],
["epi_isl_423357_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_425238_England_20200330_null_1"],
["Node750"],
["epi_isl_423156_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2"],
["epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2"],
["epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4"],
["epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_10"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6"],
["Node773"],
["epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2"],
["epi_isl_423623_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5"],
["epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10"],
["epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["Node794"],
["epi_isl_416650_USA_20200310_null_1"],
["epi_isl_423879_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423890_England_20200318_null_2"],
["Node614"],
["epi_isl_420772_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_423204_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1"],
["epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_424049_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1"],
["epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3"],
["epi_isl_425592_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1"],
["epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2"],
["epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2"],
["epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4"],
["Node816"],
["epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_425249_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425439_England_20200101_null_5"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2"],
["epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1"],
["epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3"],
["epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["Node852"],
["epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2"],
["epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4"],
["epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1"],
["epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_417281_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_424092_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_418909_Washington_20200316_null_3"],
["epi_isl_423044_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4"],
["epi_isl_425628_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1"],
["epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21"],
["Node874"],
["epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_29"],
["epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_425451_England_20200401_null_3"],
["epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_423970_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_2"],
["Node896"],
["epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1"],
["epi_isl_423546_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425397_England_20200317_null_2"],
["Node14"],
["epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1"],
["epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_423514_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1"],
["epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4"],
["epi_isl_425319_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2"],
["epi_isl_424185_USA_20200318_null_1"],
["epi_isl_425430_England_20200330_null_1"],
["Node40"],
["epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_414617_USA_20200308_null_1"],
["epi_isl_423875_England_20200318_null_1"],
["Node47"],
["epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8"],
["epi_isl_421855_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_420745_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1"],
["Node550"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1"],
["epi_isl_423255_England_20200325_null_2"],
["Node540"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423426_England_20200330_null_1"],
["Node536"],
["epi_isl_425377_England_20200318_null_25"],
["epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4"],
["epi_isl_421929_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_418669_England_20200311_null_1"],
["Node526"],
["epi_isl_421872_England_20200327_null_1"],
["Node525"],
["epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1"],
["Node522"],
["epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207"],
["epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1"],
["Node506"],
["epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1"],
["Node497"],
["epi_isl_423945_England_20200319_null_5"],
["Node496"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2"],
["Node519"],
["epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1"],
["epi_isl_424021_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423247_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423977_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4"],
["epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1"],
["Node485"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1"],
["epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3"],
["Node565"],
["epi_isl_421842_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4"],
["Node558"],
["epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6"],
["Node561"],
["epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3"],
["epi_isl_423288_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4"],
["Node569"],
["epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_423867_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_425711_Scotland_20200317_null_28"],
["Node477"],
["epi_isl_423760_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8"],
["Node575"],
["epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1"],
["epi_isl_423862_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_426083_Washington_20200325_null_9"],
["Node474"],
["epi_isl_421844_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425441_England_20200331_null_5"],
["Node581"],
["epi_isl_424637_Li_ge_20200403_null_10"],
["epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3"],
["epi_isl_425512_England_20200319_null_12"],
["Node586"],
["epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4"],
["epi_isl_423192_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1"],
["epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_426302_New_York_20200321_null_50"],
["Node467"],
["epi_isl_425549_England_20200322_null_4"],
["epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1"],
["Node593"],
["epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_418754_England_20200317_null_2"],
["epi_isl_423765_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12"],
["epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2"],
["Node461"],
["epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3"],
["epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1"],
["Node455"],
["epi_isl_420648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_7"],
["Node458"],
["epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2"],
["epi_isl_420743_England_20200327_null_1"],
["Node601"],
["epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1"],
["Node605"],
["epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2"],
["epi_isl_423726_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_422983_USA_20200317_null_1"],
["epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6"],
["Node441"],
["epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1"],
["Node440"],
["epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2"],
["epi_isl_418897_Washington_20200316_null_4"],
["Node446"],
["epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1"],
["epi_isl_417257_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_423382_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["Node431"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_423551_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_417259_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_423998_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_423203_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1"],
["epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1"],
["epi_isl_423463_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1"],
["Node414"],
["epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_424122_England_20200312_null_1"],
["Node417"],
["epi_isl_423646_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_423152_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_418916_Illinois_20200313_null_47"],
["epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2"],
["Node402"],
["epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1"],
["Node401"],
["epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_426379_Slovenia_20200329_null_32"],
["Node398"],
["epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423236_England_20200324_null_6"],
["epi_isl_423376_England_20200328_null_2"],
["Node381"],
["epi_isl_420461_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_13"],
["Node376"],
["epi_isl_420641_England_20200325_null_1"],
["Node375"],
["epi_isl_420657_England_20200325_null_1"],
["Node374"],
["epi_isl_424155_England_20200320_null_16"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423566_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1"],
["epi_isl_425276_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421783_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1"],
["epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2"],
["epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23"],
["epi_isl_421879_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1"],
["epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1"],
["epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_425264_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1"],
["epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2"],
["Node329"],
["epi_isl_420691_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_425619_England_20200329_null_1"],
["Node325"],
["epi_isl_423714_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423172_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_423783_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1"],
["epi_isl_423524_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5"],
["epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1"],
["epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_3"],
["epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_423270_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_425323_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_423589_England_20200330_null_8"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_421803_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_421804_England_20200325_null_1"],
["Node308"],
["epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2"],
["epi_isl_424097_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_423454_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1"],
["Node299"],
["epi_isl_426286_Latvia_20200330_null_1456"],
["epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_425983_Scotland_20200329_null_43"],
["Node295"],
["epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_423064_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_423548_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_417297_England_20200306_null_2"],
["epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_425428_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4"],
["epi_isl_423500_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2"],
["epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1"],
["epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1"],
["epi_isl_424056_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_424058_England_20200312_null_1"],
["Node280"],
["epi_isl_423207_England_20200324_null_3"],
["epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_421850_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_425996_Scotland_20200330_null_1"],
["epi_isl_425825_Scotland_20200313_null_11"],
["epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_423478_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423833_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423628_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3"],
["epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1"],
["epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1"],
["epi_isl_423553_England_20200326_null_1"],
["Node190"],
["epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1"],
["Node189"],
["epi_isl_423896_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4"],
["Node185"],
["epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_424142_England_20200321_null_2"],
["Node355"],
["epi_isl_424138_England_20200320_null_2"],
["Node354"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5"],
["epi_isl_420524_England_20200326_null_8"],
["epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_85"],
["epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1"],
["Node362"],
["epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1"],
["Node361"],
["epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423819_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425452_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6"],
["Node390"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_425627_England_20200329_null_11"],
["Node386"],
["epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2"],
["epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_414485_USA_20200224_null_1"],
["epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["Node162"],
["epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_424123_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_421898_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423133_England_20200323_null_1"],
["Node146"],
["epi_isl_424085_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_423187_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_423668_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423378_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423971_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["Node167"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420727_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1"],
["epi_isl_426323_New_York_20200316_null_5868"],
["epi_isl_423128_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1"],
["Node124"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4"],
["epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10"],
["epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1"],
["Node115"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["Node114"],
["epi_isl_415137_England_20200302_null_1"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node107"],
["epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2"],
["epi_isl_424366_Kayseri_20200317_null_77"],
["epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2"],
["epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_2"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2"],
["epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_423067_England_20200324_null_6"],
["Node87"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_424361_India_20200310_null_1"],
["Node110"],
["epi_isl_423828_England_20200323_null_23"],
["epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_425263_England_20200401_null_3"],
["epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_425611_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1"],
["epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1"],
["Node913"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_418881_Washington_20200314_null_3"],
["epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6"],
["epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_423790_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1"],
["epi_isl_417253_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_425505_England_20200318_null_6"],
["Node929"],
["epi_isl_423701_England_20200323_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2530503458133, 845.6332206574732, 1, 0, 0.2899126967472282, 0.002896426256041409, 0, -0.009211641785323665, 1, 0.2899126967472283, 0.0008010379545290405],
[345.3259320626482, 845.4129591795963, 0, 1, 0.2900097868663592, 0, 0.001182853881220862, 0.003761886295381862, 0.7099902131336409, 1, 0.0008031459802983454],
[345.1821625424975, 845.8359983846728, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.0008015143089954408],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008013763534816157],
[345.2432794259541, 845.9067714251001, 0, 1, 0.2898402927316204, 0, 0.001182163370456651, 0.003759690231250914, 0.7101597072683796, 1, 0.0008018535978978702],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019557642111887],
[345.0748338807643, 846.3524607809615, 1, 0, 0.2896314659122689, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.289631465912269, 0.0008018055926834002],
[345.3962568470179, 846.0310378147079, 0, 1, 0.2899012456694506, 0, 0.001181989732413355, 0.003759138001947025, 0.7100987543305494, 1, 0.0008017950722420639],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019715042271927],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015371305568486],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008016186481723557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014109546318954],
[345.1889904948477, 846.0736226977718, 0, 1, 0.289767333140533, 0, 0.00118193024007937, 0.003758948795655823, 0.710232666859467, 1, 0.0008012962116232724],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 1, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0.001181928012950077, -0.005460981410308536, 0.9161201271141473, 0.4953605707499578, 0.001603300334586452],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008019855573977063],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019138373178619],
[344.9453239054434, 846.2047269456108, 1, 0, 0.2895901516849086, 0.002899010163924183, 0, -0.00921985951010528, 1, 0.2895901516849086, 0.0008017281139710122],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008015123243150557],
[345.1112747391818, 845.8913963508304, 0, 1, 0.2897653238874217, 0, 0.001182184857670846, 0.003759758568057253, 0.7102346761125783, 1, 0.0008036210716798947],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017282440087355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.5748338807643, 846.218062902797, 0, 1, 0.2893658795005344, 0, 0.001181728497462796, 0.003758307184044673, 0.7106341204994656, 1, 0.0008016398177388445],
[345.4326977054353, 846.1419767173326, 0, 1, 0.2898959713731518, 0, 0.001181834760024045, 0.003758645135907724, 0.7101040286268483, 1, 0.0008018245836390272],
[345.0358983108955, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896661911439065, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103338088560935, 1, 0.0008014322887890905],
[345.0748338807643, 846.0387761118724, 0, 1, 0.2897077415502771, 0, 0.00118197892133938, 0.003759103618975744, 0.7102922584497229, 1, 0.0008019947262560679],
[344.9690994915492, 846.4060760426357, 0, 1, 0.2895553865614776, 0, 0.001181465998773888, 0.003757472347015319, 0.7104446134385224, 1, 0.0008009931688903717],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1476765252957, 846.1149366673239, 0, 1, 0.2897326523160914, 0, 0.001181872528972007, 0.003758765254284123, 0.7102673476839086, 1, 0.0008016963297585042],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017282440087355],
[345.2067238046482, 845.9433270464061, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283164, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019039556516875],
[345.1136546877447, 846.0363961633096, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008014983089716037],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008019138373178619],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 1, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0.001181743797532369, -0.005461567279337902, 0.916138701260323, 0.4953150085784902, 0.001577719000032514],
[344.964805322954, 845.9080017174285, 0, 1, 0.2896739293092753, 0, 0.001182161651113031, 0.003759684763140861, 0.7103260706907247, 1, 0.000799620636880511],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 2.990281347570394e-05],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020637901105101],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.000801729202742521],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0008021114270655104],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020237731883485],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 2, 0.2896988785201451, 0, 0.002363856025900154, 0.007517883425221819, 0.5045276831755396, 1, 0.001604392916293555],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008021181525678442],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017282440087355],
[345.0748338807643, 846.1116578287074, 1, 0, 0.2896900160322902, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896900160322902, 0.0008014098956750865],
[345.0748338807643, 846.0362814004211, 1, 0, 0.2897083483259264, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2897083483259264, 0.0008019843510924424],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017282440087355],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015371304078895],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723686494556],
[345.4350370328149, 846.5642609616667, 1, 0, 0.289794664824051, 0.00289490032218418, 0, -0.009206788785509991, 1, 0.289794664824051, 0.000801426234740939],
[345.3785235372174, 846.6207744572641, 0, 1, 0.2897472541454604, 0, 0.001181166385435157, 0.003756519472504967, 0.7102527458545396, 1, 0.0008014565951648652],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1889904948478, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008014110207119179],
[344.760238866861, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.0008016987127799363],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017282440146838],
[344.760238866861, 846.3898119841932, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.0008014722459302142],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008014970057313374],
[345.0376479674853, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2896950358794155, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7103049641205845, 1, 0.0008000042823881484],
[345.1062470010893, 846.0438038499648, 1, 1, 0.2897252506134869, 0.002897658355042305, 0.001181971897258097, -0.005456479008251683, 0.9160592791569524, 0.4955097803839259, 0.001585165465748457],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 2.642432370006775e-05],
[344.9994574524781, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.7103644018602171, 1, 0.000802121440627235],
[345.499457452478, 845.6505933985762, 0, 1, 0.2900553605363365, 0, 0.001182521490325112, 0.003760829176852444, 0.7099446394636635, 1, 0.0008017282440146838],
[345.0748338807643, 846.1116578287074, 1, 0, 0.2896900160322902, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896900160322902, 0.0008014970058771902],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008016152687103434],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.2277515988515, 843.9299467133613, 0, 1, 0.2897155420428026, 0, 0.0011849324744245, 0.003768496943924832, 0.7102844579571974, 1, 0.000801533096492685],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008013595225480568],
[345.8511993073568, 846.1480986871248, 0, 1, 0.2901437944546155, 0, 0.001181826209326228, 0.003758617941717939, 0.7098562055453845, 1, 0.0008011381632146312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4630165940606, 846.1116578287074, 0, 1, 0.2899214157613852, 0, 0.001181877108945882, 0.003758779820192242, 0.7100785842386148, 1, 0.0008016295736412126],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801353958518659],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014722454903772],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008015371305568486],
[345.2067238046482, 845.943327046406, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283166, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019039556516875],
[345.0748338807643, 845.9278372092479, 0, 1, 0.2897347270975891, 0, 0.001182133931540831, 0.003759596605270789, 0.7102652729024109, 1, 0.000804004650200176],
[345.0748338807643, 846.2398984393961, 0, 1, 0.289658831976928, 0, 0.001181698005310506, 0.003758210208406654, 0.710341168023072, 1, 0.0008019698511907907],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008014722454903772],
[344.8675675285942, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2895752608919033, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7104247391080967, 1, 0.0008025207050330862],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008010275520205923],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017657611825039],
[345.0358983108954, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896661911439065, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103338088560935, 1, 0.0008020457338455488],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017282440087355],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008015123243150557],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014970062962761],
[344.8675675285942, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895248732787216, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104751267212784, 1, 0.0008029326565041332],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008014322887890905],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0008017281135258252],
[345.2067238046482, 845.9433270464061, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283164, 1, 0.2898096033812066, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014970110615498],
[344.7379427903847, 846.4121080606695, 1, 0, 0.2894160500971947, 0.00290075409717242, 0, -0.009225405823720816, 1, 0.2894160500971947, 0.0008017020479125442],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008016545514055421],
[345.1889904948478, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008017220967510655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0008013763536840923],
[345.260238866861, 845.8898119841932, 0, 1, 0.289854530602739, 0, 0.001182187071924075, 0.003759765610151808, 0.710145469397261, 1, 0.0008020824131072223],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 2, 0, 0.2896988785201451, 0.005795844273857048, 0, -0.01843279841250244, 1, 0.08392544021582959, 0.001603300340349853],
[344.8728012084263, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2895019094775054, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7104980905224946, 1, 0.0008012962012864468],
[345.036013073784, 846.1140377772703, 0, 1, 0.2896662874901968, 0, 0.00118187378456335, 0.003758769247500818, 0.7103337125098033, 1, 0.0008019840619230507],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015380541042004],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017282440087355],
[345.5461445623407, 845.9222395492262, 0, 1, 0.2900170488535467, 0, 0.001182141753990152, 0.003759621483377346, 0.7099829511464533, 1, 0.0008015786421244508],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008021073460903184],
[344.8675675285942, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895248732787216, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104751267212784, 1, 0.000801961487331406],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008015123243208996],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008014970057313374],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0008019841581569181],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.00080143228874448],
[345.2108518609213, 845.7707534449432, 1, 0, 0.2898540584699167, 0.002896780314434844, 0, -0.009212767814023554, 1, 0.2898540584699167, 0.0008019626712664363],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 846.3524607809615, 1, 0, 0.2896314659122689, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.289631465912269, 0.0008019443432807823],
[345.2966797252784, 845.8533711257759, 0, 1, 0.2898851236068625, 0, 0.00118223800263285, 0.003759927587500317, 0.7101148763931375, 1, 0.000801228565021842],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008016545899031628],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017220967452692],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.000801729202742521],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008015624059339913],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008017257062703701],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 2, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0.002363487595064738, -0.00170321143575636, 0.7969865811119208, 0.6414658034236957, 0.00240626652984151],
[344.9801298701595, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895920060360179, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104079939639821, 1, 0.0008019841577531509],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014722459302142],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801728114015405],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0008019938311578893],
[345.1889904948477, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008014099373953648],
[345.1821625424976, 845.835998384673, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.0008017282388784614],
[345.260238866861, 846.314435555907, 0, 1, 0.2897512394966892, 0, 0.001181593930089522, 0.003757879213045583, 0.7102487605033108, 1, 0.0008021114270655104],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014722454903772],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017475961573708],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 1, 1, 0.2897492964164205, 0.002897922136928524, 0.001182217625421613, -0.005456536425362191, 0.9160453452261891, 0.4955439380590304, 0.001606406962418041],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017890091205965],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.000800993235469189],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008016963241518496],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008019626715415665],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801729202742521],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008014970057313374],
[344.9388159006074, 846.2112349504467, 1, 0, 0.2895846880534952, 0.002899064859920391, 0, -0.00922003346237598, 1, 0.2895846880534951, 0.0008015781359083054],
[345.1889904948478, 846.3856839279202, 0, 1, 0.2896914460372086, 0, 0.001181494464035809, 0.003757562876437774, 0.7103085539627914, 1, 0.0008015371305568486],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723686494556],
[344.760238866861, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.000801729202742521],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008020114224793705],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008027854539949111],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008024729186102941],
[344.4402440608034, 846.2952740859106, 1, 1, 0.2892667925089675, 0.002903261210741309, 0.001181620683253971, -0.005475415018500756, 0.9163247227515741, 0.4948583077695089, 0.001602914174183345],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.7575389707839, 846.1852455281003, 1, 0, 0.2894828731137141, 0.002900589216947462, 0, -0.009224881447321923, 1, 0.2894828731137141, 0.000801687459560997],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008014603272608899],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008017282440146838],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008015123243150557],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500937, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008014970057313374],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008036625695793908],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723686494556],
[345.2067238046482, 845.943327046406, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283166, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019039502767948],
[345.5748338807643, 845.5752169702899, 0, 1, 0.2901186409166986, 0, 0.00118262690288277, 0.00376116442540876, 0.7098813590833014, 1, 0.000801953870828849],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0008019443432807823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.4319879482573, 845.9563089292835, 0, 1, 0.2893442323414325, 0, 0.001182094145341487, 0.003759470071334151, 0.7106557676585674, 1, 0.0008018983486835571],
[344.7534109145108, 846.1193961258718, 0, 1, 0.2894964171457651, 0, 0.001181866299932021, 0.003758745443772841, 0.710503582854235, 1, 0.0008021958878626003],
[344.8962568470179, 846.2926148110168, 0, 1, 0.2895395222815936, 0, 0.001181624396218212, 0.003757976105919514, 0.7104604777184065, 1, 0.0008017220972069546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8728012084263, 846.3898119841932, 0, 1, 0.2895019094775055, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7104980905224945, 1, 0.0008013763534816157],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008017475962023276],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 2, 0.2896988785201451, 0, 0.002363856025900154, 0.007517883425221819, 0.5045276831755396, 1, 0.001603433376704788],
[345.4063883355745, 845.7436625154796, 0, 1, 0.2899772267052234, 0, 0.001182391360788585, 0.003760415319716025, 0.7100227732947766, 1, 0.0008012961487670825],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.000801537239482522],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019715042214048],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017281141236751],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008014723687948068],
[344.6502103090506, 846.4998405420035, 1, 0, 0.2893423965039539, 0.002901492499027614, 0, -0.009227754198159651, 1, 0.2893423965039539, 0.0008014970057313374],
[344.9388159006074, 846.2112349504469, 1, 0, 0.2895846880534951, 0.002899064859920391, 0, -0.00922003346237598, 1, 0.2895846880534951, 0.000801759384059912],
[344.3692679468764, 847.4067200510748, 1, 5, 0.2889546956935907, 0.002903859586431689, 0.005900354436295526, 0.009529894680017796, 0.4443498001446464, 0.8707639617146298, 0.004858665855123206],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019399618254289],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008016050408244626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0004288808601401338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003728625643569787],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008017432694316801],
[344.9994574524781, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.000801701297174653],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.00080129330161911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008013180663126418],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.000802111577141567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008016540078699899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.528187392085, 845.6218634589692, 0, 1, 0.290079480032941, 0, 0.001182561666404362, 0.003760956950742634, 0.7099205199670591, 1, 0.0008011144928342989],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4893665851047, 845.6606842659496, 1, 0, 0.2900468890029925, 0.002894445087801767, 0, -0.009205340982014077, 1, 0.2900468890029926, 0.0008012380841017083],
[345.4893665851047, 845.6606842659496, 1, 0, 0.2900468890029925, 0.002894445087801767, 0, -0.009205340982014077, 1, 0.2900468890029926, 0.0008010781195379898],
[345.6966329372748, 845.4534179137794, 0, 1, 0.2902208942444163, 0, 0.001182797276362755, 0.003761706272267132, 0.7097791057555838, 1, 0.0008011738007944667],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0008010780865270444],
[345.4893665851047, 845.6606842659496, 0, 0, 0.2900468890029925, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000135515242832271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615689, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384311, 1, 0.0006663623050357573],
[344.849874839977, 846.3001760110773, 0, 1, 0.2895100198279706, 0, 0.001181613839091191, 0.003757942530587777, 0.7104899801720294, 1, 0.0008010586278790677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008016896920160052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0205855708412, 846.1294652802129, 1, 0, 0.2896533357189806, 0.00289837778330092, 0, -0.009217848320018415, 1, 0.2896533357189806, 0.0008010176751616981],
[345.0383188806417, 845.8344881597409, 0, 1, 0.2897356601316209, 0, 0.00118226439569244, 0.003760011526599423, 0.7102643398683791, 1, 0.0008013982727326023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.152475494725, 845.9975753563291, 1, 0, 0.2897640605800421, 0.002897270252999483, 0, -0.009214325988876049, 1, 0.289764060580042, 0.0008014292909426434],
[345.0229655194041, 846.1270853316499, 1, 0, 0.2896553337448055, 0.002898357790457749, 0, -0.009217784735831116, 1, 0.2896553337448056, 0.0008010429979800889],
[345.152475494725, 845.9975753563291, 0, 0, 0.2897640605800421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001801138299829553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0006216722500459924],
[344.849874839977, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2895741459421236, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7104258540578765, 1, 0.0008011137393625144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2896202218179051, 0.0008014450618579078],
[344.9388159006075, 846.3796804956365, 1, 0, 0.2895437424534686, 0.00289906485992039, 0, -0.00922003346237598, 1, 0.2895437424534686, 0.000801448373221669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020640591324429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008013226058526902],
[344.6991219834044, 846.4509288676498, 0, 1, 0.2893834590672463, 0, 0.001181403393741634, 0.003757273241262193, 0.7106165409327537, 1, 0.0008026829443892931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008015917857562105],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014432094249021],
[344.4456438529576, 846.6290305698103, 1, 1, 0.289188957879477, 0.002903215697008192, 0.001181154866998791, -0.00547675172654455, 0.916369746640582, 0.4947476623995362, 0.001601902312157136],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.760238866861, 846.3898119841933, 0, 1, 0.2894347682061855, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7105652317938145, 1, 0.0008012088406445056],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008013554131812466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008013763537375835],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008017476017975364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.7379427903847, 846.4121080606695, 0, 1, 0.2894160500971947, 0, 0.001181457578969702, 0.003757445569112755, 0.7105839499028053, 1, 0.0008011561653498995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008013202190578825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008013763534816157],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008020814207634971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8675675285942, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895343095000735, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104656904999265, 1, 0.0008013223068209348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8728012084263, 846.3898119841932, 0, 1, 0.2895019094775055, 0, 0.001181488701589753, 0.003757544549857298, 0.7104980905224945, 1, 0.0008014102365212127],
[345.001991236233, 846.1480596148211, 0, 1, 0.2896377253140657, 0, 0.001181826263899033, 0.003758618115278417, 0.7103622746859343, 1, 0.0008021323313665898],
[345.0461445623407, 846.1015263401507, 0, 1, 0.2896753719049051, 0, 0.00118189126111797, 0.003758824829016301, 0.710324628095095, 1, 0.0008009473826126488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008013729889878094],
[345.0461445623407, 846.1015263401507, 0, 1, 0.2896753719049051, 0, 0.00118189126111797, 0.003758824829016301, 0.710324628095095, 1, 0.0008013548844312667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9453239054434, 846.2047269456108, 1, 0, 0.2895901516849086, 0.002899010163924183, 0, -0.00921985951010528, 1, 0.2895901516849086, 0.0008022456975720131],
[343.686677061085, 841.5561842067314, 1, 0, 0.2899715225396544, 0.002909626897822011, 0, -0.009253624412419953, 1, 0.2899715225396544, 0.0008053451641202516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008021089892675413],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.0008016935866852107],
[345.2821002329345, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2898728837615688, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7101271162384312, 1, 0.0008016371584400363],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008027427308880541],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0008014393919637763],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008019667008706054],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008015026935150306],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8110540329967, 846.0752169702899, 0, 1, 0.289541547693302, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.710458452306698, 1, 0.0008009923881332751],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2896202218179051, 0.0008017025555866097],
[344.9240810241917, 846.1530881100276, 0, 0, 0.2895900366177896, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001869225996488227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0006143226088469893],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014763651141895],
[345.0748338807643, 845.6606842659496, 0, 0, 0.2897997318647605, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000184636178926832],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0006171838277991066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4456438529576, 845.4971406459264, 0, 1, 0.2900606547595917, 0, 0.001182736111012794, 0.003761511745203879, 0.7099393452404084, 1, 0.0008018912838970684],
[345.260238866861, 845.8898119841933, 0, 1, 0.289854530602739, 0, 0.001182187071924075, 0.003759765610151808, 0.7101454693972611, 1, 0.0008018454068629918],
[345.4063883355745, 845.7436625154797, 0, 1, 0.2899772267052234, 0, 0.001182391360788585, 0.003760415319716024, 0.7100227732947766, 1, 0.0008014109652033835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.1505933985762, 0, 2, 0.2896805474249206, 0, 0.002363645449880228, 0.007517213720319067, 0.5045537247065603, 1, 0.001608084983424878],
[345.0748338807643, 846.1505933985762, 0, 1, 0.2896805474249206, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.7103194525750793, 1, 0.0008012460578339856],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001848340168304748],
[342.9013756296166, 842.3028523762142, 1, 1, 0.2893183870990457, 0.002916290429467817, 0.001187221433690872, -0.005499040128497864, 0.9162948708864067, 0.4949316450844982, 0.0008047521095346531],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0006167136872497941],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.0008017234466478007],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008038562339751349],
[344.9063883355745, 846.2436625154797, 0, 1, 0.2895574643086699, 0, 0.001181692749139741, 0.003758193491957493, 0.7104425356913301, 1, 0.000801353958518659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[342.9114933337517, 842.2538725118338, 0, 2, 0.2893364109480984, 0, 0.002374580949132887, 0.00755199240720918, 0.5050427368041301, 1, 0.0008025849843975129],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001934448208439088],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0006082652728806236],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008012804480083331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.4651454112042, 845.9970527570737, 0, 3, 0.2899505716105077, 0, 0.003546111644506454, 0.01127786703763794, 0.3579857557574928, 1, 0.002406523025872331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.3524607809615, 1, 1, 0.2896314659122689, 0.002897922136928524, 0.001181540843016232, -0.005458688828542482, 0.9161136139535101, 0.4953765457780481, 0.001604598558610364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9994574524781, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008015493014615141],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9994574524781, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008017283531123339],
[345.0748338807643, 845.6606842659496, 0, 0, 0.2897997318647605, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001868376091309368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.8679506181197, 0, 1, 0.2897492964164205, 0, 0.001182217625421613, 0.00375986278088903, 0.7102507035835794, 1, 0.0006149256485062901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2894912042307, 845.5967797990558, 1, 0, 0.2899432965276647, 0.002896120575556478, 0, -0.009210669615180519, 1, 0.2899432965276647, 0.0008009960272859908],
[345.2894912042307, 845.5967797990558, 1, 0, 0.2899432965276647, 0.002896120575556478, 0, -0.009210669615180519, 1, 0.2899432965276647, 0.0008016227861261695],
[345.2894912042307, 845.5967797990558, 0, 0, 0.2899432965276647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000336322706225251],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1821625424975, 845.8359983846728, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.0004649556798954309],
[345.4994574524781, 845.6505933985762, 1, 0, 0.2900553605363364, 0.002894360550877408, 0, -0.009205072125224371, 1, 0.2900553605363364, 0.0008024055728369076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008016631103834516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8962568470179, 846.2926148110167, 0, 1, 0.2895395222815936, 0, 0.001181624396218213, 0.003757976105919515, 0.7104604777184065, 1, 0.0008013742960524126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.152475494725, 845.9975753563291, 0, 0, 0.2897640605800421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001645630376222586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1136546877447, 846.0363961633095, 0, 1, 0.2897314695500936, 0, 0.001181982246313397, 0.003759114193548299, 0.7102685304499063, 1, 0.000531445367775726],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001051729337911844],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.1488340248188, 0, 1, 0.2900431990880499, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709218, 0.7099568009119501, 1, 0.0008020541769904191],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008022607886849012],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008025514791834797],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008023529537770313],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008026237351202764],
[345.2453769504268, 845.3824097468498, 0, 1, 0.2899691917220534, 0, 0.001182896625799738, 0.003762022237993224, 0.7100308082779465, 1, 0.0008025575882871686],
[345.0667999166803, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938923, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008036340186233748],
[344.7740662688504, 845.4989463094961, 0, 1, 0.2896596517146999, 0, 0.001182733585139145, 0.003761503712048126, 0.7103403482853001, 1, 0.0008025619461716591],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008023198536750465],
[345.1421763449666, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899140495148953, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225931, 1, 0.2899140495148953, 0.0008023112469235028],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053957, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225931, 1, 0.2898819348053957, 0.0008022895525663372],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008026254075937136],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008024155727817629],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008025133693874417],
[345.3128870758308, 845.3172795700086, 0, 1, 0.2900253132747528, 0, 0.00118298776585837, 0.003762312095044018, 0.7099746867252472, 1, 0.0008020543520845014],
[345.0954892351039, 845.5006165008809, 0, 1, 0.2898510146073239, 0, 0.001182731248781955, 0.003761496281620553, 0.7101489853926761, 1, 0.0008032144120051366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.3196595185716, 0, 1, 0.2900015839076397, 0, 0.001182984435224803, 0.003762301502472127, 0.7099984160923603, 1, 0.0008032173288382956],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008024411256888909],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0150463182086, 845.779801796737, 0, 1, 0.2897350848169817, 0, 0.001182340838449493, 0.003760254641124983, 0.7102649151830183, 1, 0.0008023130693034721],
[345.1445562935295, 845.4856103523099, 1, 0, 0.2898839337036511, 0.002897336729684783, 0, -0.009214537407830969, 1, 0.2898839337036511, 0.0008025776688862199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008023280591148999],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008023689472903589],
[345.7453769504268, 845.2031229559253, 0, 1, 0.290310938699376, 0, 0.001183147545057221, 0.003762820248407664, 0.7096890613006239, 1, 0.0008024098337169489],
[345.2740662688504, 845.1488340248189, 0, 1, 0.2900431990880498, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709217, 0.7099568009119501, 1, 0.0008023748030552345],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008024879013009226],
[345.3882228829338, 845.6665673346193, 0, 1, 0.2899851675335999, 0, 0.001182499153480562, 0.003760758137926394, 0.7100148324664002, 1, 0.0008023877684505872],
[345.3882228829338, 845.3545061044709, 0, 1, 0.2900611647460139, 0, 0.001182935671104612, 0.003762146415628041, 0.7099388352539862, 1, 0.0008023582736635654],
[344.9594712549471, 845.6706953908924, 0, 1, 0.2897284823773136, 0, 0.001182493381230116, 0.003760739780164552, 0.7102715176226864, 1, 0.0008020509257102925],
[345.0667999166802, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938922, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008020480821245344],
[345.4813326210206, 845.1488340248188, 0, 1, 0.2901667892342142, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709218, 0.7098332107657859, 1, 0.000802149802882195],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008032234748406535],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008024831902081214],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053956, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.2898819348053956, 0.0008022930475373668],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008021321290279147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008028088663179457],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1421763449666, 845.0734575965325, 1, 0, 0.289982895958104, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225933, 1, 0.289982895958104, 0.0008019733602967032],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.1488340248189, 0, 1, 0.2900431990880498, 0, 0.001183223545653775, 0.003763061956709217, 0.7099568009119501, 1, 0.0008022872729299015],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.00080216681223134],
[345.3813949305836, 845.116881791372, 0, 1, 0.2901149893988872, 0, 0.001183268281045725, 0.003763204230797816, 0.7098850106011128, 1, 0.0008023112469235028],
[345.1056207236606, 845.5245459221788, 0, 1, 0.2898512320545919, 0, 0.001182697775981584, 0.003761389826486084, 0.7101487679454082, 1, 0.0008022895525663372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.6333441876607, 0, 1, 0.2899251975739209, 0, 0.001182545611373246, 0.003760905890165767, 0.7100748024260791, 1, 0.0008022463822002832],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008037046390873535],
[345.2740662688504, 845.2807239487028, 0, 1, 0.2900110680380847, 0, 0.001183038926202565, 0.003762474802712943, 0.7099889319619153, 1, 0.0008027728114988332],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.0008023281574714094],
[345.2740662688504, 845.3172795700086, 0, 1, 0.2900021636102012, 0, 0.00118298776585837, 0.003762312095044018, 0.7099978363897987, 1, 0.000803114233255707],
[345.095489235104, 845.573498217716, 0, 1, 0.2898332726153904, 0, 0.001182629306745991, 0.003761172070528967, 0.7101667273846096, 1, 0.0008022932628754358],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008050862920597207],
[345.2740662688504, 845.5034801380311, 0, 1, 0.2899568162925977, 0, 0.001182727242987512, 0.003761483541802509, 0.7100431837074023, 1, 0.0008044506746241799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9594712549471, 845.6706953908924, 0, 1, 0.2897284823773136, 0, 0.001182493381230116, 0.003760739780164552, 0.7102715176226864, 1, 0.0008026213530795406],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 0, 1, 0.2899927080140532, 0, 0.001182933440184612, 0.003762139320527365, 0.7100072919859468, 1, 0.000802409638187394],
[345.1421763449666, 845.4879903008729, 1, 0, 0.2898819348053957, 0.002897356708443852, 0, -0.009214600947225931, 1, 0.2898819348053957, 0.0008020452300661405],
[345.2351306989816, 845.3950359468579, 0, 1, 0.2899600063649941, 0, 0.001182878958923602, 0.003761966051189196, 0.7100399936350059, 1, 0.0008020452252060414],
[345.6986898405641, 844.9314768052753, 0, 1, 0.2903493456867823, 0, 0.001183527927946354, 0.003764029998149659, 0.7096506543132177, 1, 0.0008020452849740411],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008020480770261771],
[345.1380482886935, 845.6046806987113, 1, 0, 0.2898510651265495, 0.002897391362552824, 0, -0.009214711159332168, 1, 0.2898510651265495, 0.0008021498077779268],
[345.0667999166802, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938922, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008031826477178593],
[345.0667999166802, 845.5633667291592, 0, 1, 0.2898186267938922, 0, 0.001182643476938031, 0.003761217136662734, 0.7101813732061077, 1, 0.0008025229274111707],
[345.3130018387193, 845.3171648071201, 0, 1, 0.2900254096631124, 0, 0.00118298792646447, 0.003762312605827214, 0.7099745903368877, 1, 0.0008029774263765386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8683277643615, 843.6165746978361, 0, 1, 0.2901747654092147, 0, 0.001185372632535316, 0.003769896799639191, 0.7098252345907854, 1, 0.000802420985543771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2740662688504, 845.3196595185716, 0, 1, 0.2900015839076397, 0, 0.001182984435224803, 0.003762301502472127, 0.7099984160923603, 1, 0.0008020452248736721],
[344.7376254104329, 845.5353871679135, 0, 1, 0.2896290361684912, 0, 0.00118268261172304, 0.003761341598875469, 0.7103709638315088, 1, 0.0008020452301172381],
[345.2740662688504, 845.356100376989, 1, 0, 0.2899927080140532, 0.002896249958203759, 0, -0.009211081096949649, 1, 0.2899927080140532, 0.0008029737954191982],
[345.1986898405641, 845.4314768052753, 0, 1, 0.2899294000025498, 0, 0.001182827972976367, 0.003761803898163191, 0.7100705999974501, 1, 0.0008027240286355613],
[345.4594712549471, 845.1706953908923, 0, 1, 0.2901484280615462, 0, 0.001183192940140333, 0.003762964620543351, 0.7098515719384538, 1, 0.0008030422880344468],
[345.6056207236606, 845.0245459221788, 0, 1, 0.2902711777388245, 0, 0.00118339757682269, 0.003763615436289158, 0.7097288222611755, 1, 0.0008021250267778447],
[345.101607430276, 845.6759389766055, 1, 1, 0.2898119875300008, 0.00289769731136949, 0.001182486049218983, -0.005454967721041632, 0.9160090118839108, 0.4956329869439121, 0.001254782591486799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9291485917017, 845.9957775762218, 0, 0, 0.2896313117751184, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003494714419869267],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9680841615706, 845.956842006353, 0, 1, 0.2896640053303655, 0, 0.001182093400448542, 0.003759467702315794, 0.7103359946696345, 1, 0.0008024344139215066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.001991236233, 846.0354972732558, 0, 1, 0.2896650983404243, 0, 0.001181983502137873, 0.003759118187506437, 0.7103349016595757, 1, 0.0008018860006903049],
[344.962271539199, 846.3524607809615, 0, 1, 0.289564346163472, 0, 0.001181540843016232, 0.00375771037770874, 0.710435653836528, 1, 0.00080223225314176],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 0, 0.2896988785201451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001843630045369809],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0006178770698880861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0257113564631, 845.6532932946533, 0, 1, 0.2897722308100661, 0, 0.001182517714918385, 0.00376081716974738, 0.7102277691899339, 1, 0.0008007072653334548],
[345.0257113564631, 845.8605596468235, 0, 1, 0.2897217977547, 0, 0.001182227955418013, 0.00375989563386648, 0.7102782022453, 1, 0.0008007383436293885],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0257113564631, 846.1378034574951, 0, 1, 0.2896543648840276, 0, 0.001181840588984196, 0.003758663674026131, 0.7103456351159724, 1, 0.0008006161324562448],
[345.0257113564631, 845.8605596468235, 0, 1, 0.2897217977547, 0, 0.001182227955418013, 0.00375989563386648, 0.7102782022453, 1, 0.0008006094708478137],
[344.9183826947299, 846.0997782324406, 0, 1, 0.2895995997460036, 0, 0.001181893702996906, 0.003758832595039687, 0.7104004002539963, 1, 0.0008008260316401737],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008013587291482611],
[345.1821625424975, 845.8359983846728, 0, 1, 0.2898210739908315, 0, 0.001182262284780667, 0.003760004813166603, 0.7101789260091684, 1, 0.000801355013175947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.8110540329967, 846.6162406287292, 0, 1, 0.2894100677212508, 0, 0.001181172710858183, 0.003756539589547801, 0.7105899322787492, 1, 0.0008012389776170871],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008015038266353424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2896202218179051, 0.0008014375935065168],
[345.1502103090506, 846.277084352675, 0, 2, 0.2896947315673567, 0, 0.002363292161609006, 0.007516090140875374, 0.5045335743631695, 1, 0.001605102620791122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[343.87012110606, 844.2875904773917, 0, 1, 0.2894145429968098, 0, 0.001184430532059061, 0.003766900592815372, 0.7105854570031902, 1, 0.0008029240597142613],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 845.9998405420035, 0, 1, 0.289717211935514, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731286, 0.710282788064486, 1, 0.0008014669661871605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.499457452478, 845.6505933985762, 0, 1, 0.2900553605363365, 0, 0.001182521490325112, 0.003760829176852444, 0.7099446394636635, 1, 0.0008016749072628442],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.077388613765, 844.3575702469627, 1, 0, 0.2895214298842309, 0.002906322917727452, 0, -0.009243116607833722, 1, 0.2895214298842309, 0.000803287395731093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[344.9429439568805, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896202218179051, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2896202218179051, 0.0008013210034953528],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[343.9741840272525, 841.6544403042593, 1, 1, 0.2901196689825147, 0.00290719491879301, 0.001188136071186767, -0.005467204379538542, 0.9158305776694762, 0.4960699156345055, 0.001604753389988755],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.1889904948477, 846.0736226977718, 0, 1, 0.289767333140533, 0, 0.00118193024007937, 0.003758948795655823, 0.710232666859467, 1, 0.0008014824379331866],
[345.0748338807643, 845.9244641137172, 0, 0, 0.2897355476714674, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001994527892145434],
[345.0748338807643, 845.9244641137172, 0, 1, 0.2897355476714674, 0, 0.001182138645260377, 0.00375961159653661, 0.7102644523285326, 1, 0.0008131075796310882],
[345.0748338807643, 845.9998405420037, 0, 1, 0.2897172119355139, 0, 0.001182033319721826, 0.003759276624731285, 0.7102827880644861, 1, 0.0006018689428542254],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008013860429162855],
[344.999457452478, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896539275504918, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103460724495082, 1, 0.0008026111346006039],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919447, 1, 0.2895881536590837, 0.0008019548593379433],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0008018677668944232],
[345.8001827312154, 845.3886889268191, 1, 0, 0.2902983657410187, 0.002891843468970295, 0, -0.009197066930262378, 1, 0.2902983657410187, 0.0008026283608340462],
[345.4610264551615, 846.1136479676065, 0, 1, 0.2899197455858252, 0, 0.001181874329059735, 0.003758770979188494, 0.7100802544141748, 1, 0.0008023336178987105],
[345.3468698410781, 845.8031810099762, 0, 0, 0.2899272594534452, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002018974907790888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0006000399953643938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.7354131230719, 845.3797170003777, 0, 1, 0.2902619607285478, 0, 0.001182900393622235, 0.0037620342209778, 0.7097380392714522, 1, 0.0008046238939431625],
[345.9060832327527, 845.3216092322622, 0, 1, 0.2903778055368803, 0, 0.001182981706700033, 0.003762292824815402, 0.7096221944631198, 1, 0.0008021263271317903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[346.1887260132092, 845.0389664518057, 0, 1, 0.2906150756929087, 0, 0.001183377382227535, 0.003763551210460459, 0.7093849243070913, 1, 0.0008030621463353049],
[345.9814596610391, 845.2462328039758, 0, 1, 0.2904410817927658, 0, 0.001183087201326709, 0.003762628334379711, 0.7095589182072342, 1, 0.0008020022682186594],
[345.9060832327527, 845.2851683738447, 0, 1, 0.2903866887590202, 0, 0.001183032705901838, 0.003762455019995542, 0.7096133112409798, 1, 0.0008024937780351082],
[345.9814596610391, 845.2462328039758, 0, 1, 0.2904410817927658, 0, 0.001183087201326709, 0.003762628334379711, 0.7095589182072342, 1, 0.0008018571106636116],
[345.9814596610391, 845.4109142730821, 0, 1, 0.2904009352675027, 0, 0.00118285674234504, 0.003761895394750774, 0.7095990647324973, 1, 0.0008023483585315019],
[345.8495697371552, 845.2462328039758, 1, 0, 0.2903625124018622, 0.002891430516336908, 0, -0.009195753597418106, 1, 0.2903625124018623, 0.0008018561173200093],
[345.9814596610391, 845.2462328039758, 1, 0, 0.2904410817927658, 0.002890328288052511, 0, -0.009192248128531979, 1, 0.2904410817927658, 0.0008022903977068263],
[345.9814596610391, 845.3216092322621, 0, 1, 0.2904227049313737, 0, 0.001182981706700033, 0.003762292824815403, 0.7095772950686263, 1, 0.0008022905070475612],
[345.5281467709017, 845.6607248871328, 1, 0, 0.2900699922506459, 0.002894120231145852, 0, -0.009204307824984921, 1, 0.2900699922506459, 0.000801897963583284],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.264366923134, 845.9245047349004, 1, 0, 0.2898485497455623, 0.00289633132116014, 0, -0.009211339859418471, 1, 0.2898485497455623, 0.0008013848312850578],
[344.9429439568805, 846.2071068941738, 1, 0, 0.2895881536590837, 0.00289903016576853, 0, -0.009219923122919445, 1, 0.2895881536590836, 0.0008013547493322309],
[345.4994574524781, 845.6505933985762, 0, 1, 0.2900553605363364, 0, 0.001182521490325112, 0.003760829176852444, 0.7099446394636636, 1, 0.000801729202742521],
[344.8675675285942, 846.2824833224601, 0, 1, 0.2895248732787216, 0, 0.001181638542338786, 0.003758021095497657, 0.7104751267212784, 1, 0.0008019727594258214],
[345.1873962223297, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2897659948356955, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7102340051643046, 1, 0.000803619339606928],
[344.999457452478, 846.1505933985762, 0, 1, 0.289635598139783, 0, 0.001181822724940114, 0.003758606860159533, 0.710364401860217, 1, 0.0008020814207634971],
[345.6198135502448, 846.0964020630943, 0.5, 1.5, 0.2900185539326283, 0.001446676320040639, 0.0017728476286419, 0.001037338081443672, 0.7099814460673717, 0.4959263462400838, 0.001609037322571272],
[345.2108518609212, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434845, 0, -0.009212767814023557, 1, 0.2898130689867953, 0.0008019193994742716],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008027054937819956],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008012525195836702],
[344.8894288946677, 846.2606219563866, 0, 1, 0.2895432264375514, 0, 0.00118166906748916, 0.003758118176081048, 0.7104567735624485, 1, 0.0008019626712664363],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008019039502767948],
[344.999457452478, 846.1141525401588, 0, 1, 0.2896444592339187, 0, 0.001181873624259627, 0.003758768737679283, 0.7103555407660813, 1, 0.0008014983089716037],
[344.9453239054434, 846.2047269456108, 1, 0, 0.2895901516849086, 0.002899010163924183, 0, -0.00921985951010528, 1, 0.2895901516849086, 0.0008015132256326329],
[345.4994574524781, 845.9713066076517, 0, 1, 0.2899772851120011, 0, 0.001182073188758616, 0.003759403422119781, 0.710022714887999, 1, 0.0008036638823133957],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 1, 0, 0.2896988785201451, 0.002897922136928524, 0, -0.009216399206251221, 1, 0.2896988785201451, 0.0008014322886011088],
[345.2067238046482, 845.943327046406, 1, 0, 0.2898096033812066, 0.002896814954757075, 0, -0.009212877982283166, 1, 0.2898096033812066, 0.0008019438558722571],
[345.3468698410782, 845.5959146578059, 0, 1, 0.2899777170961161, 0, 0.001182597955673282, 0.003761072363225602, 0.7100222829038839, 1, 0.0008019324270698516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.2108518609213, 845.939198990133, 1, 0, 0.2898130689867952, 0.002896780314434844, 0, -0.009212767814023554, 1, 0.2898130689867953, 0.0008022387865722563],
[345.0748338807643, 846.0752169702899, 0, 1, 0.2896988785201451, 0, 0.001181928012950077, 0.00375894171261091, 0.7103011214798549, 1, 0.0008040123704959838]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413473794590088, 0, 2, 0.1952246736567014, 0, 0.8286810507257595, 2.635493645884901, 0.6476633258909628, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 1, 0.1951557652198947, 0, 0.4141588135055782, 1.317168916104976, 0.8048442347801052, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44621830723175, 0, 1, 0.4087942588949244, 0, 0.6914585405256899, 2.199078388907652, 0.5912057411050756, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 2, 0.3333333333333334, 1, 1, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036756451187, 2.41419632435488, 1, 0, 0.1952678918817063, 1.707056547398317, 0, -5.429032894977277, 0.9999999999999999, 0.1952678918817063, 0.3144310562158533],
[0.3577364519209651, 1.795182675593811, 0, 2, 0.1661634416959816, 0, 1.114092747880624, 3.543202002017931, 0.6952834059642906, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5859966573698155, 2.414003342630184, 0, 2, 0.1953322191232719, 0, 0.8284992670394957, 2.634915510606371, 0.6474902375810783, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 6, 0.3333333333333334, 0, 3.000000000000001, 9.541042275227849, 0.08779149519890257, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078135758571, 2.000099273580815, 1, 1, 0.3332795931768275, 1.000192223366864, 0.4999751828366406, -1.590863976829409, 0.8889247127718882, 0.5554838991255434, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994713638211803, 2.000528636178819, 0, 2, 0.3331571212737268, 0, 0.9997357517561812, 3.179507023854139, 0.4446794249079432, 1, 0.3144310562158533],
[1.000093135334807, 1.446457840747807, 0, 2, 0.4087767412621596, 0, 1.382688069889417, 4.397428442756041, 0.3495449416725913, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 4, 0.3333333333333334, 0, 2, 6.360694850151899, 0.1975308641975308, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849247143427351, 0, 0, 0.3509699052631506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5913661290662526, 2.408633870933747, 0, 1, 0.1971220430220842, 0, 0.4151731037529309, 1.320394711481423, 0.8028779569779158, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849824716045765, 0, 2, 0.3508987743595459, 0, 1.081183521147481, 3.438539227515939, 0.4213324011279396, 1, 0.3144310562158533],
[0.9980817149674546, 2.001918285032545, 0, 3, 0.3326939049891516, 0, 1.498562664834858, 4.765949912422493, 0.2971496854205289, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.15056041328163, 0, 1, 0.2831005414090761, 0, 0.4649950746903492, 1.478845888464451, 0.7168994585909239, 1, 0.3144310562158533],
[0.3583576533653273, 1.794560463808562, 0, 2, 0.1664520589550982, 0, 1.114479027223991, 3.544430504532968, 0.6948021700201952, 1, 0.3144310562158533],
[0.585996030675629, 2.41400396932437, 0, 1, 0.1953320102252097, 0, 0.4142495259773245, 1.317457413280916, 0.8046679897747903, 1, 0.3144310562158533],
[1.000093080274286, 1.445749326484671, 0, 2, 0.4088951428393673, 0, 1.383365679901775, 4.399583478014048, 0.3494049521588919, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999711473083348, 2.000241999639206, 1, 1.5, 0.3332423259805018, 1.00028861018846, 0.7499092611146864, -0.7962933181189675, 0.816589455407843, 0.6369887726981004, 0.3144310562158533],
[0.5855662515691993, 2.4144337484308, 0, 1, 0.1951887505230664, 0, 0.4141757878632721, 1.31722290045976, 0.8048112494769335, 1, 0.3144310562158533],
[0.994989546597451, 2.00106684251131, 0, 3, 0.3320997395824821, 0, 1.499200294696325, 4.76797779691056, 0.2979441333484079, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 3, 0.3333333333333334, 1, 1.5, 1.590173712537975, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.3144310562158533],
[1.07584947302931, 1.078149739426997, 0, 1, 0.4994660475304761, 0, 0.9275149484629739, 2.94981977806367, 0.5005339524695238, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849247143427351, 0, 0, 0.3509699052631506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.071420536924907, 1.927668440736213, 1, 1, 0.3572486661467674, 0.9333403323312318, 0.5187614108669441, -1.318505005369712, 0.8723733905363557, 0.5868707228298902, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.214657323466388, 1.370809972193294, 0, 0, 0.4698018518762461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0, 2.28569186501413, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.848574327425661, 2.151425672574336, 2, 0, 0.2828581091418872, 2.356894305378581, 0, -7.495742735286937, 0.9999999999999999, 0.08000870990732389, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9996156571026809, 2.000198531690508, 0, 2, 0.3332258580671696, 0, 0.9999007440074761, 3.180031756535702, 0.4445877563502622, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816742576218402, 0, 1, 0.2572393150863146, 0, 0.5504357155990292, 1.75057681077521, 0.7427606849136854, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612099561, 2.151089038790041, 1, 0, 0.282970320403319, 1.177979842049272, 0, -3.746385157452776, 1, 0.2829703204033189, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.446219478357258, 1, 0, 0.4087940631850184, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.4087940631850184, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995703501653624, 2.000429649834637, 0, 1, 0.3331901167217876, 0, 0.4998926106112572, 1.589832176972006, 0.6668098832782124, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999006838310441, 2.000099316168955, 0, 1, 0.3333002279436815, 0, 0.4999751721906627, 1.590094751478478, 0.6666997720563186, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612099562, 2.151089038790041, 1, 0, 0.282970320403319, 1.177979842049272, 0, -3.746385157452776, 1, 0.2829703204033189, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413475422599707, 0, 2, 0.1952245676768023, 0, 0.8286804917390349, 2.63549186811291, 0.6476634964709898, 1, 0.3144310562158533],
[0.8483055495916177, 2.150989399593335, 1, 1, 0.2828349875433697, 1.178820532862728, 0.4649023375889531, -2.270507894053817, 0.9200043698213419, 0.4856743449080813, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2, 0, 0, 0.2980601894736986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489110247009449, 2, 1, 0, 0.2979773735791053, 1.177979753946865, 0, -3.746384877256511, 1, 0.2979773735791053, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7743604052438893, 2.000801794225097, 0, 1, 0.2790324851614292, 0, 0.4997996317707702, 1.589536471956077, 0.7209675148385708, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994713563908522, 2.000528643609147, 0, 1, 0.3331571187969508, 0, 0.4998678740214902, 1.589753506022435, 0.6668428812030492, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.0004729497157189916, 2.999527050284281, 0, 1, 0.0001576499052396639, 0, 0.3333858915875504, 1.060282961867115, 0.9998423500947603, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.412418084643116, 0, 2, 0.1952934223257559, 0, 0.829043693848727, 2.636646977007252, 0.6475526761521944, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.001085308277980422, 2.285426277363675, 0, 1, 0.0004746568024390115, 0, 0.4375551335453873, 1.391577342299835, 0.999525343197561, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2, 0, 0, 0.2264454462999895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8484062088565471, 2.15159379114345, 2.5, 0, 0.2828020696188493, 2.946701678868445, 0, -9.371535096856237, 1, 0.07147399192473658, 0.3144310562158533],
[0.8482389090874143, 2, 1, 0, 0.2978117131891837, 1.178913144972163, 0, -3.749353385000407, 1, 0.2978117131891838, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2, 0, 0, 0.2980601894736986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807878063416, 0, 1, 0.3333546815823316, 0, 0.5000480350984441, 1.590326480839624, 0.6666453184176684, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994707236468471, 2.000529276353153, 0, 1, 0.3331569078822824, 0, 0.4998677159191298, 1.589753003202, 0.6668430921177175, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2, 0, 0, 0.2264454462999895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8489109444503213, 2.151089055549676, 1, 0, 0.282970314816774, 1.177979865305554, 0, -3.746385231415831, 1, 0.282970314816774, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.845552428759822, 2.154255462712523, 1, 1, 0.2818688593904637, 1.182658775478544, 0.4641974999292116, -2.284956467710102, 0.9205499461059191, 0.4842876648868464, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9217987276114922, 2.078201272388505, 1, 0, 0.3072662425371643, 1.084835517826259, 0, -3.450153845749677, 1, 0.3072662425371643, 0.3144310562158533],
[0.370809972193295, 2.629190027806702, 0, 0, 0.1236033240644318, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.002987280253328443, 2.285093629009176, 0, 2, 0.001305583312738405, 0, 0.8752376596783944, 2.783559837287681, 0.9973905379223096, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9987115731508145, 2.001288426849185, 1, 2, 0.3329038577169382, 1.001290089034536, 0.9993562013191604, -0.006150434815979434, 0.7413131902881962, 0.7031307005706836, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.088358311163824, 0, 0, 0.1460446778392953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.446220662569097, 1, 0, 0.4087938652884114, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.4087938652884113, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999988097361984, 0.75, 0.75, 0.3333346558539156, 0.7500000000000002, 0.37500223175791, -1.192623186637959, 0.8505165631584058, 0.4556705657976798, 0.3144310562158533],
[0.9683176646586716, 1.956517451862308, 3, 2, 0.3310674366527922, 3.098156844073984, 1.022224462192404, -6.602186205348863, 0.9558419895679895, 0.2065311074141308, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807905445197, 0, 1, 0.3333546785395218, 0, 0.5000480282516836, 1.590326459064547, 0.6666453214604782, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5851763418510864, 2.413588844211271, 0, 3, 0.1951391007775019, 0, 1.242962324422062, 3.953052027942122, 0.5213897493811851, 1, 0.3144310562158533],
[0.8482387793743693, 2.151569027511872, 1, 1, 0.2827643749133479, 1.178913325252076, 0.464777093931504, -2.271201324433824, 0.9200443082798635, 0.4855730581065595, 0.3144310562158533],
[0.6630098937380463, 2.336990106261954, 0, 1, 0.221003297912682, 0, 0.4279008273593048, 1.360873294480033, 0.778996702087318, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999007597301268, 2.000099240269873, 0, 1, 0.3333002532433756, 0, 0.4999751911635495, 1.59009481181885, 0.6666997467566245, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612099561, 2.151089038790041, 1, 0, 0.282970320403319, 1.177979842049272, 0, -3.746385157452776, 1, 0.2829703204033189, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807862549261, 0, 1, 0.3333546833063474, 0, 0.500048038977728, 1.590326493177095, 0.6666453166936526, 1, 0.3144310562158533],
[0.9218980034635048, 2.078101996536494, 1, 1, 0.3072993344878351, 1.084718695824344, 0.4812083341754487, -1.91937262467672, 0.9055671190233335, 0.520165787999004, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994709937316647, 2.000529006268335, 0, 1, 0.333156997910555, 0, 0.4998677834046201, 1.589753217829306, 0.666843002089445, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6288432775833126, 1.521909578989336, 1, 0, 0.2923828628945361, 1.590221340749746, 0, -5.057456346354277, 1, 0.2923828628945361, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.446927203974402, 1, 0, 0.4086758275341243, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.4086758275341242, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991981098324507, 2.000801890167549, 0, 1, 0.333066036610817, 0, 0.4997996078043785, 1.589536395734624, 0.666933963389183, 1, 0.3144310562158533],
[0.9421643146461792, 1.98029342902873, 0, 1, 0.3223876604153851, 0, 0.5049756694342352, 1.605998070011174, 0.6776123395846149, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807869750438, 0, 1, 0.3333546825061142, 0, 0.5000480371770879, 1.590326487450434, 0.6666453174938858, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489111519337676, 2.150716636262562, 1, 2, 0.2830054966400402, 1.177979577394008, 0.9299225970909528, -0.7889073785789363, 0.8050566819882998, 0.6314066642215568, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2, 0, 0, 0.2980601894736986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7745283193495779, 2.000634157006266, 1, 0, 0.2790929633664679, 1.291108375275116, 0, -4.106173196800208, 1, 0.2790929633664679, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999763113221633, 2.000122363475158, 0, 1, 0.3332670933566717, 0, 0.4999694110026986, 1.590076428899171, 0.6667329066433283, 1, 0.3144310562158533],
[0.5856652610727584, 2.41423558350981, 0, 3, 0.195228206335684, 0, 1.242629352533446, 3.951993061653537, 0.5212166005247584, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521939889955838, 0, 1, 0.2924928069714844, 0, 0.6570561732428323, 2.089666908703098, 0.7075071930285156, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999519004338753, 2.000048099566124, 0, 1.75, 0.3333173001446252, 0, 0.8749789569459017, 2.782737072718538, 0.4918793320780165, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994709951966096, 2, 0, 1, 0.3332157559773624, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6667842440226376, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999471785155556, 2.000429280664797, 0, 2, 0.3331682489609838, 0, 0.9997854057281874, 3.179664940736154, 0.4446645841937604, 1, 0.3144310562158533],
[0.9996153071529942, 2.000192288313697, 0, 2, 0.3332264738123915, 0, 0.999903865085962, 3.180041682649628, 0.4445869352246575, 1, 0.3144310562158533],
[1.000273862873032, 1.848636746464584, 0, 1, 0.351107493367649, 0, 0.5409391552518064, 1.720374449527841, 0.648892506632351, 1, 0.3144310562158533],
[1.001368742938824, 1.846388759903742, 0, 2, 0.3516341338541925, 0, 1.083195502178136, 3.444938026206085, 0.4203782963830032, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5861019673421759, 2.413898032657824, 0, 2, 0.195367322447392, 0, 0.8285354115798748, 2.635030462802296, 0.6474337457854793, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078588770413, 2.000099250180563, 1, 3, 0.3332796058445698, 1.000192178048265, 1.499925566058369, 1.589325793782414, 0.5926881081275517, 0.8024054510806211, 0.3144310562158533],
[0.8479444639221161, 2.151767490899801, 2, 2, 0.2826752957260044, 2.358645035252805, 0.9294684525434777, -4.545278064798452, 0.9288055388160521, 0.3178884326728834, 0.3144310562158533],
[0.5870129808546437, 2.412987019145356, 1, 4, 0.1956709936182146, 1.703539840880657, 1.65769644356261, -0.1457979306171851, 0.746121034803549, 0.663357723995053, 0.3144310562158533],
[1.001482395134441, 1.845943119491339, 0, 1, 0.3517150457458271, 0, 0.5417285015128507, 1.722884844876647, 0.6482849542541729, 1, 0.3144310562158533],
[0.7741745575529356, 2.000987654045751, 0, 2, 0.2789655157155506, 0, 0.9995064167218852, 3.178777658768336, 0.5198907275273419, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036589087406, 2.414196341091259, 1, 0, 0.1952678863029136, 1.707056596168828, 0, -5.429033050084446, 1, 0.1952678863029136, 0.3144310562158533],
[1.002733307543172, 1.843155033882936, 0, 2, 0.3523445712703861, 0, 1.085095916096999, 3.450982002719519, 0.41945755436294, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995702011668038, 2.000429798833196, 1, 1, 0.3331900670556013, 1.000429983639663, 0.4998925733776196, -1.591882863881073, 0.8889843792154838, 0.5553645133266867, 0.3144310562158533],
[1.00108269558902, 1.9985328445454, 0, 3, 0.3337370013572334, 0, 1.501101174387955, 4.774023254743214, 0.2957583980943998, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998077509183497, 2.00019224908165, 0, 1, 0.3332692503061166, 0, 0.4999519423491072, 1.590020872511702, 0.6667307496938834, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108998521648, 2.151089100147833, 1, 0, 0.2829702999507219, 1.17797992719159, 0, -3.746385428234926, 1, 0.2829702999507219, 0.3144310562158533],
[0.5855662756788993, 2.4144337243211, 0, 2, 0.1951887585596331, 0, 0.8283515839981765, 2.634445827226184, 0.6477211343487845, 1, 0.3144310562158533],
[0.5230433275685471, 2.437597484330122, 1, 1, 0.176665580460305, 1.911887500121002, 0.4102400032935752, -4.775760749906851, 0.9687892726806235, 0.3221204336012335, 0.3144310562158533],
[1.011949572587376, 1.385200142392429, 1, 2, 0.4221470049466232, 0.9881915335397365, 1.443834676876172, 1.449103497663544, 0.6158357447412977, 0.807046746532412, 0.3144310562158533],
[0.9987123371331298, 2.00128766286687, 0, 1, 0.33290411237771, 0, 0.4996782914093856, 1.589150567450189, 0.66709588762229, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.7751630024296535, 1.999999999999999, 0, 1, 0.2793216116498378, 0, 0.5000000000000002, 1.590173712537975, 0.7206783883501622, 1, 0.3144310562158533],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414004052295013, 0, 1, 0.1951901611125264, 0, 0.414249511739341, 1.317457367999182, 0.8048098388874736, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998076235997858, 2.000099371712642, 1, 1, 0.3332795400530943, 1.000192413416015, 0.4999751583061204, -1.59086465926731, 0.8889247481819977, 0.5554838282881867, 0.3144310562158533],
[0.9994707293136704, 2.000529270686329, 0, 1, 0.3331569097712235, 0, 0.4998677173350861, 1.589753007705233, 0.6668430902287765, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489107510661141, 2.151089248933883, 1, 0, 0.2829702503553717, 1.177980133652612, 0, -3.746386084852706, 1, 0.2829702503553717, 0.3144310562158533],
[0.7746337659325442, 2.000528651122685, 0, 1, 0.2791309658749707, 0, 0.4998678721440985, 1.589753500051677, 0.7208690341250293, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8482388527095411, 2.151761147290456, 1, 0, 0.282746284236514, 1.178913223328177, 0, -3.749353634199755, 1, 0.282746284236514, 0.3144310562158533],
[0.3577937386487871, 1.794042622238758, 1, 1, 0.1662736745006073, 2.794906371968704, 0.5574003580539885, -7.116046489945614, 0.9723530651680661, 0.3049004141692808, 0.3144310562158533],
[1.000026861873498, 1.999973138126501, 1, 2, 0.3333422872911661, 0.9999731388480426, 1.000013431117142, 0.0001281434142800593, 0.740728802050125, 0.7037156421538013, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.088358311163824, 0, 0, 0.1460446778392953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8493108970014538, 2.150402711582976, 1, 2, 0.2831306610640891, 1.177425137874203, 0.9300583510368343, -0.7867123235675376, 0.8049042763732567, 0.6315996645270134, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.002164256565896625, 2.997835743434103, 0, 3, 0.0007214188552988752, 0, 1.000721939676194, 3.182643444066191, 0.9978373043941388, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078622368447, 2.000099248445062, 0, 1, 0.3332796067840844, 0, 0.4999751891199551, 1.59009480531951, 0.6667203932159156, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078625492617, 2.000099248283683, 0, 1, 0.3332796068714468, 0, 0.4999751891602958, 1.590094805447807, 0.6667203931285532, 1, 0.3144310562158533],
[0.6297561734137452, 1.520996683158904, 0, 1, 0.2928073169770415, 0, 0.6574636296531139, 2.090962761648368, 0.7071926830229585, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9997086588562817, 2.000291341143718, 0, 3, 0.3332362196187606, 0, 1.499781525967449, 4.769826314287053, 0.2964258001121229, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995700428994353, 2.000429957100564, 0, 1, 0.3331900142998118, 0, 0.4998925338277809, 1.589831932773875, 0.6668099857001881, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.359014534823184, 2.087204811917076, 1, 1, 0.1467630183293225, 2.785402547817469, 0.4791096658509092, -7.334812628633336, 0.9784606164508669, 0.2719866531095119, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.927118283165094, 0, 0, 0.3576272389449683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994705588578864, 2.000529441142113, 1, 1, 0.3331568529526289, 1.000529721598522, 0.4998676747436891, -1.592279251548021, 0.8890065113307004, 0.5553202172359581, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108002443584, 2, 1, 0, 0.2979773182689838, 1.177980065411055, 0, -3.746385867820845, 1, 0.2979773182689838, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991969601261081, 2.000803039873891, 0, 1, 0.3330656533753695, 0, 0.4997993206083039, 1.589535482351328, 0.6669343466246305, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991978527416503, 2.000802147258349, 0, 1, 0.3330659509138835, 0, 0.4997995435831953, 1.58953619148895, 0.6669340490861165, 1, 0.3144310562158533],
[0.6297553321051896, 1.520997524467459, 0, 1, 0.2928069258077108, 0, 0.6574632659906046, 2.090961605075243, 0.7071930741922892, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8485742476692162, 2.151425752330781, 2, 0, 0.2828580825564057, 2.356894526900164, 0, -7.495743439802533, 1, 0.0800086948674863, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.001083122442422, 1.998724684443822, 0, 2, 0.3337157534373947, 0, 1.000638064644973, 3.182376692326619, 0.4439346972174986, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 1, 0.2830823811424503, 0, 0.4649534682443986, 1.478713565511205, 0.7169176188575497, 1, 0.3144310562158533],
[0.3589450666828952, 1.797219283573136, 1, 1, 0.1664738899148725, 2.785941618424402, 0.5564151292722905, -7.090668828913539, 0.9722864439766108, 0.305234223806356, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.845203126965285, 1.152155202734173, 1, 0, 0.6156097883533003, 0.5419457540399095, 0, -1.72357578339167, 1, 0.6156097883533003, 0.3144310562158533],
[0.9218978575181883, 2.07810214248181, 1, 1, 0.3072992858393963, 1.084718867545769, 0.4812083003801404, -1.919373278291333, 0.9055671489225969, 0.5201657206013897, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109757965909, 2, 1, 0, 0.2979773615281976, 1.177979821808326, 0, -3.746385093079533, 1, 0.2979773615281976, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414004109781167, 0, 1, 0.1951901573716233, 0, 0.4142495018745645, 1.317457336625766, 0.8048098426283766, 1, 0.3144310562158533],
[0, 2.28569186501413, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036589087406, 2.414196341091259, 1, 0, 0.1952678863029136, 1.707056596168828, 0, -5.429033050084446, 1, 0.1952678863029136, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.848237821023627, 2.15176217897637, 1, 1, 0.2827459403412093, 1.178914657204546, 0.4647353735326443, -2.271338245868517, 0.9200547332205653, 0.4855466139029838, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849247143427351, 0, 0, 0.3509699052631506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108457618214, 2.151089154238176, 1, 0, 0.2829702819206074, 1.177980002249341, 0, -3.74638566694465, 1, 0.2829702819206075, 0.3144310562158533],
[0.999527120890329, 1.44598525776643, 0, 1, 0.4087188965444276, 0, 0.6915699829088643, 2.199432814404024, 0.5912811034555725, 1, 0.3144310562158533],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.927111853605567, 2, 0, 0.341633681940858, 2, 0, -6.360694850151899, 0.9999999999999999, 0.1167135726364674, 0.3144310562158533],
[0.9998540760323162, 1.999874961147741, 1.75, 1, 0.3333147973165753, 1.750255404213043, 0.5000312616675263, -3.976147132512419, 0.9267265888259205, 0.3339187158286111, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998077224514027, 2.000192277548597, 0, 2, 0.3332692408171343, 0, 0.9999038704674771, 3.180041699764716, 0.4445299052405605, 1, 0.3144310562158533],
[0.003538784449753907, 2.996461215550246, 0, 3, 0.001179594816584636, 0, 1.001180987903795, 3.184103376914827, 0.9964653882407002, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991978832475116, 2.000802116752488, 0, 1, 0.3330659610825039, 0, 0.4997995512035469, 1.589536215724315, 0.666934038917496, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9997805757771375, 1.927412394018594, 1, 3, 0.3415492542150049, 1.000219472380419, 1.556490976871377, 1.769136646950941, 0.5779887156990763, 0.8120279942372892, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44621974467453, 0, 1, 0.4087940186800553, 0, 0.6914578532635431, 2.199076203175252, 0.5912059813199447, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.002404269193022675, 2.284911490380011, 0, 2, 0.001051131302252503, 0, 0.8753074280646967, 2.783781724995409, 0.9978988422725095, 1, 0.3144310562158533],
[0.9421660355023191, 1.980291334076198, 0, 1, 0.3223882905221644, 0, 0.50497620364859, 1.605999768998421, 0.6776117094778356, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8485746298352247, 2, 1, 0, 0.2978944700789919, 1.178446732721881, 0, -3.747870032001198, 1, 0.2978944700789919, 0.3144310562158533],
[0.9959928981511708, 2.003814857160889, 0, 2, 0.3320189090075744, 0, 0.9980962027767906, 3.174292688479248, 0.4461987379234311, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9208074260197209, 2.079192573980277, 2, 0, 0.3069358086732405, 2.172006809985442, 0, -6.907736265384627, 0.9999999999999999, 0.09420959064589618, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9421657111161974, 1.98029172898052, 0, 1, 0.3223881717452888, 0, 0.5049761029476264, 1.605999448734371, 0.6776118282547112, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 1, 0.1951557652198947, 0, 0.4141588135055782, 1.317168916104976, 0.8048442347801052, 1, 0.3144310562158533],
[0.8479021945574665, 2.152097805442531, 2, 0, 0.2826340648524891, 2.358762617714218, 0, -7.501684617612818, 1, 0.07988201461504096, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5859959467826359, 2.414004053217364, 0, 1, 0.1953319822608787, 0, 0.4142495115810633, 1.317457367495804, 0.8046680177391213, 1, 0.3144310562158533],
[1.001082622265663, 1.998725184881692, 0, 2, 0.3337155866720792, 0, 1.000637814106687, 3.182375895527828, 0.4439349194437317, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036798459502, 2.414196320154049, 1, 0, 0.1952678932819834, 1.707056535156918, 0, -5.429032856045374, 1, 0.1952678932819835, 0.3144310562158533],
[0.8489108538815553, 2.151089146118442, 1, 0, 0.2829702846271854, 1.177979990982098, 0, -3.746385631110906, 1, 0.2829702846271853, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.41400408731741, 0, 2, 0.195190158833449, 0, 0.8284990114588096, 2.634914697770994, 0.647718880438529, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999807852930409, 2.00019214706959, 0, 1, 0.3332692843101364, 0, 0.4999519678472211, 1.590020953604563, 0.6667307156898636, 1, 0.3144310562158533],
[0.6635384749059811, 2.33646152509402, 0, 1, 0.221179491635327, 0, 0.4279976320002786, 1.36118116687069, 0.7788205083646731, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.848164761408897, 1.151835238591102, 1, 0, 0.6160549204696325, 0.5410773005095486, 0, -1.720813799442588, 1, 0.6160549204696325, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108538815578, 2.151089146118439, 1, 0, 0.2829702846271862, 1.177979990982095, 0, -3.746385631110895, 1, 0.2829702846271862, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.99980789147236, 0, 1, 0.3333546800922581, 0, 0.500048031745564, 1.590326470176301, 0.6666453199077419, 1, 0.3144310562158533],
[0.847902368793396, 2, 2, 0, 0.2977287346941731, 2.358762133010776, 0, -7.501683076087473, 1, 0.08864239946259322, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8494876290674251, 2.150512370932572, 1, 2, 0.2831625430224753, 1.177180179890093, 0.9300109253185546, -0.7860841023345337, 0.8048654490060428, 0.6316488149140147, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.002592669147818, 2.004553955110695, 0, 1, 0.3334033202970382, 0, 0.4988640976464904, 1.590674576553469, 0.6665966797029619, 1, 0.3136179486362222],
[1.001788119461736, 2.005989887981718, 0, 1, 0.3330658436169742, 0, 0.4985069994575734, 1.589535935763075, 0.6669341563830258, 1, 0.3136179486362222],
[0.3599075822782121, 2.091945200873297, 1, 0, 0.1467900457773822, 2.778491060593967, 0, -8.859477184505305, 1, 0.1467900457773823, 0.3136179486362222],
[1.002592669147818, 2.005185338295635, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4987070177014054, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3136179486362222],
[0.6308213093799135, 2.150435192007448, 0, 0.6666666666666666, 0.2268116259917932, 0, 0.3100147677755998, 0.9885109226806343, 0.8424100579117052, 1, 0.3136179486362222],
[0.3583717886163498, 2.423985526342744, 0, 1, 0.1288014974531115, 0, 0.4125437174159939, 1.315434015208484, 0.8711985025468885, 1, 0.3136179486362222],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 1, 0.2830823811424503, 0, 0.4649534682443986, 1.478713565511205, 0.7169176188575497, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357652659856486, 2.417846186703136, 0, 4.666666666666667, 0.128860676811239, 0, 1.930092448531608, 6.138364548846034, 0.5253017952124678, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5865241729245503, 2.411891028351035, 0, 5, 0.1956113925366411, 0, 2.07306214966868, 6.593057869721197, 0.3367670210865639, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816785732733319, 0, 3, 0.2572347763854338, 0, 1.651267921113932, 5.251605681025209, 0.409783705643023, 1, 0.3144310562158533],
[0.996797269454472, 2.003202730545528, 1, 1, 0.332265756484824, 1.003213020985983, 0.4992005974990221, -1.602934613243046, 0.8895994670675675, 0.5541309800372157, 0.3144310562158533],
[0.6289783588077915, 1.529419097179327, 1, 2, 0.2914098870266392, 1.589879820182475, 1.307686038240633, -0.8974742677711812, 0.7947337265677854, 0.6442169409784922, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 4, 0.3333333333333334, 2, 2, 0, 0.6803840877914951, 0.6488340192043897, 0.3144310562158533],
[1.2069485891304, 1.382058801504253, 1, 2, 0.466181979045852, 0.8285357048393376, 1.447116430808277, 1.967301619036927, 0.5506496788941968, 0.8478823202039937, 0.3144310562158533],
[1.001082694294305, 1.998824353003007, 3, 2, 0.3337045710120266, 2.996755429994518, 1.000588169238195, -6.348505407767279, 0.9545489277082313, 0.2104268310463704, 0.3144310562158533],
[0.357791955583164, 1.794043165426462, 1, 1, 0.1662729416811873, 2.794920300458134, 0.5574001892882494, -7.116091324114793, 0.9723533088646845, 0.304899192227059, 0.3144310562158533],
[0.774360456744407, 2.000801714031107, 0, 1, 0.2790325066041144, 0, 0.4997996518032035, 1.589536535666174, 0.7209674933958856, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 1.793598789079713, 0, 0, 0.1660600223784341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.3605810947733776, 1.794152554970707, 1.5, 2.5, 0.1673436968955321, 4.159951871416714, 1.393415511447864, -8.79854678880592, 0.925360817949337, 0.3260990563069238, 0.3144310562158533],
[0.6291594992726712, 1.522135172203696, 0.25, 0.5, 0.2924562160705294, 0.3973555200056712, 0.3284859381286859, -0.2190291973885275, 0.847641867501844, 0.228537198747234, 0.3144310562158533],
[0.9995706604161974, 2.000429339583802, 1, 1, 0.3331902201387326, 1.000429523995456, 0.499892688140664, -1.591881037066451, 0.8889842772039029, 0.5553647174813681, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2.75, 0, 0.3333333333333334, 2.75, 0, -8.745955418958861, 1, 0.0732819804361311, 0.3144310562158533],
[1.001704961781071, 2.005992913993358, 0, 2, 0.3330470689391133, 0, 0.9970124949337793, 3.178982380877703, 0.4448262122507078, 1, 0.3136263041063186],
[0.9997596015597053, 2.000240398440294, 0, 0.75, 0.3332532005199019, 0, 0.3749549307097385, 1.192486948402248, 0.737854456619457, 1, 0.3144310562158533],
[0.9993909289730837, 2.000609071026916, 1, 1, 0.3331303096576946, 1.000609442220515, 0.4998477786000932, -1.592596067471958, 0.8890241967873684, 0.5552848161027577, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999615986804206, 1, 2, 0.3333760069286071, 1, 1.00019204347151, 0.000610764960119918, 0.7406838407928287, 0.7037605981887416, 0.3144310562158533],
[0.5858781222489877, 2.413263100803317, 0.4375, 2.0625, 0.1953486277157447, 0.7467423400631272, 0.8546519437990179, 0.3431900303824058, 0.7350101235169246, 0.4192096514916296, 0.3144310562158533],
[0.9429751257116812, 1.979028209751973, 1.25, 0.5, 0.3227152803924, 1.325591700053171, 0.2526492535761599, -3.412329746907851, 0.9515227189617144, 0.3889417213745797, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414004374338017, 0, 1, 0.1951901401556271, 0, 0.414249456475913, 1.317457192242281, 0.8048098598443729, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413353863226822, 0, 2, 0.1952324812450884, 0, 0.8287222319423396, 2.635624616461013, 0.647650759242937, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612098952, 2.151089038790102, 1, 0, 0.2829703204032987, 1.177979842049357, 0, -3.746385157453045, 1, 0.2829703204032987, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5855662514082964, 2.414433748591703, 0, 1, 0.1951887504694322, 0, 0.4141757878356707, 1.317222900371978, 0.8048112495305678, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.8489110102676033, 2.151088989732394, 1, 0, 0.282970336755868, 1.177979773975094, 0, -3.746384940953238, 1, 0.282970336755868, 0.3144310562158533],
[1.000273663867647, 1.848637190016063, 0, 1, 0.3511073933759802, 0, 0.5409390254619463, 1.720374036750994, 0.6488926066240198, 1, 0.3144310562158533],
[0.999570639010755, 2.000429360989245, 0, 1, 0.333190213003585, 0, 0.4998926827916002, 1.589832406530574, 0.6668097869964149, 1, 0.3144310562158533],
[0.3580835595462467, 1.794836431345932, 1, 2, 0.1663246014998706, 2.79264426791102, 1.114307668972497, -5.337693480844856, 0.9262107461343836, 0.4205833679706674, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413473794590088, 0, 2, 0.1952246736567014, 0, 0.8286810507257595, 2.635493645884901, 0.6476633258909628, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 1, 0.1951557652198947, 0, 0.4141588135055782, 1.317168916104976, 0.8048442347801052, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44621830723175, 0, 1, 0.4087942588949244, 0, 0.6914585405256899, 2.199078388907652, 0.5912057411050756, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 2, 0.3333333333333334, 1, 1, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036756451187, 2.41419632435488, 1, 0, 0.1952678918817063, 1.707056547398317, 0, -5.429032894977277, 0.9999999999999999, 0.1952678918817063, 0.3144310562158533],
[0.3577364519209651, 1.795182675593811, 0, 2, 0.1661634416959816, 0, 1.114092747880624, 3.543202002017931, 0.6952834059642906, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5859966573698155, 2.414003342630184, 0, 2, 0.1953322191232719, 0, 0.8284992670394957, 2.634915510606371, 0.6474902375810783, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 6, 0.3333333333333334, 0, 3.000000000000001, 9.541042275227849, 0.08779149519890257, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078135758571, 2.000099273580815, 1, 1, 0.3332795931768275, 1.000192223366864, 0.4999751828366406, -1.590863976829409, 0.8889247127718882, 0.5554838991255434, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994713638211803, 2.000528636178819, 0, 2, 0.3331571212737268, 0, 0.9997357517561812, 3.179507023854139, 0.4446794249079432, 1, 0.3144310562158533],
[1.000093135334807, 1.446457840747807, 0, 2, 0.4087767412621596, 0, 1.382688069889417, 4.397428442756041, 0.3495449416725913, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 4, 0.3333333333333334, 0, 2, 6.360694850151899, 0.1975308641975308, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849247143427351, 0, 0, 0.3509699052631506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5913661290662526, 2.408633870933747, 0, 1, 0.1971220430220842, 0, 0.4151731037529309, 1.320394711481423, 0.8028779569779158, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849824716045765, 0, 2, 0.3508987743595459, 0, 1.081183521147481, 3.438539227515939, 0.4213324011279396, 1, 0.3144310562158533],
[0.9980817149674546, 2.001918285032545, 0, 3, 0.3326939049891516, 0, 1.498562664834858, 4.765949912422493, 0.2971496854205289, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.15056041328163, 0, 1, 0.2831005414090761, 0, 0.4649950746903492, 1.478845888464451, 0.7168994585909239, 1, 0.3144310562158533],
[0.3583576533653273, 1.794560463808562, 0, 2, 0.1664520589550982, 0, 1.114479027223991, 3.544430504532968, 0.6948021700201952, 1, 0.3144310562158533],
[0.585996030675629, 2.41400396932437, 0, 1, 0.1953320102252097, 0, 0.4142495259773245, 1.317457413280916, 0.8046679897747903, 1, 0.3144310562158533],
[1.000093080274286, 1.445749326484671, 0, 2, 0.4088951428393673, 0, 1.383365679901775, 4.399583478014048, 0.3494049521588919, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998077128577118, 2.000192287142288, 1, 1, 0.3332692376192373, 1.000192324123744, 0.4999519328357768, -1.590938240351673, 0.8889316152566923, 0.555470090495167, 0.3144310562158533],
[0.5855662515691993, 2.4144337484308, 0, 1, 0.1951887505230664, 0, 0.4141757878632721, 1.31722290045976, 0.8048112494769335, 1, 0.3144310562158533],
[0.994989546597451, 2.00106684251131, 0, 3, 0.3320997395824821, 0, 1.499200294696325, 4.76797779691056, 0.2979441333484079, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 3, 0.3333333333333334, 1, 1.5, 1.590173712537975, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.3144310562158533],
[1.07584947302931, 1.078149739426997, 0, 1, 0.4994660475304761, 0, 0.9275149484629739, 2.94981977806367, 0.5005339524695238, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849247143427351, 0, 0, 0.3509699052631506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.071420536924907, 1.927668440736213, 1, 1, 0.3572486661467674, 0.9333403323312318, 0.5187614108669441, -1.318505005369712, 0.8723733905363557, 0.5868707228298902, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.214657323466388, 1.370809972193294, 0, 0, 0.4698018518762461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0, 2.28569186501413, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.848574327425661, 2.151425672574336, 2, 0, 0.2828581091418872, 2.356894305378581, 0, -7.495742735286937, 0.9999999999999999, 0.08000870990732389, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9996156571026809, 2.000198531690508, 0, 2, 0.3332258580671696, 0, 0.9999007440074761, 3.180031756535702, 0.4445877563502622, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816742576218402, 0, 1, 0.2572393150863146, 0, 0.5504357155990292, 1.75057681077521, 0.7427606849136854, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612099561, 2.151089038790041, 1, 0, 0.282970320403319, 1.177979842049272, 0, -3.746385157452776, 1, 0.2829703204033189, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.446219478357258, 1, 0, 0.4087940631850184, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.4087940631850184, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995703501653624, 2.000429649834637, 0, 1, 0.3331901167217876, 0, 0.4998926106112572, 1.589832176972006, 0.6668098832782124, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999006838310441, 2.000099316168955, 0, 1, 0.3333002279436815, 0, 0.4999751721906627, 1.590094751478478, 0.6666997720563186, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612099562, 2.151089038790041, 1, 0, 0.282970320403319, 1.177979842049272, 0, -3.746385157452776, 1, 0.2829703204033189, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413475422599707, 0, 2, 0.1952245676768023, 0, 0.8286804917390349, 2.63549186811291, 0.6476634964709898, 1, 0.3144310562158533],
[0.8483055495916177, 2.150989399593335, 1, 1, 0.2828349875433697, 1.178820532862728, 0.4649023375889531, -2.270507894053817, 0.9200043698213419, 0.4856743449080813, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2, 0, 0, 0.2980601894736986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489110247009449, 2, 1, 0, 0.2979773735791053, 1.177979753946865, 0, -3.746384877256511, 1, 0.2979773735791053, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7743604052438893, 2.000801794225097, 0, 1, 0.2790324851614292, 0, 0.4997996317707702, 1.589536471956077, 0.7209675148385708, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.077871139737744, 0, 0, 0.4988400752583935, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994713563908522, 2.000528643609147, 0, 1, 0.3331571187969508, 0, 0.4998678740214902, 1.589753506022435, 0.6668428812030492, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.0004729497157189916, 2.999527050284281, 0, 1, 0.0001576499052396639, 0, 0.3333858915875504, 1.060282961867115, 0.9998423500947603, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.412418084643116, 0, 2, 0.1952934223257559, 0, 0.829043693848727, 2.636646977007252, 0.6475526761521944, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.001085308277980422, 2.285426277363675, 0, 1, 0.0004746568024390115, 0, 0.4375551335453873, 1.391577342299835, 0.999525343197561, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2, 0, 0, 0.2264454462999895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8485743127015664, 2.151425687298431, 2, 0, 0.2828581042338557, 2.356894346274392, 0, -7.495742865349825, 1, 0.0800087071307708, 0.3144310562158533],
[0.8482389090874143, 2, 1, 0, 0.2978117131891837, 1.178913144972163, 0, -3.749353385000407, 1, 0.2978117131891838, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2, 0, 0, 0.2980601894736986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807878063416, 0, 1, 0.3333546815823316, 0, 0.5000480350984441, 1.590326480839624, 0.6666453184176684, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994707236468471, 2.000529276353153, 0, 1, 0.3331569078822824, 0, 0.4998677159191298, 1.589753003202, 0.6668430921177175, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2, 0, 0, 0.2264454462999895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8489109444503213, 2.151089055549676, 1, 0, 0.282970314816774, 1.177979865305554, 0, -3.746385231415831, 1, 0.282970314816774, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.845552428759822, 2.154255462712523, 1, 1, 0.2818688593904637, 1.182658775478544, 0.4641974999292116, -2.284956467710102, 0.9205499461059191, 0.4842876648868464, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9217987276114922, 2.078201272388505, 1, 0, 0.3072662425371643, 1.084835517826259, 0, -3.450153845749677, 1, 0.3072662425371643, 0.3144310562158533],
[0.370809972193295, 2.629190027806702, 0, 0, 0.1236033240644318, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.002987280253328443, 2.285093629009176, 0, 2, 0.001305583312738405, 0, 0.8752376596783944, 2.783559837287681, 0.9973905379223096, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9987115731508145, 2.001288426849185, 1, 2, 0.3329038577169382, 1.001290089034536, 0.9993562013191604, -0.006150434815979434, 0.7413131902881962, 0.7031307005706836, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.088358311163824, 0, 0, 0.1460446778392953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.446220662569097, 1, 0, 0.4087938652884114, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.4087938652884113, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9683176646586716, 1.956517451862308, 3, 2, 0.3310674366527922, 3.098156844073984, 1.022224462192404, -6.602186205348863, 0.9558419895679895, 0.2065311074141308, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807905445197, 0, 1, 0.3333546785395218, 0, 0.5000480282516836, 1.590326459064547, 0.6666453214604782, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5851763418510864, 2.413588844211271, 0, 3, 0.1951391007775019, 0, 1.242962324422062, 3.953052027942122, 0.5213897493811851, 1, 0.3144310562158533],
[0.8482387793743693, 2.151569027511872, 1, 1, 0.2827643749133479, 1.178913325252076, 0.464777093931504, -2.271201324433824, 0.9200443082798635, 0.4855730581065595, 0.3144310562158533],
[0.6630098937380463, 2.336990106261954, 0, 1, 0.221003297912682, 0, 0.4279008273593048, 1.360873294480033, 0.778996702087318, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999007597301268, 2.000099240269873, 0, 1, 0.3333002532433756, 0, 0.4999751911635495, 1.59009481181885, 0.6666997467566245, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612099561, 2.151089038790041, 1, 0, 0.282970320403319, 1.177979842049272, 0, -3.746385157452776, 1, 0.2829703204033189, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807862549261, 0, 1, 0.3333546833063474, 0, 0.500048038977728, 1.590326493177095, 0.6666453166936526, 1, 0.3144310562158533],
[0.9218980034635048, 2.078101996536494, 1, 1, 0.3072993344878351, 1.084718695824344, 0.4812083341754487, -1.91937262467672, 0.9055671190233335, 0.520165787999004, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994709937316647, 2.000529006268335, 0, 1, 0.333156997910555, 0, 0.4998677834046201, 1.589753217829306, 0.666843002089445, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6288432775833126, 1.521909578989336, 1, 0, 0.2923828628945361, 1.590221340749746, 0, -5.057456346354277, 1, 0.2923828628945361, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.446927203974402, 1, 0, 0.4086758275341243, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.4086758275341242, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991981098324507, 2.000801890167549, 0, 1, 0.333066036610817, 0, 0.4997996078043785, 1.589536395734624, 0.666933963389183, 1, 0.3144310562158533],
[0.9421643146461792, 1.98029342902873, 0, 1, 0.3223876604153851, 0, 0.5049756694342352, 1.605998070011174, 0.6776123395846149, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999807869750438, 0, 1, 0.3333546825061142, 0, 0.5000480371770879, 1.590326487450434, 0.6666453174938858, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489111519337676, 2.150716636262562, 1, 2, 0.2830054966400402, 1.177979577394008, 0.9299225970909528, -0.7889073785789363, 0.8050566819882998, 0.6314066642215568, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2, 0, 0, 0.2980601894736986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7745283193495779, 2.000634157006266, 1, 0, 0.2790929633664679, 1.291108375275116, 0, -4.106173196800208, 1, 0.2790929633664679, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999763113221633, 2.000122363475158, 0, 1, 0.3332670933566717, 0, 0.4999694110026986, 1.590076428899171, 0.6667329066433283, 1, 0.3144310562158533],
[0.5856652610727584, 2.41423558350981, 0, 3, 0.195228206335684, 0, 1.242629352533446, 3.951993061653537, 0.5212166005247584, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521939889955838, 0, 1, 0.2924928069714844, 0, 0.6570561732428323, 2.089666908703098, 0.7075071930285156, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994709951966096, 2, 0, 1, 0.3332157559773624, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6667842440226376, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999471785155556, 2.000429280664797, 0, 2, 0.3331682489609838, 0, 0.9997854057281874, 3.179664940736154, 0.4446645841937604, 1, 0.3144310562158533],
[0.9996153071529942, 2.000192288313697, 0, 2, 0.3332264738123915, 0, 0.999903865085962, 3.180041682649628, 0.4445869352246575, 1, 0.3144310562158533],
[1.000273862873032, 1.848636746464584, 0, 1, 0.351107493367649, 0, 0.5409391552518064, 1.720374449527841, 0.648892506632351, 1, 0.3144310562158533],
[1.001368742938824, 1.846388759903742, 0, 2, 0.3516341338541925, 0, 1.083195502178136, 3.444938026206085, 0.4203782963830032, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5861019673421759, 2.413898032657824, 0, 2, 0.195367322447392, 0, 0.8285354115798748, 2.635030462802296, 0.6474337457854793, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078588770413, 2.000099250180563, 1, 3, 0.3332796058445698, 1.000192178048265, 1.499925566058369, 1.589325793782414, 0.5926881081275517, 0.8024054510806211, 0.3144310562158533],
[0.8479444639221161, 2.151767490899801, 2, 2, 0.2826752957260044, 2.358645035252805, 0.9294684525434777, -4.545278064798452, 0.9288055388160521, 0.3178884326728834, 0.3144310562158533],
[0.5870129808546437, 2.412987019145356, 1, 4, 0.1956709936182146, 1.703539840880657, 1.65769644356261, -0.1457979306171851, 0.746121034803549, 0.663357723995053, 0.3144310562158533],
[1.001482395134441, 1.845943119491339, 0, 1, 0.3517150457458271, 0, 0.5417285015128507, 1.722884844876647, 0.6482849542541729, 1, 0.3144310562158533],
[0.7741745575529356, 2.000987654045751, 0, 2, 0.2789655157155506, 0, 0.9995064167218852, 3.178777658768336, 0.5198907275273419, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036589087406, 2.414196341091259, 1, 0, 0.1952678863029136, 1.707056596168828, 0, -5.429033050084446, 1, 0.1952678863029136, 0.3144310562158533],
[1.002733307543172, 1.843155033882936, 0, 2, 0.3523445712703861, 0, 1.085095916096999, 3.450982002719519, 0.41945755436294, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995702011668038, 2.000429798833196, 1, 1, 0.3331900670556013, 1.000429983639663, 0.4998925733776196, -1.591882863881073, 0.8889843792154838, 0.5553645133266867, 0.3144310562158533],
[1.00108269558902, 1.9985328445454, 0, 3, 0.3337370013572334, 0, 1.501101174387955, 4.774023254743214, 0.2957583980943998, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998077509183497, 2.00019224908165, 0, 1, 0.3332692503061166, 0, 0.4999519423491072, 1.590020872511702, 0.6667307496938834, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108998521648, 2.151089100147833, 1, 0, 0.2829702999507219, 1.17797992719159, 0, -3.746385428234926, 1, 0.2829702999507219, 0.3144310562158533],
[0.5855662756788993, 2.4144337243211, 0, 2, 0.1951887585596331, 0, 0.8283515839981765, 2.634445827226184, 0.6477211343487845, 1, 0.3144310562158533],
[0.5230433275685471, 2.437597484330122, 1, 1, 0.176665580460305, 1.911887500121002, 0.4102400032935752, -4.775760749906851, 0.9687892726806235, 0.3221204336012335, 0.3144310562158533],
[1.011949572587376, 1.385200142392429, 1, 2, 0.4221470049466232, 0.9881915335397365, 1.443834676876172, 1.449103497663544, 0.6158357447412977, 0.807046746532412, 0.3144310562158533],
[0.9987123371331298, 2.00128766286687, 0, 1, 0.33290411237771, 0, 0.4996782914093856, 1.589150567450189, 0.66709588762229, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.7751630024296535, 1.999999999999999, 0, 1, 0.2793216116498378, 0, 0.5000000000000002, 1.590173712537975, 0.7206783883501622, 1, 0.3144310562158533],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414004052295013, 0, 1, 0.1951901611125264, 0, 0.414249511739341, 1.317457367999182, 0.8048098388874736, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998076235997858, 2.000099371712642, 1, 1, 0.3332795400530943, 1.000192413416015, 0.4999751583061204, -1.59086465926731, 0.8889247481819977, 0.5554838282881867, 0.3144310562158533],
[0.9994707293136704, 2.000529270686329, 0, 1, 0.3331569097712235, 0, 0.4998677173350861, 1.589753007705233, 0.6668430902287765, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.849247143427351, 1.150752856572649, 0, 0, 0.6164157144757837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489107510661141, 2.151089248933883, 1, 0, 0.2829702503553717, 1.177980133652612, 0, -3.746386084852706, 1, 0.2829702503553717, 0.3144310562158533],
[0.7746337659325442, 2.000528651122685, 0, 1, 0.2791309658749707, 0, 0.4998678721440985, 1.589753500051677, 0.7208690341250293, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8482388527095411, 2.151761147290456, 1, 0, 0.282746284236514, 1.178913223328177, 0, -3.749353634199755, 1, 0.282746284236514, 0.3144310562158533],
[0.3577937386487871, 1.794042622238758, 1, 1, 0.1662736745006073, 2.794906371968704, 0.5574003580539885, -7.116046489945614, 0.9723530651680661, 0.3049004141692808, 0.3144310562158533],
[1.000026861873498, 1.999973138126501, 1, 2, 0.3333422872911661, 0.9999731388480426, 1.000013431117142, 0.0001281434142800593, 0.740728802050125, 0.7037156421538013, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.088358311163824, 0, 0, 0.1460446778392953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8493108970014538, 2.150402711582976, 1, 2, 0.2831306610640891, 1.177425137874203, 0.9300583510368343, -0.7867123235675376, 0.8049042763732567, 0.6315996645270134, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.002164256565896625, 2.997835743434103, 0, 3, 0.0007214188552988752, 0, 1.000721939676194, 3.182643444066191, 0.9978373043941388, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078622368447, 2.000099248445062, 0, 1, 0.3332796067840844, 0, 0.4999751891199551, 1.59009480531951, 0.6667203932159156, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998078625492617, 2.000099248283683, 0, 1, 0.3332796068714468, 0, 0.4999751891602958, 1.590094805447807, 0.6667203931285532, 1, 0.3144310562158533],
[0.6297561734137452, 1.520996683158904, 0, 1, 0.2928073169770415, 0, 0.6574636296531139, 2.090962761648368, 0.7071926830229585, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9997086588562817, 2.000291341143718, 0, 3, 0.3332362196187606, 0, 1.499781525967449, 4.769826314287053, 0.2964258001121229, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995700428994353, 2.000429957100564, 0, 1, 0.3331900142998118, 0, 0.4998925338277809, 1.589831932773875, 0.6668099857001881, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.359014534823184, 2.087204811917076, 1, 1, 0.1467630183293225, 2.785402547817469, 0.4791096658509092, -7.334812628633336, 0.9784606164508669, 0.2719866531095119, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.072881716834905, 1.927118283165094, 0, 0, 0.3576272389449683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9994705588578864, 2.000529441142113, 1, 1, 0.3331568529526289, 1.000529721598522, 0.4998676747436891, -1.592279251548021, 0.8890065113307004, 0.5553202172359581, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108002443584, 2, 1, 0, 0.2979773182689838, 1.177980065411055, 0, -3.746385867820845, 1, 0.2979773182689838, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991969601261081, 2.000803039873891, 0, 1, 0.3330656533753695, 0, 0.4997993206083039, 1.589535482351328, 0.6669343466246305, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991978527416503, 2.000802147258349, 0, 1, 0.3330659509138835, 0, 0.4997995435831953, 1.58953619148895, 0.6669340490861165, 1, 0.3144310562158533],
[0.6297553321051896, 1.520997524467459, 0, 1, 0.2928069258077108, 0, 0.6574632659906046, 2.090961605075243, 0.7071930741922892, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8485742476692162, 2.151425752330781, 2, 0, 0.2828580825564057, 2.356894526900164, 0, -7.495743439802533, 1, 0.0800086948674863, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.001083122442422, 1.998724684443822, 0, 2, 0.3337157534373947, 0, 1.000638064644973, 3.182376692326619, 0.4439346972174986, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 1, 0.2830823811424503, 0, 0.4649534682443986, 1.478713565511205, 0.7169176188575497, 1, 0.3144310562158533],
[0.3589450666828952, 1.797219283573136, 1, 1, 0.1664738899148725, 2.785941618424402, 0.5564151292722905, -7.090668828913539, 0.9722864439766108, 0.305234223806356, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.845203126965285, 1.152155202734173, 1, 0, 0.6156097883533003, 0.5419457540399095, 0, -1.72357578339167, 1, 0.6156097883533003, 0.3144310562158533],
[0.9218978575181883, 2.07810214248181, 1, 1, 0.3072992858393963, 1.084718867545769, 0.4812083003801404, -1.919373278291333, 0.9055671489225969, 0.5201657206013897, 0.3144310562158533],
[0.7748753168693212, 1.999999999999999, 0, 0, 0.279246895223946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44551237865676, 0, 0, 0.4089122626111046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109757965909, 2, 1, 0, 0.2979773615281976, 1.177979821808326, 0, -3.746385093079533, 1, 0.2979773615281976, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414004109781167, 0, 1, 0.1951901573716233, 0, 0.4142495018745645, 1.317457336625766, 0.8048098426283766, 1, 0.3144310562158533],
[0, 2.28569186501413, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036589087406, 2.414196341091259, 1, 0, 0.1952678863029136, 1.707056596168828, 0, -5.429033050084446, 1, 0.1952678863029136, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 0, 0.3333333333333334, 2, 0, -6.360694850151899, 1, 0.111111111111111, 0.3144310562158533],
[0.848237821023627, 2.15176217897637, 1, 1, 0.2827459403412093, 1.178914657204546, 0.4647353735326443, -2.271338245868517, 0.9200547332205653, 0.4855466139029838, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.849247143427351, 0, 0, 0.3509699052631506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108457618214, 2.151089154238176, 1, 0, 0.2829702819206074, 1.177980002249341, 0, -3.74638566694465, 1, 0.2829702819206075, 0.3144310562158533],
[0.999527120890329, 1.44598525776643, 0, 1, 0.4087188965444276, 0, 0.6915699829088643, 2.199432814404024, 0.5912811034555725, 1, 0.3144310562158533],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.927111853605567, 2, 0, 0.341633681940858, 2, 0, -6.360694850151899, 0.9999999999999999, 0.1167135726364674, 0.3144310562158533],
[0.9998075684033683, 2.000192431596631, 1, 1, 0.3332691894677895, 1.000192468633678, 0.4999518967291368, -1.590938814775129, 0.8889316473514827, 0.5554700262870615, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9998077224514027, 2.000192277548597, 0, 2, 0.3332692408171343, 0, 0.9999038704674771, 3.180041699764716, 0.4445299052405605, 1, 0.3144310562158533],
[0.003538784449753907, 2.996461215550246, 0, 3, 0.001179594816584636, 0, 1.001180987903795, 3.184103376914827, 0.9964653882407002, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816322350850055, 0, 0, 0.2572835178827833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9991978832475116, 2.000802116752488, 0, 1, 0.3330659610825039, 0, 0.4997995512035469, 1.589536215724315, 0.666934038917496, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9997805757771375, 1.927412394018594, 1, 3, 0.3415492542150049, 1.000219472380419, 1.556490976871377, 1.769136646950941, 0.5779887156990763, 0.8120279942372892, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.44621974467453, 0, 1, 0.4087940186800553, 0, 0.6914578532635431, 2.199076203175252, 0.5912059813199447, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.002404269193022675, 2.284911490380011, 0, 2, 0.001051131302252503, 0, 0.8753074280646967, 2.783781724995409, 0.9978988422725095, 1, 0.3144310562158533],
[0.9421660355023191, 1.980291334076198, 0, 1, 0.3223882905221644, 0, 0.50497620364859, 1.605999768998421, 0.6776117094778356, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -3.180347425075949, 1, 0.3333333333333334, 0.3144310562158533],
[0.8485746298352247, 2, 1, 0, 0.2978944700789919, 1.178446732721881, 0, -3.747870032001198, 1, 0.2978944700789919, 0.3144310562158533],
[0.9959928981511708, 2.003814857160889, 0, 2, 0.3320189090075744, 0, 0.9980962027767906, 3.174292688479248, 0.4461987379234311, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9208074260197209, 2.079192573980277, 2, 0, 0.3069358086732405, 2.172006809985442, 0, -6.907736265384627, 0.9999999999999999, 0.09420959064589618, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9421657111161974, 1.98029172898052, 0, 1, 0.3223881717452888, 0, 0.5049761029476264, 1.605999448734371, 0.6776118282547112, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 1, 0.1951557652198947, 0, 0.4141588135055782, 1.317168916104976, 0.8048442347801052, 1, 0.3144310562158533],
[0.8479021945574665, 2.152097805442531, 2, 0, 0.2826340648524891, 2.358762617714218, 0, -7.501684617612818, 1, 0.07988201461504096, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5859959467826359, 2.414004053217364, 0, 1, 0.1953319822608787, 0, 0.4142495115810633, 1.317457367495804, 0.8046680177391213, 1, 0.3144310562158533],
[1.001082622265663, 1.998725184881692, 0, 2, 0.3337155866720792, 0, 1.000637814106687, 3.182375895527828, 0.4439349194437317, 1, 0.3144310562158533],
[0.5858036798459502, 2.414196320154049, 1, 0, 0.1952678932819834, 1.707056535156918, 0, -5.429032856045374, 1, 0.1952678932819835, 0.3144310562158533],
[0.8489108538815553, 2.151089146118442, 1, 0, 0.2829702846271854, 1.177979990982098, 0, -3.746385631110906, 1, 0.2829702846271853, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.41400408731741, 0, 2, 0.195190158833449, 0, 0.8284990114588096, 2.634914697770994, 0.647718880438529, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.999807852930409, 2.00019214706959, 0, 1, 0.3332692843101364, 0, 0.4999519678472211, 1.590020953604563, 0.6667307156898636, 1, 0.3144310562158533],
[0.6635384749059811, 2.33646152509402, 0, 1, 0.221179491635327, 0, 0.4279976320002786, 1.36118116687069, 0.7788205083646731, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.848164761408897, 1.151835238591102, 1, 0, 0.6160549204696325, 0.5410773005095486, 0, -1.720813799442588, 1, 0.6160549204696325, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414532704340315, 0, 0, 0.1951557652198947, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6631089096203956, 2.336891090379605, 0, 0, 0.2210363032067985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489108538815578, 2.151089146118439, 1, 0, 0.2829702846271862, 1.177979990982095, 0, -3.746385631110895, 1, 0.2829702846271862, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.99980789147236, 0, 1, 0.3333546800922581, 0, 0.500048031745564, 1.590326470176301, 0.6666453199077419, 1, 0.3144310562158533],
[0.847902368793396, 2, 2, 0, 0.2977287346941731, 2.358762133010776, 0, -7.501683076087473, 1, 0.08864239946259322, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8494876290674251, 2.150512370932572, 1, 2, 0.2831625430224753, 1.177180179890093, 0.9300109253185546, -0.7860841023345337, 0.8048654490060428, 0.6316488149140147, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[1.002592669147818, 2.004553955110695, 0, 1, 0.3334033202970382, 0, 0.4988640976464904, 1.590674576553469, 0.6665966797029619, 1, 0.3136179486362222],
[1.001788119461736, 2.005989887981718, 0, 1, 0.3330658436169742, 0, 0.4985069994575734, 1.589535935763075, 0.6669341563830258, 1, 0.3136179486362222],
[0.3599075822782121, 2.091945200873297, 1, 0, 0.1467900457773822, 2.778491060593967, 0, -8.859477184505305, 1, 0.1467900457773823, 0.3136179486362222],
[1.002592669147818, 2.005185338295635, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4987070177014054, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3136179486362222],
[0.6308213093799135, 2.151248341112496, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3136179486362222],
[0.3583717886163498, 2.423985526342744, 0, 1, 0.1288014974531115, 0, 0.4125437174159939, 1.315434015208484, 0.8711985025468885, 1, 0.3136179486362222],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 1, 0.2830823811424503, 0, 0.4649534682443986, 1.478713565511205, 0.7169176188575497, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357652659856486, 2.418657233033385, 0, 4, 0.1288230326061346, 0, 1.653810199051379, 5.259691008117395, 0.5760040528993008, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5865241729245503, 2.411891028351035, 0, 5, 0.1956113925366411, 0, 2.07306214966868, 6.593057869721197, 0.3367670210865639, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.816785732733319, 0, 3, 0.2572347763854338, 0, 1.651267921113932, 5.251605681025209, 0.409783705643023, 1, 0.3144310562158533],
[0.996797269454472, 2.003202730545528, 1, 1, 0.332265756484824, 1.003213020985983, 0.4992005974990221, -1.602934613243046, 0.8895994670675675, 0.5541309800372157, 0.3144310562158533],
[0.6289783588077915, 1.529419097179327, 1, 2, 0.2914098870266392, 1.589879820182475, 1.307686038240633, -0.8974742677711812, 0.7947337265677854, 0.6442169409784922, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 2, 4, 0.3333333333333334, 2, 2, 0, 0.6803840877914951, 0.6488340192043897, 0.3144310562158533],
[1.2069485891304, 1.382058801504253, 1, 2, 0.466181979045852, 0.8285357048393376, 1.447116430808277, 1.967301619036927, 0.5506496788941968, 0.8478823202039937, 0.3144310562158533],
[1.001082694294305, 1.998824353003007, 3, 2, 0.3337045710120266, 2.996755429994518, 1.000588169238195, -6.348505407767279, 0.9545489277082313, 0.2104268310463704, 0.3144310562158533],
[0.357791955583164, 1.794043165426462, 1, 1, 0.1662729416811873, 2.794920300458134, 0.5574001892882494, -7.116091324114793, 0.9723533088646845, 0.304899192227059, 0.3144310562158533],
[0.774360456744407, 2.000801714031107, 0, 1, 0.2790325066041144, 0, 0.4997996518032035, 1.589536535666174, 0.7209674933958856, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 1.793598789079713, 0, 0, 0.1660600223784341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.357154067492935, 2.417721249376385, 0, 0, 0.1287099515144647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.3605810947733776, 1.794152554970707, 1.5, 2.5, 0.1673436968955321, 4.159951871416714, 1.393415511447864, -8.79854678880592, 0.925360817949337, 0.3260990563069238, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9995706604161974, 2.000429339583802, 1, 1, 0.3331902201387326, 1.000429523995456, 0.499892688140664, -1.591881037066451, 0.8889842772039029, 0.5553647174813681, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 3, 0, 0.3333333333333334, 3.000000000000001, 0, -9.541042275227849, 0.9999999999999999, 0.0370370370370372, 0.3144310562158533],
[1.001704961781071, 2.005992913993358, 0, 2, 0.3330470689391133, 0, 0.9970124949337793, 3.178982380877703, 0.4448262122507078, 1, 0.3136263041063186],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9993909289730837, 2.000609071026916, 1, 1, 0.3331303096576946, 1.000609442220515, 0.4998477786000932, -1.592596067471958, 0.8890241967873684, 0.5552848161027577, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 3.180347425075949, 0.4444444444444444, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 1.999615986804206, 1, 2, 0.3333760069286071, 1, 1.00019204347151, 0.000610764960119918, 0.7406838407928287, 0.7037605981887416, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413881039400239, 0, 1, 0.1951981664870504, 0, 0.414270622154795, 1.317524506454613, 0.8048018335129496, 1, 0.3144310562158533],
[0.942968279720021, 1.978960482601403, 1, 0, 0.3227211737259632, 1.060481059126307, 0, -3.372698205734167, 1, 0.3227211737259632, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.414004374338017, 0, 1, 0.1951901401556271, 0, 0.414249456475913, 1.317457192242281, 0.8048098598443729, 1, 0.3144310562158533],
[0.585467295659684, 2.413353863226822, 0, 2, 0.1952324812450884, 0, 0.8287222319423396, 2.635624616461013, 0.647650759242937, 1, 0.3144310562158533],
[0.8489109612098952, 2.151089038790102, 1, 0, 0.2829703204032987, 1.177979842049357, 0, -3.746385157453045, 1, 0.2829703204032987, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 1.590173712537975, 0.6666666666666666, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 2.145685289062616, 0, 0, 0.226745333017907, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9426213631526195, 1.979737022886669, 0, 0, 0.3225550184589669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.6291900278067044, 1.521562828765944, 0, 0, 0.2925440856135166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.8492471434273502, 2.150752856572647, 0, 0, 0.2830823811424503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3144310562158533],
[0.5855662514082964, 2.414433748591703, 0, 1, 0.1951887504694322, 0, 0.4141757878356707, 1.317222900371978, 0.8048112495305678, 1, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533],
[0.8489110102676033, 2.151088989732394, 1, 0, 0.282970336755868, 1.177979773975094, 0, -3.746384940953238, 1, 0.282970336755868, 0.3144310562158533],
[1.000273663867647, 1.848637190016063, 0, 1, 0.3511073933759802, 0, 0.5409390254619463, 1.720374036750994, 0.6488926066240198, 1, 0.3144310562158533],
[0.999570639010755, 2.000429360989245, 0, 1, 0.333190213003585, 0, 0.4998926827916002, 1.589832406530574, 0.6668097869964149, 1, 0.3144310562158533],
[0.3580835595462467, 1.794836431345932, 1, 2, 0.1663246014998706, 2.79264426791102, 1.114307668972497, -5.337693480844856, 0.9262107461343836, 0.4205833679706674, 0.3144310562158533],
[0.9999999999999998, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -1.590173712537975, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3144310562158533]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node107":{
"Global MG94xREV":0.0008046238939431625,
"Nucleotide GTR":0.0007989037566719803,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node110":{
"Global MG94xREV":0.0008013547493322309,
"Nucleotide GTR":0.0007956578526782776,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node114":{
"Global MG94xREV":0.0006000399953643938,
"Nucleotide GTR":0.0005957742618117091,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node115":{
"Global MG94xREV":0.0002018974907790888,
"Nucleotide GTR":0.0002004621849540225,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node124":{
"Global MG94xREV":0.0006018689428542254,
"Nucleotide GTR":0.0005975902071637946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node14":{
"Global MG94xREV":0.0008013763534816157,
"Nucleotide GTR":0.0007956793032419926,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "I", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "ATA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.0008016749072628442,
"Nucleotide GTR":0.0007959757345798979,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.0008014669661871605,
"Nucleotide GTR":0.0007957692717743804,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node167":{
"Global MG94xREV":0.0008013210034953528,
"Nucleotide GTR":0.000795624346743322,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.0008018860006903049,
"Nucleotide GTR":0.0007961853273268654,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node189":{
"Global MG94xREV":0.0003494714419869267,
"Nucleotide GTR":0.0003469870208361611,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node190":{
"Global MG94xREV":0.001254782591486799,
"Nucleotide GTR":0.001245862239104991,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node280":{
"Global MG94xREV":0.0008026213530795406,
"Nucleotide GTR":0.0007969154520356402,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "I", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "ATA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.0008022872729299015,
"Nucleotide GTR":0.0007965837468891918,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node299":{
"Global MG94xREV":0.0008028088663179457,
"Nucleotide GTR":0.0007971016322270497,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node308":{
"Global MG94xREV":0.0008021321290279147,
"Nucleotide GTR":0.0007964297059179325,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.0008025776688862199,
"Nucleotide GTR":0.0007968720783968324,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node329":{
"Global MG94xREV":0.0008032173288382956,
"Nucleotide GTR":0.0007975071909538327,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node354":{
"Global MG94xREV":0.0006178770698880861,
"Nucleotide GTR":0.000613484531109308,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node355":{
"Global MG94xREV":0.0001843630045369809,
"Nucleotide GTR":0.0001830523528130914,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"Global MG94xREV":0.0008013587291482611,
"Nucleotide GTR":0.0007956618042014705,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node362":{
"Global MG94xREV":0.0008008260316401737,
"Nucleotide GTR":0.000795132893683668,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.0001051729337911844,
"Nucleotide GTR":0.0001044252507767633,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node375":{
"Global MG94xREV":0.000531445367775726,
"Nucleotide GTR":0.0005276672790578855,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.0001645630376222586,
"Nucleotide GTR":0.000163393145487501,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node381":{
"Global MG94xREV":0.0008013742960524126,
"Nucleotide GTR":0.0007956772604392215,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node386":{
"Global MG94xREV":0.0008014375935065168,
"Nucleotide GTR":0.0007957401079065325,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0008015038266353424,
"Nucleotide GTR":0.0007958058701786117,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node398":{
"Global MG94xREV":0.0008016631103834516,
"Nucleotide GTR":0.0007959640215654886,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node40":{
"Global MG94xREV":0.0008019399618254289,
"Nucleotide GTR":0.0007962389048478531,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "V", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node401":{
"Global MG94xREV":0.0004649556798954309,
"Nucleotide GTR":0.0004616502718233632,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node402":{
"Global MG94xREV":0.000336322706225251,
"Nucleotide GTR":0.0003339317605157013,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0008017283531123339,
"Nucleotide GTR":0.0007960288004784585,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "C", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "TGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node417":{
"Global MG94xREV":0.0006149256485062901,
"Nucleotide GTR":0.0006105540916242421,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "Y", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "TAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.0006082652728806236,
"Nucleotide GTR":0.0006039410651552975,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node440":{
"Global MG94xREV":0.0006167136872497941,
"Nucleotide GTR":0.0006123294190536325,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node441":{
"Global MG94xREV":0.0001848340168304748,
"Nucleotide GTR":0.0001835200166415504,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node446":{
"Global MG94xREV":0.0008038562339751349,
"Nucleotide GTR":0.0007981415540616403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.0006143226088469893,
"Nucleotide GTR":0.0006099553390233508,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "C", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "TGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.0008014763651141895,
"Nucleotide GTR":0.0007957786038836651,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node461":{
"Global MG94xREV":0.0008017025555866097,
"Nucleotide GTR":0.0007960031863494607,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node467":{
"Global MG94xREV":0.0008021089892675413,
"Nucleotide GTR":0.0007964067306600116,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node47":{
"Global MG94xREV":0.0003728625643569787,
"Nucleotide GTR":0.0003702118537983407,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node474":{
"Global MG94xREV":0.0008013223068209348,
"Nucleotide GTR":0.0007956256408034564,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node477":{
"Global MG94xREV":0.0008013202190578825,
"Nucleotide GTR":0.0007956235678824837,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node485":{
"Global MG94xREV":0.0008013226058526902,
"Nucleotide GTR":0.0007956259377093711,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node496":{
"Global MG94xREV":0.0006216722500459924,
"Nucleotide GTR":0.0006172527310201258,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node497":{
"Global MG94xREV":0.0001801138299829553,
"Nucleotide GTR":0.000178833385989561,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.0008014292909426434,
"Nucleotide GTR":0.0007957318643662673,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.0008014450618579078,
"Nucleotide GTR":0.0007957475231648013,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0008016896920160052,
"Nucleotide GTR":0.0007959904142270359,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.0006663623050357573,
"Nucleotide GTR":0.0006616250807427186,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.000135515242832271,
"Nucleotide GTR":0.0001345518538536768,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node536":{
"Global MG94xREV":0.0008011144928342989,
"Nucleotide GTR":0.0007954193041835006,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.0008016540078699899,
"Nucleotide GTR":0.0007959549837625402,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node550":{
"Global MG94xREV":0.0008013180663126418,
"Nucleotide GTR":0.0007956214304412853,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "S", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "TCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node558":{
"Global MG94xREV":0.0008014432094249021,
"Nucleotide GTR":0.0007957456839008928,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node561":{
"Global MG94xREV":0.0008012088406445056,
"Nucleotide GTR":0.0007955129812673833,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.0008015917857562105,
"Nucleotide GTR":0.0007958932039908742,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node569":{
"Global MG94xREV":0.0008013763537375835,
"Nucleotide GTR":0.0007956793034961404,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.0008013763534816157,
"Nucleotide GTR":0.0007956793032419926,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCT", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node581":{
"Global MG94xREV":0.0008014102365212127,
"Nucleotide GTR":0.0007957129454042819,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.0008013729889878094,
"Nucleotide GTR":0.0007956759626666485,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node593":{
"Global MG94xREV":0.0008014393919637763,
"Nucleotide GTR":0.0007957418935784113,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node601":{
"Global MG94xREV":0.0006171838277991066,
"Nucleotide GTR":0.0006127962173352099,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node605":{
"Global MG94xREV":0.0008018454068629918,
"Nucleotide GTR":0.0007961450220844006,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node614":{
"Global MG94xREV":0.0008013763536840923,
"Nucleotide GTR":0.0007956793034430295,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "S", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "TCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node634":{
"Global MG94xREV":0.0008016398177388445,
"Nucleotide GTR":0.000795940894510203,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0008016963297585042,
"Nucleotide GTR":0.0007959970047812783,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "R", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AGG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node654":{
"Global MG94xREV":2.990281347570394e-05,
"Nucleotide GTR":2.96902319215602e-05,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node662":{
"Global MG94xREV":0.0008013763534816157,
"Nucleotide GTR":0.0007956793032419926,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "I", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "ATT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node666":{
"Global MG94xREV":0.0008015143089954408,
"Nucleotide GTR":0.0007958162780187527,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node723":{
"Global MG94xREV":0.0008014110207119179,
"Nucleotide GTR":0.0007957137240201117,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node740":{
"Global MG94xREV":2.642432370006775e-05,
"Nucleotide GTR":2.623647101510479e-05,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node750":{
"Global MG94xREV":0.0008016295736412126,
"Nucleotide GTR":0.0007959307232387018,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "L", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CTA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node754":{
"Global MG94xREV":0.0008013595225480568,
"Nucleotide GTR":0.0007956625919609205,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node773":{
"Global MG94xREV":0.0008017657611825039,
"Nucleotide GTR":0.0007960659426115888,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node794":{
"Global MG94xREV":0.0008016545514055421,
"Nucleotide GTR":0.0007959555234340556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node816":{
"Global MG94xREV":0.0008016545899031628,
"Nucleotide GTR":0.0007959555616579919,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node852":{
"Global MG94xREV":0.0008016963241518496,
"Nucleotide GTR":0.0007959969992144831,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node87":{
"Global MG94xREV":0.000801897963583284,
"Nucleotide GTR":0.0007961972051746556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node874":{
"Global MG94xREV":0.000801687459560997,
"Nucleotide GTR":0.0007959881976427335,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node896":{
"Global MG94xREV":0.0008021958878626003,
"Nucleotide GTR":0.0007964930114858301,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node913":{
"Global MG94xREV":0.0008012525195836702,
"Nucleotide GTR":0.0007955563496893864,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node929":{
"Global MG94xREV":0.0008022387865722563,
"Nucleotide GTR":0.0007965356052250388,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800993235469189,
"Nucleotide GTR":0.0007952989088469471,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCT", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009960272859908,
"Nucleotide GTR":0.0007953016808164933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCT", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014322887890905,
"Nucleotide GTR":0.0007957348409007776,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "I", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ATC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008036638823133957,
"Nucleotide GTR":0.0007979505698436441,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "C", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGC", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020237731883485,
"Nucleotide GTR":0.0007963221203889173,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCC", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022607886849012,
"Nucleotide GTR":0.0007965574509228606,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019841581569181,
"Nucleotide GTR":0.0007962827869839944,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "V", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GTT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008023483585315019,
"Nucleotide GTR":0.0007966443982282375,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "K", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "AAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440087355,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921504867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "S", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "TCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012804480083331,
"Nucleotide GTR":0.0007955840795685874,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGT", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016371584400363,
"Nucleotide GTR":0.0007959382541165679,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "G", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "GGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025849843975129,
"Nucleotide GTR":0.0007968793419015558,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "DAGV", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "I", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GNC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ATT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGN", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012962116232724,
"Nucleotide GTR":0.000795599731118695,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020452300661405,
"Nucleotide GTR":0.0007963434247280057,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTT", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020022682186594,
"Nucleotide GTR":0.0007963007682998222,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "S", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "TCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008029240597142613,
"Nucleotide GTR":0.0007972160067040602,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "RC", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "YGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013860429162855,
"Nucleotide GTR":0.0007956889237936771,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001994527892145434,
"Nucleotide GTR":0.0001980348629734563,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017257062703701,
"Nucleotide GTR":0.0007960261724531108,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004288808601401338,
"Nucleotide GTR":0.0004258319109211856,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCA", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008029326565041332,
"Nucleotide GTR":0.0007972245423786477,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "H", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CAT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415137_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014824379331866,
"Nucleotide GTR":0.0007957846335304938,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "N", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAT", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022932628754358,
"Nucleotide GTR":0.0007965896942517117,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "F", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTT", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023877684505872,
"Nucleotide GTR":0.0007966835279789761,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019557642111887,
"Nucleotide GTR":0.0007962545948931557,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "A", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "GCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008053451641202516,
"Nucleotide GTR":0.0007996198992802077,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "EDAGV", "MLV", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAA", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GNN", "NTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012460578339856,
"Nucleotide GTR":0.0007955499338768092,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "P", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "CCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008018677668944232,
"Nucleotide GTR":0.0007961672231565351,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAA", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017220967452692,
"Nucleotide GTR":0.0007960225885884207,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026111346006039,
"Nucleotide GTR":0.0007969053062007089,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "Y", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TAC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018535978978702,
"Nucleotide GTR":0.0007961531548885397,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "V", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "GTT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017475961573708,
"Nucleotide GTR":0.0007960479067231101,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014098956750865,
"Nucleotide GTR":0.0007957126069812574,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCT", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020814207634971,
"Nucleotide GTR":0.0007963793581427256,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "D", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GAC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017220967510655,
"Nucleotide GTR":0.0007960225885941764,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080143228874448,
"Nucleotide GTR":0.0007957348408564851,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "I", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ATT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019855573977063,
"Nucleotide GTR":0.0007962841762774657,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "Y", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "TAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015371304078895,
"Nucleotide GTR":0.0007958389371919076,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "S", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "TCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019138373178619,
"Nucleotide GTR":0.0007962129660615528,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "P", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "CCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019840619230507,
"Nucleotide GTR":0.0007962826914342629,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "F", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "TTT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019039556516875,
"Nucleotide GTR":0.0007962031546449549,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAC", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604753389988755,
"Nucleotide GTR":0.001593345066489749,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "KQE", "K", "D", "K", "KQE", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "F", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "NAA", "AAG", "GAC", "AAA", "NAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "TTC", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011738007944667,
"Nucleotide GTR":0.0007954781905185135,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019324270698516,
"Nucleotide GTR":0.0007962314236574714,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "GV", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GKC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417257_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCY", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417259_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015371305568486,
"Nucleotide GTR":0.0007958389373398067,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "H", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAT", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417281_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022463822002832,
"Nucleotide GTR":0.0007965431468551224,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "V", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GTA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417297_England_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008014970058771902,
"Nucleotide GTR":0.0007957990979097888,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCT", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008026283608340462,
"Nucleotide GTR":0.0007969224099714446,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019626715415665,
"Nucleotide GTR":0.0007962614531187537,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "S", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "AGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008022903977068263,
"Nucleotide GTR":0.0007965868494518204,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCC", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "ED", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAM", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001577719000032514,
"Nucleotide GTR":0.001566502866229535,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "S", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAT", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "TCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014322887890905,
"Nucleotide GTR":0.0007957348409007776,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "S", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "TCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014565951648652,
"Nucleotide GTR":0.0007957589744805333,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "S", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TCC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024155727817629,
"Nucleotide GTR":0.0007967111346468799,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002406523025872331,
"Nucleotide GTR":0.002389414856256841,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "Y", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TAT", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801537239482522,
"Nucleotide GTR":0.0007958390454911195,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "S", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "TCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008029737954191982,
"Nucleotide GTR":0.0007972653888337918,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGC", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000804004650200176,
"Nucleotide GTR":0.0007982889151835618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "Q", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "CAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "KTRIQPLEAGVS", "SI", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "KQE", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "DAGV", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "NNA", "AKT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "NAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GNT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 18.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "VF", "QP", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "KTC", "CMA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801355013175947,
"Nucleotide GTR":0.0007956581146463071,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602914174183345,
"Nucleotide GTR":0.001591518925820384,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACC", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001606406962418041,
"Nucleotide GTR":0.001594986883536979,
"amino-acid": [
["M", "S", "Y", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "TAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCA", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440087355,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921504867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015380541042004,
"Nucleotide GTR":0.0007958398543215857,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "D", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "GAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019715042271927,
"Nucleotide GTR":0.0007962702230120956,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "T", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "ACG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010586278790677,
"Nucleotide GTR":0.0007953638363768181,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017220972069546,
"Nucleotide GTR":0.000796022589046824,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "F", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTT", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440087355,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921504867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGT", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019438558722571,
"Nucleotide GTR":0.0007962427712115817,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAC", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440146838,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921563938,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "L", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CTG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "KI", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AWA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801759384059912,
"Nucleotide GTR":0.0007960596108244857,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAG", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000802121440627235,
"Nucleotide GTR":0.0007964190935019686,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "H", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CAC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022930475373668,
"Nucleotide GTR":0.000796589480444498,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001934448208439088,
"Nucleotide GTR":0.0001920696057428459,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801728114015405,
"Nucleotide GTR":0.0007960285630812903,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "V", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GTA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008013554131812466,
"Nucleotide GTR":0.0007956585118079367,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAT", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010780865270444,
"Nucleotide GTR":0.0007953831566916708,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418669_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015026935150306,
"Nucleotide GTR":0.000795804745113745,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418754_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008017281135258252,
"Nucleotide GTR":0.0007960285625951896,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000184636178926832,
"Nucleotide GTR":0.0001833235851837944,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418881_Washington_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008019039502767948,
"Nucleotide GTR":0.0007962031493082714,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACC", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418881_Washington_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418897_Washington_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418897_Washington_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418898_Connecticut_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585165465748457,
"Nucleotide GTR":0.001573896394409816,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "T", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "ACT", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418898_Connecticut_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418909_Washington_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000801729202742521,
"Nucleotide GTR":0.000796029644068556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "I", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ATA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418909_Washington_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418916_Illinois_20200313_null_47":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418916_Illinois_20200313_null_47",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008020637901105101,
"Nucleotide GTR":0.0007963618528274973,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCC", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801961487331406,
"Nucleotide GTR":0.0007962602773272419,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "S", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "AGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008027427308880541,
"Nucleotide GTR":0.0007970359669593554,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019841577531509,
"Nucleotide GTR":0.0007962827865830987,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "S", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGT", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014109652033835,
"Nucleotide GTR":0.0007957136689061909,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATT", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009931688903717,
"Nucleotide GTR":0.0007952988427414433,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "M", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "ATG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019626712664363,
"Nucleotide GTR":0.0007962614528455795,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "E", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GAA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008027240286355613,
"Nucleotide GTR":0.0007970173976627091,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "H", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CAC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017950722420639,
"Nucleotide GTR":0.000796095045296421,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "G", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GGG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "KAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "RC", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "YGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "SL", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TYA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "TS", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "WCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008027054937819956,
"Nucleotide GTR":0.0007969989945749381,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "T", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "ACT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802111577141567,
"Nucleotide GTR":0.0007964093001366302,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "T", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "ACA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "QH", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAM", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016987127799363,
"Nucleotide GTR":0.0007959993708616162,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "I", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ATA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024344139215066,
"Nucleotide GTR":0.0007967298418434168,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "T", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ACC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015493014615141,
"Nucleotide GTR":0.0007958510217205138,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "R", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "CGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603300340349853,
"Nucleotide GTR":0.001591902346699935,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGT", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACT", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "AS", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "KCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024055728369076,
"Nucleotide GTR":0.0007967012057924548,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTA", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018055926834002,
"Nucleotide GTR":0.0007961054909470776,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGG", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015123243150557,
"Nucleotide GTR":0.0007958143074476235,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAT", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "DY", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "KAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008012380841017083,
"Nucleotide GTR":0.0007955420168304491,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCT", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023198536750465,
"Nucleotide GTR":0.0007966160960151469,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016050408244626,
"Nucleotide GTR":0.000795906364827758,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCT", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000799620636880511,
"Nucleotide GTR":0.0007939360681742389,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "E", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAA", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAY", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022456975720131,
"Nucleotide GTR":0.0007965424670939315,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATT", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603300334586452,
"Nucleotide GTR":0.001591902340977506,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "V", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAT", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GTC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008020457338455488,
"Nucleotide GTR":0.0007963439249260045,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "I", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "ATC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010379545290405,
"Nucleotide GTR":0.0007953433099953326,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGT", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026254075937136,
"Nucleotide GTR":0.0007969194777259392,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014603272608899,
"Nucleotide GTR":0.0007957626800447807,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021498077779268,
"Nucleotide GTR":0.0007964472589882599,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGG", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019947262560679,
"Nucleotide GTR":0.0007962932799536609,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008050862920597207,
"Nucleotide GTR":0.0007993628675623921,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGC", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604598558610364,
"Nucleotide GTR":0.001593191335820329,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "A", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGG", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GCC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008036625695793908,
"Nucleotide GTR":0.0007979492664419737,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "R", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "CGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017475962023276,
"Nucleotide GTR":0.000796047906767747,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "L", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CTC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604392916293555,
"Nucleotide GTR":0.001592987155431622,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "P", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "S", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "CCT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "TCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008032144120051366,
"Nucleotide GTR":0.00079750429485668,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026829443892931,
"Nucleotide GTR":0.0007969766054877173,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420461_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420524_England_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008007383436293885,
"Nucleotide GTR":0.0007950458290541452,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420524_England_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020814207634971,
"Nucleotide GTR":0.0007963793581427256,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCA", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019938311578893,
"Nucleotide GTR":0.0007962923912188081,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAA", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420641_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "SG", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "PL", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "RGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CYT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420657_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008024411256888909,
"Nucleotide GTR":0.0007967365058962966,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420691_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "VF", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "KTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "PA", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "SCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DY", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "KAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420743_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420745_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020824131072223,
"Nucleotide GTR":0.0007963803434317974,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "I", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATA", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420772_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGY", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008047521095346531,
"Nucleotide GTR":0.0007990310607683105,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "F", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "-", "ILVF", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTT", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTN", "---", "NTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGY", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "YS", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TMT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "AS", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "KCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013982727326023,
"Nucleotide GTR":0.0007957010666672256,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "E", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAG", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "PL", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGW", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CYT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010429979800889,
"Nucleotide GTR":0.0007953483175920731,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016186481723557,
"Nucleotide GTR":0.0007959198754398985,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGT", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010176751616981,
"Nucleotide GTR":0.0007953231747956768,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTT", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016227861261695,
"Nucleotide GTR":0.0007959239839766592,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACC", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008030621463353049,
"Nucleotide GTR":0.0007973531116559869,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "T", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "ACT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017020479125442,
"Nucleotide GTR":0.0007960026822844918,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTC", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015786421244508,
"Nucleotide GTR":0.0007958801537982709,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008019548593379433,
"Nucleotide GTR":0.0007962536964527291,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014722454903772,
"Nucleotide GTR":0.0007957745135465976,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "V", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GTT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022895525663372,
"Nucleotide GTR":0.0007965860103195035,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801353958518659,
"Nucleotide GTR":0.0007956570674866645,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014722454903772,
"Nucleotide GTR":0.0007957745135465976,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "I", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ATT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008131075796310882,
"Nucleotide GTR":0.0008073271311423696,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008024937780351082,
"Nucleotide GTR":0.0007967887839326633,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "C", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "TGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421783_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023529537770313,
"Nucleotide GTR":0.00079664896080579,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421783_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421803_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421803_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421804_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "AV", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GYG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421804_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421842_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCY", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421842_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "SL", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TYG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421844_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020480770261771,
"Nucleotide GTR":0.0007963462514487698,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGT", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421850_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421855_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801701297174653,
"Nucleotide GTR":0.0007960019368836576,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "C", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "TGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421855_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "PS", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "KGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "YCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "TM", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "AYG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "DG", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GRT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421878_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801533096492685,
"Nucleotide GTR":0.0007958349319541378,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTY", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421878_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421879_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025619461716591,
"Nucleotide GTR":0.0007968564674563392,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421879_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "-", "RG", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "SR", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "---", "NGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "MGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421898_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAY", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAY", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010781195379898,
"Nucleotide GTR":0.0007953831894679387,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGT", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421929_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021114270655104,
"Nucleotide GTR":0.0007964091511274761,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "P", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CCA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801228565021842,
"Nucleotide GTR":0.000795532565422504,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "R", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CGA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011137393625144,
"Nucleotide GTR":0.0007954185560682084,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "DY", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "KAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014723687948068,
"Nucleotide GTR":0.0007957746359744444,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTT", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATY", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "PS", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "YCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019727594258214,
"Nucleotide GTR":0.0007962714692874125,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "S", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "AGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008014099373953648,
"Nucleotide GTR":0.000795712648404944,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "H", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAT", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "KQE", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACN", "NAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "TI", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AYT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RM", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AKG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008009923881332751,
"Nucleotide GTR":0.0007952980675348131,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "L", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CTT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "KE", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "RAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCK", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008014983089716037,
"Nucleotide GTR":0.0007958003917403965,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "I", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "ATT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCR", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020452252060414,
"Nucleotide GTR":0.0007963434199024568,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "I", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ATC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001601902312157136,
"Nucleotide GTR":0.00159051425720433,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "S", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "TCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCY", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAY", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014722459302142,
"Nucleotide GTR":0.0007957745139833068,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "I", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ATA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00080223225314176,
"Nucleotide GTR":0.0007965291182412356,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "AGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020452849740411,
"Nucleotide GTR":0.0007963434792455607,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "L", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CTA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RM", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AKG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023112469235028,
"Nucleotide GTR":0.0007966075504497056,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "L", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TTA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017234466478007,
"Nucleotide GTR":0.0007960239288943853,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016152687103434,
"Nucleotide GTR":0.0007959165200027591,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "GV", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GKC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DV", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GWT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008000042823881484,
"Nucleotide GTR":0.0007943169863144894,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "R", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGA", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014970057313374,
"Nucleotide GTR":0.000795799097764972,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "I", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "ATT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801953870828849,
"Nucleotide GTR":0.0007962527149710265,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAC", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603433376704788,
"Nucleotide GTR":0.001592034437288507,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "L", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CTC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AGC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801953870828849,
"Nucleotide GTR":0.0007962527149710265,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "A", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GCC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801953870828849,
"Nucleotide GTR":0.0007962527149710265,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "T", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ACG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008015123243208996,
"Nucleotide GTR":0.0007958143074534255,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "S", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "TCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025133693874417,
"Nucleotide GTR":0.0007968082360084661,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "-"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008015123243150557,
"Nucleotide GTR":0.0007958143074476235,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "C", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "TGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018571106636116,
"Nucleotide GTR":0.0007961566426817412,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008030422880344468,
"Nucleotide GTR":0.0007973333945294193,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATA", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008017432694316801,
"Nucleotide GTR":0.000796043610756468,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008009473826126488,
"Nucleotide GTR":0.0007952533819621252,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080216681223134,
"Nucleotide GTR":0.0007964641425556174,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "S", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AGT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008037046390873535,
"Nucleotide GTR":0.0007979910368743521,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACA", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023336178987105,
"Nucleotide GTR":0.000796629762387814,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801448373221669,
"Nucleotide GTR":0.0007957508109878061,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTG", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014970057313374,
"Nucleotide GTR":0.000795799097764972,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "C", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "TGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021114270655104,
"Nucleotide GTR":0.0007964091511274761,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "T", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "ACT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008014983089716037,
"Nucleotide GTR":0.0007958003917403965,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024098337169489,
"Nucleotide GTR":0.0007967054363815492,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440087355,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921504867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008023281574714094,
"Nucleotide GTR":0.0007966243407791385,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "S", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "TCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001868376091309368,
"Nucleotide GTR":0.0001855093652399787,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "Y", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "TAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422983_USA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001608084983424878,
"Nucleotide GTR":0.00159665297535482,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "T", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "T", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "ACC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "ACA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422983_USA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008013548844312667,
"Nucleotide GTR":0.0007956579868168842,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423044_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020114224793705,
"Nucleotide GTR":0.0007963098574821431,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "I", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "ATT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423044_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018245836390272,
"Nucleotide GTR":0.0007961243468944432,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "R", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CGG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423064_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022895525663372,
"Nucleotide GTR":0.0007965860103195035,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "I", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ATT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423064_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423067_England_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008022905070475612,
"Nucleotide GTR":0.0007965869580152429,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "P", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "CCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423067_England_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423128_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "TM", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "AYG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423128_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423133_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423133_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423152_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "PL", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CYT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423152_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423156_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801353958518659,
"Nucleotide GTR":0.0007956570674866645,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423156_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423172_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008023280591148999,
"Nucleotide GTR":0.0007966242431218543,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "H", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAT", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423172_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTY", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "YAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423192_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAR", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423192_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "GV", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GKA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423204_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012962012864468,
"Nucleotide GTR":0.000795599720855355,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "I", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "ATA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423204_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423207_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000802409638187394,
"Nucleotide GTR":0.0007967052422420283,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "V", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GTC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423207_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423236_England_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423236_England_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423255_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423255_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020480821245344,
"Nucleotide GTR":0.0007963462565108827,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423270_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423288_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "DY", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "KAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423288_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015123243150557,
"Nucleotide GTR":0.0007958143074476235,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGT", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423338_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423357_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011381632146312,
"Nucleotide GTR":0.0007954428062891563,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "L", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CTA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423357_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423376_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "LF", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTK", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423376_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000803287395731093,
"Nucleotide GTR":0.0007975767597353421,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "TPAS", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGT", "-C-", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423382_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "SG", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "RGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423382_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "TR", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "ASA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423454_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423463_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "PL", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CYA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423463_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017281139710122,
"Nucleotide GTR":0.0007960285630372132,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATT", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423478_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802420985543771,
"Nucleotide GTR":0.0007967165089291197,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "R", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "QH", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CGA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CA-", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423478_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423500_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000803114233255707,
"Nucleotide GTR":0.000797404828286198,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "C", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "TGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423500_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423514_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008012961487670825,
"Nucleotide GTR":0.000795599668709354,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATT", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423514_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423524_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023748030552345,
"Nucleotide GTR":0.0007966706547556815,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "Y", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "TAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423524_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "NHDY", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "KTRIQPLEAGVS", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "NAY", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "NNA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423546_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "RI", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AKA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423546_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "GV", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GKC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423551_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "RL", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CKC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423551_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423553_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021250267778447,
"Nucleotide GTR":0.0007964226541583404,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATT", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423553_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423566_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008020541769904191,
"Nucleotide GTR":0.0007963523080478644,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423566_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "SL", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "EDAGV", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TYA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GNN", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423589_England_20200330_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008024831902081214,
"Nucleotide GTR":0.0007967782713754069,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423589_England_20200330_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423623_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440087355,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921504867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAT", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423623_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423628_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020452248736721,
"Nucleotide GTR":0.0007963434195724509,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "S", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "TCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423628_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCS", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423634_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423646_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "AV", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GYT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423646_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423668_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "PL", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "AV", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "HY", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CYY", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GYT", "CCA", "ATY", "AAC", "ACC", "AAY", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "YAC", "CGA", "AGA", "GCY", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423668_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423701_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008040123704959838,
"Nucleotide GTR":0.000798296580595153,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "H", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "CAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423701_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423714_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "TI", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "AYT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423714_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "NY", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "WAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423726_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423760_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCK", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423760_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423765_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGY", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423765_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023689472903589,
"Nucleotide GTR":0.00079666484061992,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "H", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAT", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423783_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423790_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014322886011088,
"Nucleotide GTR":0.0007957348407141335,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCT", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423790_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423805_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440087355,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921504867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "V", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GTA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423805_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008036210716798947,
"Nucleotide GTR":0.0007979080635544485,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "R", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "CGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423807_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423819_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAY", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423819_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423828_England_20200323_null_23":{
"Global MG94xREV":0.000801729202742521,
"Nucleotide GTR":0.000796029644068556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "L", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CTA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423828_England_20200323_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "EV", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "KTRMQPLEAGVSW", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GWA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACN", "NNG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 23, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423833_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423862_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "RC", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "YGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423862_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423867_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "TI", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "AYT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423867_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCR", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423879_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "AS", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "KCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423879_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423890_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "S", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "TCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423890_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423896_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "SI", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AKT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423896_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423921_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021181525678442,
"Nucleotide GTR":0.0007964158288176611,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "N", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "AAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423921_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423945_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423945_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423970_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019443432807823,
"Nucleotide GTR":0.0007962432551550791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "S", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "TCA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423970_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423971_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RS", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGK", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423971_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423977_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "KTRMQPLEAGVSW", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "NNG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 21, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423977_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAY", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423998_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "LF", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTW", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424021_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424049_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021073460903184,
"Nucleotide GTR":0.000796405099164271,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGC", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424049_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424056_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "IV", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "RTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424056_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424058_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "I", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "ATA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424058_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424085_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "TI", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "AYA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424085_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424092_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014723686494556,
"Nucleotide GTR":0.0007957746358301287,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTT", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424092_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424097_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "FL", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTS", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424097_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "GC", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "PA", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "DY", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "KGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "SCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "KAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424122_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424123_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "TI", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "AYT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424123_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "TA", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "RCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424155_England_20200320_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424155_England_20200320_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "S", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "TCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004858665855123206,
"Nucleotide GTR":0.004824125200967491,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "V", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "N", "H", "P", "K", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "AAT", "CAT", "CCA", "AAA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008014970110615498,
"Nucleotide GTR":0.000795799103057292,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "L", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CTT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008019715042214048,
"Nucleotide GTR":0.0007962702230063484,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "N", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "AAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008020640591324429,
"Nucleotide GTR":0.0007963621199369312,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCT", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018561173200093,
"Nucleotide GTR":0.0007961556563999004,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440146838,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921563938,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTT", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011561653498995,
"Nucleotide GTR":0.0007954606804457679,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "V", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GTT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019039556516875,
"Nucleotide GTR":0.0007962031546449549,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTC", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424361_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013848312850578,
"Nucleotide GTR":0.0007956877207760338,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424361_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424366_Kayseri_20200317_null_77":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424366_Kayseri_20200317_null_77",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014970062962761,
"Nucleotide GTR":0.0007957990983258953,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACT", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015781359083054,
"Nucleotide GTR":0.0007958796511808561,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAG", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015132256326329,
"Nucleotide GTR":0.0007958152023576593,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATT", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801953870828849,
"Nucleotide GTR":0.0007962527149710265,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCC", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014723686494556,
"Nucleotide GTR":0.0007957746358301287,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAT", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "R", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AGG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001609037322571272,
"Nucleotide GTR":0.001597598544244094,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "L", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CTC", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424637_Li_ge_20200403_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008021323313665898,
"Nucleotide GTR":0.0007964299068181644,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "K", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AAA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424637_Li_ge_20200403_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017890091205965,
"Nucleotide GTR":0.0007960890252781829,
"amino-acid": [
["M", "S", "N", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "AAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008024879013009226,
"Nucleotide GTR":0.0007967829489766644,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "I", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "ATT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023112469235028,
"Nucleotide GTR":0.0007966075504497056,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "SI", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AKT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019443432807823,
"Nucleotide GTR":0.0007962432551550791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGT", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014722454903772,
"Nucleotide GTR":0.0007957745135465976,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "V", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GTT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018912838970684,
"Nucleotide GTR":0.0007961905729748783,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014109546318954,
"Nucleotide GTR":0.0007957136584098573,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020509257102925,
"Nucleotide GTR":0.0007963490798813558,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "I", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ATA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019626712664363,
"Nucleotide GTR":0.0007962614528455795,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTA", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008027854539949111,
"Nucleotide GTR":0.0007970783863441403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACA", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008021263271317903,
"Nucleotide GTR":0.0007964239452679615,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "F", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TTC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019138373178619,
"Nucleotide GTR":0.0007962129660615528,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACC", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008007072653334548,
"Nucleotide GTR":0.000795014971696368,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010275520205923,
"Nucleotide GTR":0.0007953329814391701,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "F", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "TTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008006161324562448,
"Nucleotide GTR":0.0007949244866902583,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "V", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GTA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425238_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "L", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CTA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425238_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425249_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801729202742521,
"Nucleotide GTR":0.000796029644068556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "S", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "TCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425249_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425263_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000803619339606928,
"Nucleotide GTR":0.0007979063437949319,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "T", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "ACA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425263_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425264_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008020543520845014,
"Nucleotide GTR":0.0007963524818971895,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "I", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "ATT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425264_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425276_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025514791834797,
"Nucleotide GTR":0.0007968460748788366,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "S", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "TCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425276_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425296_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014723686494556,
"Nucleotide GTR":0.0007957746358301287,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGT", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425296_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425319_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017281141236751,
"Nucleotide GTR":0.0007960285631887895,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCT", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425319_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425323_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802149802882195,
"Nucleotide GTR":0.0007964472541273323,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425323_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425333_England_20200329_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0008014970057313374,
"Nucleotide GTR":0.000795799097764972,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "S", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "TCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425333_England_20200329_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425377_England_20200318_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425377_England_20200318_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425397_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "I", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "ATA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425397_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425428_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008027728114988332,
"Nucleotide GTR":0.0007970658337246041,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "Y", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "TAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425428_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425430_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "V", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425430_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008015624059339913,
"Nucleotide GTR":0.0007958640330322203,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "Y", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "TAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425441_England_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425441_England_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425451_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008019039502767948,
"Nucleotide GTR":0.0007962031493082714,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGC", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425451_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425452_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012389776170871,
"Nucleotide GTR":0.0007955429039937548,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "V", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GTA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425452_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425457_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801426234740939,
"Nucleotide GTR":0.0007957288298913522,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAC", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425457_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425512_England_20200319_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425512_England_20200319_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008016935866852107,
"Nucleotide GTR":0.0007959942812087194,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "I", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "ATT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425549_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425592_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014970057313374,
"Nucleotide GTR":0.000795799097764972,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "Y", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "TAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425592_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019193994742716,
"Nucleotide GTR":0.0007962184886761365,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAA", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425611_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425619_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023130693034721,
"Nucleotide GTR":0.0007966093598742252,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "K", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "AAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425619_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425627_England_20200329_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425627_England_20200329_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425628_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024729186102941,
"Nucleotide GTR":0.0007967680727992119,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "T", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "ACC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425628_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008044506746241799,
"Nucleotide GTR":0.000798731768783345,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "E", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "GAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "C", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "TPAS", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "TGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "-CT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008032234748406535,
"Nucleotide GTR":0.0007975132932637557,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "T", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "ACT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425711_Scotland_20200317_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425711_Scotland_20200317_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008025575882871686,
"Nucleotide GTR":0.0007968521405524086,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019733602967032,
"Nucleotide GTR":0.0007962720658866556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAT", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_29":{
"Global MG94xREV":0.0008017282440146838,
"Nucleotide GTR":0.0007960286921563938,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0008036340186233748,
"Nucleotide GTR":0.0007979209184570468,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008006094708478137,
"Nucleotide GTR":0.0007949178724397472,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "V", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GTT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026237351202764,
"Nucleotide GTR":0.0007969178171422522,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001605102620791122,
"Nucleotide GTR":0.001593691814581695,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "V", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "L", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GTA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "CTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425825_Scotland_20200313_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0008029774263765386,
"Nucleotide GTR":0.0007972689939783578,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "T", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ACC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425825_Scotland_20200313_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425886_Scotland_20200321_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425886_Scotland_20200321_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019667008706054,
"Nucleotide GTR":0.000796265453802963,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "T"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "ACC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020452301172381,
"Nucleotide GTR":0.0007963434247787397,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "W", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "TGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008031826477178593,
"Nucleotide GTR":0.000797472756384327,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "H", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CAT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019843510924424,
"Nucleotide GTR":0.0007962829785479255,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCA", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008023582736635654,
"Nucleotide GTR":0.0007966542428728144,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019698511907907,
"Nucleotide GTR":0.0007962685817272637,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "K", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "AAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017476017975364,
"Nucleotide GTR":0.00079604791232318,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTT", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008031459802983454,
"Nucleotide GTR":0.0007974363496365077,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "R", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "CGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425983_Scotland_20200329_null_43":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425983_Scotland_20200329_null_43",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015371305568486,
"Nucleotide GTR":0.0007958389373398067,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "S", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "TCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425996_Scotland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025229274111707,
"Nucleotide GTR":0.0007968177260834205,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "F", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "TTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425996_Scotland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015371305568486,
"Nucleotide GTR":0.0007958389373398067,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "F", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014970057313374,
"Nucleotide GTR":0.000795799097764972,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTT", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018983486835571,
"Nucleotide GTR":0.0007961975875372205,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "Y", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "TAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008014722459302142,
"Nucleotide GTR":0.0007957745139833068,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "V", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GTT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001869225996488227,
"Nucleotide GTR":0.0001855937515533009,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "C", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "TGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008025207050330862,
"Nucleotide GTR":0.0007968155195044054,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "Y", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TAT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017282388784614,
"Nucleotide GTR":0.0007960286870566854,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "L", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TTA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426083_Washington_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426083_Washington_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00240626652984151,
"Nucleotide GTR":0.002389160183677348,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "N", "V", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AAT", "GTT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCT", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080129330161911,
"Nucleotide GTR":0.0007955968418019907,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "Y", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "TAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000801729202742521,
"Nucleotide GTR":0.000796029644068556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "L", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CTT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426286_Latvia_20200330_null_1456":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426286_Latvia_20200330_null_1456",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000801729202742521,
"Nucleotide GTR":0.000796029644068556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "Y", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "TAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426302_New_York_20200321_null_50":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426302_New_York_20200321_null_50",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426323_New_York_20200316_null_5868":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426323_New_York_20200316_null_5868",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "GC", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "KGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_85":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_85",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426379_Slovenia_20200329_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426379_Slovenia_20200329_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":11288.50174936028,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03562160059302235],
[0.02372998705023723],
[0.01705822516904434],
[0.03332262226083767],
[0.02771652944669907],
[0.0184638779251408],
[0.01327269949511626],
[0.02592773558060308],
[0.022768901382076],
[0.01516792412328121],
[0.0109034136636549],
[0.0212994219074424],
[0.01615523688907846],
[0.01076210938838164],
[0.007736307856057798],
[0.01511259593693166],
[0.02730605725796978],
[0.01819043429653146],
[0.01307613541870173],
[0.02554375480865863],
[0.02124635410717675],
[0.01415365113960707],
[0.0101743067786927],
[0.01987513813380216],
[0.01745370546212402],
[0.01162710820681055],
[0.008358109485552163],
[0.01632726279796096],
[0.01238394165801895],
[0.008249791426644854],
[0.005930336137792063],
[0.0115846958895848],
[0.0333793097428462],
[0.02223624359256766],
[0.01598445246989491],
[0.03122504635870406],
[0.02597184309509406],
[0.01730162289333231],
[0.01243721618893191],
[0.02429564933825829],
[0.021335655868465],
[0.01421314115700255],
[0.01021707098711363],
[0.0199586764591187],
[0.01513830504840467],
[0.01008466146329065],
[0.007249326585396359],
[0.01416129574189133],
[0.0146904860100353],
[0.02062898370337008],
[0.01715842858327197],
[0.01143040406115894],
[0.008216709340617141],
[0.01605104275920523],
[0.00938998309028205],
[0.006749959262449272],
[0.01318579984433637],
[0.0100011972617339],
[0.00666248224551431],
[0.00478930401808235],
[0.009355731156397387]
],
"Log Likelihood":-5074.597913135975,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.052054684251785, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":568
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":12180.46418937025,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3169391963335566],
[0.2504798097420502],
[0.2220601134883911],
[0.2105208804360021]
],
"Log Likelihood":-5147.722864843161,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2052729397424624,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3774128333223715,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3130365391716852,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.601040259996739,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.337313833035294
},
"display order":0,
"estimated parameters":941
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-16/sequences.N.compressed.fas",
"number of sequences":468,
"number of sites":419,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_425886_Scotland_20200321_null_10,epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2,epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1)Node666,(epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2,epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3)Node662,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1,epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1,epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2,epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1,epi_isl_423634_England_20200321_null_1,epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2,epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1,epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1,epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1,epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1,epi_isl_423469_England_20200331_null_2,epi_isl_423338_England_20200327_null_1,epi_isl_423807_England_20200324_null_1,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,(epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node634,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1,(epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1)Node643,epi_isl_418060_USA_20200314_null_1,epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1,epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4,epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1,(epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1)Node654,epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6,epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3,epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_423921_England_20200319_null_1,epi_isl_413607_USA_20200218_null_1,epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1,epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2,epi_isl_423805_England_20200324_null_2,epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2,epi_isl_425296_England_20200320_null_1,(epi_isl_425457_England_20200401_null_1,epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2)Node723,epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1,epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1,epi_isl_425333_England_20200329_null_23,(epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1,epi_isl_418898_Connecticut_20200314_null_1)Node740,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3,epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1,epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3,epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1,(epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1,epi_isl_421878_England_20200327_null_1)Node754,(epi_isl_423357_England_20200329_null_2,epi_isl_425238_England_20200330_null_1)Node750,epi_isl_423156_England_20200324_null_2,epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2,epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2,epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4,epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_10,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6)Node773,epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2,epi_isl_423623_England_20200323_null_1,epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5,epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10,epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1,epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3,(epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_421906_England_20200327_null_1)Node794,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,(epi_isl_423879_England_20200319_null_1,epi_isl_423890_England_20200318_null_2)Node614,epi_isl_420772_England_20200330_null_1,epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_423204_England_20200326_null_1,epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2,epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1,epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1,epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_424049_England_20200313_null_1,epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1,epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3,epi_isl_425592_England_20200325_null_2,epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1,epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1,epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2,epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1,epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2,(epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4)Node816,epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_425249_England_20200331_null_1,epi_isl_425439_England_20200101_null_5,epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2,epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1,epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1,epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3,epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1,epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1,epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1,(epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1)Node852,epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4,epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_417281_England_20200306_null_1,epi_isl_424092_England_20200311_null_1,epi_isl_418909_Washington_20200316_null_3,epi_isl_423044_England_20200325_null_1,epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4,epi_isl_425628_England_20200330_null_1,(epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1,epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21)Node874,epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1,epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_29,epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1,epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_425451_England_20200401_null_3,epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_423970_England_20200320_null_1,(epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_2)Node896,epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1,(epi_isl_423546_England_20200331_null_1,epi_isl_425397_England_20200317_null_2)Node14,epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1,epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_423514_England_20200329_null_3,epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1,epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4,epi_isl_425319_England_20200328_null_1,epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1,epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2,(epi_isl_424185_USA_20200318_null_1,epi_isl_425430_England_20200330_null_1)Node40,epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,(epi_isl_414617_USA_20200308_null_1,epi_isl_423875_England_20200318_null_1)Node47,epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8,epi_isl_421855_England_20200327_null_1,epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1,(epi_isl_420745_England_20200328_null_1,epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1)Node550,(epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_423255_England_20200325_null_2)Node540,(((epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node536,epi_isl_425377_England_20200318_null_25,epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4,epi_isl_421929_England_20200329_null_1,epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_418669_England_20200311_null_1)Node526,epi_isl_421872_England_20200327_null_1)Node525,(epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1,epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1)Node522,((epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1,epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1,epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207,epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1,epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1,(epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1)Node506,epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1)Node497,epi_isl_423945_England_20200319_null_5)Node496,(epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2)Node519,epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_424021_England_20200320_null_1,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_423977_England_20200320_null_1,epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4,(epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1)Node485,(epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1,epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3)Node565,epi_isl_421842_England_20200323_null_1,(epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4)Node558,(epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1,epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6)Node561,epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3,(epi_isl_423288_England_20200326_null_1,epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4)Node569,epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1,(epi_isl_423867_England_20200318_null_1,epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1,epi_isl_425711_Scotland_20200317_null_28)Node477,(epi_isl_423760_England_20200322_null_1,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8)Node575,epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1,(epi_isl_423862_England_20200318_null_1,epi_isl_426083_Washington_20200325_null_9)Node474,(epi_isl_421844_England_20200324_null_1,epi_isl_425441_England_20200331_null_5)Node581,epi_isl_424637_Li_ge_20200403_null_10,(epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3,epi_isl_425512_England_20200319_null_12)Node586,epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4,epi_isl_423192_England_20200325_null_1,(epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1,epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_426302_New_York_20200321_null_50)Node467,epi_isl_425549_England_20200322_null_4,epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1,(epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1,epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1)Node593,epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_418754_England_20200317_null_2,epi_isl_423765_England_20200323_null_1,(epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12,epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2)Node461,(epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3,epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1)Node455,(epi_isl_420648_England_20200323_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_7)Node458,(epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2,epi_isl_420743_England_20200327_null_1)Node601,(epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2,epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1)Node605,epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2,epi_isl_423726_England_20200322_null_1,epi_isl_422983_USA_20200317_null_1,((epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6)Node441,epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1)Node440,(epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2,epi_isl_418897_Washington_20200316_null_4)Node446,epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1,epi_isl_417257_England_20200303_null_1,epi_isl_423382_England_20200329_null_1,(epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1)Node431,epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_423551_England_20200331_null_1,epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_417259_England_20200304_null_1,epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_423998_England_20200321_null_1,epi_isl_423203_England_20200324_null_2,epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1,epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1,epi_isl_423463_England_20200330_null_1,(epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1)Node414,(epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_424122_England_20200312_null_1)Node417,epi_isl_423646_England_20200321_null_1,epi_isl_423152_England_20200324_null_1,((epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,epi_isl_418916_Illinois_20200313_null_47,epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2)Node402,epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1)Node401,(epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_426379_Slovenia_20200329_null_32)Node398,epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_423236_England_20200324_null_6,epi_isl_423376_England_20200328_null_2)Node381,(((epi_isl_420461_England_20200310_null_1,epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_13)Node376,epi_isl_420641_England_20200325_null_1)Node375,epi_isl_420657_England_20200325_null_1)Node374,(epi_isl_424155_England_20200320_null_16,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,((epi_isl_423566_England_20200401_null_2,epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1,epi_isl_425276_England_20200331_null_1,epi_isl_421783_England_20200325_null_1,epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1,epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2,epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23,epi_isl_421879_England_20200327_null_1,epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1,epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1,epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_425264_England_20200331_null_3,(epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1,epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2)Node329,epi_isl_420691_England_20200328_null_2,(epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_425619_England_20200329_null_1)Node325,epi_isl_423714_England_20200323_null_1,epi_isl_423172_England_20200324_null_2,epi_isl_423783_England_20200324_null_1,epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1,epi_isl_423524_England_20200328_null_1,epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5,epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_3,epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1,epi_isl_423270_England_20200326_null_1,epi_isl_425323_England_20200329_null_1,epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_423589_England_20200330_null_8,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,(epi_isl_421803_England_20200326_null_1,epi_isl_421804_England_20200325_null_1)Node308,epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2,epi_isl_424097_England_20200321_null_1,epi_isl_423454_England_20200331_null_1,(epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2,epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1)Node299,epi_isl_426286_Latvia_20200330_null_1456,(epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_425983_Scotland_20200329_null_43)Node295,epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_423064_England_20200324_null_2,epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1,epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1,epi_isl_423548_England_20200331_null_1,epi_isl_417297_England_20200306_null_2,epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_425428_England_20200331_null_1,epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4,epi_isl_423500_England_20200331_null_2,epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2,epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1,epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1,(epi_isl_424056_England_20200312_null_1,epi_isl_424058_England_20200312_null_1)Node280,epi_isl_423207_England_20200324_null_3,epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1,epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1,epi_isl_421850_England_20200327_null_1,epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1,epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_425996_Scotland_20200330_null_1,epi_isl_425825_Scotland_20200313_null_11,epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1,epi_isl_423478_England_20200330_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423833_England_20200323_null_1,epi_isl_423628_England_20200322_null_1,epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3,epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1,epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1,epi_isl_423553_England_20200326_null_1)Node190,epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1)Node189,epi_isl_423896_England_20200318_null_1,epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4)Node185,((epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2,epi_isl_424142_England_20200321_null_2)Node355,epi_isl_424138_England_20200320_null_2)Node354,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1,((epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5,epi_isl_420524_England_20200326_null_8,epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_85,epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1)Node362,epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1)Node361,epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1,(epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_423819_England_20200323_null_1,epi_isl_425452_England_20200331_null_1,epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6)Node390,(epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_425627_England_20200329_null_11)Node386,epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2,epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1,epi_isl_414485_USA_20200224_null_1,epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1,epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1,(epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1)Node162,epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_424123_England_20200312_null_1,(epi_isl_421898_England_20200320_null_1,epi_isl_423133_England_20200323_null_1)Node146,epi_isl_424085_England_20200313_null_1,epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1,epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_423668_England_20200320_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,epi_isl_423971_England_20200320_null_1,(epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1)Node167,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1,epi_isl_426323_New_York_20200316_null_5868,epi_isl_423128_England_20200323_null_1,epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1,(epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1)Node124,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4,epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3,((epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10,epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1)Node115,epi_isl_423569_England_20200331_null_1)Node114,epi_isl_415137_England_20200302_null_1,((epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node107,epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2,epi_isl_424366_Kayseri_20200317_null_77,epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2,epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1,epi_isl_421670_India_20200312_null_2,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2,epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1,epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_423067_England_20200324_null_6)Node87,(epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_424361_India_20200310_null_1)Node110,epi_isl_423828_England_20200323_null_23,epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_425263_England_20200401_null_3,epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1,epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_425611_England_20200329_null_2,(epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1,epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1)Node913,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_418881_Washington_20200314_null_3,epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6,epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_423790_England_20200312_null_1,epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1,(epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_425505_England_20200318_null_6)Node929,epi_isl_423701_England_20200323_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node107":"test",
"Node110":"test",
"Node114":"test",
"Node115":"test",
"Node124":"test",
"Node14":"test",
"Node146":"test",
"Node162":"test",
"Node167":"test",
"Node185":"test",
"Node189":"test",
"Node190":"test",
"Node280":"test",
"Node295":"test",
"Node299":"test",
"Node308":"test",
"Node325":"test",
"Node329":"test",
"Node354":"test",
"Node355":"test",
"Node361":"test",
"Node362":"test",
"Node374":"test",
"Node375":"test",
"Node376":"test",
"Node381":"test",
"Node386":"test",
"Node390":"test",
"Node398":"test",
"Node40":"test",
"Node401":"test",
"Node402":"test",
"Node414":"test",
"Node417":"test",
"Node431":"test",
"Node440":"test",
"Node441":"test",
"Node446":"test",
"Node455":"test",
"Node458":"test",
"Node461":"test",
"Node467":"test",
"Node47":"test",
"Node474":"test",
"Node477":"test",
"Node485":"test",
"Node496":"test",
"Node497":"test",
"Node506":"test",
"Node519":"test",
"Node522":"test",
"Node525":"test",
"Node526":"test",
"Node536":"test",
"Node540":"test",
"Node550":"test",
"Node558":"test",
"Node561":"test",
"Node565":"test",
"Node569":"test",
"Node575":"test",
"Node581":"test",
"Node586":"test",
"Node593":"test",
"Node601":"test",
"Node605":"test",
"Node614":"test",
"Node634":"test",
"Node643":"test",
"Node654":"test",
"Node662":"test",
"Node666":"test",
"Node723":"test",
"Node740":"test",
"Node750":"test",
"Node754":"test",
"Node773":"test",
"Node794":"test",
"Node816":"test",
"Node852":"test",
"Node87":"test",
"Node874":"test",
"Node896":"test",
"Node913":"test",
"Node929":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":"test",
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":"test",
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":"test",
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":"test",
"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418881_Washington_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_418897_Washington_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_418898_Connecticut_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418909_Washington_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_418916_Illinois_20200313_null_47":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_420524_England_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12":"test",
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421783_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421803_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421804_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421842_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421855_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421878_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421879_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207":"test",
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8":"test",
"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422983_USA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_423044_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423064_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423067_England_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_423128_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423133_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423152_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423156_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423172_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423192_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423204_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423207_England_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_423236_England_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423255_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423288_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423357_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423376_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423382_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423463_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423478_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423500_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423514_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423524_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423546_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423551_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423553_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423566_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423589_England_20200330_null_8":"test",
"epi_isl_423623_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423628_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423646_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423668_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423701_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423714_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423760_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423765_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423790_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_423805_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423819_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423828_England_20200323_null_23":"test",
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423862_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423867_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423879_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423890_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423896_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423921_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423945_England_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423970_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423971_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423977_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424049_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424056_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424058_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424085_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424092_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424097_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424123_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424155_England_20200320_null_16":"test",
"epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424361_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_424366_Kayseri_20200317_null_77":"test",
"epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424637_Li_ge_20200403_null_10":"test",
"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3":"test",
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21":"test",
"epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_425238_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425249_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425263_England_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_425264_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_425276_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425296_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425319_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425323_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425333_England_20200329_null_23":"test",
"epi_isl_425377_England_20200318_null_25":"test",
"epi_isl_425397_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425428_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425430_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_5":"test",
"epi_isl_425441_England_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_425451_England_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_425452_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425457_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_425512_England_20200319_null_12":"test",
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_425592_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_425619_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425627_England_20200329_null_11":"test",
"epi_isl_425628_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425711_Scotland_20200317_null_28":"test",
"epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425755_Scotland_20200319_null_29":"test",
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23":"test",
"epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_425825_Scotland_20200313_null_11":"test",
"epi_isl_425886_Scotland_20200321_null_10":"test",
"epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_425940_Scotland_20200326_null_13":"test",
"epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425983_Scotland_20200329_null_43":"test",
"epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_425996_Scotland_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426083_Washington_20200325_null_9":"test",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8":"test",
"epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_426286_Latvia_20200330_null_1456":"test",
"epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_426302_New_York_20200321_null_50":"test",
"epi_isl_426323_New_York_20200316_null_5868":"test",
"epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_426362_Mexico_City_20200310_null_85":"test",
"epi_isl_426379_Slovenia_20200329_null_32":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":16
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":11
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":28
}
}
}