{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714374466538532],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714374440325836],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714357226379163],
[159.4817170654943, 411.5130510172288, 0, 1, 0.2793050409218274, 0, 0.002430056586366037, 0.02527308729886878, 0.7206949590781726, 1, 0.001715005800576284],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001712942160200589],
[159.9645300108302, 411.0302380718929, 1, 0, 0.2801506054914593, 0.006251385853678288, 0, -0.06501569605635782, 1, 0.2801506054914593, 0.001717085845796316],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.00171500578083249],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714111378868947],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001721667666079048],
[159.6323587008597, 411.2437884494612, 1, 0, 0.2796269549843811, 0.006264394062321242, 0, -0.06515098409634824, 1, 0.2796269549843811, 0.00171495424668676],
[159.6356737901044, 411.3590942926187, 1, 0, 0.2795746698802976, 0.00626426397219234, 0, -0.06514963113230497, 1, 0.2795746698802976, 0.00171347226883733],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001712993996856693],
[159.6356737901044, 411.3590942926187, 1, 0, 0.2795746698802976, 0.00626426397219234, 0, -0.06514963113230497, 1, 0.2795746698802976, 0.001714076805199166],
[159.8291100720522, 411.7053722533183, 1, 1, 0.2796491113217953, 0.006256682525161984, 0.002428921426326955, -0.03980950112554284, 0.9217963745369302, 0.4810945971805206, 0.003455970233360677],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.00171355034288452],
[159.3619753477344, 411.5802698881168, 0, 1, 0.2791210086090291, 0, 0.002429659711996977, 0.02526895972396694, 0.720878991390971, 1, 0.001714357226352647],
[159.4338795531575, 411.5608885295657, 1, 0, 0.2792212616737311, 0.00627219260299431, 0, -0.06523209052009986, 1, 0.2792212616737311, 0.001712993996883638],
[159.8619753477344, 411.6199841307642, 0, 1, 0.279732321723008, 0, 0.002429425291660081, 0.02526652170434541, 0.720267678276992, 1, 0.001714065804516149],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714322545838941],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.00171299398908089],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714357226352647],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714305744246575],
[159.5921182264107, 411.8340607401341, 0, 1, 0.2792873762189925, 0, 0.002428162445337411, 0.02525338784337403, 0.7207126237810075, 1, 0.001714078264468556],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714357226379163],
[159.5331191270085, 411.3930598395363, 0, 1, 0.2794286284363164, 0, 0.002430765361938895, 0.02528045871031189, 0.7205713715636837, 1, 0.001714357226379163],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714065798163115],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001712959317064118],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170966, 0.02525359112405504, 0.7212513470722821, 1, 0.001714374466538532],
[159.4305644639127, 411.5642036188104, 1, 0, 0.2792154558600354, 0.006272323022643197, 0, -0.06523344691121861, 1, 0.2792154558600354, 0.00171437447423032],
[159.7310720429092, 411.161141376718, 0, 1, 0.2797919962616496, 0, 0.002432136453001453, 0.02529471833879673, 0.7202080037383504, 1, 0.001714357246128842],
[159.4338795531575, 411.5608885295657, 1, 0, 0.2792212616737311, 0.00627219260299431, 0, -0.06523209052009986, 1, 0.2792212616737311, 0.001712976283899741],
[159.4022158221834, 411.5925522605398, 0, 1, 0.2791658080465808, 0, 0.002429587208290873, 0.02526820567054113, 0.7208341919534192, 1, 0.00171292450978814],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714111902368134],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170966, 0.02525359112405504, 0.7212513470722821, 1, 0.001714176110427537],
[159.1492903909804, 411.7243657286925, 0, 6, 0.2787819838679291, 0, 0.01457285625877611, 0.1515606963592073, 0.1407341199043073, 1, 0.01039394000698845],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170966, 0.02525359112405504, 0.7212513470722821, 1, 0.001715005773121813],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714339488514573],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714356698988447],
[159.5921182264107, 411.5074193374177, 0, 1, 0.2794471151337152, 0, 0.002430089842876064, 0.02527343317339939, 0.7205528848662848, 1, 0.001714527651407597],
[159.6323587008597, 411.3624093818635, 1, 0, 0.2795688640666018, 0.006264394062321242, 0, -0.06515098409634824, 1, 0.2795688640666019, 0.00171482456840123],
[159.6640224318337, 411.3307456508894, 0, 1, 0.2796243176937522, 0, 0.002431133608594225, 0.02528428855111473, 0.7203756823062478, 1, 0.00171500623386676],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170965, 0.02525359112405503, 0.7212513470722821, 1, 0.001714357226352647],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714305339789548],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001717780491358808],
[159.8619753477344, 411.6199841307642, 0, 1, 0.279732321723008, 0, 0.002429425291660081, 0.02526652170434541, 0.720267678276992, 1, 0.001722021527504111],
[159.2996611590875, 411.5239631443615, 1, 0, 0.2790698464056632, 0.006277477257163351, 0, -0.06528705200820177, 1, 0.2790698464056632, 0.001714272356336882],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714357234072162],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714357226352647],
[159.3619753477344, 411.6327927349887, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001717084757366458],
[159.5845211885228, 411.4102468942004, 0, 1, 0.2794850848185055, 0, 0.002430663814402181, 0.02527940259508611, 0.7205149151814945, 1, 0.001712959820694499]
],
"NAMES": [
["epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2"],
["epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5"],
["epi_isl_422374_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_412978_Hubei_20200117_null_1"],
["epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_12"],
["epi_isl_422526_New_York_20200322_null_2"],
["epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1"],
["epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1"],
["epi_isl_422133_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_1"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_418836_British_Columbia_20200310_null_3"],
["epi_isl_414008_England_20200227_null_1"],
["epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_417349_Washington_20200312_null_2"],
["epi_isl_417707_Reykjavik_20200305_null_1"],
["epi_isl_422115_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_422918_Zuid_Holland_20200319_null_6"],
["epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1"],
["epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1"],
["epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1"],
["epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_5988"],
["epi_isl_421980_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_420498_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_420701_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_3"],
["epi_isl_420805_Utah_20200314_null_3"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1"],
["epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_413880_Guangdong_20200205_null_7"],
["epi_isl_421789_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_418697_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714374466538532],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714374440325836],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714357226379163],
[159.4817170654943, 411.5130510172288, 0, 1, 0.2793050409218274, 0, 0.002430056586366037, 0.02527308729886878, 0.7206949590781726, 1, 0.001715005800576284],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001712942160200589],
[159.9645300108302, 411.0302380718929, 1, 0, 0.2801506054914593, 0.006251385853678288, 0, -0.06501569605635782, 1, 0.2801506054914593, 0.001717085845796316],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.00171500578083249],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714111378868947],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001721667666079048],
[159.6323587008597, 411.2437884494612, 1, 0, 0.2796269549843811, 0.006264394062321242, 0, -0.06515098409634824, 1, 0.2796269549843811, 0.00171495424668676],
[159.6356737901044, 411.3590942926187, 1, 0, 0.2795746698802976, 0.00626426397219234, 0, -0.06514963113230497, 1, 0.2795746698802976, 0.00171347226883733],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001712993996856693],
[159.6356737901044, 411.3590942926187, 1, 0, 0.2795746698802976, 0.00626426397219234, 0, -0.06514963113230497, 1, 0.2795746698802976, 0.001714076805199166],
[159.8291100720522, 411.7053722533183, 1, 1, 0.2796491113217953, 0.006256682525161984, 0.002428921426326955, -0.03980950112554284, 0.9217963745369302, 0.4810945971805206, 0.003455970233360677],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.00171355034288452],
[159.3619753477344, 411.5802698881168, 0, 1, 0.2791210086090291, 0, 0.002429659711996977, 0.02526895972396694, 0.720878991390971, 1, 0.001714357226352647],
[159.4338795531575, 411.5608885295657, 1, 0, 0.2792212616737311, 0.00627219260299431, 0, -0.06523209052009986, 1, 0.2792212616737311, 0.001712993996883638],
[159.8619753477344, 411.6199841307642, 0, 1, 0.279732321723008, 0, 0.002429425291660081, 0.02526652170434541, 0.720267678276992, 1, 0.001714065804516149],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714322545838941],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.00171299398908089],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714357226352647],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714305744246575],
[159.5921182264107, 411.8340607401341, 0, 1, 0.2792873762189925, 0, 0.002428162445337411, 0.02525338784337403, 0.7207126237810075, 1, 0.001714078264468556],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714357226379163],
[159.5331191270085, 411.3930598395363, 0, 1, 0.2794286284363164, 0, 0.002430765361938895, 0.02528045871031189, 0.7205713715636837, 1, 0.001714357226379163],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714065798163115],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001712959317064118],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170966, 0.02525359112405504, 0.7212513470722821, 1, 0.001714374466538532],
[159.4305644639127, 411.5642036188104, 1, 0, 0.2792154558600354, 0.006272323022643197, 0, -0.06523344691121861, 1, 0.2792154558600354, 0.00171437447423032],
[159.7310720429092, 411.161141376718, 0, 1, 0.2797919962616496, 0, 0.002432136453001453, 0.02529471833879673, 0.7202080037383504, 1, 0.001714357246128842],
[159.4338795531575, 411.5608885295657, 1, 0, 0.2792212616737311, 0.00627219260299431, 0, -0.06523209052009986, 1, 0.2792212616737311, 0.001712976283899741],
[159.4022158221834, 411.5925522605398, 0, 1, 0.2791658080465808, 0, 0.002429587208290873, 0.02526820567054113, 0.7208341919534192, 1, 0.00171292450978814],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714111902368134],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170966, 0.02525359112405504, 0.7212513470722821, 1, 0.001714176110427537],
[159.1492903909804, 411.7243657286925, 0, 6, 0.2787819838679291, 0, 0.01457285625877611, 0.1515606963592073, 0.1407341199043073, 1, 0.01039394000698845],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170966, 0.02525359112405504, 0.7212513470722821, 1, 0.001715005773121813],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001714339488514573],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714356698988447],
[159.5921182264107, 411.5074193374177, 0, 1, 0.2794471151337152, 0, 0.002430089842876064, 0.02527343317339939, 0.7205528848662848, 1, 0.001714527651407597],
[159.6323587008597, 411.3624093818635, 1, 0, 0.2795688640666018, 0.006264394062321242, 0, -0.06515098409634824, 1, 0.2795688640666019, 0.00171482456840123],
[159.6640224318337, 411.3307456508894, 0, 1, 0.2796243176937522, 0, 0.002431133608594225, 0.02528428855111473, 0.7203756823062478, 1, 0.00171500623386676],
[159.1640224318337, 411.8307456508894, 0, 1, 0.2787486529277178, 0, 0.002428181991170965, 0.02525359112405503, 0.7212513470722821, 1, 0.001714357226352647],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 1, 0, 0.2793950628701665, 0.006268290907067852, 0, -0.06519151208159095, 1, 0.2793950628701665, 0.001714305339789548],
[159.5331191270085, 411.4616489557146, 0, 1, 0.2793950628701665, 0, 0.00243036016245497, 0.02527624455250661, 0.7206049371298335, 1, 0.001717780491358808],
[159.8619753477344, 411.6199841307642, 0, 1, 0.279732321723008, 0, 0.002429425291660081, 0.02526652170434541, 0.720267678276992, 1, 0.001722021527504111],
[159.2996611590875, 411.5239631443615, 1, 0, 0.2790698464056632, 0.006277477257163351, 0, -0.06528705200820177, 1, 0.2790698464056632, 0.001714272356336882],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714357234072162],
[159.3619753477344, 411.6327927349888, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001714357226352647],
[159.3619753477344, 411.6327927349887, 0, 1, 0.2790953337152938, 0, 0.002429349696256598, 0.02526573549663224, 0.7209046662847062, 1, 0.001717084757366458],
[159.5845211885228, 411.4102468942004, 0, 1, 0.2794850848185055, 0, 0.002430663814402181, 0.02527940259508611, 0.7205149151814945, 1, 0.001712959820694499]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.2594745978405916, 2.740525402159407, 0, 1, 0.08649153261353056, 0, 0.3648935343609828, 3.794967656489294, 0.9135084673864694, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[1, 1.862821767643405, 0, 0, 0.3493057134406142, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.114289348851607, 0, 0, 0.2033585200774292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6595400130625179, 2.340459986937482, 1, 1, 0.2198466710208393, 1.51620823633821, 0.4272664371880638, -11.32521823060272, 0.9516674412410548, 0.3913607832827335, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -5.200102631491133, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.09615194841964583],
[0.9969485633981811, 2.003051436601819, 0, 1, 0.3323161877993936, 0, 0.4992383029846213, 5.192180826182994, 0.6676838122006064, 1, 0.09615194841964583],
[1, 1.998777078895395, 1, 1, 0.3334692688688789, 1, 0.5003059173325323, -5.196921028439293, 0.8887982467200553, 0.5557367844578132, 0.09615194841964583],
[1, 1.862821767643405, 0, 0, 0.3493057134406142, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969355513240264, 2.003064448675973, 0, 1, 0.3323118504413421, 0, 0.499235059890859, 5.192147097342178, 0.6676881495586579, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.114289348851607, 0, 0, 0.2033585200774292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969490821200847, 2.003050917879915, 0, 1, 0.3323163607066949, 0, 0.4992384322703228, 5.192182170780828, 0.6676836392933051, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485633981338, 2.003051436601866, 0, 1, 0.332316187799378, 0, 0.4992383029846097, 5.192180826182873, 0.667683812200622, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485633844408, 2.003051436615559, 0, 1, 0.3323161877948136, 0, 0.4992383029811967, 5.192180826147378, 0.6676838122051865, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485633981811, 2.002114971729672, 1, 1, 0.3324199543360725, 1.003060776366855, 0.4994718156151031, -5.237428559990137, 0.8894969739592036, 0.5543368826313484, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5425361724282599, 2.249793056025381, 1, 1, 0.1942952023349733, 1.843195073103132, 0.4444853260266791, -14.54686847292912, 0.9622493743496117, 0.3508397790195584, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7364254070770618, 2.054035630712416, 1, 0, 0.2639081489059015, 1.357910781445047, 0, -14.12255085584514, 1, 0.2639081489059014, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 10.40020526298227, 0.4444444444444445, 1, 0.09615194841964583],
[0.790461037789478, 2, 0, 0, 0.283272558578943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9814995098530814, 2.01282281716831, 0, 1, 0.3277868588147056, 0, 0.4968147178532213, 5.166975043344122, 0.6722131411852944, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.114289348851607, 0, 0, 0.2033585200774292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5919818900872685, 2.408018109912731, 0, 0, 0.1973272966957562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 1.992585577615358, 0, 1, 0.3341591991487341, 0, 0.5018605028732355, 5.219452243265151, 0.665840800851266, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6347213870089946, 2.365278612991005, 0, 2, 0.2115737956696649, 0, 0.8455663485118595, 8.794063587993739, 0.6216158796747394, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934191288164627, 2.006580871183538, 0, 1, 0.3311397096054875, 0, 0.498360177933009, 5.183048145399659, 0.6688602903945124, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.007704155084822, 1.992295844915178, 1, 0, 0.3359013850282739, 0.9923547451442501, 0, -10.32069304319466, 1, 0.3359013850282739, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485327118494, 2.003051467288151, 0, 1, 0.3323161775706164, 0, 0.4992382953363945, 5.192180746639865, 0.6676838224293835, 1, 0.09615194841964583],
[0.790461037789478, 2, 0, 0, 0.283272558578943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8981116115720873, 2.101888388427913, 0, 1, 0.2993705371906957, 0, 0.4757626549085892, 4.948029267510726, 0.7006294628093043, 1, 0.09615194841964583],
[0.8609932337497662, 2.139006766250234, 1, 0, 0.2869977445832554, 1.161449313190112, 0, -12.07931125972695, 1, 0.2869977445832554, 0.09615194841964583],
[0.6595406578546821, 2.340459342145317, 1, 0, 0.2198468859515608, 1.516206754035067, 0, -15.76886146308476, 1, 0.2198468859515608, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.790461037789478, 2, 0, 0, 0.283272558578943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2271926848829214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.2618066096503648, 2.738193390349635, 0, 0, 0.08726886988345496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.2618066096503648, 2.738193390349635, 0, 0, 0.08726886988345496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934198240627939, 2.006580175937206, 0, 1, 0.3311399413542647, 0, 0.4983603506064411, 5.183049941238796, 0.6688600586457353, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.85865949587095, 1.138289218589954, 1, 0, 0.62018395139781, 0.5380221617899998, 0, -5.595540918649453, 1, 0.62018395139781, 0.09615194841964583],
[0.002334845913149261, 2.99766515408685, 0, 1, 0.0007782819710497538, 0, 0.3335929627218889, 3.469435286594036, 0.9992217180289502, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.999083171635028, 2.000916828364972, 0, 1, 0.3330277238783427, 0, 0.499770897932394, 5.197719922961857, 0.6669722761216573, 1, 0.09615194841964583],
[0.2618066096503648, 2.738193390349635, 0, 0, 0.08726886988345496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2271926848829214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6822338356291471, 2.074565699634032, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09269597818628515],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 1.862821767643405, 0, 0, 0.3493057134406142, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[1.199196708850724, 1.693641889142529, 1, 0, 0.4145397913601542, 0.8338915480833596, 0, -8.672643267132987, 1, 0.4145397913601542, 0.09615194841964583],
[0.01652835343515469, 1.932167296798152, 0, 2, 0.008481752105915482, 0, 1.035107054815727, 10.7653258392446, 0.9831084359069552, 1, 0.09615194841964583],
[0.7364253887952796, 1.917578202703753, 1, 0, 0.2774771636157932, 1.357910815155223, 0, -14.12255120643789, 1, 0.2774771636157931, 0.09615194841964583],
[0.8971958769715732, 2.102804123028427, 0, 0, 0.2990652923238578, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7516550645400141, 1.424496690780702, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09442992689214172],
[0.5407660057741284, 1.604102887366443, 0, 1, 0.2521207741431343, 0, 0.6234014088970086, 6.483502613761228, 0.7478792258568657, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934166392520483, 2.006583360747952, 0, 1, 0.3311388797506827, 0, 0.4983595596184207, 5.183041714801024, 0.6688611202493173, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969437085827201, 2.00305629141728, 0, 1, 0.3323145695275734, 0, 0.4992370929787706, 5.192168241873777, 0.6676854304724267, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 1, 0.2192374804839066, 0, 0.4269330622324559, 4.440191480771124, 0.7807625195160934, 1, 0.09615194841964583],
[1.003529434622433, 1.857463817502645, 0, 1, 0.3507626010222271, 0, 0.5383684950291505, 5.599142855426013, 0.6492373989777729, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.395905831801355, 1.261806609650365, 0, 0, 0.5252283166642628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.005862400209390238, 1.923394098268617, 0, 1, 0.003038683665969296, 0, 0.5199142499710125, 5.407214918848002, 0.9969613163340307, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934190626368818, 2.006580937363118, 0, 1, 0.3311396875456273, 0, 0.4983601614964592, 5.183047974456167, 0.6688603124543727, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.395905831801355, 1.261806609650365, 0, 0, 0.5252283166642628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5919818900872685, 2.408018109912731, 0, 0, 0.1973272966957562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.395905831801355, 1.261806609650365, 0, 0, 0.5252283166642628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.2594745978405916, 2.740525402159407, 0, 1, 0.08649153261353056, 0, 0.3648935343609828, 3.794967656489294, 0.9135084673864694, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[1, 1.862821767643405, 0, 0, 0.3493057134406142, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.114289348851607, 0, 0, 0.2033585200774292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6595400130625179, 2.340459986937482, 1, 1, 0.2198466710208393, 1.51620823633821, 0.4272664371880638, -11.32521823060272, 0.9516674412410548, 0.3913607832827335, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -5.200102631491133, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.09615194841964583],
[0.9969485633981811, 2.003051436601819, 0, 1, 0.3323161877993936, 0, 0.4992383029846213, 5.192180826182994, 0.6676838122006064, 1, 0.09615194841964583],
[1, 1.998777078895395, 1, 1, 0.3334692688688789, 1, 0.5003059173325323, -5.196921028439293, 0.8887982467200553, 0.5557367844578132, 0.09615194841964583],
[1, 1.862821767643405, 0, 0, 0.3493057134406142, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969355513240264, 2.003064448675973, 0, 1, 0.3323118504413421, 0, 0.499235059890859, 5.192147097342178, 0.6676881495586579, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.114289348851607, 0, 0, 0.2033585200774292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969490821200847, 2.003050917879915, 0, 1, 0.3323163607066949, 0, 0.4992384322703228, 5.192182170780828, 0.6676836392933051, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485633981338, 2.003051436601866, 0, 1, 0.332316187799378, 0, 0.4992383029846097, 5.192180826182873, 0.667683812200622, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485633844408, 2.003051436615559, 0, 1, 0.3323161877948136, 0, 0.4992383029811967, 5.192180826147378, 0.6676838122051865, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485633981811, 2.002114971729672, 1, 1, 0.3324199543360725, 1.003060776366855, 0.4994718156151031, -5.237428559990137, 0.8894969739592036, 0.5543368826313484, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5425361724282599, 2.249793056025381, 1, 1, 0.1942952023349733, 1.843195073103132, 0.4444853260266791, -14.54686847292912, 0.9622493743496117, 0.3508397790195584, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7364254070770618, 2.054035630712416, 1, 0, 0.2639081489059015, 1.357910781445047, 0, -14.12255085584514, 1, 0.2639081489059014, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 10.40020526298227, 0.4444444444444445, 1, 0.09615194841964583],
[0.790461037789478, 2, 0, 0, 0.283272558578943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9814995098530814, 2.01282281716831, 0, 1, 0.3277868588147056, 0, 0.4968147178532213, 5.166975043344122, 0.6722131411852944, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.114289348851607, 0, 0, 0.2033585200774292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5919818900872685, 2.408018109912731, 0, 0, 0.1973272966957562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 1.992585577615358, 0, 1, 0.3341591991487341, 0, 0.5018605028732355, 5.219452243265151, 0.665840800851266, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.200102631491133, 0.6666666666666667, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6347213870089946, 2.365278612991005, 0, 2, 0.2115737956696649, 0, 0.8455663485118595, 8.794063587993739, 0.6216158796747394, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934191288164627, 2.006580871183538, 0, 1, 0.3311397096054875, 0, 0.498360177933009, 5.183048145399659, 0.6688602903945124, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.007704155084822, 1.992295844915178, 1, 0, 0.3359013850282739, 0.9923547451442501, 0, -10.32069304319466, 1, 0.3359013850282739, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969485327118494, 2.003051467288151, 0, 1, 0.3323161775706164, 0, 0.4992382953363945, 5.192180746639865, 0.6676838224293835, 1, 0.09615194841964583],
[0.790461037789478, 2, 0, 0, 0.283272558578943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 2.250746795142053, 0, 0, 0.1934140041155963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8981116115720873, 2.101888388427913, 0, 1, 0.2993705371906957, 0, 0.4757626549085892, 4.948029267510726, 0.7006294628093043, 1, 0.09615194841964583],
[0.8609932337497662, 2.139006766250234, 1, 0, 0.2869977445832554, 1.161449313190112, 0, -12.07931125972695, 1, 0.2869977445832554, 0.09615194841964583],
[0.6595406578546821, 2.340459342145317, 1, 0, 0.2198468859515608, 1.516206754035067, 0, -15.76886146308476, 1, 0.2198468859515608, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.790461037789478, 2, 0, 0, 0.283272558578943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2271926848829214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.197426684099145, 1.697527622157047, 0, 0, 0.4136254176832514, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.2618066096503648, 2.738193390349635, 0, 0, 0.08726886988345496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.2618066096503648, 2.738193390349635, 0, 0, 0.08726886988345496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934198240627939, 2.006580175937206, 0, 1, 0.3311399413542647, 0, 0.4983603506064411, 5.183049941238796, 0.6688600586457353, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.85865949587095, 1.138289218589954, 1, 0, 0.62018395139781, 0.5380221617899998, 0, -5.595540918649453, 1, 0.62018395139781, 0.09615194841964583],
[0.002334845913149261, 2.99766515408685, 0, 1, 0.0007782819710497538, 0, 0.3335929627218889, 3.469435286594036, 0.9992217180289502, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.999083171635028, 2.000916828364972, 0, 1, 0.3330277238783427, 0, 0.499770897932394, 5.197719922961857, 0.6669722761216573, 1, 0.09615194841964583],
[0.2618066096503648, 2.738193390349635, 0, 0, 0.08726886988345496, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2271926848829214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6822338356291471, 2.074565699634032, 0, 0, 0.2474731393786372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09269597818628515],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 1.862821767643405, 0, 0, 0.3493057134406142, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[1.199196708850724, 1.693641889142529, 1, 0, 0.4145397913601542, 0.8338915480833596, 0, -8.672643267132987, 1, 0.4145397913601542, 0.09615194841964583],
[0.01652835343515469, 1.932167296798152, 0, 2, 0.008481752105915482, 0, 1.035107054815727, 10.7653258392446, 0.9831084359069552, 1, 0.09615194841964583],
[0.7364253887952796, 1.917578202703753, 1, 0, 0.2774771636157932, 1.357910815155223, 0, -14.12255120643789, 1, 0.2774771636157931, 0.09615194841964583],
[0.8971958769715732, 2.102804123028427, 0, 0, 0.2990652923238578, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7516550645400141, 1.424496690780702, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09442992689214172],
[0.5407660057741284, 1.604102887366443, 0, 1, 0.2521207741431343, 0, 0.6234014088970086, 6.483502613761228, 0.7478792258568657, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934166392520483, 2.006583360747952, 0, 1, 0.3311388797506827, 0, 0.4983595596184207, 5.183041714801024, 0.6688611202493173, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.398984842006959, 0, 0, 0.3454056283998618, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9969437085827201, 2.00305629141728, 0, 1, 0.3323145695275734, 0, 0.4992370929787706, 5.192168241873777, 0.6676854304724267, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 1.915810201149397, 0, 0, 0.2781433275803102, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.8628217676434058, 2.137178232356594, 0, 0, 0.2876072558811353, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 1, 0.2192374804839066, 0, 0.4269330622324559, 4.440191480771124, 0.7807625195160934, 1, 0.09615194841964583],
[1.003529434622433, 1.857463817502645, 0, 1, 0.3507626010222271, 0, 0.5383684950291505, 5.599142855426013, 0.6492373989777729, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.395905831801355, 1.261806609650365, 0, 0, 0.5252283166642628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.005862400209390238, 1.923394098268617, 0, 1, 0.003038683665969296, 0, 0.5199142499710125, 5.407214918848002, 0.9969613163340307, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.7627581351955274, 2.237241864804473, 0, 0, 0.2542527117318424, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.9934190626368818, 2.006580937363118, 0, 1, 0.3311396875456273, 0, 0.4983601614964592, 5.183047974456167, 0.6688603124543727, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.395905831801355, 1.261806609650365, 0, 0, 0.5252283166642628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5919818900872685, 2.408018109912731, 0, 0, 0.1973272966957562, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.6577124414517196, 2.34228755854828, 0, 0, 0.2192374804839066, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.40020526298227, 1, 0.3333333333333333, 0.09615194841964583],
[0.738193390349635, 2.052267647439843, 0, 0, 0.2645417299696148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[1.395905831801355, 1.261806609650365, 0, 0, 0.5252283166642628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583],
[0.5397142426474253, 1.597463989709169, 0, 0, 0.2525359066811665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09615194841964583]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node51":{
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001717084757366458,
"Nucleotide GTR":0.001687977563920857,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "H", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CAT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01039394000698845,
"Nucleotide GTR":0.01021774694421301,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "S", "R", "C", "E", "D", "K", "R", "S", "K", "L", "T", "M", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "TCT", "AGA", "TGT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "TCA", "AAA", "CTT", "ACT", "ATG", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714305339789548,
"Nucleotide GTR":0.001685245261691474,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCT", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412978_Hubei_20200117_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721667666079048,
"Nucleotide GTR":0.001692482785373182,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "N", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "AAT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412978_Hubei_20200117_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712942160200589,
"Nucleotide GTR":0.001683905190066073,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "S", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AGT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413880_Guangdong_20200205_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001714272356336882,
"Nucleotide GTR":0.001685212837358404,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "TTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413880_Guangdong_20200205_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414008_England_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714305744246575,
"Nucleotide GTR":0.00168524565929234,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "V", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GTA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414008_England_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001722021527504111,
"Nucleotide GTR":0.001692830648309871,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "C", "E", "I", "-", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGT", "GAA", "ATC", "---", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417349_Washington_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001714357226379163,
"Nucleotide GTR":0.001685296268724623,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "F", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TTT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417349_Washington_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003455970233360677,
"Nucleotide GTR":0.003397386291191766,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "-", "A", "S", "A", "L", "R", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "---", "GCA", "TCA", "GCT", "TTG", "AGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714078264468556,
"Nucleotide GTR":0.001685022035641909,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "H", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAT", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417707_Reykjavik_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714357226379163,
"Nucleotide GTR":0.001685296268724623,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "S", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "TCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417707_Reykjavik_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714111378868947,
"Nucleotide GTR":0.001685054588702939,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "P", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "CCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001717085845796316,
"Nucleotide GTR":0.001687978633900175,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTA", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171500578083249,
"Nucleotide GTR":0.001685933829195357,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "N", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AAT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712993996883638,
"Nucleotide GTR":0.001683956148038645,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAG", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712993996856693,
"Nucleotide GTR":0.001683956148012157,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCG", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001714357226352647,
"Nucleotide GTR":0.001685296268698557,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "F", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "TTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418836_British_Columbia_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001714357226352647,
"Nucleotide GTR":0.001685296268698557,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "V", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418836_British_Columbia_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714065804516149,
"Nucleotide GTR":0.001685009786904611,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "C", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGT", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714176110427537,
"Nucleotide GTR":0.001685118222963337,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "I", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ATA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714527651407597,
"Nucleotide GTR":0.001685463804790092,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "N", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAT", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001715005800576284,
"Nucleotide GTR":0.001685933848604464,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "I", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "ATC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712976283899741,
"Nucleotide GTR":0.00168393873531672,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAG", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001717780491358808,
"Nucleotide GTR":0.001688661504165799,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "G", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "GGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171355034288452,
"Nucleotide GTR":0.00168450306313019,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGC", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420498_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714339488514573,
"Nucleotide GTR":0.001685278831543766,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "V", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GTT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420498_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001714076805199166,
"Nucleotide GTR":0.00168502060110935,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAC", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420701_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001714356698988447,
"Nucleotide GTR":0.00168529575027398,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCT", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420701_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420805_Utah_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001714357226352647,
"Nucleotide GTR":0.001685296268698557,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "I", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ATA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420805_Utah_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712959820694499,
"Nucleotide GTR":0.001683922551187797,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "V", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "GTC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171482456840123,
"Nucleotide GTR":0.001685755688589914,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAA", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171292450978814,
"Nucleotide GTR":0.001683887838854909,
"amino-acid": [
["A", "M", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATG", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714322545838941,
"Nucleotide GTR":0.00168526217607221,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTT", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421789_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714357234072162,
"Nucleotide GTR":0.001685296276287213,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "F", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TTT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421789_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421980_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001715005773121813,
"Nucleotide GTR":0.001685933821615386,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "I", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "ATA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421980_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422115_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714065798163115,
"Nucleotide GTR":0.00168500978065927,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "F", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "TTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422115_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422133_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001714357226352647,
"Nucleotide GTR":0.001685296268698557,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "C", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "TGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422133_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714111902368134,
"Nucleotide GTR":0.00168505510332802,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCC", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171299398908089,
"Nucleotide GTR":0.001683956140368165,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACG", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422374_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714357226379163,
"Nucleotide GTR":0.001685296268724623,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTT", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422374_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00171500623386676,
"Nucleotide GTR":0.001685934274550007,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "I", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATA", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422526_New_York_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171347226883733,
"Nucleotide GTR":0.001684426312556629,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGC", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422526_New_York_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_5988":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_5988",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712959317064118,
"Nucleotide GTR":0.001683922056094714,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCG", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001714374466538532,
"Nucleotide GTR":0.001685313216637117,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "I", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ATA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001714374466538532,
"Nucleotide GTR":0.001685313216637117,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "F", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "TTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001714374440325836,
"Nucleotide GTR":0.001685313190868764,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "V", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GTT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171437447423032,
"Nucleotide GTR":0.001685313224198518,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAT", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422918_Zuid_Holland_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001714357246128842,
"Nucleotide GTR":0.001685296288139514,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "L", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TTA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422918_Zuid_Holland_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_12":{
"Global MG94xREV":0.00171495424668676,
"Nucleotide GTR":0.001685883168631636,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTA", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":2527.292942078218,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03809839477461618],
[0.01355280077056681],
[0.02399984143509286],
[0.05183614681238714],
[0.0290125879303485],
[0.01032069267969639],
[0.01827629521057866],
[0.03947412420553843],
[0.01036285780205312],
[0.003686395398960868],
[0.006528016351738677],
[0.01409956040407818],
[0.02822877914910741],
[0.01004186717229053],
[0.01778253985483457],
[0.03840768486347142],
[0.01517763505835346],
[0.00539916354300801],
[0.009561054656373219],
[0.02065047947043249],
[0.01155803215096628],
[0.004111556614616709],
[0.007280908830041133],
[0.01572569802439438],
[0.004128354352240755],
[0.001468585865027039],
[0.002600630562725637],
[0.005616981596266349],
[0.01124577847971355],
[0.004000478134239736],
[0.007084206616157196],
[0.01530085001592795],
[0.03585757483678201],
[0.01275567043581542],
[0.0225882511696561],
[0.04878731832591539],
[0.02730616471049653],
[0.009713664114169228],
[0.01720134475820699],
[0.03715238847174716],
[0.009753349225296692],
[0.003469573972294477],
[0.006144060301043603],
[0.01327027149951766],
[0.02656845693573735],
[0.009451238188947025],
[0.01673663043823644],
[0.03614867351883963],
[0.008311320925348364],
[0.03178876890353675],
[0.01779211051989293],
[0.006329214933871032],
[0.01120802684205426],
[0.0242076984730567],
[0.002260699890537091],
[0.004003337747209636],
[0.008646623927293751],
[0.01731143597628505],
[0.00615822383664661],
[0.01090522897099642],
[0.02355369936472586]
],
"Log Likelihood":-1197.2056376227,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6728293885541258, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":66
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":2697.474062478133,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3249141574220814],
[0.1795760697305864],
[0.2036119915478077],
[0.2918977812995245]
],
"Log Likelihood":-1241.354204763217,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.08028190889412985,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1980009136267586,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3831440207570939,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.243082105717655,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.713584738362815
},
"display order":0,
"estimated parameters":107
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-11/sequences.nsp8.compressed.fas",
"number of sequences":51,
"number of sites":198,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2,epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5,epi_isl_422374_Wales_20200329_null_1,epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_412978_Hubei_20200117_null_1,epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_12,epi_isl_422526_New_York_20200322_null_2,epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1,epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1,epi_isl_422133_Wales_20200330_null_2,epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_1,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1,epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2,epi_isl_418836_British_Columbia_20200310_null_3,epi_isl_414008_England_20200227_null_1,epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_417349_Washington_20200312_null_2,epi_isl_417707_Reykjavik_20200305_null_1,epi_isl_422115_Wales_20200330_null_1,epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_422918_Zuid_Holland_20200319_null_6,epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1,epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1,epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_5988,epi_isl_421980_England_20200331_null_1,epi_isl_420498_England_20200322_null_1,epi_isl_420701_England_20200327_null_3,epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2,epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_3,epi_isl_420805_Utah_20200314_null_3,epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1,epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1,epi_isl_413880_Guangdong_20200205_null_7,epi_isl_421789_England_20200325_null_1,epi_isl_418697_England_20200316_null_2,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_412978_Hubei_20200117_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413880_Guangdong_20200205_null_7":"test",
"epi_isl_414008_England_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417349_Washington_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417707_Reykjavik_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418836_British_Columbia_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420498_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420701_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420805_Utah_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421789_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421980_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422115_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422133_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422374_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_422526_New_York_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_422565_Pichincha_20200330_null_5988":"test",
"epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422918_Zuid_Holland_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_12":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":1
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":2
}
}
}